MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 38976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017596	GGA	2	6	161552	161557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017596	A	6	6	161557	161562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017596	TCAG	2	8	161666	161673	25 %	25 %	25 %	25 %	386362021
3504	NC_017596	CTT	2	6	161674	161679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362021
3505	NC_017596	TTGG	2	8	161778	161785	0 %	50 %	50 %	0 %	386362021
3506	NC_017596	GATG	2	8	161798	161805	25 %	25 %	50 %	0 %	386362021
3507	NC_017596	AAG	2	6	161830	161835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362021
3508	NC_017596	CTCTTT	2	12	161889	161900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017596	GT	4	8	161925	161932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017596	ACA	2	6	161991	161996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386362022
3511	NC_017596	TGAT	2	8	162063	162070	25 %	50 %	25 %	0 %	386362022
3512	NC_017596	TAC	2	6	162092	162097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362022
3513	NC_017596	CAT	2	6	162103	162108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362022
3514	NC_017596	TTA	2	6	162133	162138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362022
3515	NC_017596	CA	3	6	162296	162301	50 %	0 %	0 %	50 %	386362022
3516	NC_017596	TGG	2	6	162360	162365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362022
3517	NC_017596	AGA	2	6	162400	162405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362022
3518	NC_017596	CTTA	2	8	162420	162427	25 %	50 %	0 %	25 %	386362022
3519	NC_017596	ATG	2	6	162478	162483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017596	AGC	2	6	162604	162609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362023
3521	NC_017596	GTTT	2	8	162653	162660	0 %	75 %	25 %	0 %	386362023
3522	NC_017596	GTTG	2	8	162679	162686	0 %	50 %	50 %	0 %	386362023
3523	NC_017596	GTG	2	6	162780	162785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362023
3524	NC_017596	CGA	2	6	162813	162818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362023
3525	NC_017596	AGC	2	6	162832	162837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362023
3526	NC_017596	AGA	2	6	162853	162858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362023
3527	NC_017596	ACC	2	6	162957	162962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386362023
3528	NC_017596	CTT	2	6	162977	162982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362023
3529	NC_017596	ATTG	2	8	163027	163034	25 %	50 %	25 %	0 %	386362023
3530	NC_017596	TGG	2	6	163060	163065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362023
3531	NC_017596	AGA	2	6	163144	163149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362023
3532	NC_017596	CTG	2	6	163152	163157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362023
3533	NC_017596	GCG	2	6	163160	163165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386362023
3534	NC_017596	TGA	2	6	163319	163324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362024
3535	NC_017596	GC	3	6	163341	163346	0 %	0 %	50 %	50 %	386362024
3536	NC_017596	GAA	2	6	163362	163367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362024
3537	NC_017596	CTA	2	6	163465	163470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362024
3538	NC_017596	TGA	2	6	163492	163497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362024
3539	NC_017596	GAA	2	6	163569	163574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362024
3540	NC_017596	GAA	2	6	163635	163640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362024
3541	NC_017596	GAT	2	6	163671	163676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362024
3542	NC_017596	TG	3	6	163902	163907	0 %	50 %	50 %	0 %	386362024
3543	NC_017596	T	6	6	163958	163963	0 %	100 %	0 %	0 %	386362024
3544	NC_017596	GGA	2	6	163997	164002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386362024
3545	NC_017596	GCT	2	6	164010	164015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362024
3546	NC_017596	AAG	2	6	164020	164025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362024
3547	NC_017596	ATA	2	6	164069	164074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386362024
3548	NC_017596	TCA	2	6	164201	164206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362025
3549	NC_017596	GTT	2	6	164251	164256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362025
3550	NC_017596	CTT	2	6	164297	164302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362025
3551	NC_017596	CACT	2	8	164364	164371	25 %	25 %	0 %	50 %	386362025
3552	NC_017596	CAGG	2	8	164395	164402	25 %	0 %	50 %	25 %	386362025
3553	NC_017596	ACT	2	6	164438	164443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362025
3554	NC_017596	TC	3	6	164470	164475	0 %	50 %	0 %	50 %	386362025
3555	NC_017596	AGA	2	6	164529	164534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362025
3556	NC_017596	AGA	2	6	164649	164654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362025
3557	NC_017596	AATC	2	8	164685	164692	50 %	25 %	0 %	25 %	386362025
3558	NC_017596	ATT	2	6	164732	164737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362025
3559	NC_017596	TTA	2	6	164760	164765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362025
3560	NC_017596	TTA	2	6	164793	164798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017596	TGT	2	6	164925	164930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017596	GGTGTT	2	12	164955	164966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017596	TTA	2	6	165009	165014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017596	GGAT	2	8	165072	165079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017596	AG	3	6	165084	165089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017596	ATG	2	6	165103	165108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362026
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3569	NC_017596	CGG	2	6	165302	165307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386362026
3570	NC_017596	GCT	2	6	165316	165321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362026
3571	NC_017596	TTA	3	9	165328	165336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362026
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3579	NC_017596	AT	3	6	165647	165652	50 %	50 %	0 %	0 %	386362026
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3581	NC_017596	ATTTG	2	10	165875	165884	20 %	60 %	20 %	0 %	386362026
3582	NC_017596	AG	3	6	165922	165927	50 %	0 %	50 %	0 %	386362026
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3589	NC_017596	GAT	2	6	166294	166299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362026
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3591	NC_017596	GAT	2	6	166384	166389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362026
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3594	NC_017596	GAT	2	6	166582	166587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362026
3595	NC_017596	ATC	2	6	166588	166593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362026
3596	NC_017596	TGAG	2	8	166625	166632	25 %	25 %	50 %	0 %	386362026
3597	NC_017596	TGT	2	6	166674	166679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362026
3598	NC_017596	TCAT	2	8	166727	166734	25 %	50 %	0 %	25 %	386362026
3599	NC_017596	GCT	2	6	166740	166745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362026
3600	NC_017596	GTC	2	6	166761	166766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017596	AGTC	2	8	166891	166898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_017596	TG	3	6	166917	166922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017596	GAA	2	6	166976	166981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017596	GGA	2	6	166989	166994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017596	GAA	2	6	167077	167082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362027
3606	NC_017596	AAG	2	6	167090	167095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362027
3607	NC_017596	TGG	2	6	167122	167127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362027
3608	NC_017596	TGT	2	6	167172	167177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362027
3609	NC_017596	CAAG	2	8	167211	167218	50 %	0 %	25 %	25 %	386362027
3610	NC_017596	TGAT	2	8	167303	167310	25 %	50 %	25 %	0 %	386362027
3611	NC_017596	ATT	3	9	167333	167341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362027
3612	NC_017596	TAT	2	6	167484	167489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362027
3613	NC_017596	GAT	2	6	167632	167637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362027
3614	NC_017596	GGT	2	6	167680	167685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362027
3615	NC_017596	ACT	2	6	167720	167725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362027
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3618	NC_017596	CAAGA	2	10	167797	167806	60 %	0 %	20 %	20 %	386362027
3619	NC_017596	CTT	2	6	167821	167826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362027
3620	NC_017596	TGG	2	6	167979	167984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362027
3621	NC_017596	CAT	2	6	168025	168030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362027
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3997	NC_017596	TGCT	2	8	186195	186202	0 %	50 %	25 %	25 %	386362048
3998	NC_017596	T	6	6	186381	186386	0 %	100 %	0 %	0 %	386362048
3999	NC_017596	ATG	2	6	186436	186441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362049
4000	NC_017596	ATT	3	9	186451	186459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362049

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