MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae INV200

Total Repeats: 870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017593	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758385
2	NC_017593	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758389
3	NC_017593	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758390
4	NC_017593	TGCTTA	2	12	7703	7714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387758390
5	NC_017593	GCTAAC	2	12	7944	7955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387758390
6	NC_017593	TTGATT	2	12	8878	8889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387758392
7	NC_017593	TAAGGA	2	12	16883	16894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017593	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017593	ACTAAT	2	12	20001	20012	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017593	GATAGA	2	12	20590	20601	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758400
11	NC_017593	TCTTGT	2	12	21237	21248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387758400
12	NC_017593	AGTTGA	2	12	21888	21899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017593	AGGTTG	2	12	26028	26039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387758406
14	NC_017593	GATAAA	2	12	28823	28834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387758409
15	NC_017593	TTGTTT	2	12	29696	29707	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017593	CGATTG	2	12	33664	33675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758412
17	NC_017593	TTCCTT	2	12	37081	37092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758414
18	NC_017593	TAAAAA	2	12	41345	41356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017593	AGGATA	2	12	42622	42633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758421
20	NC_017593	TCAATC	2	12	43951	43962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387758421
21	NC_017593	TTACTG	2	12	54334	54345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387758428
22	NC_017593	AAAAAT	2	12	57494	57505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017593	GTTTCT	2	12	64635	64646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387758435
24	NC_017593	TTCTAT	2	12	65074	65085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017593	TTCCTT	2	12	65716	65727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387758436
26	NC_017593	TCCACT	2	12	67713	67724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387758437
27	NC_017593	TTGCAG	2	12	69869	69880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758440
28	NC_017593	TCTTGC	2	12	71494	71505	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387758442
29	NC_017593	GACTTG	2	12	71898	71909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758442
30	NC_017593	TAAAAT	2	12	73351	73362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017593	TCAGCT	2	12	75042	75053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387758446
32	NC_017593	ACATCA	2	12	81511	81522	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387758454
33	NC_017593	GCTTGC	2	12	83615	83626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387758454
34	NC_017593	TACAGG	2	12	85840	85851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387758457
35	NC_017593	AAAAAC	2	12	85941	85952	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387758457
36	NC_017593	TAAAAA	2	12	89489	89500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017593	TTTTGA	2	12	92855	92866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387758463
38	NC_017593	AAGCAG	2	12	93383	93394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387758463
39	NC_017593	AAGGAA	2	12	98245	98256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387758469
40	NC_017593	TTATCT	2	12	115238	115249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387758487
41	NC_017593	TAACAA	2	12	116983	116994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387758490
42	NC_017593	ATAAAA	2	12	119375	119386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017593	CCAGCT	2	12	120797	120808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387758494
44	NC_017593	CCAGCT	2	12	120923	120934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387758494
45	NC_017593	TTTGCT	2	12	128233	128244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017593	ATAAAA	2	12	128624	128635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017593	TCAGGG	2	12	130192	130203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387758504
48	NC_017593	ATAAAT	2	12	133535	133546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017593	GAAGCA	2	12	141541	141552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017593	GTTGGT	2	12	144094	144105	0 %	50 %	50 %	0 %	387758514
51	NC_017593	CTTATA	2	12	149224	149235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387758515
52	NC_017593	TCAGGT	2	12	161414	161425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758529
53	NC_017593	ATTGAG	2	12	168044	168055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758536
54	NC_017593	TTCGGA	2	12	168174	168185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758536
55	NC_017593	AACAAG	2	12	171797	171808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758538
56	NC_017593	GGATTG	2	12	173526	173537	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387758540
57	NC_017593	TGCACT	2	12	177310	177321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387758545
58	NC_017593	CAATAT	2	12	178790	178801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387758546
59	NC_017593	TGTTCG	2	12	179581	179592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387758547
60	NC_017593	TTCCAT	2	12	180119	180130	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387758547
61	NC_017593	ACTTGG	2	12	180378	180389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758547
62	NC_017593	ACCACG	2	12	184915	184926	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387758553
63	NC_017593	GCAGAC	2	12	185776	185787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758554
64	NC_017593	TTTTAC	2	12	187341	187352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017593	ACAAGA	2	12	193238	193249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758559
66	NC_017593	CAGGAA	2	12	193442	193453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387758560
67	NC_017593	TAAAGG	2	12	196130	196141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758564
68	NC_017593	GCAATC	2	12	198718	198729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387758569
69	NC_017593	ACATCA	2	12	199265	199276	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387758570
70	NC_017593	TAAAGG	2	12	203516	203527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758579
71	NC_017593	AAATTA	2	12	204555	204566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387758582
72	NC_017593	ACTTGG	2	12	204622	204633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758582
73	NC_017593	TTGAAG	2	12	207563	207574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387758586
74	NC_017593	GTAAAG	2	12	208246	208257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387758587
75	NC_017593	AAACTC	2	12	209621	209632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387758589
76	NC_017593	AGATAA	2	12	213723	213734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387758594
77	NC_017593	CATAAT	2	12	215781	215792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387758596
78	NC_017593	TATCTG	2	12	221159	221170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387758604
79	NC_017593	ACAATT	2	12	223279	223290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387758605
80	NC_017593	CGAAAT	2	12	229290	229301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387758608
81	NC_017593	TCTTAA	2	12	231447	231458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017593	TGTCAA	2	12	238064	238075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758616
83	NC_017593	GATGGT	2	12	238823	238834	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387758617
84	NC_017593	TGCCTT	2	12	240474	240485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387758618
85	NC_017593	GTTGCT	2	12	245092	245103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387758621
86	NC_017593	GCAAGA	2	12	250646	250657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387758625
87	NC_017593	ATTCGA	2	12	252044	252055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758625
88	NC_017593	GTCAGT	2	12	255449	255460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758626
89	NC_017593	CGATAC	2	12	265786	265797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387758638
90	NC_017593	TCTTTT	2	12	269558	269569	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017593	TAGATA	2	12	275695	275706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387758650
92	NC_017593	GATAAA	2	12	281044	281055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387758653
93	NC_017593	AAAATG	2	12	284989	285000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387758655
94	NC_017593	AGAGGA	2	12	287563	287574	50 %	0 %	50 %	0 %	387758658
95	NC_017593	ATGGAG	2	12	287996	288007	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387758659
96	NC_017593	GGACAA	2	12	288863	288874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387758660
97	NC_017593	CCATAG	2	12	292326	292337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387758664
98	NC_017593	TTGATT	2	12	292769	292780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387758664
99	NC_017593	AGGAGT	2	12	294515	294526	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387758666
100	NC_017593	AGCGTG	2	12	296153	296164	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387758670
101	NC_017593	AACTGT	2	12	298697	298708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758672
102	NC_017593	GAAAAA	2	12	300812	300823	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017593	CAACCT	2	12	305749	305760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387758677
104	NC_017593	GACCGT	2	12	309891	309902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017593	TCTATA	2	12	314877	314888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387758685
106	NC_017593	TTTAGA	2	12	315237	315248	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387758685
107	NC_017593	GTTTTT	2	12	319763	319774	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387758689
108	NC_017593	ACAAAG	2	12	322766	322777	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758692
109	NC_017593	ACAAAG	2	12	323195	323206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758692
110	NC_017593	ACAAAG	2	12	323624	323635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758692
111	NC_017593	ACAAAG	2	12	324053	324064	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758692
112	NC_017593	AGCCAG	2	12	324101	324112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387758692
113	NC_017593	CATCTC	2	12	326173	326184	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017593	AGTTGA	2	12	326292	326303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017593	GCTAAA	2	12	328186	328197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387758693
116	NC_017593	GAAAAA	2	12	329497	329508	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387758694
117	NC_017593	AGCTAT	2	12	331366	331377	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758694
118	NC_017593	AGACAA	2	12	334161	334172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387758694
119	NC_017593	TGAGCT	2	12	339670	339681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387758699
120	NC_017593	TTTGAT	2	12	340133	340144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387758700
121	NC_017593	GCCAAA	2	12	340931	340942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387758700
122	NC_017593	TCAAGT	2	12	341048	341059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758700
123	NC_017593	TCAAGT	2	12	341072	341083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758700
124	NC_017593	TTCACG	2	12	341296	341307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387758700
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126	NC_017593	GCAGTT	2	12	343682	343693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017593	GATTTT	2	12	346913	346924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387758705
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221	NC_017593	CAGCTA	2	12	564030	564041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387758910
222	NC_017593	CTGTAA	2	12	565072	565083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387758911
223	NC_017593	AAAGTT	2	12	570054	570065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_017593	TCTGGT	2	12	849144	849155	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387759170
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352	NC_017593	CTCTAA	2	12	851042	851053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387759171
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463	NC_017593	TTCAAA	2	12	1098426	1098437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387759389
464	NC_017593	TCTTCC	2	12	1099204	1099215	0 %	50 %	0 %	50 %	387759389
465	NC_017593	TCCATA	2	12	1100207	1100218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387759390
466	NC_017593	CTCATC	2	12	1101331	1101342	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387759390
467	NC_017593	ATTACG	2	12	1101520	1101531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387759390
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469	NC_017593	TGCTTC	2	12	1103230	1103241	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387759390
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