MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625544
2	NC_017591	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625548
3	NC_017591	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625549
4	NC_017591	TGCTTA	2	12	7703	7714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625549
5	NC_017591	GCTAAC	2	12	7944	7955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625549
6	NC_017591	TTGATT	2	12	8878	8889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625551
7	NC_017591	TAAGGA	2	12	16882	16893	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017591	GAAGTG	2	12	19970	19981	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017591	ACTAAT	2	12	20000	20011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017591	GATAGA	2	12	20589	20600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017591	TCTTGT	2	12	21235	21246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017591	CATCTC	2	12	21780	21791	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017591	AGTTGA	2	12	21899	21910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017591	AGGTTG	2	12	26041	26052	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625562
15	NC_017591	TTGTTT	2	12	28270	28281	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017591	CGATTG	2	12	32291	32302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625565
17	NC_017591	TTCCTT	2	12	35751	35762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625567
18	NC_017591	TAAAAA	2	12	40016	40027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017591	AGGATA	2	12	41293	41304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625573
20	NC_017591	TCAATC	2	12	42622	42633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387625573
21	NC_017591	TTACTG	2	12	53005	53016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625580
22	NC_017591	AAAAAT	2	12	56165	56176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017591	GTTTCT	2	12	63306	63317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387625586
24	NC_017591	TTCTAT	2	12	63745	63756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017591	TTCCTT	2	12	64386	64397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387625587
26	NC_017591	TTGCAG	2	12	68539	68550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625591
27	NC_017591	TCCCAT	2	12	69644	69655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017591	TCTTGC	2	12	70164	70175	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387625593
29	NC_017591	GACTTG	2	12	70568	70579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625593
30	NC_017591	TAAAAT	2	12	72022	72033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017591	ACATCA	2	12	80276	80287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017591	GCTTGC	2	12	81924	81935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387625603
33	NC_017591	TACAGG	2	12	84149	84160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387625606
34	NC_017591	AAAAAC	2	12	84250	84261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387625606
35	NC_017591	TAAAAA	2	12	88084	88095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017591	TTTTGA	2	12	91297	91308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625611
37	NC_017591	AAGCAG	2	12	91825	91836	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625611
38	NC_017591	AAAGGA	2	12	96686	96697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387625617
39	NC_017591	TTATCT	2	12	108257	108268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387625624
40	NC_017591	TAACAA	2	12	110021	110032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387625625
41	NC_017591	ATAAAA	2	12	112720	112731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017591	CTCCAG	2	12	114094	114105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387625628
43	NC_017591	TCCAGC	2	12	114188	114199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387625628
44	NC_017591	TTTGCT	2	12	121654	121665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017591	ATAAAA	2	12	122043	122054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017591	TCAGGG	2	12	123611	123622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387625637
47	NC_017591	ATAAAT	2	12	126955	126966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017591	GAAGCA	2	12	134690	134701	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625643
49	NC_017591	GTTTTA	2	12	137840	137851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625646
50	NC_017591	TCAGGT	2	12	149459	149470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625658
51	NC_017591	ATTTTT	2	12	157809	157820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387625666
52	NC_017591	CATTTT	2	12	159942	159953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387625668
53	NC_017591	GATAAA	2	12	161090	161101	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625669
54	NC_017591	AAATTT	2	12	161270	161281	50 %	50 %	0 %	0 %	387625669
55	NC_017591	ATTGAG	2	12	164144	164155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625671
56	NC_017591	TTCGGA	2	12	164274	164285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625671
57	NC_017591	AACAAG	2	12	167897	167908	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387625673
58	NC_017591	GGATTG	2	12	169626	169637	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625675
59	NC_017591	TGCACT	2	12	173396	173407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625680
60	NC_017591	CAATAT	2	12	174876	174887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387625681
61	NC_017591	ACTTGG	2	12	176464	176475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625682
62	NC_017591	ACCACG	2	12	182247	182258	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387625689
63	NC_017591	GCAGAC	2	12	183008	183019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387625690
64	NC_017591	TTTTAC	2	12	184585	184596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017591	ACAAGA	2	12	190482	190493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387625695
66	NC_017591	TAAAGG	2	12	193373	193384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625700
67	NC_017591	GCAATC	2	12	195961	195972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625705
68	NC_017591	ACATCA	2	12	196508	196519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387625706
69	NC_017591	TAAAGG	2	12	200759	200770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625715
70	NC_017591	AAATTA	2	12	201798	201809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387625718
71	NC_017591	ACTTGG	2	12	201865	201876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625718
72	NC_017591	TTGAAG	2	12	204806	204817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625722
73	NC_017591	GTAAAG	2	12	205489	205500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387625723
74	NC_017591	AAACTC	2	12	206864	206875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387625725
75	NC_017591	AGATAA	2	12	210973	210984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625730
76	NC_017591	CATAAT	2	12	213040	213051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017591	TATCTG	2	12	218418	218429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387625738
78	NC_017591	CCAATC	2	12	225518	225529	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387625742
79	NC_017591	CGAAAT	2	12	226549	226560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387625742
80	NC_017591	TCTTAA	2	12	228517	228528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017591	TGTCAA	2	12	235134	235145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625750
82	NC_017591	GATGGT	2	12	235893	235904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625751
83	NC_017591	TGCCTT	2	12	237544	237555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387625752
84	NC_017591	GCTATG	2	12	237653	237664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625752
85	NC_017591	GTTGCT	2	12	241983	241994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387625754
86	NC_017591	GGTTGC	2	12	246542	246553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017591	GCAAGA	2	12	247074	247085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387625758
88	NC_017591	ATTCGA	2	12	248472	248483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625758
89	NC_017591	GTCAGT	2	12	251877	251888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387625759
90	NC_017591	CGATAC	2	12	262156	262167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625768
91	NC_017591	TCTTTT	2	12	267175	267186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017591	GAATTA	2	12	273566	273577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017591	AAAAGG	2	12	275693	275704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017591	TATTCC	2	12	275876	275887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017591	TAGATA	2	12	280704	280715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387625784
96	NC_017591	GATAAA	2	12	286053	286064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625787
97	NC_017591	AAAATG	2	12	289998	290009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387625789
98	NC_017591	AGAGGA	2	12	292571	292582	50 %	0 %	50 %	0 %	387625792
99	NC_017591	ATGGAG	2	12	293004	293015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387625793
100	NC_017591	CCATAG	2	12	297334	297345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387625798
101	NC_017591	TTGATT	2	12	297777	297788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387625798
102	NC_017591	AGGAGT	2	12	299523	299534	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387625800
103	NC_017591	AGCGTG	2	12	301157	301168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387625804
104	NC_017591	AACTGT	2	12	303701	303712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625806
105	NC_017591	GAAAAA	2	12	305816	305827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017591	CTATAG	2	12	308342	308353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017591	TCATGC	2	12	313358	313369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625812
108	NC_017591	AATCAG	2	12	313862	313873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017591	GAAAAT	2	12	316708	316719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017591	TCAACT	2	12	317523	317534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017591	CAACCT	2	12	322516	322527	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387625817
112	NC_017591	ACAAGA	2	12	324816	324827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017591	AGTTGA	2	12	325893	325904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017591	TCTATC	2	12	326937	326948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017591	GACCGT	2	12	328491	328502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387625820
116	NC_017591	AAAATA	2	12	332979	332990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387625826
117	NC_017591	GGTGAT	2	12	333473	333484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387625826
118	NC_017591	TAGCAG	2	12	337857	337868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387625830
119	NC_017591	AGTTGA	2	12	340676	340687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387625831
120	NC_017591	GCCAAA	2	12	344638	344649	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017591	GCTAAA	2	12	347403	347414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387625835
122	NC_017591	GAAAAA	2	12	348714	348725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387625836
123	NC_017591	AGCTAT	2	12	350583	350594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625836
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128	NC_017591	TCAAGT	2	12	360289	360300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387625841
129	NC_017591	TTCACG	2	12	360513	360524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387625841
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465	NC_017591	TGCAAC	2	12	1120951	1120962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387626490
466	NC_017591	CATCTG	2	12	1121057	1121068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387626491
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