MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 5863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	TATT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017582	AGCT	2	8	98	105	25 %	25 %	25 %	25 %	414562957
3	NC_017582	TTTA	2	8	495	502	25 %	75 %	0 %	0 %	414562957
4	NC_017582	TGCT	2	8	1220	1227	0 %	50 %	25 %	25 %	414562957
5	NC_017582	TTCA	2	8	1597	1604	25 %	50 %	0 %	25 %	414562958
6	NC_017582	ATAA	2	8	2742	2749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017582	TGAG	2	8	2763	2770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017582	AATT	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	414562961
9	NC_017582	AATC	2	8	3971	3978	50 %	25 %	0 %	25 %	414562961
10	NC_017582	GTGC	2	8	4438	4445	0 %	25 %	50 %	25 %	414562961
11	NC_017582	AGGA	2	8	4601	4608	50 %	0 %	50 %	0 %	414562961
12	NC_017582	CAAA	2	8	4869	4876	75 %	0 %	0 %	25 %	414562962
13	NC_017582	ATCA	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
14	NC_017582	ATTT	2	8	4992	4999	25 %	75 %	0 %	0 %	414562962
15	NC_017582	CAAT	2	8	5296	5303	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
16	NC_017582	CTTG	2	8	5602	5609	0 %	50 %	25 %	25 %	414562963
17	NC_017582	AGGA	2	8	6038	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	414562963
18	NC_017582	AATG	2	8	6239	6246	50 %	25 %	25 %	0 %	414562963
19	NC_017582	AGTT	2	8	6303	6310	25 %	50 %	25 %	0 %	414562963
20	NC_017582	TCAA	2	8	6528	6535	50 %	25 %	0 %	25 %	414562963
21	NC_017582	ACTG	2	8	7684	7691	25 %	25 %	25 %	25 %	414562963
22	NC_017582	TTGG	2	8	9379	9386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017582	GCTG	2	8	9894	9901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017582	GCTG	2	8	10126	10133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017582	GCTT	2	8	10171	10178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017582	GATT	2	8	10428	10435	25 %	50 %	25 %	0 %	414562964
27	NC_017582	TTAT	2	8	10993	11000	25 %	75 %	0 %	0 %	414562965
28	NC_017582	GCTT	2	8	12175	12182	0 %	50 %	25 %	25 %	414562967
29	NC_017582	CTAT	2	8	12214	12221	25 %	50 %	0 %	25 %	414562967
30	NC_017582	CTAT	2	8	12690	12697	25 %	50 %	0 %	25 %	414562968
31	NC_017582	TGAT	2	8	13071	13078	25 %	50 %	25 %	0 %	414562968
32	NC_017582	CAGG	3	12	13510	13521	25 %	0 %	50 %	25 %	414562968
33	NC_017582	TGGT	2	8	13647	13654	0 %	50 %	50 %	0 %	414562968
34	NC_017582	TATG	2	8	14166	14173	25 %	50 %	25 %	0 %	414562969
35	NC_017582	ATTA	2	8	14438	14445	50 %	50 %	0 %	0 %	414562970
36	NC_017582	TTGC	2	8	15006	15013	0 %	50 %	25 %	25 %	414562970
37	NC_017582	GAGC	2	8	15138	15145	25 %	0 %	50 %	25 %	414562970
38	NC_017582	GTCG	2	8	15174	15181	0 %	25 %	50 %	25 %	414562970
39	NC_017582	AACC	2	8	15296	15303	50 %	0 %	0 %	50 %	414562970
40	NC_017582	GTCG	2	8	15363	15370	0 %	25 %	50 %	25 %	414562970
41	NC_017582	TGAT	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	414562970
42	NC_017582	ATGC	2	8	17787	17794	25 %	25 %	25 %	25 %	414562971
43	NC_017582	AAGA	2	8	17814	17821	75 %	0 %	25 %	0 %	414562971
44	NC_017582	GTGA	2	8	18505	18512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017582	TAAC	2	8	18588	18595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017582	AGCG	2	8	18676	18683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017582	TGGT	2	8	19341	19348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017582	AGCC	2	8	19558	19565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017582	GTAA	2	8	20334	20341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017582	GAAG	2	8	20416	20423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017582	ATTC	2	8	21354	21361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017582	CTAA	2	8	21709	21716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017582	CTGA	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017582	TAGG	2	8	22364	22371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017582	TTGG	2	8	22547	22554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017582	AATC	2	8	22556	22563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017582	ATAG	2	8	23685	23692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017582	GCGT	2	8	24353	24360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017582	AGTC	2	8	26024	26031	25 %	25 %	25 %	25 %	414562973
60	NC_017582	GCAG	2	8	26979	26986	25 %	0 %	50 %	25 %	414562974
61	NC_017582	AATC	2	8	27427	27434	50 %	25 %	0 %	25 %	414562974
62	NC_017582	TGGT	2	8	27450	27457	0 %	50 %	50 %	0 %	414562974
63	NC_017582	ATTG	2	8	27549	27556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017582	TGAT	2	8	28264	28271	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
65	NC_017582	TGAT	2	8	28276	28283	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
66	NC_017582	ATTG	2	8	28415	28422	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
67	NC_017582	TGAT	2	8	28456	28463	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
68	NC_017582	TAGC	2	8	28725	28732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017582	GGCA	2	8	29014	29021	25 %	0 %	50 %	25 %	414562976
70	NC_017582	TTTG	2	8	29257	29264	0 %	75 %	25 %	0 %	414562976
71	NC_017582	GAAT	2	8	29364	29371	50 %	25 %	25 %	0 %	414562976
72	NC_017582	ATTT	2	8	29498	29505	25 %	75 %	0 %	0 %	414562976
73	NC_017582	ATCA	2	8	29929	29936	50 %	25 %	0 %	25 %	414562977
74	NC_017582	GTTT	2	8	30136	30143	0 %	75 %	25 %	0 %	414562977
75	NC_017582	GCTT	2	8	30334	30341	0 %	50 %	25 %	25 %	414562977
76	NC_017582	TAAA	2	8	31138	31145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017582	AAAG	2	8	31192	31199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017582	TAAA	2	8	31447	31454	75 %	25 %	0 %	0 %	414562979
79	NC_017582	TGAT	2	8	31726	31733	25 %	50 %	25 %	0 %	414562979
80	NC_017582	AAAT	2	8	31980	31987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017582	TCAA	2	8	32454	32461	50 %	25 %	0 %	25 %	414562980
82	NC_017582	ACCT	2	8	32849	32856	25 %	25 %	0 %	50 %	414562980
83	NC_017582	TGCT	2	8	32983	32990	0 %	50 %	25 %	25 %	414562980
84	NC_017582	GCAG	2	8	34339	34346	25 %	0 %	50 %	25 %	414562980
85	NC_017582	CTTG	2	8	34372	34379	0 %	50 %	25 %	25 %	414562980
86	NC_017582	TGAT	2	8	34584	34591	25 %	50 %	25 %	0 %	414562980
87	NC_017582	AACT	2	8	35044	35051	50 %	25 %	0 %	25 %	414562980
88	NC_017582	GGTG	2	8	35494	35501	0 %	25 %	75 %	0 %	414562980
89	NC_017582	TGGT	2	8	36811	36818	0 %	50 %	50 %	0 %	414562981
90	NC_017582	CCAA	2	8	36923	36930	50 %	0 %	0 %	50 %	414562981
91	NC_017582	GTAT	2	8	37893	37900	25 %	50 %	25 %	0 %	414562982
92	NC_017582	TGAT	2	8	37959	37966	25 %	50 %	25 %	0 %	414562982
93	NC_017582	TTCA	2	8	38019	38026	25 %	50 %	0 %	25 %	414562982
94	NC_017582	ACCT	2	8	38220	38227	25 %	25 %	0 %	50 %	414562982
95	NC_017582	ATCA	2	8	38318	38325	50 %	25 %	0 %	25 %	414562982
96	NC_017582	TGCT	2	8	38367	38374	0 %	50 %	25 %	25 %	414562982
97	NC_017582	AAGC	2	8	38650	38657	50 %	0 %	25 %	25 %	414562983
98	NC_017582	AGTC	2	8	38848	38855	25 %	25 %	25 %	25 %	414562983
99	NC_017582	CGGG	2	8	39362	39369	0 %	0 %	75 %	25 %	414562984
100	NC_017582	GCAG	2	8	39434	39441	25 %	0 %	50 %	25 %	414562984
101	NC_017582	GATT	2	8	39455	39462	25 %	50 %	25 %	0 %	414562984
102	NC_017582	CGTT	2	8	39634	39641	0 %	50 %	25 %	25 %	414562984
103	NC_017582	CAAA	2	8	40488	40495	75 %	0 %	0 %	25 %	414562984
104	NC_017582	GCAA	2	8	40526	40533	50 %	0 %	25 %	25 %	414562984
105	NC_017582	CACC	2	8	41231	41238	25 %	0 %	0 %	75 %	414562985
106	NC_017582	AACT	2	8	41681	41688	50 %	25 %	0 %	25 %	414562985
107	NC_017582	AGGC	2	8	42018	42025	25 %	0 %	50 %	25 %	414562985
108	NC_017582	ACTT	2	8	42119	42126	25 %	50 %	0 %	25 %	414562985
109	NC_017582	ATTA	2	8	42262	42269	50 %	50 %	0 %	0 %	414562985
110	NC_017582	AAGA	2	8	42292	42299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017582	AGGC	2	8	42467	42474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017582	AATG	2	8	42481	42488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017582	CTTT	2	8	42574	42581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017582	TTAT	2	8	42591	42598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017582	GCAG	2	8	43137	43144	25 %	0 %	50 %	25 %	414562987
116	NC_017582	TCCT	2	8	43544	43551	0 %	50 %	0 %	50 %	414562987
117	NC_017582	AAAT	2	8	43912	43919	75 %	25 %	0 %	0 %	414562987
118	NC_017582	GCGA	2	8	43973	43980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017582	CTCG	2	8	44742	44749	0 %	25 %	25 %	50 %	414562989
120	NC_017582	TGAG	2	8	44750	44757	25 %	25 %	50 %	0 %	414562989
121	NC_017582	AAGC	2	8	44954	44961	50 %	0 %	25 %	25 %	414562989
122	NC_017582	GCCA	2	8	45488	45495	25 %	0 %	25 %	50 %	414562989
123	NC_017582	TTGG	2	8	46590	46597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017582	TGCT	2	8	47198	47205	0 %	50 %	25 %	25 %	414562991
125	NC_017582	TCGA	2	8	47798	47805	25 %	25 %	25 %	25 %	414562991
126	NC_017582	ATTA	2	8	48063	48070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017582	GAAA	2	8	48087	48094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017582	GAAT	2	8	48639	48646	50 %	25 %	25 %	0 %	414562992
129	NC_017582	TTTG	2	8	50509	50516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017582	CTGG	2	8	50609	50616	0 %	25 %	50 %	25 %	414562994
131	NC_017582	AAGC	2	8	51079	51086	50 %	0 %	25 %	25 %	414562995
132	NC_017582	GAAT	2	8	51139	51146	50 %	25 %	25 %	0 %	414562995
133	NC_017582	ATTC	2	8	51727	51734	25 %	50 %	0 %	25 %	414562996
134	NC_017582	TGGC	2	8	52077	52084	0 %	25 %	50 %	25 %	414562996
135	NC_017582	ATTT	2	8	52274	52281	25 %	75 %	0 %	0 %	414562996
136	NC_017582	CTGG	2	8	52327	52334	0 %	25 %	50 %	25 %	414562996
137	NC_017582	ATTG	2	8	52439	52446	25 %	50 %	25 %	0 %	414562996
138	NC_017582	GCTT	2	8	52474	52481	0 %	50 %	25 %	25 %	414562996
139	NC_017582	TGGT	2	8	52500	52507	0 %	50 %	50 %	0 %	414562996
140	NC_017582	AGCT	2	8	52950	52957	25 %	25 %	25 %	25 %	414562996
141	NC_017582	GAGC	2	8	53108	53115	25 %	0 %	50 %	25 %	414562996
142	NC_017582	AAAG	2	8	53347	53354	75 %	0 %	25 %	0 %	414562997
143	NC_017582	ATTG	2	8	53441	53448	25 %	50 %	25 %	0 %	414562997
144	NC_017582	TGCC	2	8	54231	54238	0 %	25 %	25 %	50 %	414562998
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