MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 29928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	AAG	2	6	43	48	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017582	ATG	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
3	NC_017582	CAA	2	6	182	187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
4	NC_017582	CAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
5	NC_017582	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
6	NC_017582	TGA	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
7	NC_017582	TGC	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562957
8	NC_017582	AAC	2	6	480	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
9	NC_017582	TTA	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562957
10	NC_017582	TGT	2	6	624	629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562957
11	NC_017582	TCC	2	6	686	691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562957
12	NC_017582	TGA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
13	NC_017582	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
14	NC_017582	AGC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
15	NC_017582	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
16	NC_017582	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562957
17	NC_017582	CTA	5	15	1521	1535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017582	CAG	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562958
19	NC_017582	TTG	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562958
20	NC_017582	AGT	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
21	NC_017582	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
22	NC_017582	GTC	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
23	NC_017582	GAT	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
24	NC_017582	TGA	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
25	NC_017582	GTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562958
26	NC_017582	GAT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
27	NC_017582	GTC	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562959
28	NC_017582	GAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562959
29	NC_017582	ATT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017582	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562960
31	NC_017582	AAG	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562960
32	NC_017582	TTA	2	6	3315	3320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562960
33	NC_017582	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562960
34	NC_017582	TGT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
35	NC_017582	TTG	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
36	NC_017582	TCT	2	6	3487	3492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017582	CAG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
38	NC_017582	GCT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
39	NC_017582	TGT	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
40	NC_017582	TGA	3	9	3867	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
41	NC_017582	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
42	NC_017582	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
43	NC_017582	TTA	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562961
44	NC_017582	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
45	NC_017582	GCA	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
46	NC_017582	GTT	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
47	NC_017582	AGA	3	9	4290	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
48	NC_017582	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
49	NC_017582	CAC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562961
50	NC_017582	AGC	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
51	NC_017582	ATG	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
52	NC_017582	GTC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
53	NC_017582	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017582	AGA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562962
55	NC_017582	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562962
56	NC_017582	AAT	2	6	5022	5027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562962
57	NC_017582	ATG	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
58	NC_017582	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
59	NC_017582	TTA	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
60	NC_017582	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
61	NC_017582	TAT	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
62	NC_017582	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562962
63	NC_017582	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
64	NC_017582	AGC	3	9	5500	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
65	NC_017582	GTG	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562963
66	NC_017582	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
67	NC_017582	CTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
68	NC_017582	CAG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
69	NC_017582	AAG	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
70	NC_017582	GTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
71	NC_017582	TGA	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
72	NC_017582	GGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
73	NC_017582	GGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
74	NC_017582	GCT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
75	NC_017582	TAA	2	6	6180	6185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562963
76	NC_017582	AAG	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
77	NC_017582	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
78	NC_017582	TTG	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
79	NC_017582	GAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
80	NC_017582	ACA	2	6	6364	6369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562963
81	NC_017582	ATT	2	6	6393	6398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
82	NC_017582	CTT	2	6	6442	6447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562963
83	NC_017582	TGA	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
84	NC_017582	TCA	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562963
85	NC_017582	CTG	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
86	NC_017582	ATT	2	6	6707	6712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
87	NC_017582	TGA	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
88	NC_017582	CGT	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
89	NC_017582	TCG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
90	NC_017582	CAG	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
91	NC_017582	CAG	2	6	7026	7031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
92	NC_017582	TAA	2	6	7051	7056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562963
93	NC_017582	GAT	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
94	NC_017582	CGA	2	6	7231	7236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
95	NC_017582	GCT	2	6	7346	7351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
96	NC_017582	CAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562963
97	NC_017582	CAG	2	6	7412	7417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
98	NC_017582	ATT	3	9	7541	7549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
99	NC_017582	TGA	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
100	NC_017582	AGC	2	6	7617	7622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
101	NC_017582	CCT	2	6	7760	7765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562963
102	NC_017582	TAT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
103	NC_017582	GTG	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562963
104	NC_017582	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
105	NC_017582	ATG	2	6	8010	8015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
106	NC_017582	CAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562963
107	NC_017582	TAT	2	6	8032	8037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
108	NC_017582	GCT	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
109	NC_017582	AGC	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
110	NC_017582	TTG	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
111	NC_017582	TAC	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562963
112	NC_017582	GAA	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
113	NC_017582	ATT	2	6	8715	8720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
114	NC_017582	AGA	2	6	8824	8829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
115	NC_017582	TCT	2	6	8903	8908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017582	TTA	2	6	8914	8919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017582	ATT	2	6	8936	8941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017582	AGC	2	6	8942	8947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017582	CAA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017582	TAT	2	6	9026	9031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017582	TGT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017582	TAT	2	6	9142	9147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017582	CAG	2	6	9198	9203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017582	TGC	3	9	9353	9361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017582	TGC	2	6	9410	9415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017582	AGA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017582	TGC	2	6	9687	9692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017582	TTA	2	6	9843	9848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017582	TTC	2	6	9852	9857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017582	TGA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017582	TGA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017582	TCA	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017582	TTA	2	6	10019	10024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017582	TTG	2	6	10065	10070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017582	CTG	2	6	10269	10274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017582	TGC	2	6	10609	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562964
137	NC_017582	GAA	2	6	10658	10663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562964
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139	NC_017582	GAA	2	6	10701	10706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562965
140	NC_017582	ATG	2	6	10779	10784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562965
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142	NC_017582	ATT	2	6	10854	10859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562965
143	NC_017582	AGC	2	6	10921	10926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562965
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145	NC_017582	ATT	2	6	11012	11017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562965
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152	NC_017582	TAT	2	6	11304	11309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562967
153	NC_017582	GAG	2	6	11340	11345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562967
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157	NC_017582	TAT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562967
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162	NC_017582	CAG	2	6	12057	12062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562967
163	NC_017582	CTA	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562967
164	NC_017582	CTA	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562967
165	NC_017582	TCT	2	6	12183	12188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562967
166	NC_017582	GCA	3	9	12192	12200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562967
167	NC_017582	ATT	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562967
168	NC_017582	TGA	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562967
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182	NC_017582	TCA	2	6	13018	13023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562968
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189	NC_017582	GAC	2	6	13269	13274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562968
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200	NC_017582	ATA	2	6	14311	14316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017582	AAT	2	6	14319	14324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017582	TGA	2	6	14356	14361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562970
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246	NC_017582	GTT	3	9	16284	16292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017582	TAA	2	6	16468	16473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562971
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252	NC_017582	ATC	2	6	16748	16753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562971
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