MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017582	TATT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017582	AAG	2	6	43	48	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017582	T	6	6	77	82	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
4	NC_017582	AGCT	2	8	98	105	25 %	25 %	25 %	25 %	414562957
5	NC_017582	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
6	NC_017582	ATG	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
7	NC_017582	CAA	2	6	182	187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
8	NC_017582	T	7	7	188	194	0 %	100 %	0 %	0 %	414562957
9	NC_017582	A	7	7	221	227	100 %	0 %	0 %	0 %	414562957
10	NC_017582	CAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
11	NC_017582	TGA	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
12	NC_017582	ACAGT	2	10	373	382	40 %	20 %	20 %	20 %	414562957
13	NC_017582	TGA	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
14	NC_017582	TGC	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562957
15	NC_017582	AAC	2	6	480	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562957
16	NC_017582	TTTA	2	8	495	502	25 %	75 %	0 %	0 %	414562957
17	NC_017582	TTA	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562957
18	NC_017582	TGT	2	6	624	629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562957
19	NC_017582	TCC	2	6	686	691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562957
20	NC_017582	TGA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562957
21	NC_017582	A	7	7	718	724	100 %	0 %	0 %	0 %	414562957
22	NC_017582	ATAACA	2	12	773	784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414562957
23	NC_017582	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
24	NC_017582	AGC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562957
25	NC_017582	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562957
26	NC_017582	CA	3	6	1206	1211	50 %	0 %	0 %	50 %	414562957
27	NC_017582	TGCT	2	8	1220	1227	0 %	50 %	25 %	25 %	414562957
28	NC_017582	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562957
29	NC_017582	AATTGA	2	12	1374	1385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414562957
30	NC_017582	CTA	5	15	1521	1535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017582	TA	3	6	1547	1552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017582	TTCA	2	8	1597	1604	25 %	50 %	0 %	25 %	414562958
33	NC_017582	CAG	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562958
34	NC_017582	TTG	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562958
35	NC_017582	T	6	6	1807	1812	0 %	100 %	0 %	0 %	414562958
36	NC_017582	AGT	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
37	NC_017582	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
38	NC_017582	GTC	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562958
39	NC_017582	GA	3	6	2190	2195	50 %	0 %	50 %	0 %	414562958
40	NC_017582	GAT	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
41	NC_017582	TGA	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
42	NC_017582	AC	3	6	2366	2371	50 %	0 %	0 %	50 %	414562958
43	NC_017582	GTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562958
44	NC_017582	GAT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562958
45	NC_017582	AG	3	6	2661	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	414562958
46	NC_017582	T	7	7	2729	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017582	ATAA	2	8	2742	2749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017582	TGAG	2	8	2763	2770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017582	TGAAA	2	10	2804	2813	60 %	20 %	20 %	0 %	414562959
50	NC_017582	A	6	6	2846	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	414562959
51	NC_017582	GTC	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562959
52	NC_017582	GAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562959
53	NC_017582	ATT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017582	A	6	6	3052	3057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017582	AAAGG	2	10	3079	3088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017582	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562960
57	NC_017582	AAG	2	6	3125	3130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562960
58	NC_017582	TTA	2	6	3315	3320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562960
59	NC_017582	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562960
60	NC_017582	TGT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
61	NC_017582	TTG	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562960
62	NC_017582	TCT	2	6	3487	3492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017582	T	8	8	3492	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017582	A	6	6	3519	3524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017582	A	7	7	3539	3545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017582	CAG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
67	NC_017582	GCT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
68	NC_017582	TGGTA	2	10	3669	3678	20 %	40 %	40 %	0 %	414562961
69	NC_017582	A	7	7	3727	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
70	NC_017582	TGT	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
71	NC_017582	TGA	3	9	3867	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
72	NC_017582	AATT	2	8	3950	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	414562961
73	NC_017582	AATC	2	8	3971	3978	50 %	25 %	0 %	25 %	414562961
74	NC_017582	A	6	6	4001	4006	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
75	NC_017582	A	6	6	4058	4063	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
76	NC_017582	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
77	NC_017582	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
78	NC_017582	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	414562961
79	NC_017582	TTA	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562961
80	NC_017582	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
81	NC_017582	GCA	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
82	NC_017582	GTT	2	6	4267	4272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562961
83	NC_017582	AGA	3	9	4290	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562961
84	NC_017582	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
85	NC_017582	ACTTGG	2	12	4398	4409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414562961
86	NC_017582	GTGC	2	8	4438	4445	0 %	25 %	50 %	25 %	414562961
87	NC_017582	CAC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562961
88	NC_017582	AGC	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562961
89	NC_017582	ATG	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562961
90	NC_017582	GTC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562961
91	NC_017582	AGGA	2	8	4601	4608	50 %	0 %	50 %	0 %	414562961
92	NC_017582	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	414562961
93	NC_017582	A	6	6	4738	4743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017582	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017582	CAAA	2	8	4869	4876	75 %	0 %	0 %	25 %	414562962
96	NC_017582	AGA	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562962
97	NC_017582	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562962
98	NC_017582	ATCA	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
99	NC_017582	ATTT	2	8	4992	4999	25 %	75 %	0 %	0 %	414562962
100	NC_017582	AAT	2	6	5022	5027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562962
101	NC_017582	ATG	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
102	NC_017582	G	6	6	5151	5156	0 %	0 %	100 %	0 %	414562962
103	NC_017582	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
104	NC_017582	TTA	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
105	NC_017582	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562962
106	NC_017582	CAAT	2	8	5296	5303	50 %	25 %	0 %	25 %	414562962
107	NC_017582	TAT	2	6	5337	5342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562962
108	NC_017582	A	6	6	5350	5355	100 %	0 %	0 %	0 %	414562962
109	NC_017582	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562962
110	NC_017582	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
111	NC_017582	AGC	3	9	5500	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
112	NC_017582	GTG	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562963
113	NC_017582	CTTG	2	8	5602	5609	0 %	50 %	25 %	25 %	414562963
114	NC_017582	T	6	6	5630	5635	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
115	NC_017582	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
116	NC_017582	CTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
117	NC_017582	T	6	6	5710	5715	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
118	NC_017582	TTAGC	2	10	5748	5757	20 %	40 %	20 %	20 %	414562963
119	NC_017582	CAG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562963
120	NC_017582	AAG	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
121	NC_017582	GTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
122	NC_017582	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
123	NC_017582	TGA	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
124	NC_017582	TC	3	6	6029	6034	0 %	50 %	0 %	50 %	414562963
125	NC_017582	AGGA	2	8	6038	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	414562963
126	NC_017582	GTGAT	2	10	6069	6078	20 %	40 %	40 %	0 %	414562963
127	NC_017582	GGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
128	NC_017582	CAGCTT	2	12	6125	6136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414562963
129	NC_017582	GGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562963
130	NC_017582	GCT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562963
131	NC_017582	TAA	2	6	6180	6185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562963
132	NC_017582	AAG	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562963
133	NC_017582	AATG	2	8	6239	6246	50 %	25 %	25 %	0 %	414562963
134	NC_017582	T	6	6	6284	6289	0 %	100 %	0 %	0 %	414562963
135	NC_017582	GAT	2	6	6290	6295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
136	NC_017582	AGTT	2	8	6303	6310	25 %	50 %	25 %	0 %	414562963
137	NC_017582	TTG	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562963
138	NC_017582	GAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562963
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140	NC_017582	ATT	2	6	6393	6398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562963
141	NC_017582	CTT	2	6	6442	6447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562963
142	NC_017582	TCAA	2	8	6528	6535	50 %	25 %	0 %	25 %	414562963
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155	NC_017582	AGCAA	2	10	7081	7090	60 %	0 %	20 %	20 %	414562963
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163	NC_017582	A	6	6	7522	7527	100 %	0 %	0 %	0 %	414562963
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257	NC_017582	TA	3	6	11567	11572	50 %	50 %	0 %	0 %	414562967
258	NC_017582	TAT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562967
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268	NC_017582	TCT	2	6	12183	12188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562967
269	NC_017582	GCA	3	9	12192	12200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562967
270	NC_017582	CTAT	2	8	12214	12221	25 %	50 %	0 %	25 %	414562967
271	NC_017582	ATT	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562967
272	NC_017582	TGA	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562967
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279	NC_017582	TCA	2	6	12505	12510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562968
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291	NC_017582	AG	3	6	12884	12889	50 %	0 %	50 %	0 %	414562968
292	NC_017582	TCA	2	6	13018	13023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562968
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321	NC_017582	ATT	2	6	14293	14298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_017582	ATA	2	6	14311	14316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_017582	GCA	2	6	17339	17344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562971
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432	NC_017582	CAT	2	6	19231	19236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017582	TAA	2	6	19266	19271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_017582	ATC	2	6	19299	19304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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