MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017582	ATG	2	6	186700	186705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563125
4002	NC_017582	ATT	2	6	186727	186732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563125
4003	NC_017582	AATTG	2	10	186737	186746	40 %	40 %	20 %	0 %	414563125
4004	NC_017582	TGC	2	6	186785	186790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563125
4005	NC_017582	TAA	2	6	186938	186943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563125
4006	NC_017582	CGT	2	6	187080	187085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563125
4007	NC_017582	GCAGC	2	10	187165	187174	20 %	0 %	40 %	40 %	414563125
4008	NC_017582	GAT	2	6	187193	187198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563125
4009	NC_017582	TAG	2	6	187216	187221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563125
4010	NC_017582	TGG	2	6	187223	187228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563125
4011	NC_017582	TGC	2	6	187243	187248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563125
4012	NC_017582	ATG	2	6	187258	187263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563125
4013	NC_017582	GCT	2	6	187446	187451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563126
4014	NC_017582	A	7	7	187500	187506	100 %	0 %	0 %	0 %	414563126
4015	NC_017582	CAG	2	6	187507	187512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563126
4016	NC_017582	AGG	2	6	187527	187532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563126
4017	NC_017582	TGT	2	6	187596	187601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563126
4018	NC_017582	TGA	2	6	187641	187646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563127
4019	NC_017582	TGA	2	6	187669	187674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563127
4020	NC_017582	CTG	2	6	187743	187748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563127
4021	NC_017582	ATG	2	6	187752	187757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563127
4022	NC_017582	CGA	2	6	187895	187900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563127
4023	NC_017582	GTCAGG	2	12	187941	187952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414563127
4024	NC_017582	GCTTG	2	10	187966	187975	0 %	40 %	40 %	20 %	414563127
4025	NC_017582	AAG	2	6	187983	187988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563127
4026	NC_017582	GAG	2	6	187991	187996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563127
4027	NC_017582	CAG	2	6	188007	188012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563127
4028	NC_017582	TAGT	2	8	188093	188100	25 %	50 %	25 %	0 %	414563127
4029	NC_017582	AGG	3	9	188115	188123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563128
4030	NC_017582	CATT	2	8	188137	188144	25 %	50 %	0 %	25 %	414563128
4031	NC_017582	TAA	2	6	188332	188337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563128
4032	NC_017582	TTG	2	6	188349	188354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563128
4033	NC_017582	GAC	2	6	188395	188400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563128
4034	NC_017582	TAT	2	6	188402	188407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563128
4035	NC_017582	TGT	2	6	188434	188439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563128
4036	NC_017582	TGA	2	6	188641	188646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017582	AGA	2	6	188662	188667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017582	GA	3	6	188666	188671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017582	T	7	7	188687	188693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017582	A	6	6	188731	188736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017582	A	6	6	188779	188784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017582	A	6	6	188791	188796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017582	T	6	6	188825	188830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017582	CTA	2	6	188885	188890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017582	AGC	2	6	188897	188902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017582	AGA	2	6	188960	188965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017582	GAA	2	6	188968	188973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563129
4048	NC_017582	TTG	2	6	189006	189011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563129
4049	NC_017582	ATA	2	6	189048	189053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563129
4050	NC_017582	CTA	2	6	189087	189092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563129
4051	NC_017582	GAA	2	6	189107	189112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563129
4052	NC_017582	GTG	2	6	189114	189119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563129
4053	NC_017582	CAA	2	6	189122	189127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563129
4054	NC_017582	GATTAC	2	12	189211	189222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414563129
4055	NC_017582	GAA	2	6	189278	189283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563129
4056	NC_017582	CAG	2	6	189312	189317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4057	NC_017582	ATG	2	6	189363	189368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563129
4058	NC_017582	GGA	2	6	189392	189397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563129
4059	NC_017582	A	7	7	189442	189448	100 %	0 %	0 %	0 %	414563129
4060	NC_017582	TGA	2	6	189553	189558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563129
4061	NC_017582	CAA	2	6	189623	189628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563129
4062	NC_017582	CTG	2	6	189660	189665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4063	NC_017582	TTG	2	6	189675	189680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563129
4064	NC_017582	AAG	2	6	189750	189755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563129
4065	NC_017582	AGG	2	6	189822	189827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563129
4066	NC_017582	GCT	2	6	189919	189924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4067	NC_017582	AGC	2	6	190000	190005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4068	NC_017582	CTACA	2	10	190075	190084	40 %	20 %	0 %	40 %	414563129
4069	NC_017582	AAAC	2	8	190086	190093	75 %	0 %	0 %	25 %	414563129
4070	NC_017582	GTT	2	6	190097	190102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563129
4071	NC_017582	TAAAGG	2	12	190113	190124	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414563129
4072	NC_017582	GAA	2	6	190136	190141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563129
4073	NC_017582	CAG	2	6	190218	190223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4074	NC_017582	AGCT	2	8	190248	190255	25 %	25 %	25 %	25 %	414563129
4075	NC_017582	AGG	2	6	190263	190268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563129
4076	NC_017582	GCA	2	6	190271	190276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
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4079	NC_017582	AGC	2	6	190537	190542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4080	NC_017582	AGC	2	6	190548	190553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4081	NC_017582	CTG	2	6	190569	190574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4082	NC_017582	CAG	3	9	190596	190604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563129
4083	NC_017582	GAT	2	6	190678	190683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017582	TAAT	2	8	190694	190701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017582	TTG	2	6	190721	190726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017582	TGGT	2	8	190746	190753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017582	AGC	2	6	190829	190834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4088	NC_017582	CTG	2	6	190919	190924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4089	NC_017582	AGC	2	6	190928	190933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4090	NC_017582	CAA	2	6	190990	190995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563130
4091	NC_017582	CAA	2	6	191009	191014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563130
4092	NC_017582	CCG	2	6	191015	191020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563130
4093	NC_017582	CAG	2	6	191030	191035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4094	NC_017582	AGC	2	6	191106	191111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4095	NC_017582	CAG	2	6	191114	191119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
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4097	NC_017582	CAGA	2	8	191164	191171	50 %	0 %	25 %	25 %	414563130
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4099	NC_017582	TAG	2	6	191315	191320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563130
4100	NC_017582	TAT	2	6	191380	191385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563130
4101	NC_017582	AC	3	6	191411	191416	50 %	0 %	0 %	50 %	414563130
4102	NC_017582	CCTA	2	8	191426	191433	25 %	25 %	0 %	50 %	414563130
4103	NC_017582	A	6	6	191616	191621	100 %	0 %	0 %	0 %	414563130
4104	NC_017582	ATG	2	6	191726	191731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563130
4105	NC_017582	CTG	2	6	191840	191845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4106	NC_017582	AAGGTC	2	12	191860	191871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414563130
4107	NC_017582	AGGC	2	8	191921	191928	25 %	0 %	50 %	25 %	414563130
4108	NC_017582	TGC	2	6	191982	191987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563130
4109	NC_017582	TAA	2	6	191988	191993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563130
4110	NC_017582	GGA	2	6	192003	192008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563130
4111	NC_017582	A	7	7	192031	192037	100 %	0 %	0 %	0 %	414563130
4112	NC_017582	TGG	2	6	192096	192101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563130
4113	NC_017582	AGA	2	6	192180	192185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563130
4114	NC_017582	GTGC	2	8	192211	192218	0 %	25 %	50 %	25 %	414563130
4115	NC_017582	GCTA	2	8	192298	192305	25 %	25 %	25 %	25 %	414563130
4116	NC_017582	TGG	2	6	192348	192353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563130
4117	NC_017582	TTG	2	6	192492	192497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563130
4118	NC_017582	GAT	2	6	192598	192603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563130
4119	NC_017582	CAACAG	2	12	192683	192694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414563130
4120	NC_017582	CTTG	2	8	192705	192712	0 %	50 %	25 %	25 %	414563130
4121	NC_017582	GCTA	2	8	192751	192758	25 %	25 %	25 %	25 %	414563130
4122	NC_017582	TGC	2	6	192761	192766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563130
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4126	NC_017582	A	6	6	192950	192955	100 %	0 %	0 %	0 %	414563130
4127	NC_017582	CTGG	2	8	192966	192973	0 %	25 %	50 %	25 %	414563130
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4135	NC_017582	AGC	3	9	193425	193433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563130
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4226	NC_017582	T	6	6	198551	198556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4227	NC_017582	T	7	7	198693	198699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4228	NC_017582	TCA	2	6	198705	198710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4229	NC_017582	A	7	7	198717	198723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_017582	A	6	6	198728	198733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_017582	CAAAAG	2	12	198739	198750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4232	NC_017582	TCG	2	6	198768	198773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_017582	A	9	9	198890	198898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_017582	GAA	2	6	198968	198973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_017582	A	6	6	198972	198977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_017582	CTAAA	2	10	198999	199008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4237	NC_017582	CAG	2	6	199072	199077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4238	NC_017582	TAGC	2	8	199096	199103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4239	NC_017582	AGA	2	6	199130	199135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_017582	TTTC	2	8	199169	199176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4241	NC_017582	A	6	6	199187	199192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_017582	A	7	7	199310	199316	100 %	0 %	0 %	0 %	414563136
4243	NC_017582	CAA	2	6	199542	199547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563135
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4245	NC_017582	A	6	6	199689	199694	100 %	0 %	0 %	0 %	414563135
4246	NC_017582	AGC	2	6	199777	199782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_017582	CTC	2	6	199804	199809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4248	NC_017582	CAAA	2	8	199819	199826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4249	NC_017582	TTC	2	6	199887	199892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_017582	GAA	2	6	199940	199945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_017582	TC	3	6	199969	199974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_017582	T	6	6	200042	200047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_017582	A	6	6	200114	200119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_017582	AGA	2	6	200143	200148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_017582	CTTA	2	8	200420	200427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4262	NC_017582	GTT	2	6	200442	200447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_017582	TAAC	2	8	200512	200519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4281	NC_017582	TG	3	6	201197	201202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4333	NC_017582	GCCAT	2	10	203634	203643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4345	NC_017582	CAGA	2	8	204286	204293	50 %	0 %	25 %	25 %	414563142
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4353	NC_017582	CAT	2	6	204600	204605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563142
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4358	NC_017582	CTG	2	6	204765	204770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563142
4359	NC_017582	GA	3	6	204841	204846	50 %	0 %	50 %	0 %	414563142
4360	NC_017582	TGC	2	6	204861	204866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563142
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4362	NC_017582	GGA	2	6	205114	205119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_017582	CAG	2	6	205123	205128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_017582	GT	3	6	205145	205150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017582	T	7	7	205155	205161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_017582	T	6	6	205179	205184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_017582	ATA	2	6	205187	205192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_017582	AGATT	2	10	205225	205234	40 %	40 %	20 %	0 %	414563143
4369	NC_017582	ATT	3	9	205260	205268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563143
4370	NC_017582	ATT	2	6	205449	205454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563143
4371	NC_017582	TTTG	2	8	205463	205470	0 %	75 %	25 %	0 %	414563143
4372	NC_017582	TTG	2	6	205486	205491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563143
4373	NC_017582	TATTT	2	10	205541	205550	20 %	80 %	0 %	0 %	414563143
4374	NC_017582	TGA	2	6	205580	205585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563143
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4382	NC_017582	GCT	2	6	205976	205981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563145
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4384	NC_017582	TGA	2	6	206050	206055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563145
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4386	NC_017582	TGCT	2	8	206145	206152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4387	NC_017582	TAT	2	6	206166	206171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4392	NC_017582	AAGGG	2	10	206400	206409	40 %	0 %	60 %	0 %	414563146
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4402	NC_017582	TGA	2	6	206999	207004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563146
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4420	NC_017582	TGT	2	6	207809	207814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563147
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4429	NC_017582	CAGA	2	8	208125	208132	50 %	0 %	25 %	25 %	414563147
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4468	NC_017582	GGCT	2	8	209977	209984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4469	NC_017582	AGC	2	6	210080	210085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563149
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4489	NC_017582	CA	3	6	211042	211047	50 %	0 %	0 %	50 %	414563149
4490	NC_017582	GT	3	6	211073	211078	0 %	50 %	50 %	0 %	414563149
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4493	NC_017582	CAG	2	6	211348	211353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563149
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