MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017582	AAT	2	6	139477	139482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017582	ATT	2	6	139489	139494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017582	A	6	6	139522	139527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017582	A	6	6	139540	139545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017582	GGA	2	6	139546	139551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017582	GCT	2	6	139567	139572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017582	TCG	2	6	139667	139672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017582	T	6	6	139727	139732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017582	TAG	2	6	139739	139744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017582	TAG	2	6	139834	139839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017582	TC	3	6	139861	139866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_017582	GGCTTT	2	12	139945	139956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414563079
3013	NC_017582	CAATC	2	10	140000	140009	40 %	20 %	0 %	40 %	414563079
3014	NC_017582	ATA	2	6	140122	140127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017582	GTT	2	6	140138	140143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017582	AGC	2	6	140244	140249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017582	CAA	2	6	140285	140290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563080
3018	NC_017582	A	6	6	140289	140294	100 %	0 %	0 %	0 %	414563080
3019	NC_017582	GAA	2	6	140311	140316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563080
3020	NC_017582	GTA	2	6	140389	140394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563080
3021	NC_017582	ATTA	2	8	140404	140411	50 %	50 %	0 %	0 %	414563080
3022	NC_017582	AG	3	6	140454	140459	50 %	0 %	50 %	0 %	414563080
3023	NC_017582	GTG	2	6	140465	140470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563080
3024	NC_017582	CAC	2	6	140515	140520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563080
3025	NC_017582	TGA	2	6	140547	140552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563080
3026	NC_017582	GATTC	2	10	140578	140587	20 %	40 %	20 %	20 %	414563080
3027	NC_017582	GCT	2	6	140589	140594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563080
3028	NC_017582	TGA	2	6	140598	140603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563080
3029	NC_017582	TTA	2	6	140608	140613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563080
3030	NC_017582	ATT	2	6	140632	140637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563080
3031	NC_017582	ATG	2	6	140654	140659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563080
3032	NC_017582	TGA	2	6	140743	140748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017582	TTA	2	6	140838	140843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563081
3034	NC_017582	AGC	2	6	140870	140875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3035	NC_017582	AGG	2	6	140959	140964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563081
3036	NC_017582	GTC	2	6	141112	141117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3037	NC_017582	ATG	2	6	141288	141293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3038	NC_017582	TTA	2	6	141363	141368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563081
3039	NC_017582	AAT	2	6	141435	141440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563081
3040	NC_017582	TTG	2	6	141448	141453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563081
3041	NC_017582	ATG	2	6	141561	141566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3042	NC_017582	TTTG	2	8	141656	141663	0 %	75 %	25 %	0 %	414563081
3043	NC_017582	AGCC	2	8	141736	141743	25 %	0 %	25 %	50 %	414563081
3044	NC_017582	TCG	2	6	141827	141832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3045	NC_017582	ATTG	2	8	141845	141852	25 %	50 %	25 %	0 %	414563081
3046	NC_017582	GAT	2	6	141867	141872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3047	NC_017582	GCTTG	2	10	141887	141896	0 %	40 %	40 %	20 %	414563081
3048	NC_017582	CCT	2	6	141901	141906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563081
3049	NC_017582	CTG	2	6	141952	141957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3050	NC_017582	AGC	2	6	141988	141993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3051	NC_017582	TGA	2	6	142019	142024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3052	NC_017582	CGC	2	6	142078	142083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563081
3053	NC_017582	CAG	2	6	142168	142173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3054	NC_017582	GAT	2	6	142182	142187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3055	NC_017582	AC	3	6	142193	142198	50 %	0 %	0 %	50 %	414563081
3056	NC_017582	AAGC	2	8	142202	142209	50 %	0 %	25 %	25 %	414563081
3057	NC_017582	AACT	2	8	142231	142238	50 %	25 %	0 %	25 %	414563081
3058	NC_017582	A	6	6	142251	142256	100 %	0 %	0 %	0 %	414563081
3059	NC_017582	GTT	2	6	142290	142295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563081
3060	NC_017582	TCG	2	6	142334	142339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3061	NC_017582	CAGG	2	8	142360	142367	25 %	0 %	50 %	25 %	414563081
3062	NC_017582	TGA	3	9	142451	142459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3063	NC_017582	CTC	2	6	142528	142533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563081
3064	NC_017582	ATG	2	6	142549	142554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3065	NC_017582	GAG	2	6	142558	142563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563081
3066	NC_017582	TTC	2	6	142600	142605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563081
3067	NC_017582	TGA	2	6	142610	142615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3068	NC_017582	CTG	2	6	142650	142655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3069	NC_017582	TGA	2	6	142664	142669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3070	NC_017582	ATT	2	6	142719	142724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563081
3071	NC_017582	GAT	2	6	142761	142766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3072	NC_017582	AGA	2	6	142832	142837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563081
3073	NC_017582	TGA	2	6	142877	142882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563081
3074	NC_017582	GGT	2	6	142886	142891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563081
3075	NC_017582	TCG	2	6	143057	143062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563081
3076	NC_017582	GA	3	6	143219	143224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017582	TGA	2	6	143266	143271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017582	CAGA	2	8	143300	143307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_017582	TTTAAT	2	12	143313	143324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017582	AAC	2	6	143449	143454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017582	A	6	6	143498	143503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017582	T	6	6	143534	143539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017582	ATA	2	6	143556	143561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017582	CAC	3	9	143680	143688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_017582	T	6	6	143785	143790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017582	GAA	2	6	143809	143814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017582	TTGT	2	8	143842	143849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017582	T	6	6	143862	143867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017582	TAT	2	6	143917	143922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017582	TAT	2	6	143927	143932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017582	AGG	2	6	144000	144005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563082
3092	NC_017582	AGA	2	6	144042	144047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563082
3093	NC_017582	CAA	2	6	144049	144054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563082
3094	NC_017582	A	6	6	144053	144058	100 %	0 %	0 %	0 %	414563082
3095	NC_017582	CTG	2	6	144085	144090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563082
3096	NC_017582	ACG	2	6	144166	144171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563082
3097	NC_017582	ATC	2	6	144251	144256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563082
3098	NC_017582	AGTT	2	8	144269	144276	25 %	50 %	25 %	0 %	414563082
3099	NC_017582	GAA	2	6	144292	144297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563082
3100	NC_017582	ATG	2	6	144389	144394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017582	TAG	2	6	144403	144408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017582	AAG	2	6	144413	144418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017582	ATG	2	6	144465	144470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017582	TTA	2	6	144494	144499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017582	T	6	6	144554	144559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017582	TAT	2	6	144579	144584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017582	AGG	2	6	144652	144657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563083
3108	NC_017582	GCT	2	6	144658	144663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563083
3109	NC_017582	AAC	2	6	144699	144704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563083
3110	NC_017582	A	6	6	144705	144710	100 %	0 %	0 %	0 %	414563083
3111	NC_017582	CTG	2	6	144737	144742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563083
3112	NC_017582	AAGTT	2	10	144768	144777	40 %	40 %	20 %	0 %	414563083
3113	NC_017582	TAG	2	6	144822	144827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563083
3114	NC_017582	AGTT	2	8	144921	144928	25 %	50 %	25 %	0 %	414563083
3115	NC_017582	ATG	2	6	145041	145046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563084
3116	NC_017582	TAG	2	6	145055	145060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563084
3117	NC_017582	ATG	2	6	145117	145122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563084
3118	NC_017582	AAC	2	6	145203	145208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563084
3119	NC_017582	GCT	2	6	145352	145357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563084
3120	NC_017582	GAT	2	6	145374	145379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563084
3121	NC_017582	GGC	2	6	145401	145406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563084
3122	NC_017582	AAAG	2	8	145465	145472	75 %	0 %	25 %	0 %	414563084
3123	NC_017582	AAC	2	6	145490	145495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563084
3124	NC_017582	CT	3	6	145505	145510	0 %	50 %	0 %	50 %	414563084
3125	NC_017582	CAA	2	6	145558	145563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563084
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3245	NC_017582	CCA	2	6	151203	151208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_017582	CCT	2	6	151260	151265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3247	NC_017582	CAT	3	9	151336	151344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_017582	TAA	2	6	151413	151418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_017582	AGG	2	6	151481	151486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_017582	CAT	2	6	151511	151516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_017582	TTA	2	6	151523	151528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563092
3253	NC_017582	GATT	2	8	151569	151576	25 %	50 %	25 %	0 %	414563092
3254	NC_017582	TAC	2	6	151627	151632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563092
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3289	NC_017582	T	6	6	153097	153102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3300	NC_017582	TAT	2	6	153391	153396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3301	NC_017582	TA	3	6	153491	153496	50 %	50 %	0 %	0 %	414563094
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3351	NC_017582	CCT	2	6	155319	155324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3352	NC_017582	GATT	2	8	155352	155359	25 %	50 %	25 %	0 %	414563098
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3362	NC_017582	ATA	2	6	155616	155621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_017582	AAGG	2	8	155630	155637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_017582	A	8	8	155667	155674	100 %	0 %	0 %	0 %	414563100
3365	NC_017582	TGT	2	6	155713	155718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563100
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3367	NC_017582	CAAG	2	8	155777	155784	50 %	0 %	25 %	25 %	414563100
3368	NC_017582	GTC	2	6	155785	155790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563100
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3371	NC_017582	AAGC	2	8	155914	155921	50 %	0 %	25 %	25 %	414563100
3372	NC_017582	TCA	2	6	155923	155928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563100
3373	NC_017582	TGA	2	6	155950	155955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563100
3374	NC_017582	TATG	2	8	155956	155963	25 %	50 %	25 %	0 %	414563100
3375	NC_017582	TTG	2	6	156065	156070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563100
3376	NC_017582	GCT	2	6	156134	156139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563100
3377	NC_017582	TAT	2	6	156164	156169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563100
3378	NC_017582	ATG	2	6	156201	156206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563100
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3389	NC_017582	A	7	7	156888	156894	100 %	0 %	0 %	0 %	414563100
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3401	NC_017582	AAG	2	6	157372	157377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_017582	AG	3	6	157376	157381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_017582	GAG	2	6	157408	157413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_017582	CTT	2	6	157446	157451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563101
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3427	NC_017582	TAT	2	6	158647	158652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_017582	TGCT	2	8	158757	158764	0 %	50 %	25 %	25 %	414563103
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3451	NC_017582	GACA	2	8	159595	159602	50 %	0 %	25 %	25 %	414563103
3452	NC_017582	GTC	2	6	159738	159743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563103
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3466	NC_017582	TCA	2	6	160496	160501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3468	NC_017582	AAAAT	2	10	160616	160625	80 %	20 %	0 %	0 %	414563104
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3472	NC_017582	ATT	2	6	160706	160711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563104
3473	NC_017582	TGA	2	6	160761	160766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563104
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3478	NC_017582	TAG	2	6	161024	161029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3479	NC_017582	ATT	2	6	161056	161061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563105
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3481	NC_017582	A	6	6	161081	161086	100 %	0 %	0 %	0 %	414563105
3482	NC_017582	AAAGG	2	10	161107	161116	60 %	0 %	40 %	0 %	414563105
3483	NC_017582	GCAGC	2	10	161117	161126	20 %	0 %	40 %	40 %	414563105
3484	NC_017582	GCT	2	6	161144	161149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563105
3485	NC_017582	TGC	2	6	161152	161157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563105
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3487	NC_017582	CAGG	2	8	161177	161184	25 %	0 %	50 %	25 %	414563105
3488	NC_017582	GCA	2	6	161214	161219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563105
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3490	NC_017582	TCG	2	6	161314	161319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563105
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3492	NC_017582	T	6	6	161385	161390	0 %	100 %	0 %	0 %	414563105
3493	NC_017582	CGA	2	6	161439	161444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563105
3494	NC_017582	GCAG	2	8	161474	161481	25 %	0 %	50 %	25 %	414563105
3495	NC_017582	GAT	2	6	161528	161533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563105
3496	NC_017582	CAA	2	6	161578	161583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563105
3497	NC_017582	CAG	2	6	161657	161662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563105
3498	NC_017582	TTAT	2	8	161677	161684	25 %	75 %	0 %	0 %	414563105
3499	NC_017582	GAGCA	2	10	161690	161699	40 %	0 %	40 %	20 %	414563105
3500	NC_017582	AAAG	2	8	161703	161710	75 %	0 %	25 %	0 %	414563105

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