MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017582	AGT	2	6	23278	23283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017582	AGT	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017582	GCTTA	2	10	23340	23349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_017582	ATAG	2	8	23685	23692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017582	ACC	2	6	23801	23806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017582	CGT	2	6	23837	23842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017582	GCATA	2	10	23938	23947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_017582	CTC	2	6	24014	24019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017582	CGC	2	6	24185	24190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017582	ATT	2	6	24205	24210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017582	TGG	2	6	24290	24295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017582	GCGT	2	8	24353	24360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017582	TCC	2	6	24377	24382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017582	TCG	2	6	24419	24424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017582	AT	3	6	24480	24485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017582	CGG	2	6	24540	24545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017582	TGT	2	6	24610	24615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017582	GGT	2	6	24685	24690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017582	GGT	2	6	24720	24725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017582	CAT	2	6	24743	24748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017582	T	7	7	24874	24880	0 %	100 %	0 %	0 %	414562972
522	NC_017582	T	8	8	24927	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	414562972
523	NC_017582	CAT	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562972
524	NC_017582	TTC	2	6	24970	24975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562972
525	NC_017582	TAT	2	6	25043	25048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562972
526	NC_017582	AGG	2	6	25072	25077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562972
527	NC_017582	A	6	6	25130	25135	100 %	0 %	0 %	0 %	414562972
528	NC_017582	ATA	2	6	25254	25259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562972
529	NC_017582	ATC	2	6	25382	25387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562972
530	NC_017582	GAA	2	6	25415	25420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562972
531	NC_017582	GATAAG	2	12	25446	25457	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414562972
532	NC_017582	TGC	2	6	25625	25630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562972
533	NC_017582	CGT	2	6	25644	25649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562972
534	NC_017582	CTGATA	2	12	25669	25680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414562972
535	NC_017582	TTG	3	9	25696	25704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562972
536	NC_017582	A	6	6	25721	25726	100 %	0 %	0 %	0 %	414562973
537	NC_017582	CTTTT	2	10	25752	25761	0 %	80 %	0 %	20 %	414562973
538	NC_017582	T	6	6	25763	25768	0 %	100 %	0 %	0 %	414562973
539	NC_017582	GTA	2	6	25823	25828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562973
540	NC_017582	T	7	7	25836	25842	0 %	100 %	0 %	0 %	414562973
541	NC_017582	T	6	6	25847	25852	0 %	100 %	0 %	0 %	414562973
542	NC_017582	TCT	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562973
543	NC_017582	ATT	2	6	25915	25920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562973
544	NC_017582	ATT	3	9	25926	25934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562973
545	NC_017582	TA	3	6	25943	25948	50 %	50 %	0 %	0 %	414562973
546	NC_017582	AAT	2	6	25981	25986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562973
547	NC_017582	AGTC	2	8	26024	26031	25 %	25 %	25 %	25 %	414562973
548	NC_017582	AGC	2	6	26096	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562973
549	NC_017582	TGA	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562973
550	NC_017582	TTTTG	2	10	26178	26187	0 %	80 %	20 %	0 %	414562973
551	NC_017582	ATT	2	6	26221	26226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017582	T	6	6	26266	26271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017582	T	7	7	26307	26313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017582	A	7	7	26320	26326	100 %	0 %	0 %	0 %	414562974
555	NC_017582	GAT	2	6	26389	26394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562974
556	NC_017582	GCA	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
557	NC_017582	AAG	2	6	26461	26466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562974
558	NC_017582	AGT	2	6	26469	26474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562974
559	NC_017582	ATT	2	6	26596	26601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562974
560	NC_017582	TTA	2	6	26702	26707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562974
561	NC_017582	GAA	2	6	26788	26793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562974
562	NC_017582	AAG	2	6	26810	26815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562974
563	NC_017582	CAA	2	6	26878	26883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562974
564	NC_017582	CTG	2	6	26930	26935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562974
565	NC_017582	GCAG	2	8	26979	26986	25 %	0 %	50 %	25 %	414562974
566	NC_017582	AGC	3	9	27018	27026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
567	NC_017582	AGC	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
568	NC_017582	GCTCAA	2	12	27040	27051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414562974
569	NC_017582	AGC	2	6	27075	27080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
570	NC_017582	TGT	2	6	27126	27131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562974
571	NC_017582	CAG	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
572	NC_017582	ATT	2	6	27248	27253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562974
573	NC_017582	TGG	2	6	27261	27266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562974
574	NC_017582	GCA	2	6	27289	27294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562974
575	NC_017582	TGT	3	9	27330	27338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562974
576	NC_017582	ATG	2	6	27344	27349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562974
577	NC_017582	AATC	2	8	27427	27434	50 %	25 %	0 %	25 %	414562974
578	NC_017582	TGGT	2	8	27450	27457	0 %	50 %	50 %	0 %	414562974
579	NC_017582	ATTG	2	8	27549	27556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017582	GGA	2	6	27590	27595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562975
581	NC_017582	A	6	6	27595	27600	100 %	0 %	0 %	0 %	414562975
582	NC_017582	TGC	3	9	27662	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562975
583	NC_017582	CAA	2	6	27778	27783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562975
584	NC_017582	TTA	2	6	27875	27880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562975
585	NC_017582	TGC	2	6	27995	28000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562975
586	NC_017582	CTT	2	6	28013	28018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562975
587	NC_017582	ATC	2	6	28033	28038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562975
588	NC_017582	ATT	2	6	28063	28068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562975
589	NC_017582	TAG	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562975
590	NC_017582	TGA	2	6	28091	28096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562975
591	NC_017582	GTT	3	9	28101	28109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562975
592	NC_017582	TGG	2	6	28121	28126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562975
593	NC_017582	TCC	2	6	28156	28161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562975
594	NC_017582	TAT	2	6	28175	28180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562975
595	NC_017582	CGT	2	6	28188	28193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562975
596	NC_017582	TGA	2	6	28222	28227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562975
597	NC_017582	A	6	6	28251	28256	100 %	0 %	0 %	0 %	414562975
598	NC_017582	TGAT	2	8	28264	28271	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
599	NC_017582	TGAT	2	8	28276	28283	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
600	NC_017582	CTG	2	6	28285	28290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562975
601	NC_017582	TGC	2	6	28304	28309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562975
602	NC_017582	CAG	2	6	28336	28341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562975
603	NC_017582	CAT	2	6	28348	28353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562975
604	NC_017582	ATA	2	6	28387	28392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562975
605	NC_017582	ATTG	2	8	28415	28422	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
606	NC_017582	AGA	2	6	28445	28450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562975
607	NC_017582	TGAT	2	8	28456	28463	25 %	50 %	25 %	0 %	414562975
608	NC_017582	GTA	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017582	T	6	6	28594	28599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017582	TGT	2	6	28656	28661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017582	GTA	2	6	28670	28675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017582	TAT	2	6	28686	28691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017582	TAGC	2	8	28725	28732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017582	CTT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017582	GATCCT	2	12	28793	28804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017582	AAG	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017582	GAT	2	6	28982	28987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562976
618	NC_017582	GGCA	2	8	29014	29021	25 %	0 %	50 %	25 %	414562976
619	NC_017582	GCT	2	6	29087	29092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562976
620	NC_017582	TA	3	6	29129	29134	50 %	50 %	0 %	0 %	414562976
621	NC_017582	T	7	7	29179	29185	0 %	100 %	0 %	0 %	414562976
622	NC_017582	TTTG	2	8	29257	29264	0 %	75 %	25 %	0 %	414562976
623	NC_017582	T	6	6	29266	29271	0 %	100 %	0 %	0 %	414562976
624	NC_017582	TTGAT	2	10	29283	29292	20 %	60 %	20 %	0 %	414562976
625	NC_017582	GAA	2	6	29294	29299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562976
626	NC_017582	GAAT	2	8	29364	29371	50 %	25 %	25 %	0 %	414562976
627	NC_017582	T	6	6	29385	29390	0 %	100 %	0 %	0 %	414562976
628	NC_017582	GCA	2	6	29449	29454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562976
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630	NC_017582	ATTT	2	8	29498	29505	25 %	75 %	0 %	0 %	414562976
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756	NC_017582	AACT	2	8	35044	35051	50 %	25 %	0 %	25 %	414562980
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759	NC_017582	GGT	2	6	35198	35203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
760	NC_017582	CTG	2	6	35255	35260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
761	NC_017582	GCG	2	6	35276	35281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562980
762	NC_017582	GGT	2	6	35303	35308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562980
763	NC_017582	GCT	2	6	35356	35361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562980
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