MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017582	TGA	2	6	281778	281783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563225
6002	NC_017582	CAC	2	6	281826	281831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563225
6003	NC_017582	TGC	2	6	281860	281865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
6004	NC_017582	TGC	2	6	281896	281901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
6005	NC_017582	TGC	2	6	281950	281955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
6006	NC_017582	GTTCCA	2	12	281963	281974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414563225
6007	NC_017582	AAG	2	6	282012	282017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563225
6008	NC_017582	TGC	2	6	282037	282042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
6009	NC_017582	GCT	2	6	282050	282055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563225
6010	NC_017582	AAT	2	6	282264	282269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563225
6011	NC_017582	T	6	6	282298	282303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017582	T	7	7	282387	282393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017582	AG	3	6	282422	282427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017582	CTT	2	6	282443	282448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_017582	CTT	2	6	282473	282478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017582	T	6	6	282590	282595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017582	T	6	6	282646	282651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017582	T	6	6	282671	282676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017582	ATG	2	6	282742	282747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017582	TAA	2	6	282749	282754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017582	ATAA	2	8	282767	282774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017582	TAA	2	6	282782	282787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017582	AGG	2	6	282801	282806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017582	A	7	7	282821	282827	100 %	0 %	0 %	0 %	414563226
6025	NC_017582	GA	3	6	282888	282893	50 %	0 %	50 %	0 %	414563226
6026	NC_017582	A	6	6	282893	282898	100 %	0 %	0 %	0 %	414563226
6027	NC_017582	CAG	2	6	282998	283003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563226
6028	NC_017582	CT	3	6	283020	283025	0 %	50 %	0 %	50 %	414563226
6029	NC_017582	AGC	2	6	283050	283055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563226
6030	NC_017582	ATT	2	6	283066	283071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563226
6031	NC_017582	TGA	2	6	283114	283119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563226
6032	NC_017582	ATA	2	6	283131	283136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563226
6033	NC_017582	CTT	2	6	283243	283248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563226
6034	NC_017582	AAG	2	6	283338	283343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563226
6035	NC_017582	GCAAG	2	10	283354	283363	40 %	0 %	40 %	20 %	414563226
6036	NC_017582	AGG	2	6	283383	283388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563226
6037	NC_017582	CGT	2	6	283409	283414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563226
6038	NC_017582	ACA	2	6	283430	283435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563226
6039	NC_017582	GTT	2	6	283444	283449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563226
6040	NC_017582	AGA	2	6	283505	283510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563226
6041	NC_017582	TGCA	2	8	283527	283534	25 %	25 %	25 %	25 %	414563226
6042	NC_017582	GCA	2	6	283542	283547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563226
6043	NC_017582	ATC	2	6	283553	283558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563226
6044	NC_017582	TTA	2	6	283660	283665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563226
6045	NC_017582	TGT	2	6	283696	283701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017582	CTG	2	6	283731	283736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017582	A	6	6	283851	283856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017582	A	6	6	283914	283919	100 %	0 %	0 %	0 %	414563227
6049	NC_017582	TTA	2	6	283963	283968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563227
6050	NC_017582	GCA	2	6	283989	283994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6051	NC_017582	CAA	2	6	283999	284004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563227
6052	NC_017582	ATT	2	6	284013	284018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563227
6053	NC_017582	TGG	2	6	284024	284029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563227
6054	NC_017582	GAAG	2	8	284063	284070	50 %	0 %	50 %	0 %	414563227
6055	NC_017582	AAGG	2	8	284079	284086	50 %	0 %	50 %	0 %	414563227
6056	NC_017582	GCA	2	6	284152	284157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6057	NC_017582	GCT	2	6	284178	284183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6058	NC_017582	ATG	2	6	284320	284325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563227
6059	NC_017582	TGGC	2	8	284392	284399	0 %	25 %	50 %	25 %	414563227
6060	NC_017582	CTT	2	6	284403	284408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563227
6061	NC_017582	AAG	2	6	284431	284436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563227
6062	NC_017582	TGG	2	6	284474	284479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563227
6063	NC_017582	GGT	3	9	284547	284555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563227
6064	NC_017582	CTT	2	6	284640	284645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563227
6065	NC_017582	AAG	2	6	284686	284691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563227
6066	NC_017582	TGAAG	2	10	284714	284723	40 %	20 %	40 %	0 %	414563227
6067	NC_017582	TGA	2	6	284795	284800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563227
6068	NC_017582	GTT	2	6	284823	284828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563227
6069	NC_017582	AAG	2	6	284869	284874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563227
6070	NC_017582	AGC	2	6	284905	284910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6071	NC_017582	ATC	2	6	284925	284930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563227
6072	NC_017582	CAG	2	6	284944	284949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6073	NC_017582	AGC	2	6	285050	285055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563227
6074	NC_017582	TTGTGC	2	12	285168	285179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6075	NC_017582	ATGA	2	8	285261	285268	50 %	25 %	25 %	0 %	414563228
6076	NC_017582	GTTTT	2	10	285306	285315	0 %	80 %	20 %	0 %	414563228
6077	NC_017582	GCTT	2	8	285329	285336	0 %	50 %	25 %	25 %	414563228
6078	NC_017582	T	6	6	285563	285568	0 %	100 %	0 %	0 %	414563229
6079	NC_017582	T	7	7	285586	285592	0 %	100 %	0 %	0 %	414563229
6080	NC_017582	GA	4	8	285640	285647	50 %	0 %	50 %	0 %	414563229
6081	NC_017582	TGG	2	6	285700	285705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563229
6082	NC_017582	T	7	7	285706	285712	0 %	100 %	0 %	0 %	414563229
6083	NC_017582	TAA	2	6	285820	285825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563229
6084	NC_017582	CAT	2	6	285835	285840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563229
6085	NC_017582	TGC	2	6	285850	285855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563229
6086	NC_017582	TATG	2	8	285898	285905	25 %	50 %	25 %	0 %	414563229
6087	NC_017582	A	6	6	286007	286012	100 %	0 %	0 %	0 %	414563229
6088	NC_017582	TTA	2	6	286048	286053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017582	GAAA	2	8	286093	286100	75 %	0 %	25 %	0 %	414563230
6090	NC_017582	ATCT	2	8	286158	286165	25 %	50 %	0 %	25 %	414563230
6091	NC_017582	GA	3	6	286211	286216	50 %	0 %	50 %	0 %	414563230
6092	NC_017582	GCAAAA	2	12	286348	286359	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414563230
6093	NC_017582	CTGATG	2	12	286368	286379	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414563230
6094	NC_017582	ATG	2	6	286395	286400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563230
6095	NC_017582	CTT	2	6	286403	286408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563230
6096	NC_017582	C	7	7	286425	286431	0 %	0 %	0 %	100 %	414563230
6097	NC_017582	GAAA	2	8	286477	286484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017582	GATT	2	8	286490	286497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017582	CAG	2	6	286509	286514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6100	NC_017582	TCG	2	6	286522	286527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6101	NC_017582	TTC	2	6	286554	286559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563231
6102	NC_017582	TAA	2	6	286642	286647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563231
6103	NC_017582	CTC	2	6	286663	286668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563231
6104	NC_017582	TGG	2	6	286768	286773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563231
6105	NC_017582	CTG	2	6	286794	286799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6106	NC_017582	AGAT	2	8	286917	286924	50 %	25 %	25 %	0 %	414563231
6107	NC_017582	CGT	2	6	287006	287011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6108	NC_017582	AGCC	2	8	287053	287060	25 %	0 %	25 %	50 %	414563231
6109	NC_017582	ATA	2	6	287127	287132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563231
6110	NC_017582	GTC	2	6	287150	287155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6111	NC_017582	AGG	2	6	287259	287264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563231
6112	NC_017582	CAA	2	6	287266	287271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563231
6113	NC_017582	GAT	2	6	287315	287320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563231
6114	NC_017582	TAT	2	6	287324	287329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563231
6115	NC_017582	TGA	2	6	287343	287348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563231
6116	NC_017582	GTG	2	6	287487	287492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563231
6117	NC_017582	AGGC	2	8	287565	287572	25 %	0 %	50 %	25 %	414563231
6118	NC_017582	ATG	2	6	287630	287635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563231
6119	NC_017582	CAG	2	6	287637	287642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6120	NC_017582	TGC	2	6	287653	287658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563231
6121	NC_017582	TTG	2	6	287664	287669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563231
6122	NC_017582	TCC	2	6	287786	287791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563231
6123	NC_017582	TTAC	2	8	287827	287834	25 %	50 %	0 %	25 %	414563231
6124	NC_017582	ACTC	2	8	287855	287862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6246	NC_017582	AAG	2	6	293516	293521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563237
6247	NC_017582	TGA	2	6	293629	293634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563237
6248	NC_017582	TTG	2	6	293963	293968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_017582	AAC	2	6	294076	294081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_017582	TAA	2	6	294132	294137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6251	NC_017582	TGCT	2	8	294198	294205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6252	NC_017582	GCT	3	9	294203	294211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_017582	AATC	2	8	294232	294239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_017582	TGT	2	6	294254	294259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_017582	CT	3	6	294262	294267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_017582	CAG	2	6	294301	294306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_017582	TAG	2	6	294315	294320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_017582	A	7	7	294446	294452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_017582	ATA	2	6	294515	294520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563238
6260	NC_017582	AAAGG	2	10	294543	294552	60 %	0 %	40 %	0 %	414563238
6261	NC_017582	CT	4	8	294647	294654	0 %	50 %	0 %	50 %	414563238
6262	NC_017582	ATC	2	6	294719	294724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563238
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6264	NC_017582	CTG	2	6	294798	294803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563238
6265	NC_017582	TGCCAT	2	12	294819	294830	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414563238
6266	NC_017582	TAA	2	6	295014	295019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563238
6267	NC_017582	CTG	2	6	295042	295047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563238
6268	NC_017582	CCA	2	6	295049	295054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563238
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6271	NC_017582	TGA	2	6	295165	295170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563238
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6273	NC_017582	GGC	2	6	295237	295242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563238
6274	NC_017582	CTG	2	6	295438	295443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563238
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6280	NC_017582	AGAGCT	2	12	295850	295861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414563238
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6282	NC_017582	GCTT	2	8	295889	295896	0 %	50 %	25 %	25 %	414563238
6283	NC_017582	A	6	6	295901	295906	100 %	0 %	0 %	0 %	414563238
6284	NC_017582	CAA	2	6	295974	295979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563238
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6290	NC_017582	ACG	2	6	296345	296350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563239
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6292	NC_017582	ATG	2	6	296414	296419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6293	NC_017582	ATT	2	6	296492	296497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6294	NC_017582	ATT	2	6	296579	296584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6295	NC_017582	TGA	2	6	296596	296601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6296	NC_017582	TTTAT	2	10	296630	296639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6297	NC_017582	ATT	2	6	296746	296751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563240
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6301	NC_017582	TAG	2	6	296862	296867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563240
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6304	NC_017582	TGAT	2	8	297024	297031	25 %	50 %	25 %	0 %	414563240
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6312	NC_017582	TGA	2	6	297349	297354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563240
6313	NC_017582	GAT	2	6	297381	297386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563241
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6317	NC_017582	ATC	2	6	297512	297517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563241
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6319	NC_017582	CAGGGG	2	12	297601	297612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	414563241
6320	NC_017582	GCA	2	6	297693	297698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
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6322	NC_017582	ATT	2	6	297743	297748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563241
6323	NC_017582	AGC	2	6	297765	297770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563241
6324	NC_017582	GGAA	2	8	297786	297793	50 %	0 %	50 %	0 %	414563241
6325	NC_017582	AGAT	2	8	297802	297809	50 %	25 %	25 %	0 %	414563241
6326	NC_017582	AT	3	6	297808	297813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6327	NC_017582	TGA	2	6	297835	297840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563242
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6329	NC_017582	ATT	2	6	297887	297892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563242
6330	NC_017582	TGG	2	6	297922	297927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
6331	NC_017582	GGT	2	6	297928	297933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
6332	NC_017582	GTC	2	6	297948	297953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563242
6333	NC_017582	TGA	2	6	297982	297987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563242
6334	NC_017582	AGG	2	6	297996	298001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563242
6335	NC_017582	TGACT	2	10	298018	298027	20 %	40 %	20 %	20 %	414563242
6336	NC_017582	GCGGTT	2	12	298028	298039	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414563242
6337	NC_017582	TGG	2	6	298056	298061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
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6341	NC_017582	TGG	2	6	298210	298215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
6342	NC_017582	TTG	2	6	298260	298265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563242
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6348	NC_017582	AT	3	6	298539	298544	50 %	50 %	0 %	0 %	414563242
6349	NC_017582	GTC	2	6	298595	298600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563242
6350	NC_017582	TGG	2	6	298603	298608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563242
6351	NC_017582	AGC	2	6	298612	298617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
6352	NC_017582	CCT	2	6	298676	298681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563242
6353	NC_017582	TG	3	6	298689	298694	0 %	50 %	50 %	0 %	414563242
6354	NC_017582	AGC	3	9	298720	298728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563242
6355	NC_017582	TCA	2	6	298801	298806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563242
6356	NC_017582	GAG	2	6	298823	298828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6357	NC_017582	TATT	2	8	298841	298848	25 %	75 %	0 %	0 %	414563243
6358	NC_017582	CTT	2	6	298850	298855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563243
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6360	NC_017582	TG	3	6	298956	298961	0 %	50 %	50 %	0 %	414563243
6361	NC_017582	T	6	6	298974	298979	0 %	100 %	0 %	0 %	414563243
6362	NC_017582	TCA	2	6	299106	299111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563243
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6364	NC_017582	CTTTC	2	10	299123	299132	0 %	60 %	0 %	40 %	414563243
6365	NC_017582	TTGT	2	8	299165	299172	0 %	75 %	25 %	0 %	414563243
6366	NC_017582	CAG	2	6	299185	299190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563243
6367	NC_017582	AG	3	6	299200	299205	50 %	0 %	50 %	0 %	414563243
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6369	NC_017582	AGCC	2	8	299395	299402	25 %	0 %	25 %	50 %	414563243
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6493	NC_017582	AATT	2	8	304644	304651	50 %	50 %	0 %	0 %	414563250
6494	NC_017582	AAAG	2	8	304715	304722	75 %	0 %	25 %	0 %	414563251
6495	NC_017582	ACA	2	6	304737	304742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563251
6496	NC_017582	ACA	2	6	304749	304754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563251
6497	NC_017582	AGC	2	6	304775	304780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563251
6498	NC_017582	GGA	2	6	304821	304826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563251
6499	NC_017582	CAGC	2	8	304887	304894	25 %	0 %	25 %	50 %	414563251
6500	NC_017582	TCAA	2	8	305137	305144	50 %	25 %	0 %	25 %	414563251

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