MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017582	ATT	2	6	211635	211640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563150
4502	NC_017582	GGCT	2	8	211754	211761	0 %	25 %	50 %	25 %	414563150
4503	NC_017582	AGA	2	6	211786	211791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
4504	NC_017582	AGC	2	6	211810	211815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
4505	NC_017582	TTG	2	6	211845	211850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563150
4506	NC_017582	ATTGGT	2	12	211853	211864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414563150
4507	NC_017582	CAC	2	6	211947	211952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563150
4508	NC_017582	TCA	2	6	211979	211984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
4509	NC_017582	ACA	3	9	212057	212065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
4510	NC_017582	AAG	2	6	212121	212126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
4511	NC_017582	CAA	2	6	212131	212136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
4512	NC_017582	TGT	2	6	212212	212217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563150
4513	NC_017582	TGG	2	6	212230	212235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
4514	NC_017582	GCA	2	6	212276	212281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
4515	NC_017582	TCA	2	6	212339	212344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
4516	NC_017582	CAT	2	6	212442	212447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563150
4517	NC_017582	TGG	2	6	212465	212470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
4518	NC_017582	CTGG	2	8	212477	212484	0 %	25 %	50 %	25 %	414563150
4519	NC_017582	AAGGA	2	10	212493	212502	60 %	0 %	40 %	0 %	414563150
4520	NC_017582	AAG	2	6	212571	212576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563150
4521	NC_017582	CTAC	2	8	212671	212678	25 %	25 %	0 %	50 %	414563150
4522	NC_017582	CAA	2	6	212701	212706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563150
4523	NC_017582	A	6	6	212705	212710	100 %	0 %	0 %	0 %	414563150
4524	NC_017582	CTT	2	6	212726	212731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
4525	NC_017582	TGG	2	6	212743	212748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563150
4526	NC_017582	CTT	2	6	212812	212817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
4527	NC_017582	CTT	2	6	212909	212914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563150
4528	NC_017582	AGC	2	6	212941	212946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563150
4529	NC_017582	ACGC	2	8	212952	212959	25 %	0 %	25 %	50 %	414563150
4530	NC_017582	AGCT	2	8	212972	212979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_017582	T	8	8	213024	213031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017582	CTT	2	6	213033	213038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_017582	GGTC	2	8	213044	213051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_017582	TAG	2	6	213073	213078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017582	TGC	2	6	213108	213113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_017582	TAGCTG	2	12	213117	213128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4537	NC_017582	AAG	2	6	213176	213181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017582	ATC	2	6	213294	213299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_017582	GCT	2	6	213313	213318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_017582	A	7	7	213401	213407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017582	GTCT	2	8	213408	213415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_017582	ATC	2	6	213420	213425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_017582	TAA	2	6	213440	213445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017582	AGG	2	6	213465	213470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017582	TCA	2	6	213527	213532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563151
4546	NC_017582	TTG	2	6	213549	213554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
4547	NC_017582	TTG	2	6	213597	213602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
4548	NC_017582	ACGTC	2	10	213650	213659	20 %	20 %	20 %	40 %	414563151
4549	NC_017582	GGT	2	6	213685	213690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563151
4550	NC_017582	AAT	2	6	213722	213727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563151
4551	NC_017582	GA	3	6	213806	213811	50 %	0 %	50 %	0 %	414563151
4552	NC_017582	A	6	6	213878	213883	100 %	0 %	0 %	0 %	414563151
4553	NC_017582	ATT	2	6	213893	213898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563151
4554	NC_017582	ACA	2	6	214148	214153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563151
4555	NC_017582	TTG	2	6	214194	214199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563151
4556	NC_017582	TTA	2	6	214201	214206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563151
4557	NC_017582	TA	3	6	214205	214210	50 %	50 %	0 %	0 %	414563151
4558	NC_017582	ACA	2	6	214241	214246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563151
4559	NC_017582	GGT	2	6	214256	214261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563151
4560	NC_017582	AG	3	6	214286	214291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017582	GAG	2	6	214365	214370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
4562	NC_017582	AGC	2	6	214420	214425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4563	NC_017582	CAA	2	6	214461	214466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563152
4564	NC_017582	TCT	2	6	214577	214582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563152
4565	NC_017582	CTG	2	6	214590	214595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4566	NC_017582	CTC	2	6	214601	214606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563152
4567	NC_017582	TGA	2	6	214619	214624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4568	NC_017582	TGA	2	6	214631	214636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4569	NC_017582	GCA	2	6	214651	214656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4570	NC_017582	GCT	2	6	214769	214774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4571	NC_017582	TG	3	6	214816	214821	0 %	50 %	50 %	0 %	414563152
4572	NC_017582	T	6	6	214833	214838	0 %	100 %	0 %	0 %	414563152
4573	NC_017582	GGA	2	6	214994	214999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
4574	NC_017582	TTA	2	6	215059	215064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563152
4575	NC_017582	TTG	2	6	215206	215211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
4576	NC_017582	ATG	3	9	215409	215417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4577	NC_017582	A	7	7	215451	215457	100 %	0 %	0 %	0 %	414563152
4578	NC_017582	GTC	2	6	215503	215508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4579	NC_017582	TTG	2	6	215535	215540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
4580	NC_017582	GAG	2	6	215556	215561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563152
4581	NC_017582	TGA	2	6	215573	215578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4582	NC_017582	CAC	2	6	215603	215608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563152
4583	NC_017582	TGT	2	6	215642	215647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563152
4584	NC_017582	TGA	2	6	215666	215671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4585	NC_017582	AATG	2	8	215685	215692	50 %	25 %	25 %	0 %	414563152
4586	NC_017582	CAT	2	6	215703	215708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563152
4587	NC_017582	CTGA	2	8	215784	215791	25 %	25 %	25 %	25 %	414563152
4588	NC_017582	GCT	2	6	215801	215806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4589	NC_017582	AGC	2	6	215815	215820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4590	NC_017582	CTG	3	9	215937	215945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563152
4591	NC_017582	TGG	2	6	215983	215988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563152
4592	NC_017582	ATG	2	6	216058	216063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4593	NC_017582	GAT	2	6	216084	216089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563152
4594	NC_017582	T	6	6	216160	216165	0 %	100 %	0 %	0 %	414563152
4595	NC_017582	GCT	2	6	216203	216208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563153
4596	NC_017582	ATT	2	6	216220	216225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563153
4597	NC_017582	GAC	2	6	216276	216281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563153
4598	NC_017582	TCAG	2	8	216352	216359	25 %	25 %	25 %	25 %	414563153
4599	NC_017582	ATT	2	6	216447	216452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563153
4600	NC_017582	TGC	2	6	216492	216497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563153
4601	NC_017582	AG	3	6	216518	216523	50 %	0 %	50 %	0 %	414563153
4602	NC_017582	TCT	2	6	216525	216530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563153
4603	NC_017582	AGC	2	6	216603	216608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563153
4604	NC_017582	GATT	2	8	216643	216650	25 %	50 %	25 %	0 %	414563154
4605	NC_017582	AGC	2	6	216692	216697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563154
4606	NC_017582	TAT	2	6	216698	216703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563154
4607	NC_017582	GCAG	2	8	216707	216714	25 %	0 %	50 %	25 %	414563154
4608	NC_017582	CTTG	2	8	216729	216736	0 %	50 %	25 %	25 %	414563154
4609	NC_017582	CAT	2	6	216743	216748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563154
4610	NC_017582	GAG	2	6	216751	216756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563154
4611	NC_017582	TTTA	2	8	216757	216764	25 %	75 %	0 %	0 %	414563155
4612	NC_017582	TGG	2	6	216814	216819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
4613	NC_017582	GGT	2	6	216856	216861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
4614	NC_017582	TGC	2	6	216867	216872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563155
4615	NC_017582	AATG	2	8	216880	216887	50 %	25 %	25 %	0 %	414563155
4616	NC_017582	TCAA	2	8	216918	216925	50 %	25 %	0 %	25 %	414563155
4617	NC_017582	CAAGC	2	10	217045	217054	40 %	0 %	20 %	40 %	414563155
4618	NC_017582	CA	3	6	217104	217109	50 %	0 %	0 %	50 %	414563155
4619	NC_017582	TTGT	2	8	217124	217131	0 %	75 %	25 %	0 %	414563155
4620	NC_017582	TTGG	2	8	217202	217209	0 %	50 %	50 %	0 %	414563155
4621	NC_017582	TGG	2	6	217228	217233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563155
4622	NC_017582	AGC	2	6	217269	217274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563155
4623	NC_017582	TAAG	2	8	217287	217294	50 %	25 %	25 %	0 %	414563155
4624	NC_017582	AGA	2	6	217308	217313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563155
4625	NC_017582	ATG	2	6	217322	217327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563156
4626	NC_017582	GTT	2	6	217346	217351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563156
4627	NC_017582	TGG	2	6	217369	217374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563156
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4629	NC_017582	TGA	3	9	217513	217521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563156
4630	NC_017582	GGC	2	6	217547	217552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563156
4631	NC_017582	A	6	6	217577	217582	100 %	0 %	0 %	0 %	414563156
4632	NC_017582	CTG	2	6	217662	217667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563156
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4636	NC_017582	GC	3	6	217780	217785	0 %	0 %	50 %	50 %	414563156
4637	NC_017582	AGC	2	6	217790	217795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563156
4638	NC_017582	AGGTA	2	10	217822	217831	40 %	20 %	40 %	0 %	414563156
4639	NC_017582	GCG	2	6	217850	217855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563156
4640	NC_017582	TC	3	6	217908	217913	0 %	50 %	0 %	50 %	414563156
4641	NC_017582	TGGC	2	8	217952	217959	0 %	25 %	50 %	25 %	414563156
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4645	NC_017582	GTT	3	9	218276	218284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563156
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4647	NC_017582	GGC	2	6	218395	218400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4648	NC_017582	TGC	2	6	218413	218418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563157
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4653	NC_017582	A	7	7	218577	218583	100 %	0 %	0 %	0 %	414563157
4654	NC_017582	CAGC	2	8	218628	218635	25 %	0 %	25 %	50 %	414563157
4655	NC_017582	GCTTA	2	10	218711	218720	20 %	40 %	20 %	20 %	414563157
4656	NC_017582	CAG	2	6	218746	218751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4657	NC_017582	TGC	2	6	218758	218763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4658	NC_017582	TAAGC	2	10	218798	218807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4662	NC_017582	ATC	2	6	218929	218934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563158
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4673	NC_017582	T	6	6	220298	220303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4674	NC_017582	TTA	2	6	220421	220426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4682	NC_017582	AG	3	6	220677	220682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4683	NC_017582	TAGC	2	8	220686	220693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4684	NC_017582	ATT	2	6	220815	220820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4685	NC_017582	TAAT	2	8	220821	220828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4686	NC_017582	ATAA	2	8	220849	220856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4687	NC_017582	TA	3	6	220857	220862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4688	NC_017582	CCA	2	6	220891	220896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4690	NC_017582	TAA	2	6	220960	220965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4691	NC_017582	T	7	7	220995	221001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4733	NC_017582	T	13	13	222948	222960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4734	NC_017582	TGAT	2	8	222988	222995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4740	NC_017582	AGC	3	9	223152	223160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4741	NC_017582	CGG	2	6	223236	223241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4742	NC_017582	GAA	2	6	223248	223253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_017582	T	6	6	223321	223326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_017582	AAG	2	6	223354	223359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_017582	AAG	2	6	223361	223366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_017582	GCT	2	6	223383	223388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_017582	TAG	2	6	223444	223449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_017582	A	6	6	223481	223486	100 %	0 %	0 %	0 %	414563163
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4751	NC_017582	TAG	2	6	223579	223584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563163
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4869	NC_017582	AG	3	6	229269	229274	50 %	0 %	50 %	0 %	414563168
4870	NC_017582	TTTTA	2	10	229307	229316	20 %	80 %	0 %	0 %	414563169
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4874	NC_017582	CT	3	6	229405	229410	0 %	50 %	0 %	50 %	414563169
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4996	NC_017582	TTTG	2	8	235816	235823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_017582	TAT	2	6	235850	235855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_017582	AGC	2	6	235862	235867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_017582	GCTG	2	8	235905	235912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5000	NC_017582	T	9	9	235956	235964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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