MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 26013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	AGA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343609
2	NC_017581	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343609
3	NC_017581	TCA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343609
4	NC_017581	GAA	2	6	239	244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343609
5	NC_017581	TGA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343609
6	NC_017581	AAC	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343609
7	NC_017581	AGC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343609
8	NC_017581	TAA	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343609
9	NC_017581	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343609
10	NC_017581	TGA	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343609
11	NC_017581	ATA	3	9	831	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343609
12	NC_017581	GGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343609
13	NC_017581	ACT	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017581	CTA	5	15	1576	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017581	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017581	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017581	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343610
18	NC_017581	AGA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
19	NC_017581	GTA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343610
20	NC_017581	GTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343610
21	NC_017581	GAA	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
22	NC_017581	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343610
23	NC_017581	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
24	NC_017581	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343610
25	NC_017581	GTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343610
26	NC_017581	CAG	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
27	NC_017581	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343610
28	NC_017581	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343610
29	NC_017581	CAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343610
30	NC_017581	AGG	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017581	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343611
32	NC_017581	ATG	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343611
33	NC_017581	GTC	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343611
34	NC_017581	AAG	2	6	2975	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343611
35	NC_017581	CTA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017581	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
37	NC_017581	GCT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343612
38	NC_017581	CAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343612
39	NC_017581	GAT	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
40	NC_017581	TTC	2	6	3716	3721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343612
41	NC_017581	AGA	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
42	NC_017581	GAA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
43	NC_017581	ACA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343612
44	NC_017581	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
45	NC_017581	TGA	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
46	NC_017581	AGT	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
47	NC_017581	GAA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
48	NC_017581	GAT	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343612
49	NC_017581	GCA	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
50	NC_017581	AGC	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343612
51	NC_017581	AAG	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
52	NC_017581	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343612
53	NC_017581	TGT	2	6	4281	4286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343612
54	NC_017581	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343613
55	NC_017581	TAG	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343613
56	NC_017581	CAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343613
57	NC_017581	TTA	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343613
58	NC_017581	GGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386343613
59	NC_017581	GAT	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343613
60	NC_017581	CAG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343613
61	NC_017581	ACT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343613
62	NC_017581	GAA	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343614
63	NC_017581	TCA	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
64	NC_017581	TAG	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
65	NC_017581	GAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
66	NC_017581	GCT	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
67	NC_017581	TGT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
68	NC_017581	CGG	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386343614
69	NC_017581	AGA	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343614
70	NC_017581	TGA	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
71	NC_017581	TCA	2	6	5938	5943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
72	NC_017581	ACT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
73	NC_017581	CTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343614
74	NC_017581	TCG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
75	NC_017581	TAG	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
76	NC_017581	GTT	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
77	NC_017581	CGT	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
78	NC_017581	TGT	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
79	NC_017581	ACT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
80	NC_017581	TGC	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
81	NC_017581	TAA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343614
82	NC_017581	ATG	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
83	NC_017581	GAT	3	9	6755	6763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
84	NC_017581	TGC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
85	NC_017581	ATG	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
86	NC_017581	ATT	3	9	7115	7123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
87	NC_017581	TTG	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343614
88	NC_017581	TGA	2	6	7183	7188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
89	NC_017581	AAC	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343614
90	NC_017581	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
91	NC_017581	GTA	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343614
92	NC_017581	ATC	2	6	7746	7751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
93	NC_017581	TCG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
94	NC_017581	TGC	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343614
95	NC_017581	ATC	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343614
96	NC_017581	TTC	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343614
97	NC_017581	ATT	2	6	8357	8362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343614
98	NC_017581	AGA	2	6	8618	8623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017581	AAG	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343615
100	NC_017581	GCA	2	6	8866	8871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343615
101	NC_017581	AAG	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343615
102	NC_017581	GTT	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343616
103	NC_017581	GAT	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343616
104	NC_017581	TTA	2	6	9272	9277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343616
105	NC_017581	GAA	2	6	9399	9404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343617
106	NC_017581	CTG	2	6	9436	9441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343618
107	NC_017581	TCT	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343618
108	NC_017581	TGA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343618
109	NC_017581	TTA	2	6	9917	9922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
110	NC_017581	AGC	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343618
111	NC_017581	AGC	2	6	10070	10075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343618
112	NC_017581	TAT	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
113	NC_017581	TGA	2	6	10259	10264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343618
114	NC_017581	TTA	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
115	NC_017581	AGC	2	6	10439	10444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343618
116	NC_017581	ATT	2	6	10485	10490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343618
117	NC_017581	ATG	2	6	10513	10518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343618
118	NC_017581	ATG	2	6	10588	10593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343618
119	NC_017581	AAG	2	6	10645	10650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343618
120	NC_017581	GAT	2	6	10677	10682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343618
121	NC_017581	AAT	2	6	10699	10704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343618
122	NC_017581	TTG	2	6	10715	10720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343619
123	NC_017581	ATG	2	6	10724	10729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343619
124	NC_017581	TAG	2	6	10767	10772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343619
125	NC_017581	TGC	2	6	10803	10808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343619
126	NC_017581	GAA	2	6	10895	10900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343619
127	NC_017581	ATT	2	6	10902	10907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343619
128	NC_017581	GCC	2	6	10979	10984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343619
129	NC_017581	AAG	2	6	11022	11027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343619
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