MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	ATTG	2	8	162	169	25 %	50 %	25 %	0 %	386322373
2	NC_017572	TTCT	2	8	184	191	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
3	NC_017572	TTTC	2	8	585	592	0 %	75 %	0 %	25 %	386322373
4	NC_017572	AGCC	2	8	1162	1169	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
5	NC_017572	TCTT	2	8	1203	1210	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
6	NC_017572	CAGC	2	8	1461	1468	25 %	0 %	25 %	50 %	386322374
7	NC_017572	TAAA	2	8	1647	1654	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
8	NC_017572	CATT	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
9	NC_017572	GACT	2	8	1952	1959	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
10	NC_017572	TTTC	2	8	2008	2015	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
11	NC_017572	AAAT	2	8	2339	2346	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
12	NC_017572	CTAT	2	8	3220	3227	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
13	NC_017572	AATT	2	8	3272	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	386322374
14	NC_017572	GACT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	386322374
15	NC_017572	AATG	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
16	NC_017572	TGAA	2	8	4147	4154	50 %	25 %	25 %	0 %	386322374
17	NC_017572	TAAA	2	8	4283	4290	75 %	25 %	0 %	0 %	386322374
18	NC_017572	ATCA	2	8	5244	5251	50 %	25 %	0 %	25 %	386322374
19	NC_017572	CTTA	2	8	5430	5437	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
20	NC_017572	GAAC	2	8	5640	5647	50 %	0 %	25 %	25 %	386322374
21	NC_017572	CTTT	2	8	5779	5786	0 %	75 %	0 %	25 %	386322374
22	NC_017572	GCTT	2	8	5832	5839	0 %	50 %	25 %	25 %	386322374
23	NC_017572	GTTT	2	8	5844	5851	0 %	75 %	25 %	0 %	386322374
24	NC_017572	TATC	2	8	5987	5994	25 %	50 %	0 %	25 %	386322374
25	NC_017572	ACTC	2	8	6347	6354	25 %	25 %	0 %	50 %	386322374
26	NC_017572	TACA	2	8	6590	6597	50 %	25 %	0 %	25 %	386322374
27	NC_017572	CCCA	2	8	6951	6958	25 %	0 %	0 %	75 %	386322374
28	NC_017572	GATC	2	8	7291	7298	25 %	25 %	25 %	25 %	386322375
29	NC_017572	TTTG	2	8	7375	7382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017572	TGTC	2	8	7407	7414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017572	AAAC	2	8	8943	8950	75 %	0 %	0 %	25 %	386322376
32	NC_017572	GCAA	2	8	10060	10067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017572	TTGC	2	8	10201	10208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017572	TGTC	2	8	10351	10358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017572	GCAA	2	8	10447	10454	50 %	0 %	25 %	25 %	386322378
36	NC_017572	ACCT	2	8	10810	10817	25 %	25 %	0 %	50 %	386322378
37	NC_017572	ACTG	2	8	10837	10844	25 %	25 %	25 %	25 %	386322378
38	NC_017572	CTGA	2	8	10880	10887	25 %	25 %	25 %	25 %	386322378
39	NC_017572	AAGC	2	8	11117	11124	50 %	0 %	25 %	25 %	386322378
40	NC_017572	CTTG	2	8	11311	11318	0 %	50 %	25 %	25 %	386322378
41	NC_017572	AGTT	2	8	11394	11401	25 %	50 %	25 %	0 %	386322378
42	NC_017572	TCTG	2	8	11750	11757	0 %	50 %	25 %	25 %	386322378
43	NC_017572	AGAA	2	8	11967	11974	75 %	0 %	25 %	0 %	386322378
44	NC_017572	GAAT	2	8	12499	12506	50 %	25 %	25 %	0 %	386322379
45	NC_017572	TTAA	2	8	12593	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	386322379
46	NC_017572	TTTG	2	8	12753	12760	0 %	75 %	25 %	0 %	386322380
47	NC_017572	ACTG	2	8	12856	12863	25 %	25 %	25 %	25 %	386322380
48	NC_017572	CAAT	2	8	13046	13053	50 %	25 %	0 %	25 %	386322381
49	NC_017572	TTGA	2	8	13270	13277	25 %	50 %	25 %	0 %	386322381
50	NC_017572	TAGC	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017572	ATTC	2	8	13523	13530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017572	TCGG	2	8	13597	13604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017572	GCAA	2	8	13646	13653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017572	GCGA	2	8	13896	13903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017572	AGCA	2	8	13946	13953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017572	TAGA	2	8	14705	14712	50 %	25 %	25 %	0 %	386322382
57	NC_017572	ATTT	2	8	15010	15017	25 %	75 %	0 %	0 %	386322383
58	NC_017572	ATAA	2	8	15672	15679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017572	TATT	2	8	15721	15728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017572	ATTA	2	8	16478	16485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017572	TTTG	2	8	16540	16547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017572	TTAT	2	8	17151	17158	25 %	75 %	0 %	0 %	386322386
63	NC_017572	GTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	25 %	0 %	386322386
64	NC_017572	CTTG	2	8	17332	17339	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
65	NC_017572	GCGA	2	8	17355	17362	25 %	0 %	50 %	25 %	386322386
66	NC_017572	GTTC	2	8	17488	17495	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
67	NC_017572	GTTA	2	8	17990	17997	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
68	NC_017572	GAAA	2	8	18304	18311	75 %	0 %	25 %	0 %	386322386
69	NC_017572	TGAT	2	8	18720	18727	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
70	NC_017572	ATTG	2	8	18911	18918	25 %	50 %	25 %	0 %	386322386
71	NC_017572	TCAA	2	8	19014	19021	50 %	25 %	0 %	25 %	386322386
72	NC_017572	GTCT	2	8	19465	19472	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
73	NC_017572	TTTG	2	8	20164	20171	0 %	75 %	25 %	0 %	386322386
74	NC_017572	TTTG	2	8	20680	20687	0 %	75 %	25 %	0 %	386322386
75	NC_017572	CTTG	2	8	20758	20765	0 %	50 %	25 %	25 %	386322386
76	NC_017572	CTTT	2	8	21148	21155	0 %	75 %	0 %	25 %	386322386
77	NC_017572	CAAA	2	8	21751	21758	75 %	0 %	0 %	25 %	386322386
78	NC_017572	GTGA	2	8	21951	21958	25 %	25 %	50 %	0 %	386322386
79	NC_017572	CATC	2	8	23595	23602	25 %	25 %	0 %	50 %	386322388
80	NC_017572	CCAT	2	8	24957	24964	25 %	25 %	0 %	50 %	386322389
81	NC_017572	GGGT	2	8	25124	25131	0 %	25 %	75 %	0 %	386322389
82	NC_017572	GCAA	2	8	25170	25177	50 %	0 %	25 %	25 %	386322389
83	NC_017572	AACA	2	8	26105	26112	75 %	0 %	0 %	25 %	386322390
84	NC_017572	TTGA	2	8	26212	26219	25 %	50 %	25 %	0 %	386322391
85	NC_017572	GTTG	2	8	26873	26880	0 %	50 %	50 %	0 %	386322391
86	NC_017572	ACAT	2	8	27102	27109	50 %	25 %	0 %	25 %	386322391
87	NC_017572	GCTT	2	8	27308	27315	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
88	NC_017572	CTTG	2	8	27487	27494	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
89	NC_017572	GTGA	2	8	27936	27943	25 %	25 %	50 %	0 %	386322391
90	NC_017572	CATA	2	8	28660	28667	50 %	25 %	0 %	25 %	386322391
91	NC_017572	GCAA	2	8	28782	28789	50 %	0 %	25 %	25 %	386322391
92	NC_017572	CTTG	2	8	28948	28955	0 %	50 %	25 %	25 %	386322391
93	NC_017572	AAGG	2	8	29677	29684	50 %	0 %	50 %	0 %	386322392
94	NC_017572	TCTT	2	8	29750	29757	0 %	75 %	0 %	25 %	386322392
95	NC_017572	CCGC	2	8	29786	29793	0 %	0 %	25 %	75 %	386322392
96	NC_017572	GCAA	2	8	30464	30471	50 %	0 %	25 %	25 %	386322393
97	NC_017572	ATGC	2	8	30485	30492	25 %	25 %	25 %	25 %	386322393
98	NC_017572	GGAA	2	8	30758	30765	50 %	0 %	50 %	0 %	386322394
99	NC_017572	GAAA	2	8	30889	30896	75 %	0 %	25 %	0 %	386322394
100	NC_017572	GGCG	2	8	31426	31433	0 %	0 %	75 %	25 %	386322395
101	NC_017572	TTGA	2	8	31513	31520	25 %	50 %	25 %	0 %	386322395
102	NC_017572	AGCG	2	8	31833	31840	25 %	0 %	50 %	25 %	386322396
103	NC_017572	TAAC	2	8	31865	31872	50 %	25 %	0 %	25 %	386322396
104	NC_017572	TGGC	2	8	31931	31938	0 %	25 %	50 %	25 %	386322396
105	NC_017572	TGCT	2	8	32403	32410	0 %	50 %	25 %	25 %	386322396
106	NC_017572	CGGT	2	8	32420	32427	0 %	25 %	50 %	25 %	386322396
107	NC_017572	AAGT	2	8	34498	34505	50 %	25 %	25 %	0 %	386322398
108	NC_017572	ATCT	2	8	35693	35700	25 %	50 %	0 %	25 %	386322399
109	NC_017572	AACG	2	8	36110	36117	50 %	0 %	25 %	25 %	386322399
110	NC_017572	GTTT	2	8	36207	36214	0 %	75 %	25 %	0 %	386322400
111	NC_017572	GCTT	2	8	36274	36281	0 %	50 %	25 %	25 %	386322400
112	NC_017572	CTCG	2	8	36905	36912	0 %	25 %	25 %	50 %	386322401
113	NC_017572	ATTG	2	8	37236	37243	25 %	50 %	25 %	0 %	386322401
114	NC_017572	GCCC	2	8	37475	37482	0 %	0 %	25 %	75 %	386322402
115	NC_017572	TGAG	2	8	38353	38360	25 %	25 %	50 %	0 %	386322402
116	NC_017572	TGCC	2	8	38732	38739	0 %	25 %	25 %	50 %	386322402
117	NC_017572	GATT	2	8	39107	39114	25 %	50 %	25 %	0 %	386322402
118	NC_017572	TCAA	2	8	39298	39305	50 %	25 %	0 %	25 %	386322402
119	NC_017572	ATAG	2	8	39498	39505	50 %	25 %	25 %	0 %	386322402
120	NC_017572	GACT	2	8	39981	39988	25 %	25 %	25 %	25 %	386322403
121	NC_017572	CACT	2	8	40238	40245	25 %	25 %	0 %	50 %	386322403
122	NC_017572	ATCA	2	8	41642	41649	50 %	25 %	0 %	25 %	386322404
123	NC_017572	TGTT	2	8	41902	41909	0 %	75 %	25 %	0 %	386322405
124	NC_017572	CAAT	2	8	42494	42501	50 %	25 %	0 %	25 %	386322405
125	NC_017572	CCAT	2	8	43121	43128	25 %	25 %	0 %	50 %	386322406
126	NC_017572	CGTT	2	8	43315	43322	0 %	50 %	25 %	25 %	386322407
127	NC_017572	CATC	2	8	43506	43513	25 %	25 %	0 %	50 %	386322407
128	NC_017572	GTTT	2	8	44158	44165	0 %	75 %	25 %	0 %	386322409
129	NC_017572	AACC	2	8	44486	44493	50 %	0 %	0 %	50 %	386322411
130	NC_017572	GGTT	2	8	44544	44551	0 %	50 %	50 %	0 %	386322411
131	NC_017572	ATTT	2	8	45031	45038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017572	ATAA	2	8	45039	45046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017572	GCTC	2	8	45834	45841	0 %	25 %	25 %	50 %	386322412
134	NC_017572	CAAG	2	8	45903	45910	50 %	0 %	25 %	25 %	386322412
135	NC_017572	AAGC	2	8	46051	46058	50 %	0 %	25 %	25 %	386322412
136	NC_017572	CTTT	2	8	46425	46432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017572	GCAA	2	8	46504	46511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017572	TTTA	2	8	47564	47571	25 %	75 %	0 %	0 %	386322414
139	NC_017572	TTGA	2	8	47585	47592	25 %	50 %	25 %	0 %	386322414
140	NC_017572	ATTC	2	8	47725	47732	25 %	50 %	0 %	25 %	386322414
141	NC_017572	TACC	2	8	48102	48109	25 %	25 %	0 %	50 %	386322415
142	NC_017572	TGAT	2	8	48200	48207	25 %	50 %	25 %	0 %	386322416
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166	NC_017572	GGAA	2	8	60710	60717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.