MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 89299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017571	ATA	2	6	27573	27578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322518
502	NC_017571	CTG	2	6	27591	27596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322518
503	NC_017571	TGC	2	6	27619	27624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322518
504	NC_017571	GGC	3	9	27657	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322518
505	NC_017571	T	6	6	27684	27689	0 %	100 %	0 %	0 %	386322518
506	NC_017571	TATT	2	8	27697	27704	25 %	75 %	0 %	0 %	386322518
507	NC_017571	AGA	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322518
508	NC_017571	TCT	2	6	27823	27828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322518
509	NC_017571	TTC	2	6	27861	27866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322518
510	NC_017571	ACC	3	9	27885	27893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322518
511	NC_017571	CTT	2	6	27920	27925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322518
512	NC_017571	TGC	2	6	27955	27960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322518
513	NC_017571	CGG	2	6	27968	27973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322518
514	NC_017571	ATT	2	6	27981	27986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322518
515	NC_017571	TGGC	2	8	28158	28165	0 %	25 %	50 %	25 %	386322518
516	NC_017571	GT	3	6	28174	28179	0 %	50 %	50 %	0 %	386322518
517	NC_017571	CATT	2	8	28194	28201	25 %	50 %	0 %	25 %	386322518
518	NC_017571	ATG	2	6	28234	28239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322518
519	NC_017571	TGG	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322518
520	NC_017571	GAA	2	6	28467	28472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322518
521	NC_017571	CTATT	2	10	28564	28573	20 %	60 %	0 %	20 %	386322518
522	NC_017571	TGG	2	6	28601	28606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322518
523	NC_017571	TGC	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322518
524	NC_017571	CG	3	6	28663	28668	0 %	0 %	50 %	50 %	386322518
525	NC_017571	TTC	2	6	28761	28766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322518
526	NC_017571	GAT	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322518
527	NC_017571	GCTT	2	8	28854	28861	0 %	50 %	25 %	25 %	386322518
528	NC_017571	AAC	2	6	28863	28868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322518
529	NC_017571	GAA	2	6	29006	29011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322518
530	NC_017571	TAA	2	6	29028	29033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322519
531	NC_017571	CGA	2	6	29040	29045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322519
532	NC_017571	A	6	6	29073	29078	100 %	0 %	0 %	0 %	386322519
533	NC_017571	CCA	2	6	29233	29238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322519
534	NC_017571	T	6	6	29267	29272	0 %	100 %	0 %	0 %	386322519
535	NC_017571	GC	3	6	29288	29293	0 %	0 %	50 %	50 %	386322519
536	NC_017571	CTG	2	6	29342	29347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322519
537	NC_017571	GATT	2	8	29392	29399	25 %	50 %	25 %	0 %	386322519
538	NC_017571	TTC	2	6	29414	29419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322519
539	NC_017571	TCA	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322519
540	NC_017571	AGCT	2	8	29589	29596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_017571	GTTC	2	8	29655	29662	0 %	50 %	25 %	25 %	386322520
542	NC_017571	GTA	2	6	29671	29676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322520
543	NC_017571	CCA	2	6	29703	29708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322520
544	NC_017571	TCAC	2	8	29918	29925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017571	TTTA	2	8	30055	30062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017571	GTG	2	6	30145	30150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322521
547	NC_017571	TGC	2	6	30233	30238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322521
548	NC_017571	GT	3	6	30316	30321	0 %	50 %	50 %	0 %	386322521
549	NC_017571	AGC	2	6	30334	30339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322521
550	NC_017571	TCT	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322521
551	NC_017571	GTG	2	6	30387	30392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322521
552	NC_017571	AAT	2	6	30423	30428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322521
553	NC_017571	ATT	2	6	30483	30488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322521
554	NC_017571	GAT	2	6	30533	30538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322521
555	NC_017571	ATC	2	6	30628	30633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322521
556	NC_017571	TAA	2	6	30679	30684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017571	A	6	6	30683	30688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017571	AAT	2	6	30865	30870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322522
559	NC_017571	CCG	2	6	30900	30905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322522
560	NC_017571	ACAA	2	8	30983	30990	75 %	0 %	0 %	25 %	386322522
561	NC_017571	AGCG	2	8	31007	31014	25 %	0 %	50 %	25 %	386322522
562	NC_017571	TGA	2	6	31029	31034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322522
563	NC_017571	TTG	2	6	31040	31045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322522
564	NC_017571	AGC	2	6	31158	31163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322522
565	NC_017571	CAC	2	6	31249	31254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322522
566	NC_017571	GAG	2	6	31291	31296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322522
567	NC_017571	AAG	2	6	31361	31366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322522
568	NC_017571	CGC	2	6	31447	31452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322522
569	NC_017571	GCC	2	6	31522	31527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322522
570	NC_017571	CATGG	2	10	31543	31552	20 %	20 %	40 %	20 %	386322522
571	NC_017571	GAT	2	6	31584	31589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322522
572	NC_017571	GCA	2	6	31597	31602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322522
573	NC_017571	ATAA	2	8	31621	31628	75 %	25 %	0 %	0 %	386322522
574	NC_017571	ACC	2	6	31711	31716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322522
575	NC_017571	AAG	2	6	31724	31729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322522
576	NC_017571	AAG	2	6	31874	31879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322522
577	NC_017571	GAG	2	6	32095	32100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322522
578	NC_017571	CTTA	2	8	32186	32193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_017571	AGA	3	9	32201	32209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322523
580	NC_017571	TTGG	2	8	32216	32223	0 %	50 %	50 %	0 %	386322523
581	NC_017571	TCG	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322523
582	NC_017571	TGG	2	6	32348	32353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322523
583	NC_017571	CGG	2	6	32441	32446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322523
584	NC_017571	CGC	2	6	32447	32452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322523
585	NC_017571	TGG	2	6	32513	32518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322523
586	NC_017571	CTT	2	6	32552	32557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322523
587	NC_017571	ATA	2	6	32638	32643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322523
588	NC_017571	TCG	2	6	32650	32655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322523
589	NC_017571	AATA	2	8	32670	32677	75 %	25 %	0 %	0 %	386322523
590	NC_017571	TTC	2	6	32697	32702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322523
591	NC_017571	GTA	2	6	32743	32748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322523
592	NC_017571	ATA	2	6	32869	32874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322523
593	NC_017571	CGA	2	6	32939	32944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322523
594	NC_017571	AGA	2	6	32945	32950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322523
595	NC_017571	TCA	2	6	32953	32958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322523
596	NC_017571	GGC	2	6	32996	33001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322523
597	NC_017571	CGC	2	6	33015	33020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322523
598	NC_017571	TGC	2	6	33057	33062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322523
599	NC_017571	CCA	2	6	33074	33079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322523
600	NC_017571	ATA	2	6	33090	33095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322523
601	NC_017571	CAA	2	6	33164	33169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322523
602	NC_017571	GCC	2	6	33228	33233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322523
603	NC_017571	TTG	2	6	33326	33331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322523
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606	NC_017571	ATT	2	6	33537	33542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322523
607	NC_017571	TAA	2	6	33639	33644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322524
608	NC_017571	TTGTC	2	10	33670	33679	0 %	60 %	20 %	20 %	386322524
609	NC_017571	GT	3	6	33728	33733	0 %	50 %	50 %	0 %	386322524
610	NC_017571	TC	3	6	33753	33758	0 %	50 %	0 %	50 %	386322524
611	NC_017571	TGT	2	6	33868	33873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322524
612	NC_017571	TTC	2	6	33885	33890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322524
613	NC_017571	GGC	2	6	33929	33934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322524
614	NC_017571	CCA	2	6	33996	34001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322524
615	NC_017571	ACC	2	6	34152	34157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322524
616	NC_017571	CGC	2	6	34212	34217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322524
617	NC_017571	GCGCC	2	10	34223	34232	0 %	0 %	40 %	60 %	386322524
618	NC_017571	CTG	2	6	34315	34320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322524
619	NC_017571	TCGC	2	8	34324	34331	0 %	25 %	25 %	50 %	386322524
620	NC_017571	GCA	2	6	34354	34359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322524
621	NC_017571	ATG	2	6	34432	34437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322524
622	NC_017571	CTT	2	6	34460	34465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322524
623	NC_017571	GCG	2	6	34526	34531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322524
624	NC_017571	CGG	2	6	34610	34615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322524
625	NC_017571	TGG	2	6	34684	34689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322524
626	NC_017571	AGT	2	6	34789	34794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322524
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628	NC_017571	CAGC	2	8	34889	34896	25 %	0 %	25 %	50 %	386322524
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