MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 89299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017571	TGA	2	6	277376	277381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322717
5002	NC_017571	CAA	2	6	277425	277430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322717
5003	NC_017571	GGT	2	6	277455	277460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322717
5004	NC_017571	TCG	2	6	277582	277587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322717
5005	NC_017571	GA	3	6	277764	277769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017571	TTA	2	6	277782	277787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322718
5007	NC_017571	AGCAA	2	10	277801	277810	60 %	0 %	20 %	20 %	386322718
5008	NC_017571	GAA	2	6	277815	277820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5009	NC_017571	CTGAT	2	10	277852	277861	20 %	40 %	20 %	20 %	386322718
5010	NC_017571	AAG	2	6	277887	277892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5011	NC_017571	TCTGT	2	10	277937	277946	0 %	60 %	20 %	20 %	386322718
5012	NC_017571	GTG	2	6	278014	278019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5013	NC_017571	CGT	2	6	278064	278069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5014	NC_017571	AGA	2	6	278255	278260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5015	NC_017571	AGA	2	6	278279	278284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5016	NC_017571	TGA	2	6	278291	278296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5017	NC_017571	GAA	2	6	278379	278384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5018	NC_017571	TCAA	2	8	278391	278398	50 %	25 %	0 %	25 %	386322718
5019	NC_017571	TCG	2	6	278408	278413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5020	NC_017571	CAA	2	6	278465	278470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322718
5021	NC_017571	GAT	2	6	278480	278485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5022	NC_017571	ACC	2	6	278507	278512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322718
5023	NC_017571	GGC	2	6	278541	278546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322718
5024	NC_017571	CGC	2	6	278580	278585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322718
5025	NC_017571	AAC	2	6	278598	278603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322718
5026	NC_017571	GTC	2	6	278701	278706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5027	NC_017571	AAG	2	6	278880	278885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5028	NC_017571	AGC	2	6	278957	278962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5029	NC_017571	AAG	2	6	278964	278969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5030	NC_017571	TGA	2	6	279220	279225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5031	NC_017571	CAA	2	6	279233	279238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322718
5032	NC_017571	TAC	2	6	279303	279308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322718
5033	NC_017571	GTG	2	6	279334	279339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5034	NC_017571	GCT	2	6	279393	279398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5035	NC_017571	ATT	2	6	279438	279443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322718
5036	NC_017571	AAC	2	6	279466	279471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322718
5037	NC_017571	CTG	2	6	279504	279509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5038	NC_017571	CAG	2	6	279523	279528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5039	NC_017571	ACA	2	6	279808	279813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322718
5040	NC_017571	ATG	2	6	279861	279866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5041	NC_017571	ATG	2	6	279942	279947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5042	NC_017571	ATC	2	6	280032	280037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322718
5043	NC_017571	TCG	2	6	280163	280168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5044	NC_017571	GGT	2	6	280254	280259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5045	NC_017571	CAC	2	6	280345	280350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322718
5046	NC_017571	CGA	2	6	280364	280369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
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5048	NC_017571	CGA	2	6	280403	280408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5049	NC_017571	GT	4	8	280450	280457	0 %	50 %	50 %	0 %	386322718
5050	NC_017571	GCA	2	6	280527	280532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5051	NC_017571	GGT	2	6	280584	280589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5052	NC_017571	TTC	2	6	280706	280711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322718
5053	NC_017571	AGA	2	6	280790	280795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5054	NC_017571	GTA	2	6	280870	280875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5055	NC_017571	TCA	2	6	280941	280946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322718
5056	NC_017571	TGA	2	6	281035	281040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5057	NC_017571	CTT	2	6	281069	281074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322718
5058	NC_017571	GGT	2	6	281178	281183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5059	NC_017571	CGT	2	6	281289	281294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5060	NC_017571	CTG	2	6	281308	281313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5061	NC_017571	GGC	2	6	281316	281321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322718
5062	NC_017571	GAT	2	6	281336	281341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5063	NC_017571	GTG	2	6	281389	281394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5064	NC_017571	ATC	2	6	281538	281543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322718
5065	NC_017571	TGC	2	6	281551	281556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5066	NC_017571	ACT	2	6	281687	281692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322718
5067	NC_017571	CAG	2	6	281734	281739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322718
5068	NC_017571	CG	3	6	281758	281763	0 %	0 %	50 %	50 %	386322718
5069	NC_017571	GCC	2	6	281775	281780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322718
5070	NC_017571	GGT	2	6	281784	281789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322718
5071	NC_017571	GAAA	2	8	281813	281820	75 %	0 %	25 %	0 %	386322718
5072	NC_017571	GAA	2	6	281894	281899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322718
5073	NC_017571	GTA	2	6	281910	281915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322718
5074	NC_017571	CTGG	2	8	281970	281977	0 %	25 %	50 %	25 %	386322718
5075	NC_017571	T	6	6	282027	282032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017571	CCA	2	6	282101	282106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017571	CG	3	6	282203	282208	0 %	0 %	50 %	50 %	386322719
5078	NC_017571	GTG	2	6	282261	282266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322719
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5080	NC_017571	A	6	6	282296	282301	100 %	0 %	0 %	0 %	386322719
5081	NC_017571	CTAA	2	8	282338	282345	50 %	25 %	0 %	25 %	386322719
5082	NC_017571	CGG	2	6	282370	282375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322719
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5084	NC_017571	TAAG	2	8	282554	282561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017571	TCA	2	6	282702	282707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322720
5086	NC_017571	A	6	6	282744	282749	100 %	0 %	0 %	0 %	386322720
5087	NC_017571	TGT	2	6	282769	282774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322720
5088	NC_017571	GAAAA	2	10	282779	282788	80 %	0 %	20 %	0 %	386322720
5089	NC_017571	AGC	2	6	282814	282819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322720
5090	NC_017571	TCG	2	6	282856	282861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322720
5091	NC_017571	TGG	2	6	282865	282870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322720
5092	NC_017571	CGT	2	6	282908	282913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322720
5093	NC_017571	GCT	2	6	282944	282949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322720
5094	NC_017571	GTG	2	6	282957	282962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322720
5095	NC_017571	CTG	2	6	283023	283028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322720
5096	NC_017571	AAG	2	6	283031	283036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322720
5097	NC_017571	ATG	2	6	283098	283103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017571	GTT	2	6	283128	283133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017571	TGG	2	6	283156	283161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017571	ACC	2	6	283244	283249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322721
5101	NC_017571	ACA	2	6	283250	283255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322721
5102	NC_017571	GTTCT	2	10	283262	283271	0 %	60 %	20 %	20 %	386322721
5103	NC_017571	CAAGAG	2	12	283337	283348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386322721
5104	NC_017571	TATCAC	2	12	283354	283365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322721
5105	NC_017571	ATC	2	6	283430	283435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322721
5106	NC_017571	TGT	2	6	283501	283506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322721
5107	NC_017571	TCAG	2	8	283537	283544	25 %	25 %	25 %	25 %	386322721
5108	NC_017571	CAA	2	6	283597	283602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322721
5109	NC_017571	GTGCAG	2	12	283611	283622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386322721
5110	NC_017571	TG	3	6	283670	283675	0 %	50 %	50 %	0 %	386322721
5111	NC_017571	AGA	2	6	283699	283704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322721
5112	NC_017571	GAAT	2	8	283753	283760	50 %	25 %	25 %	0 %	386322721
5113	NC_017571	GAG	2	6	283787	283792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386322721
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5117	NC_017571	A	6	6	283919	283924	100 %	0 %	0 %	0 %	386322721
5118	NC_017571	AAT	2	6	283946	283951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322721
5119	NC_017571	AAG	2	6	284082	284087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322721
5120	NC_017571	TGC	2	6	284119	284124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322721
5121	NC_017571	ATGC	2	8	284264	284271	25 %	25 %	25 %	25 %	386322721
5122	NC_017571	ACTGA	2	10	284282	284291	40 %	20 %	20 %	20 %	386322721
5123	NC_017571	AAG	2	6	284292	284297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322721
5124	NC_017571	GCG	2	6	284318	284323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322721
5125	NC_017571	AAG	2	6	284334	284339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322721
5126	NC_017571	CAT	2	6	284496	284501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322721
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5129	NC_017571	CAT	2	6	284569	284574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322721
5130	NC_017571	GGT	2	6	284693	284698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322721
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5132	NC_017571	ATTC	2	8	284800	284807	25 %	50 %	0 %	25 %	386322721
5133	NC_017571	GAA	2	6	284839	284844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322721
5134	NC_017571	ATG	2	6	284907	284912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322721
5135	NC_017571	CGT	2	6	285046	285051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322721
5136	NC_017571	CGT	3	9	285065	285073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322721
5137	NC_017571	TTGA	2	8	285077	285084	25 %	50 %	25 %	0 %	386322721
5138	NC_017571	GATG	2	8	285088	285095	25 %	25 %	50 %	0 %	386322721
5139	NC_017571	TGG	2	6	285103	285108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322721
5140	NC_017571	ATT	2	6	285251	285256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322721
5141	NC_017571	TTA	2	6	285293	285298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_017571	ACTG	2	8	285308	285315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5143	NC_017571	AT	3	6	285337	285342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_017571	ACTG	2	8	285424	285431	25 %	25 %	25 %	25 %	386322722
5145	NC_017571	TC	3	6	285438	285443	0 %	50 %	0 %	50 %	386322722
5146	NC_017571	TC	3	6	285483	285488	0 %	50 %	0 %	50 %	386322722
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5149	NC_017571	TGC	2	6	285628	285633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322722
5150	NC_017571	TAG	3	9	285654	285662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322722
5151	NC_017571	CGTAC	2	10	285724	285733	20 %	20 %	20 %	40 %	386322722
5152	NC_017571	ATC	2	6	285734	285739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322722
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5155	NC_017571	GTA	2	6	286022	286027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322722
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5159	NC_017571	TGA	2	6	286195	286200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322722
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5161	NC_017571	CA	3	6	286245	286250	50 %	0 %	0 %	50 %	386322722
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5169	NC_017571	TGA	2	6	286643	286648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_017571	TCG	2	6	286701	286706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5171	NC_017571	ATC	2	6	286787	286792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5172	NC_017571	TA	3	6	286807	286812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_017571	GAA	2	6	286813	286818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_017571	T	6	6	286831	286836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_017571	ATC	2	6	286904	286909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322723
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5180	NC_017571	AAG	2	6	287189	287194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5182	NC_017571	A	6	6	287371	287376	100 %	0 %	0 %	0 %	386322724
5183	NC_017571	GCG	2	6	287420	287425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322724
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5187	NC_017571	TAC	2	6	287724	287729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322724
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5190	NC_017571	TCA	2	6	287945	287950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322725
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5192	NC_017571	CGTGCT	2	12	288060	288071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322725
5193	NC_017571	TGGCG	2	10	288093	288102	0 %	20 %	60 %	20 %	386322725
5194	NC_017571	GCT	2	6	288117	288122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322725
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5196	NC_017571	TCTG	2	8	288185	288192	0 %	50 %	25 %	25 %	386322725
5197	NC_017571	GTT	3	9	288216	288224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322725
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5200	NC_017571	CTG	2	6	288427	288432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322725
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5207	NC_017571	TGAAGT	2	12	288619	288630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322726
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5210	NC_017571	A	6	6	288707	288712	100 %	0 %	0 %	0 %	386322726
5211	NC_017571	TGC	2	6	288727	288732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322726
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5227	NC_017571	GTG	2	6	289447	289452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322727
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5229	NC_017571	TGG	2	6	289505	289510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322727
5230	NC_017571	GTA	2	6	289561	289566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322727
5231	NC_017571	CGT	3	9	289593	289601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322727
5232	NC_017571	AATA	2	8	289602	289609	75 %	25 %	0 %	0 %	386322727
5233	NC_017571	TC	3	6	289634	289639	0 %	50 %	0 %	50 %	386322728
5234	NC_017571	GAA	2	6	289672	289677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322728
5235	NC_017571	GTC	2	6	289785	289790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322728
5236	NC_017571	GAA	2	6	289891	289896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322728
5237	NC_017571	GGA	2	6	289908	289913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_017571	GCC	2	6	290045	290050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322729
5239	NC_017571	A	6	6	290060	290065	100 %	0 %	0 %	0 %	386322729
5240	NC_017571	TGA	2	6	290116	290121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322729
5241	NC_017571	GA	3	6	290252	290257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5243	NC_017571	TGC	2	6	290524	290529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322730
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5363	NC_017571	GAA	2	6	297411	297416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322745
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5368	NC_017571	GTT	2	6	297872	297877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322746
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5395	NC_017571	AG	3	6	299052	299057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5485	NC_017571	AGC	2	6	304476	304481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322754
5486	NC_017571	GCC	2	6	304592	304597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322754
5487	NC_017571	GCC	2	6	304709	304714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322754
5488	NC_017571	GCT	2	6	305028	305033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322754
5489	NC_017571	ACC	3	9	305097	305105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322754
5490	NC_017571	TGC	2	6	305202	305207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322754
5491	NC_017571	TCT	2	6	305223	305228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322754
5492	NC_017571	TCCAT	2	10	305320	305329	20 %	40 %	0 %	40 %	386322754
5493	NC_017571	TGT	2	6	305369	305374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322754
5494	NC_017571	GTA	2	6	305381	305386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322754
5495	NC_017571	AGTC	2	8	305416	305423	25 %	25 %	25 %	25 %	386322754
5496	NC_017571	GTTC	2	8	305456	305463	0 %	50 %	25 %	25 %	386322754
5497	NC_017571	CGC	2	6	305464	305469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322754
5498	NC_017571	GTG	2	6	305537	305542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322754
5499	NC_017571	ACC	2	6	305549	305554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322754
5500	NC_017571	CTT	2	6	305647	305652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322754

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