MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	ACTAAA	2	12	4763	4774	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386322433
2	NC_017570	ATTGAT	2	12	5958	5969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386322433
3	NC_017570	AAAGAT	2	12	17023	17034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386322440
4	NC_017570	CGCTAT	2	12	26638	26649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386322452
5	NC_017570	CCAAGC	2	12	27840	27851	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386322454
6	NC_017570	ACCTAT	2	12	31201	31212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322457
7	NC_017570	TTTCTA	2	12	37568	37579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386322462
8	NC_017570	TCAAAA	2	12	41890	41901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017570	AGGCTT	2	12	46160	46171	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017570	TGCGTG	2	12	50864	50875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386322468
11	NC_017570	ACGCTA	2	12	52701	52712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386322470
12	NC_017570	ACTTTT	2	12	53737	53748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386322471
13	NC_017570	CTCAGA	2	12	57046	57057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017570	TAAATT	2	12	57525	57536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017570	GGTTTA	2	12	67314	67325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017570	TTTCAG	2	12	67365	67376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386322490
17	NC_017570	TTTGCA	2	12	67637	67648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.