MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	386085707
2	NC_017563	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	386085707
3	NC_017563	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	386085707
4	NC_017563	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	386085711
5	NC_017563	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	386085711
6	NC_017563	CTTTT	2	10	8597	8606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017563	GGAAA	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017563	TCAGA	2	10	9231	9240	40 %	20 %	20 %	20 %	386085713
9	NC_017563	CAGTA	2	10	12769	12778	40 %	20 %	20 %	20 %	386085718
10	NC_017563	GGTAA	2	10	12849	12858	40 %	20 %	40 %	0 %	386085718
11	NC_017563	TCGTG	2	10	18887	18896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017563	GTTAA	2	10	19633	19642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017563	GGGAG	2	10	20151	20160	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017563	AGGGA	2	10	22360	22369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017563	TTGAG	2	10	22594	22603	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017563	CTAGT	2	10	25527	25536	20 %	40 %	20 %	20 %	386085724
17	NC_017563	CAATC	2	10	25863	25872	40 %	20 %	0 %	40 %	386085725
18	NC_017563	ATTCA	2	10	27066	27075	40 %	40 %	0 %	20 %	386085725
19	NC_017563	TGATT	2	10	28285	28294	20 %	60 %	20 %	0 %	386085726
20	NC_017563	ACCTT	2	10	29028	29037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017563	TTTTG	2	10	29913	29922	0 %	80 %	20 %	0 %	386085728
22	NC_017563	ATGAA	2	10	31266	31275	60 %	20 %	20 %	0 %	386085729
23	NC_017563	GTAGA	2	10	32630	32639	40 %	20 %	40 %	0 %	386085731
24	NC_017563	AAATG	2	10	38743	38752	60 %	20 %	20 %	0 %	386085734
25	NC_017563	AAAAT	2	10	40918	40927	80 %	20 %	0 %	0 %	386085737
26	NC_017563	GTGAA	2	10	41857	41866	40 %	20 %	40 %	0 %	386085737
27	NC_017563	AGTGG	2	10	42009	42018	20 %	20 %	60 %	0 %	386085737
28	NC_017563	TCAAA	2	10	42172	42181	60 %	20 %	0 %	20 %	386085737
29	NC_017563	ACTAT	2	10	44790	44799	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017563	TTGAT	2	10	45141	45150	20 %	60 %	20 %	0 %	386085742
31	NC_017563	GAAGC	2	10	48099	48108	40 %	0 %	40 %	20 %	386085744
32	NC_017563	ATTTT	2	10	48409	48418	20 %	80 %	0 %	0 %	386085745
33	NC_017563	GCTTG	2	10	49717	49726	0 %	40 %	40 %	20 %	386085747
34	NC_017563	CTTTT	2	10	51721	51730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017563	GCATC	2	10	54193	54202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017563	TCAAA	2	10	54663	54672	60 %	20 %	0 %	20 %	386085752
37	NC_017563	ACATC	2	10	57545	57554	40 %	20 %	0 %	40 %	386085754
38	NC_017563	GACTT	2	10	59643	59652	20 %	40 %	20 %	20 %	386085757
39	NC_017563	TAGCT	2	10	69960	69969	20 %	40 %	20 %	20 %	386085770
40	NC_017563	TTCTT	2	10	71654	71663	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017563	TTTGA	2	10	71664	71673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017563	GATAA	2	10	71769	71778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017563	TTGAT	2	10	72048	72057	20 %	60 %	20 %	0 %	386085772
44	NC_017563	TCGTG	2	10	73698	73707	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017563	GTTAA	2	10	74444	74453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017563	GGGAG	2	10	74962	74971	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017563	AGGGA	2	10	77170	77179	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017563	TTGAG	2	10	77404	77413	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017563	CAAAT	2	10	81058	81067	60 %	20 %	0 %	20 %	386085773
50	NC_017563	CGAAT	2	10	83396	83405	40 %	20 %	20 %	20 %	386085774
51	NC_017563	AGAAA	2	10	83451	83460	80 %	0 %	20 %	0 %	386085774
52	NC_017563	TCAAA	2	10	84331	84340	60 %	20 %	0 %	20 %	386085774
53	NC_017563	AATTT	2	10	84893	84902	40 %	60 %	0 %	0 %	386085776
54	NC_017563	AAGAT	2	10	85634	85643	60 %	20 %	20 %	0 %	386085777
55	NC_017563	GGGGC	2	10	89363	89372	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017563	CAGCC	2	10	89374	89383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_017563	AAAAG	2	10	90477	90486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017563	TCAGC	2	10	91553	91562	20 %	20 %	20 %	40 %	386085787
59	NC_017563	TTTTA	2	10	101091	101100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017563	GCTTC	2	10	102124	102133	0 %	40 %	20 %	40 %	386085793
61	NC_017563	AAGCC	2	10	102253	102262	40 %	0 %	20 %	40 %	386085793
62	NC_017563	CTGTT	2	10	102333	102342	0 %	60 %	20 %	20 %	386085793
63	NC_017563	AAATA	2	10	105306	105315	80 %	20 %	0 %	0 %	386085799
64	NC_017563	AAATG	2	10	106539	106548	60 %	20 %	20 %	0 %	386085801
65	NC_017563	AACAA	2	10	108302	108311	80 %	0 %	0 %	20 %	386085803
66	NC_017563	CACAC	2	10	108436	108445	40 %	0 %	0 %	60 %	386085803
67	NC_017563	TTTAC	2	10	109623	109632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017563	ATTTT	2	10	110042	110051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017563	TTTAT	2	10	113173	113182	20 %	80 %	0 %	0 %	386085806
70	NC_017563	TATTT	2	10	114677	114686	20 %	80 %	0 %	0 %	386085808
71	NC_017563	GACGA	2	10	115104	115113	40 %	0 %	40 %	20 %	386085808
72	NC_017563	ATTAT	2	10	115500	115509	40 %	60 %	0 %	0 %	386085808
73	NC_017563	ATGGC	2	10	116464	116473	20 %	20 %	40 %	20 %	386085810
74	NC_017563	AAAAG	2	10	116631	116640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017563	TTTGT	2	10	118811	118820	0 %	80 %	20 %	0 %	386085813
76	NC_017563	ATTGT	2	10	122799	122808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017563	TCTGT	2	10	124345	124354	0 %	60 %	20 %	20 %	386085819
78	NC_017563	CGGTT	2	10	124996	125005	0 %	40 %	40 %	20 %	386085820
79	NC_017563	CAGTT	2	10	127140	127149	20 %	40 %	20 %	20 %	386085823
80	NC_017563	AAGGT	2	10	127362	127371	40 %	20 %	40 %	0 %	386085823
81	NC_017563	TTAGT	2	10	127611	127620	20 %	60 %	20 %	0 %	386085823
82	NC_017563	GTATC	2	10	129840	129849	20 %	40 %	20 %	20 %	386085825
83	NC_017563	AAGTG	2	10	130545	130554	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017563	TTCGT	2	10	130574	130583	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017563	AAATA	2	10	130587	130596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017563	AAAGG	2	10	131670	131679	60 %	0 %	40 %	0 %	386085826
87	NC_017563	TGATA	2	10	131961	131970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017563	TCGTG	2	10	135394	135403	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017563	GTTAA	2	10	136141	136150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017563	GGGAG	2	10	136659	136668	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017563	AGGGA	2	10	138868	138877	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017563	TTGAG	2	10	139102	139111	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017563	TCCTT	2	10	140715	140724	0 %	60 %	0 %	40 %	386085830
94	NC_017563	GGATC	2	10	140830	140839	20 %	20 %	40 %	20 %	386085830
95	NC_017563	GGATG	2	10	144843	144852	20 %	20 %	60 %	0 %	386085836
96	NC_017563	TATTT	2	10	147004	147013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017563	TTACT	2	10	147925	147934	20 %	60 %	0 %	20 %	386085839
98	NC_017563	AAATT	2	10	148485	148494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017563	TAAAC	2	10	148621	148630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017563	GGTTT	2	10	153016	153025	0 %	60 %	40 %	0 %	386085843
101	NC_017563	TTTGG	2	10	156299	156308	0 %	60 %	40 %	0 %	386085849
102	NC_017563	AAGGT	2	10	156325	156334	40 %	20 %	40 %	0 %	386085849
103	NC_017563	CTGGT	2	10	157909	157918	0 %	40 %	40 %	20 %	386085851
104	NC_017563	ATAAA	2	10	158598	158607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017563	TGATT	2	10	159426	159435	20 %	60 %	20 %	0 %	386085853
106	NC_017563	GAGAT	2	10	160478	160487	40 %	20 %	40 %	0 %	386085853
107	NC_017563	ATTGA	2	10	160783	160792	40 %	40 %	20 %	0 %	386085853
108	NC_017563	AATGA	2	10	163852	163861	60 %	20 %	20 %	0 %	386085858
109	NC_017563	GGTTG	2	10	165539	165548	0 %	40 %	60 %	0 %	386085859
110	NC_017563	TATTT	2	10	165628	165637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017563	AAGTA	2	10	168622	168631	60 %	20 %	20 %	0 %	386085864
112	NC_017563	CACAA	2	10	169613	169622	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017563	CGTAG	2	10	172937	172946	20 %	20 %	40 %	20 %	386085868
114	NC_017563	AGATA	2	10	173292	173301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017563	TTTTA	2	10	173693	173702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017563	GTCTT	2	10	177028	177037	0 %	60 %	20 %	20 %	386085872
117	NC_017563	AAGTT	2	10	177379	177388	40 %	40 %	20 %	0 %	386085872
118	NC_017563	CTCAG	2	10	180174	180183	20 %	20 %	20 %	40 %	386085875
119	NC_017563	CTTTA	2	10	181425	181434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017563	TTGAT	2	10	183195	183204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017563	TCATC	2	10	183282	183291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017563	AGCTT	2	10	187017	187026	20 %	40 %	20 %	20 %	386085885
123	NC_017563	TCCAA	2	10	189426	189435	40 %	20 %	0 %	40 %	386085887
124	NC_017563	TTGGT	2	10	191589	191598	0 %	60 %	40 %	0 %	386085890
125	NC_017563	TTGCC	2	10	192020	192029	0 %	40 %	20 %	40 %	386085891
126	NC_017563	GAAAT	2	10	192968	192977	60 %	20 %	20 %	0 %	386085892
127	NC_017563	CAAGT	2	10	194660	194669	40 %	20 %	20 %	20 %	386085895
128	NC_017563	TTGGT	2	10	194885	194894	0 %	60 %	40 %	0 %	386085895
129	NC_017563	ATCGT	2	10	198741	198750	20 %	40 %	20 %	20 %	386085899
130	NC_017563	ATAAA	2	10	204386	204395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017563	TGGCT	2	10	206103	206112	0 %	40 %	40 %	20 %	386085904
132	NC_017563	TTTCT	2	10	210747	210756	0 %	80 %	0 %	20 %	386085912
133	NC_017563	TGGTA	2	10	210900	210909	20 %	40 %	40 %	0 %	386085912
134	NC_017563	TTTCT	2	10	210942	210951	0 %	80 %	0 %	20 %	386085912
135	NC_017563	CAATC	2	10	211398	211407	40 %	20 %	0 %	40 %	386085913
136	NC_017563	AGTTC	2	10	215884	215893	20 %	40 %	20 %	20 %	386085917
137	NC_017563	TTTGG	2	10	216965	216974	0 %	60 %	40 %	0 %	386085919
138	NC_017563	AATCC	2	10	217926	217935	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017563	TAGTA	2	10	219051	219060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017563	ATGGG	2	10	219431	219440	20 %	20 %	60 %	0 %	386085921
141	NC_017563	CAACA	2	10	219577	219586	60 %	0 %	0 %	40 %	386085921
142	NC_017563	GCAAC	2	10	219859	219868	40 %	0 %	20 %	40 %	386085921
143	NC_017563	GCTTT	2	10	221929	221938	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017563	TACAT	2	10	223474	223483	40 %	40 %	0 %	20 %	386085924
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149	NC_017563	AAATT	2	10	231971	231980	60 %	40 %	0 %	0 %	386085930
150	NC_017563	TGGAT	2	10	232787	232796	20 %	40 %	40 %	0 %	386085932
151	NC_017563	GAACA	2	10	233982	233991	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017563	ATAAA	2	10	235045	235054	80 %	20 %	0 %	0 %	386085934
153	NC_017563	ATTGA	2	10	238108	238117	40 %	40 %	20 %	0 %	386085936
154	NC_017563	TTTGA	2	10	238381	238390	20 %	60 %	20 %	0 %	386085936
155	NC_017563	GAAGA	2	10	240262	240271	60 %	0 %	40 %	0 %	386085936
156	NC_017563	GTTAC	2	10	243181	243190	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_017563	TCTTA	2	10	244163	244172	20 %	60 %	0 %	20 %	386085940
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161	NC_017563	TATAA	2	10	253532	253541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017563	ATGTA	2	10	253856	253865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017563	TGTCC	2	10	254308	254317	0 %	40 %	20 %	40 %	386085954
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166	NC_017563	GATTT	2	10	256921	256930	20 %	60 %	20 %	0 %	386085958
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169	NC_017563	TATGG	2	10	267335	267344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017563	CTTTT	2	10	269190	269199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017563	GTTTA	2	10	270705	270714	20 %	60 %	20 %	0 %	386085971
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174	NC_017563	TTCTT	2	10	278041	278050	0 %	80 %	0 %	20 %	386085981
175	NC_017563	GAGAA	2	10	279775	279784	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017563	GATGT	2	10	279881	279890	20 %	40 %	40 %	0 %	386085983
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178	NC_017563	ATTTT	2	10	281857	281866	20 %	80 %	0 %	0 %	386085983
179	NC_017563	ATTCC	2	10	282278	282287	20 %	40 %	0 %	40 %	386085983
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181	NC_017563	AAACT	2	10	284750	284759	60 %	20 %	0 %	20 %	386085985
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194	NC_017563	AATTT	2	10	302378	302387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017563	AGATG	2	10	305021	305030	40 %	20 %	40 %	0 %	386086005
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199	NC_017563	AAGCT	2	10	307858	307867	40 %	20 %	20 %	20 %	386086008
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201	NC_017563	TAAAA	2	10	312267	312276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017563	TAAAA	2	10	312722	312731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_017563	AAGTT	2	10	313103	313112	40 %	40 %	20 %	0 %	386086017
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220	NC_017563	TGGAA	2	10	329028	329037	40 %	20 %	40 %	0 %	386086033
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252	NC_017563	GAACA	2	10	376890	376899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_017563	CATTC	2	10	384529	384538	20 %	40 %	0 %	40 %	386086092
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261	NC_017563	GGACT	2	10	386422	386431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_017563	CCTTT	2	10	387420	387429	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_017563	ATCAG	2	10	387789	387798	40 %	20 %	20 %	20 %	386086093
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267	NC_017563	AGGTA	2	10	392404	392413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017563	ATTTG	2	10	392700	392709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017563	ATAAG	2	10	392978	392987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017563	GGTTT	2	10	395971	395980	0 %	60 %	40 %	0 %	386086099
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274	NC_017563	ACAGG	2	10	403553	403562	40 %	0 %	40 %	20 %	386086105
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392	NC_017563	TCTGT	2	10	588015	588024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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