MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 24682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017563	AGA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085706
3	NC_017563	ATT	2	6	262	267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085706
4	NC_017563	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085706
5	NC_017563	GAA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085706
6	NC_017563	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085706
7	NC_017563	AAC	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085706
8	NC_017563	AGC	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085706
9	NC_017563	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085706
10	NC_017563	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085706
11	NC_017563	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085706
12	NC_017563	ATA	3	9	916	924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085706
13	NC_017563	GGA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085706
14	NC_017563	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017563	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017563	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017563	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017563	TAA	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085707
19	NC_017563	AGA	2	6	1887	1892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
20	NC_017563	GTA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085707
21	NC_017563	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085707
22	NC_017563	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
23	NC_017563	AAG	2	6	2084	2089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085707
24	NC_017563	GCA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
25	NC_017563	GTC	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085707
26	NC_017563	GTA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085707
27	NC_017563	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
28	NC_017563	TCT	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085707
29	NC_017563	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085707
30	NC_017563	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085707
31	NC_017563	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017563	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085708
33	NC_017563	ATG	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085708
34	NC_017563	GTC	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085708
35	NC_017563	AAG	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085708
36	NC_017563	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017563	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
38	NC_017563	GCT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085709
39	NC_017563	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085709
40	NC_017563	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
41	NC_017563	TTC	2	6	3801	3806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085709
42	NC_017563	AGA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
43	NC_017563	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
44	NC_017563	ACA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085709
45	NC_017563	TGA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
46	NC_017563	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
47	NC_017563	AGT	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
48	NC_017563	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
49	NC_017563	GAT	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085709
50	NC_017563	GCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
51	NC_017563	AGC	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085709
52	NC_017563	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
53	NC_017563	GAA	2	6	4349	4354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085709
54	NC_017563	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085709
55	NC_017563	CAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085709
56	NC_017563	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085710
57	NC_017563	TAG	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085710
58	NC_017563	CAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085710
59	NC_017563	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085710
60	NC_017563	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085710
61	NC_017563	GAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085710
62	NC_017563	CAG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085710
63	NC_017563	ACT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085710
64	NC_017563	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085711
65	NC_017563	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
66	NC_017563	TAG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
67	NC_017563	GAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
68	NC_017563	GCT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
69	NC_017563	TGT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
70	NC_017563	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085711
71	NC_017563	AGA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085711
72	NC_017563	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
73	NC_017563	TCA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
74	NC_017563	ACT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
75	NC_017563	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085711
76	NC_017563	TCG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
77	NC_017563	TAG	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
78	NC_017563	GTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
79	NC_017563	CGT	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
80	NC_017563	TGT	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
81	NC_017563	ACT	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
82	NC_017563	TGC	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
83	NC_017563	TAA	2	6	6710	6715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085711
84	NC_017563	ATG	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
85	NC_017563	GAT	3	9	6840	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
86	NC_017563	TGC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
87	NC_017563	ATG	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
88	NC_017563	ATT	3	9	7200	7208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085711
89	NC_017563	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085711
90	NC_017563	TGA	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
91	NC_017563	AAC	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085711
92	NC_017563	ATT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085711
93	NC_017563	GTA	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085711
94	NC_017563	ATC	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
95	NC_017563	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
96	NC_017563	TGC	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085711
97	NC_017563	ATC	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085711
98	NC_017563	TTC	2	6	8358	8363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085711
99	NC_017563	ATT	2	6	8442	8447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085711
100	NC_017563	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017563	AAG	2	6	8796	8801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085712
102	NC_017563	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085712
103	NC_017563	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085712
104	NC_017563	GTT	2	6	9123	9128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085713
105	NC_017563	GAT	2	6	9276	9281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085713
106	NC_017563	TTA	2	6	9357	9362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085713
107	NC_017563	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085714
108	NC_017563	CTG	2	6	9521	9526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085715
109	NC_017563	TCT	2	6	9535	9540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085715
110	NC_017563	TGA	2	6	9834	9839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085715
111	NC_017563	TTA	2	6	10002	10007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085715
112	NC_017563	AGC	2	6	10133	10138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085715
113	NC_017563	AGC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085715
114	NC_017563	TAT	2	6	10216	10221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085715
115	NC_017563	TGA	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085715
116	NC_017563	TTA	2	6	10425	10430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085715
117	NC_017563	AGC	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085715
118	NC_017563	ATT	2	6	10570	10575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085715
119	NC_017563	ATG	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085715
120	NC_017563	ATG	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085715
121	NC_017563	AAG	2	6	10730	10735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085715
122	NC_017563	GAT	2	6	10762	10767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085715
123	NC_017563	AAT	2	6	10784	10789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085715
124	NC_017563	TTG	2	6	10800	10805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085716
125	NC_017563	ATG	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085716
126	NC_017563	TAG	2	6	10852	10857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085716
127	NC_017563	TGC	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085716
128	NC_017563	GAA	2	6	10980	10985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085716
129	NC_017563	ATT	2	6	10987	10992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085716
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259	NC_017563	CGC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_017563	ACC	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_017563	CGT	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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300	NC_017563	TGT	2	6	23975	23980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017563	GGT	2	6	24089	24094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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