MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 37616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017563	A	6	6	48992	48997	100 %	0 %	0 %	0 %	386085745
1003	NC_017563	TCT	2	6	49045	49050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085745
1004	NC_017563	TTG	2	6	49052	49057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085745
1005	NC_017563	AGG	2	6	49138	49143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085745
1006	NC_017563	TTG	2	6	49173	49178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017563	CTAT	2	8	49290	49297	25 %	50 %	0 %	25 %	386085746
1008	NC_017563	GTT	2	6	49387	49392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017563	AAG	2	6	49436	49441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017563	AATA	2	8	49490	49497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017563	A	7	7	49501	49507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017563	CTT	2	6	49595	49600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017563	GAA	2	6	49699	49704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085747
1014	NC_017563	AATA	2	8	49705	49712	75 %	25 %	0 %	0 %	386085747
1015	NC_017563	GCTTG	2	10	49717	49726	0 %	40 %	40 %	20 %	386085747
1016	NC_017563	AGC	2	6	49841	49846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085747
1017	NC_017563	ACAA	2	8	49970	49977	75 %	0 %	0 %	25 %	386085747
1018	NC_017563	ATC	2	6	50020	50025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085747
1019	NC_017563	ATG	2	6	50059	50064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085747
1020	NC_017563	GCT	2	6	50167	50172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085747
1021	NC_017563	CCA	2	6	50224	50229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085747
1022	NC_017563	TTG	2	6	50231	50236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085747
1023	NC_017563	AAC	2	6	50393	50398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085747
1024	NC_017563	TC	3	6	50561	50566	0 %	50 %	0 %	50 %	386085747
1025	NC_017563	TCA	2	6	50569	50574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085747
1026	NC_017563	ATC	2	6	50584	50589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085747
1027	NC_017563	TTGA	2	8	50608	50615	25 %	50 %	25 %	0 %	386085747
1028	NC_017563	TTGA	2	8	50734	50741	25 %	50 %	25 %	0 %	386085747
1029	NC_017563	CTT	2	6	50827	50832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085747
1030	NC_017563	CTCA	2	8	50860	50867	25 %	25 %	0 %	50 %	386085747
1031	NC_017563	AGA	2	6	50868	50873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085747
1032	NC_017563	CGA	2	6	50877	50882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085747
1033	NC_017563	TAT	2	6	50899	50904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085747
1034	NC_017563	TGA	2	6	50916	50921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085747
1035	NC_017563	T	6	6	50987	50992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017563	T	6	6	51025	51030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017563	AGGA	2	8	51064	51071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017563	ATC	2	6	51148	51153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017563	ATGA	2	8	51160	51167	50 %	25 %	25 %	0 %	386085748
1040	NC_017563	CTT	2	6	51188	51193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085748
1041	NC_017563	TGA	2	6	51261	51266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085748
1042	NC_017563	AAT	2	6	51272	51277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085748
1043	NC_017563	AT	3	6	51306	51311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017563	AGC	2	6	51329	51334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017563	T	6	6	51365	51370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017563	T	6	6	51410	51415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017563	CTT	2	6	51416	51421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017563	TTA	2	6	51431	51436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017563	TA	3	6	51488	51493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017563	CTG	2	6	51575	51580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017563	T	7	7	51596	51602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017563	TGC	2	6	51604	51609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017563	AAC	2	6	51712	51717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017563	CTTTT	2	10	51721	51730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_017563	ATG	2	6	51755	51760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017563	T	7	7	51771	51777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017563	A	6	6	51785	51790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017563	CTT	2	6	51857	51862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085749
1059	NC_017563	CTGTTG	2	12	51869	51880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386085749
1060	NC_017563	GT	3	6	51932	51937	0 %	50 %	50 %	0 %	386085749
1061	NC_017563	TGA	2	6	52022	52027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085749
1062	NC_017563	TGA	2	6	52052	52057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085749
1063	NC_017563	CGT	2	6	52073	52078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085749
1064	NC_017563	TGTA	2	8	52085	52092	25 %	50 %	25 %	0 %	386085749
1065	NC_017563	AGAT	2	8	52127	52134	50 %	25 %	25 %	0 %	386085749
1066	NC_017563	CCAACA	2	12	52258	52269	50 %	0 %	0 %	50 %	386085749
1067	NC_017563	CAAG	2	8	52361	52368	50 %	0 %	25 %	25 %	386085749
1068	NC_017563	GTC	2	6	52440	52445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085749
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1071	NC_017563	CATC	2	8	52715	52722	25 %	25 %	0 %	50 %	386085749
1072	NC_017563	TCA	2	6	52843	52848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085749
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1077	NC_017563	T	6	6	53318	53323	0 %	100 %	0 %	0 %	386085749
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1091	NC_017563	AGT	2	6	54132	54137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017563	T	6	6	54165	54170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017563	GCATC	2	10	54193	54202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_017563	TAT	2	6	54203	54208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_017563	TTA	2	6	54300	54305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_017563	A	9	9	54318	54326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017563	A	6	6	54345	54350	100 %	0 %	0 %	0 %	386085752
1101	NC_017563	TTA	2	6	54400	54405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085752
1102	NC_017563	ATT	2	6	54456	54461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085752
1103	NC_017563	TAG	2	6	54482	54487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085752
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1109	NC_017563	A	7	7	54729	54735	100 %	0 %	0 %	0 %	386085752
1110	NC_017563	TAT	2	6	54756	54761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085752
1111	NC_017563	GA	3	6	54780	54785	50 %	0 %	50 %	0 %	386085752
1112	NC_017563	ATC	2	6	54823	54828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085752
1113	NC_017563	AAG	2	6	54854	54859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085752
1114	NC_017563	GAAGCA	2	12	54925	54936	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386085752
1115	NC_017563	TACT	2	8	54954	54961	25 %	50 %	0 %	25 %	386085752
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1117	NC_017563	GGC	2	6	55099	55104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085752
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1121	NC_017563	A	7	7	55229	55235	100 %	0 %	0 %	0 %	386085752
1122	NC_017563	TTAT	2	8	55349	55356	25 %	75 %	0 %	0 %	386085752
1123	NC_017563	CAC	2	6	55373	55378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085752
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1125	NC_017563	GA	3	6	55509	55514	50 %	0 %	50 %	0 %	386085752
1126	NC_017563	AT	3	6	55572	55577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017563	TTAA	2	8	55582	55589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017563	GAA	2	6	55595	55600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017563	TGCT	2	8	55643	55650	0 %	50 %	25 %	25 %	386085753
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