MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	C	6	6	251	256	0 %	0 %	0 %	100 %	387144421
2	NC_017352	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	387144422
3	NC_017352	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017352	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	387144423
5	NC_017352	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017352	T	6	6	2611	2616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017352	A	6	6	2680	2685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017352	A	6	6	2904	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017352	A	7	7	2911	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017352	T	7	7	3102	3108	0 %	100 %	0 %	0 %	387144424
11	NC_017352	A	7	7	3549	3555	100 %	0 %	0 %	0 %	387144424
12	NC_017352	T	6	6	3606	3611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017352	A	6	6	3654	3659	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
14	NC_017352	T	6	6	3753	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	387144425
15	NC_017352	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
16	NC_017352	A	7	7	4138	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
17	NC_017352	A	7	7	4146	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017352	A	7	7	4299	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017352	T	6	6	4316	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017352	T	7	7	4428	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017352	T	9	9	4461	4469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017352	A	7	7	4528	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017352	A	6	6	4619	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017352	A	6	6	4692	4697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017352	T	6	6	4725	4730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017352	T	6	6	4738	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017352	A	7	7	4907	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017352	T	6	6	4941	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017352	T	7	7	5067	5073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017352	A	6	6	5193	5198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017352	T	8	8	5714	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	387144426
32	NC_017352	T	6	6	5924	5929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017352	A	6	6	6231	6236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017352	A	7	7	6432	6438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017352	T	6	6	6606	6611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017352	A	7	7	6626	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017352	T	6	6	6873	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017352	T	6	6	6884	6889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017352	A	6	6	6892	6897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017352	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017352	T	6	6	7384	7389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017352	T	6	6	7401	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017352	T	7	7	7445	7451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017352	T	6	6	7456	7461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017352	T	6	6	7519	7524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017352	T	7	7	7528	7534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017352	A	7	7	7558	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017352	T	6	6	7879	7884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017352	T	7	7	8072	8078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017352	T	6	6	8440	8445	0 %	100 %	0 %	0 %	387144427
51	NC_017352	A	6	6	8484	8489	100 %	0 %	0 %	0 %	387144427
52	NC_017352	T	6	6	8897	8902	0 %	100 %	0 %	0 %	387144429
53	NC_017352	T	6	6	9088	9093	0 %	100 %	0 %	0 %	387144429
54	NC_017352	A	6	6	9109	9114	100 %	0 %	0 %	0 %	387144429
55	NC_017352	T	7	7	9423	9429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017352	A	6	6	9520	9525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017352	A	6	6	9779	9784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017352	T	7	7	9972	9978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017352	T	6	6	10065	10070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017352	T	6	6	10280	10285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017352	A	7	7	10288	10294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017352	A	7	7	10299	10305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017352	T	6	6	10505	10510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017352	T	7	7	10726	10732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017352	T	6	6	11163	11168	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
66	NC_017352	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
67	NC_017352	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	387144430
68	NC_017352	A	6	6	11865	11870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017352	A	6	6	12137	12142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017352	A	6	6	12285	12290	100 %	0 %	0 %	0 %	387144431
71	NC_017352	A	7	7	12386	12392	100 %	0 %	0 %	0 %	387144431
72	NC_017352	T	6	6	13309	13314	0 %	100 %	0 %	0 %	387144432
73	NC_017352	T	6	6	13530	13535	0 %	100 %	0 %	0 %	387144432
74	NC_017352	T	6	6	13633	13638	0 %	100 %	0 %	0 %	387144432
75	NC_017352	T	6	6	13640	13645	0 %	100 %	0 %	0 %	387144432
76	NC_017352	A	6	6	13950	13955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017352	T	7	7	15339	15345	0 %	100 %	0 %	0 %	387144433
78	NC_017352	T	8	8	15545	15552	0 %	100 %	0 %	0 %	387144433
79	NC_017352	A	6	6	15579	15584	100 %	0 %	0 %	0 %	387144433
80	NC_017352	T	7	7	15651	15657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017352	A	6	6	15670	15675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017352	T	6	6	15725	15730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017352	A	6	6	15818	15823	100 %	0 %	0 %	0 %	387144434
84	NC_017352	A	6	6	16111	16116	100 %	0 %	0 %	0 %	387144434
85	NC_017352	T	7	7	16312	16318	0 %	100 %	0 %	0 %	387144434
86	NC_017352	T	6	6	16678	16683	0 %	100 %	0 %	0 %	387144435
87	NC_017352	T	6	6	16903	16908	0 %	100 %	0 %	0 %	387144435
88	NC_017352	A	6	6	16962	16967	100 %	0 %	0 %	0 %	387144435
89	NC_017352	T	6	6	17148	17153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017352	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	387144437
91	NC_017352	T	6	6	18836	18841	0 %	100 %	0 %	0 %	387144438
92	NC_017352	T	6	6	18880	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	387144438
93	NC_017352	A	6	6	19036	19041	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
94	NC_017352	A	7	7	19226	19232	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
95	NC_017352	A	6	6	19418	19423	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
96	NC_017352	T	6	6	20888	20893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017352	T	6	6	21216	21221	0 %	100 %	0 %	0 %	387144440
98	NC_017352	A	6	6	21858	21863	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
99	NC_017352	A	6	6	22725	22730	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
100	NC_017352	A	6	6	23161	23166	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
101	NC_017352	A	7	7	23367	23373	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
102	NC_017352	G	6	6	23777	23782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017352	T	6	6	24441	24446	0 %	100 %	0 %	0 %	387144442
104	NC_017352	A	7	7	24828	24834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017352	A	6	6	24931	24936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017352	A	7	7	25090	25096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017352	T	6	6	25524	25529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017352	A	6	6	25603	25608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017352	T	6	6	25636	25641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017352	A	6	6	25676	25681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017352	A	6	6	26005	26010	100 %	0 %	0 %	0 %	387144443
112	NC_017352	A	6	6	26170	26175	100 %	0 %	0 %	0 %	387144444
113	NC_017352	A	6	6	27241	27246	100 %	0 %	0 %	0 %	387144445
114	NC_017352	A	6	6	27352	27357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017352	A	6	6	27372	27377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017352	T	8	8	27441	27448	0 %	100 %	0 %	0 %	387144446
117	NC_017352	A	6	6	27740	27745	100 %	0 %	0 %	0 %	387144446
118	NC_017352	G	6	6	28218	28223	0 %	0 %	100 %	0 %	387144447
119	NC_017352	A	6	6	28956	28961	100 %	0 %	0 %	0 %	387144447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.