MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	TCGGT	2	10	466	475	0 %	40 %	40 %	20 %	387144421
2	NC_017352	AATTA	2	10	3639	3648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017352	TAATT	2	10	6747	6756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017352	TTTTC	2	10	7914	7923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017352	TTAGA	2	10	8040	8049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017352	ATTTT	2	10	8086	8095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017352	CAAGA	2	10	8177	8186	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017352	ATCAC	2	10	8526	8535	40 %	20 %	0 %	40 %	387144427
9	NC_017352	AAAAT	2	10	10365	10374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017352	ATATT	2	10	10823	10832	40 %	60 %	0 %	0 %	387144430
11	NC_017352	ACAGC	2	10	13177	13186	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017352	CTTTT	2	10	14982	14991	0 %	80 %	0 %	20 %	387144433
13	NC_017352	CAAAT	2	10	15975	15984	60 %	20 %	0 %	20 %	387144434
14	NC_017352	TCAAT	2	10	17174	17183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017352	TAAAG	2	10	17398	17407	60 %	20 %	20 %	0 %	387144436
16	NC_017352	TTACT	2	10	17921	17930	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017352	CGTCT	2	10	18235	18244	0 %	40 %	20 %	40 %	387144437
18	NC_017352	TGTTT	2	10	18922	18931	0 %	80 %	20 %	0 %	387144438
19	NC_017352	GTTTT	2	10	20012	20021	0 %	80 %	20 %	0 %	387144438
20	NC_017352	AAATT	2	10	20456	20465	60 %	40 %	0 %	0 %	387144439
21	NC_017352	TAAAG	2	10	25194	25203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017352	AAAAG	2	10	26072	26081	80 %	0 %	20 %	0 %	387144443
23	NC_017352	TCAAG	2	10	26987	26996	40 %	20 %	20 %	20 %	387144445

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.