MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	CGG	2	6	137	142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387144421
2	NC_017352	TGA	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144421
3	NC_017352	GTC	2	6	220	225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144421
4	NC_017352	ACG	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144421
5	NC_017352	GAG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387144421
6	NC_017352	CTA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144421
7	NC_017352	TGT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144421
8	NC_017352	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017352	TAA	2	6	786	791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017352	TAT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144422
11	NC_017352	CAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144422
12	NC_017352	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144422
13	NC_017352	GGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144422
14	NC_017352	CCT	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144422
15	NC_017352	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
16	NC_017352	TCA	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144423
17	NC_017352	TAA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144423
18	NC_017352	TTC	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144423
19	NC_017352	ATG	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
20	NC_017352	TAG	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
21	NC_017352	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017352	TAA	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017352	CTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017352	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017352	TGA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017352	CCT	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017352	TAT	3	9	2540	2548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017352	GTC	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017352	AGA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017352	ATC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017352	TAA	2	6	2691	2696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017352	ATT	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017352	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017352	TAC	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017352	CTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
36	NC_017352	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144424
37	NC_017352	AAG	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
38	NC_017352	ATT	2	6	3261	3266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144424
39	NC_017352	GAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
40	NC_017352	CTT	2	6	3293	3298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
41	NC_017352	CAT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
42	NC_017352	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
43	NC_017352	AAC	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144424
44	NC_017352	GCA	2	6	3478	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144424
45	NC_017352	ATA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
46	NC_017352	TAA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
47	NC_017352	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
48	NC_017352	TCC	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017352	ATT	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017352	AAT	3	9	3710	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
51	NC_017352	ATA	2	6	3762	3767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
52	NC_017352	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
53	NC_017352	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
54	NC_017352	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
55	NC_017352	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
56	NC_017352	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
57	NC_017352	TAA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
58	NC_017352	ACA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144425
59	NC_017352	GAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144425
60	NC_017352	CCA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017352	GTG	2	6	4263	4268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017352	CAT	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017352	CGT	2	6	4627	4632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017352	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017352	TCA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017352	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017352	ACC	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017352	GGT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017352	TTC	3	9	5078	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017352	ATA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017352	ATA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017352	ATG	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
73	NC_017352	GAA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144426
74	NC_017352	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
75	NC_017352	ATT	2	6	5419	5424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144426
76	NC_017352	TAA	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
77	NC_017352	TAA	2	6	5559	5564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
78	NC_017352	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
79	NC_017352	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144426
80	NC_017352	ATG	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
81	NC_017352	TAG	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
82	NC_017352	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
83	NC_017352	TAT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017352	GAA	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017352	CAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017352	TTG	2	6	6329	6334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017352	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017352	AAG	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017352	TGT	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017352	TGG	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017352	TGA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017352	GAA	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017352	ATT	3	9	6839	6847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017352	TGA	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017352	TAT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017352	AGA	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017352	ATT	2	6	7432	7437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017352	GAC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017352	GAA	2	6	7607	7612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017352	CAT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017352	GTT	2	6	7935	7940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017352	TAT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017352	TAG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017352	TAT	2	6	8004	8009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017352	TAA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
106	NC_017352	AAT	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
107	NC_017352	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144427
108	NC_017352	TCT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
109	NC_017352	ATA	2	6	8407	8412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144427
110	NC_017352	TCT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144427
111	NC_017352	ATC	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144427
112	NC_017352	AAT	3	9	8615	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
113	NC_017352	AAT	2	6	8645	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144428
114	NC_017352	CAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144428
115	NC_017352	AAG	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144428
116	NC_017352	ATA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
117	NC_017352	TAA	2	6	9118	9123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
118	NC_017352	TAA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144429
119	NC_017352	AGC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144429
120	NC_017352	TAT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017352	AAT	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017352	TTC	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017352	CGT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017352	TTC	2	6	9451	9456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017352	ATC	3	9	9469	9477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017352	CAA	2	6	9501	9506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017352	AAG	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017352	ATT	2	6	9576	9581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017352	AAC	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017352	CAA	2	6	10189	10194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017352	TCA	2	6	10314	10319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017352	ATT	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017352	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017352	TAA	2	6	10421	10426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017352	ATT	2	6	10428	10433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017352	ATA	2	6	10513	10518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017352	TCT	2	6	10565	10570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017352	TCA	2	6	10589	10594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017352	CCA	2	6	10664	10669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017352	CGT	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017352	GAT	2	6	10756	10761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017352	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144430
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264	NC_017352	TAA	4	12	19181	19192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
265	NC_017352	GTT	2	6	19198	19203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144438
266	NC_017352	TTC	2	6	19322	19327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
267	NC_017352	ATT	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
268	NC_017352	GTT	2	6	19387	19392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144438
269	NC_017352	TAT	2	6	19579	19584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
270	NC_017352	ATA	2	6	19686	19691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
271	NC_017352	TAA	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
272	NC_017352	ATT	2	6	19916	19921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
273	NC_017352	AAT	2	6	19930	19935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
274	NC_017352	TAT	2	6	20006	20011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
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276	NC_017352	CTT	2	6	20200	20205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
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280	NC_017352	ATA	2	6	20501	20506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144439
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285	NC_017352	CCT	2	6	20828	20833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_017352	ATT	2	6	21002	21007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017352	ATG	2	6	21127	21132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017352	GAT	2	6	21182	21187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017352	GAA	2	6	21230	21235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144440
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291	NC_017352	GGT	2	6	21442	21447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144440
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295	NC_017352	GAA	3	9	21579	21587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
296	NC_017352	GAA	2	6	21732	21737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
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304	NC_017352	GCT	2	6	22341	22346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144441
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385	NC_017352	AGG	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
386	NC_017352	AGG	2	6	29571	29576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.