MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017352	T	6	6	18836	18841	0 %	100 %	0 %	0 %	387144438
502	NC_017352	T	6	6	18880	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	387144438
503	NC_017352	TTAA	2	8	18891	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
504	NC_017352	GTG	2	6	18903	18908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144438
505	NC_017352	TGTTT	2	10	18922	18931	0 %	80 %	20 %	0 %	387144438
506	NC_017352	TCT	2	6	18941	18946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
507	NC_017352	CGTG	2	8	18954	18961	0 %	25 %	50 %	25 %	387144438
508	NC_017352	AAT	2	6	18985	18990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
509	NC_017352	A	6	6	19036	19041	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
510	NC_017352	ATAC	2	8	19081	19088	50 %	25 %	0 %	25 %	387144438
511	NC_017352	TGAA	2	8	19151	19158	50 %	25 %	25 %	0 %	387144438
512	NC_017352	TAA	4	12	19181	19192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
513	NC_017352	GTT	2	6	19198	19203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144438
514	NC_017352	A	7	7	19226	19232	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
515	NC_017352	TTC	2	6	19322	19327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
516	NC_017352	ATT	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
517	NC_017352	TA	3	6	19373	19378	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
518	NC_017352	GTT	2	6	19387	19392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144438
519	NC_017352	A	6	6	19418	19423	100 %	0 %	0 %	0 %	387144438
520	NC_017352	TAT	2	6	19579	19584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
521	NC_017352	ATA	2	6	19686	19691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
522	NC_017352	AT	3	6	19732	19737	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
523	NC_017352	GA	3	6	19843	19848	50 %	0 %	50 %	0 %	387144438
524	NC_017352	TAA	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
525	NC_017352	ATT	2	6	19916	19921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
526	NC_017352	AAT	2	6	19930	19935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144438
527	NC_017352	TAT	2	6	20006	20011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
528	NC_017352	GTTTT	2	10	20012	20021	0 %	80 %	20 %	0 %	387144438
529	NC_017352	TAT	2	6	20050	20055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144438
530	NC_017352	TA	3	6	20083	20088	50 %	50 %	0 %	0 %	387144438
531	NC_017352	TTGC	2	8	20153	20160	0 %	50 %	25 %	25 %	387144438
532	NC_017352	CTT	2	6	20200	20205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144438
533	NC_017352	TTAG	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	387144438
534	NC_017352	TCC	2	6	20263	20268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144439
535	NC_017352	TAAG	2	8	20360	20367	50 %	25 %	25 %	0 %	387144439
536	NC_017352	TGC	2	6	20424	20429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144439
537	NC_017352	GAA	2	6	20443	20448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144439
538	NC_017352	AAATT	2	10	20456	20465	60 %	40 %	0 %	0 %	387144439
539	NC_017352	ATA	2	6	20501	20506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144439
540	NC_017352	TCT	2	6	20545	20550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144439
541	NC_017352	TCGT	2	8	20571	20578	0 %	50 %	25 %	25 %	387144439
542	NC_017352	TCC	2	6	20605	20610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144439
543	NC_017352	ACA	2	6	20641	20646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144439
544	NC_017352	TCC	2	6	20761	20766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144439
545	NC_017352	CCT	2	6	20828	20833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_017352	ATATAC	2	12	20834	20845	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
547	NC_017352	T	6	6	20888	20893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017352	AT	3	6	20915	20920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017352	AG	3	6	20948	20953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017352	ATT	2	6	21002	21007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017352	CGTT	2	8	21058	21065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_017352	TACT	2	8	21089	21096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017352	TTCA	2	8	21106	21113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_017352	ATG	2	6	21127	21132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017352	AAAT	2	8	21158	21165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017352	TGAA	2	8	21169	21176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017352	GAT	2	6	21182	21187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017352	AAAG	2	8	21196	21203	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
559	NC_017352	T	6	6	21216	21221	0 %	100 %	0 %	0 %	387144440
560	NC_017352	GAA	2	6	21230	21235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144440
561	NC_017352	TTAC	2	8	21330	21337	25 %	50 %	0 %	25 %	387144440
562	NC_017352	TG	3	6	21360	21365	0 %	50 %	50 %	0 %	387144440
563	NC_017352	TCA	2	6	21412	21417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144440
564	NC_017352	TACG	2	8	21420	21427	25 %	25 %	25 %	25 %	387144440
565	NC_017352	GGT	2	6	21442	21447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144440
566	NC_017352	AAG	2	6	21459	21464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144440
567	NC_017352	TGA	2	6	21490	21495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144440
568	NC_017352	ATG	2	6	21512	21517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144440
569	NC_017352	AAGA	2	8	21533	21540	75 %	0 %	25 %	0 %	387144440
570	NC_017352	GAA	3	9	21579	21587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
571	NC_017352	GAA	2	6	21732	21737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
572	NC_017352	AGA	2	6	21836	21841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
573	NC_017352	A	6	6	21858	21863	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
574	NC_017352	ACT	2	6	21887	21892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
575	NC_017352	TGA	2	6	22045	22050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144441
576	NC_017352	CAT	2	6	22073	22078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
577	NC_017352	TTG	2	6	22102	22107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144441
578	NC_017352	AAG	2	6	22198	22203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
579	NC_017352	AAT	2	6	22229	22234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144441
580	NC_017352	ATGG	2	8	22299	22306	25 %	25 %	50 %	0 %	387144441
581	NC_017352	GT	3	6	22321	22326	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
582	NC_017352	GCT	2	6	22341	22346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144441
583	NC_017352	GAT	2	6	22383	22388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144441
584	NC_017352	ACT	2	6	22421	22426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
585	NC_017352	ATT	2	6	22473	22478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144441
586	NC_017352	GC	3	6	22505	22510	0 %	0 %	50 %	50 %	387144441
587	NC_017352	GCG	2	6	22572	22577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387144441
588	NC_017352	TGG	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144441
589	NC_017352	A	6	6	22725	22730	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
590	NC_017352	GT	3	6	22732	22737	0 %	50 %	50 %	0 %	387144441
591	NC_017352	TCTA	2	8	22753	22760	25 %	50 %	0 %	25 %	387144441
592	NC_017352	GAA	2	6	22761	22766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
593	NC_017352	GAA	2	6	22863	22868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
594	NC_017352	AAT	2	6	22931	22936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144441
595	NC_017352	ATA	2	6	22954	22959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144441
596	NC_017352	GAA	2	6	22983	22988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144441
597	NC_017352	ACT	2	6	23034	23039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
598	NC_017352	ATT	2	6	23148	23153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144441
599	NC_017352	A	6	6	23161	23166	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
600	NC_017352	TCA	2	6	23234	23239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
601	NC_017352	A	7	7	23367	23373	100 %	0 %	0 %	0 %	387144441
602	NC_017352	ATG	2	6	23419	23424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144441
603	NC_017352	TGC	2	6	23435	23440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144441
604	NC_017352	GAT	2	6	23517	23522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144441
605	NC_017352	TAAG	2	8	23524	23531	50 %	25 %	25 %	0 %	387144441
606	NC_017352	AAT	2	6	23609	23614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144441
607	NC_017352	CTA	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144441
608	NC_017352	TGA	2	6	23713	23718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144441
609	NC_017352	G	6	6	23777	23782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017352	GAA	2	6	23794	23799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017352	CAG	2	6	23859	23864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017352	ATG	2	6	23983	23988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144442
613	NC_017352	TA	3	6	24044	24049	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
614	NC_017352	TCTT	2	8	24113	24120	0 %	75 %	0 %	25 %	387144442
615	NC_017352	GTTTAA	2	12	24188	24199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387144442
616	NC_017352	ATGT	2	8	24347	24354	25 %	50 %	25 %	0 %	387144442
617	NC_017352	TCA	2	6	24415	24420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144442
618	NC_017352	TAA	2	6	24433	24438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144442
619	NC_017352	T	6	6	24441	24446	0 %	100 %	0 %	0 %	387144442
620	NC_017352	TTC	2	6	24454	24459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144442
621	NC_017352	ATG	2	6	24513	24518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144442
622	NC_017352	AT	3	6	24551	24556	50 %	50 %	0 %	0 %	387144442
623	NC_017352	TAG	2	6	24583	24588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144442
624	NC_017352	AGA	2	6	24647	24652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017352	A	7	7	24828	24834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017352	A	6	6	24931	24936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017352	GTAA	2	8	24970	24977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017352	TGC	2	6	25002	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017352	A	7	7	25090	25096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017352	CTG	2	6	25118	25123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017352	GGTA	2	8	25149	25156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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