MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 plasmid p11819-97

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017350	AATT	2	8	243	250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017350	GAAA	2	8	342	349	75 %	0 %	25 %	0 %	385782933
3	NC_017350	TAAT	2	8	359	366	50 %	50 %	0 %	0 %	385782933
4	NC_017350	AAAT	2	8	722	729	75 %	25 %	0 %	0 %	385782933
5	NC_017350	TAAT	3	12	1139	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017350	TTAT	2	8	1288	1295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017350	AAAT	2	8	1305	1312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017350	CAAA	2	8	1538	1545	75 %	0 %	0 %	25 %	385782934
9	NC_017350	CATT	2	8	1911	1918	25 %	50 %	0 %	25 %	385782934
10	NC_017350	TCTT	2	8	2760	2767	0 %	75 %	0 %	25 %	385782936
11	NC_017350	ATGT	2	8	2994	3001	25 %	50 %	25 %	0 %	385782936
12	NC_017350	TATT	2	8	3349	3356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017350	TTAA	2	8	3579	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	385782937
14	NC_017350	TTTA	2	8	3668	3675	25 %	75 %	0 %	0 %	385782937
15	NC_017350	TGCT	2	8	4450	4457	0 %	50 %	25 %	25 %	385782938
16	NC_017350	AAAG	2	8	5023	5030	75 %	0 %	25 %	0 %	385782938
17	NC_017350	CATT	2	8	5166	5173	25 %	50 %	0 %	25 %	385782938
18	NC_017350	TTAA	2	8	5205	5212	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
19	NC_017350	AATT	2	8	5245	5252	50 %	50 %	0 %	0 %	385782938
20	NC_017350	AAAG	2	8	5457	5464	75 %	0 %	25 %	0 %	385782938
21	NC_017350	ATTT	2	8	5499	5506	25 %	75 %	0 %	0 %	385782938
22	NC_017350	TGGA	2	8	5745	5752	25 %	25 %	50 %	0 %	385782938
23	NC_017350	ATTT	2	8	6265	6272	25 %	75 %	0 %	0 %	385782939
24	NC_017350	TAGA	2	8	6901	6908	50 %	25 %	25 %	0 %	385782940
25	NC_017350	TAAA	2	8	7147	7154	75 %	25 %	0 %	0 %	385782940
26	NC_017350	ATAA	2	8	7285	7292	75 %	25 %	0 %	0 %	385782940
27	NC_017350	AAGA	2	8	7307	7314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017350	AAGA	2	8	7785	7792	75 %	0 %	25 %	0 %	385782941
29	NC_017350	GAAA	2	8	7834	7841	75 %	0 %	25 %	0 %	385782941
30	NC_017350	AGAC	2	8	7982	7989	50 %	0 %	25 %	25 %	385782941
31	NC_017350	CGTT	2	8	8165	8172	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017350	TACT	2	8	8196	8203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017350	TTCA	2	8	8213	8220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017350	AAAT	2	8	8265	8272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017350	TGAA	2	8	8276	8283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017350	TTAC	2	8	8437	8444	25 %	50 %	0 %	25 %	385782942
37	NC_017350	TACG	2	8	8527	8534	25 %	25 %	25 %	25 %	385782942
38	NC_017350	AAGA	2	8	8640	8647	75 %	0 %	25 %	0 %	385782942
39	NC_017350	ATGG	2	8	9406	9413	25 %	25 %	50 %	0 %	385782943
40	NC_017350	TAAG	2	8	10631	10638	50 %	25 %	25 %	0 %	385782943
41	NC_017350	TCTT	2	8	11055	11062	0 %	75 %	0 %	25 %	385782944
42	NC_017350	ATGT	2	8	11289	11296	25 %	50 %	25 %	0 %	385782944
43	NC_017350	TAAA	2	8	11814	11821	75 %	25 %	0 %	0 %	385782945
44	NC_017350	ATTA	2	8	12206	12213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017350	ATTT	2	8	12259	12266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017350	CAGA	2	8	12505	12512	50 %	0 %	25 %	25 %	385782946
47	NC_017350	ACAT	2	8	12610	12617	50 %	25 %	0 %	25 %	385782946
48	NC_017350	TAAA	2	8	13512	13519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017350	CAAA	2	8	14215	14222	75 %	0 %	0 %	25 %	385782947
50	NC_017350	TACT	2	8	14882	14889	25 %	50 %	0 %	25 %	385782948
51	NC_017350	CATT	2	8	15189	15196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017350	GTTG	2	8	15367	15374	0 %	50 %	50 %	0 %	385782949
53	NC_017350	TTTG	2	8	15379	15386	0 %	75 %	25 %	0 %	385782949
54	NC_017350	TCTT	2	8	15486	15493	0 %	75 %	0 %	25 %	385782949
55	NC_017350	TTTA	2	8	15567	15574	25 %	75 %	0 %	0 %	385782949
56	NC_017350	TAAT	2	8	15856	15863	50 %	50 %	0 %	0 %	385782949
57	NC_017350	GTTT	2	8	15916	15923	0 %	75 %	25 %	0 %	385782949
58	NC_017350	GTTT	2	8	16276	16283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017350	ATCT	2	8	16309	16316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017350	TATG	2	8	16521	16528	25 %	50 %	25 %	0 %	385782950
61	NC_017350	ATCC	2	8	16554	16561	25 %	25 %	0 %	50 %	385782950
62	NC_017350	AATG	2	8	16564	16571	50 %	25 %	25 %	0 %	385782950
63	NC_017350	TATT	2	8	16732	16739	25 %	75 %	0 %	0 %	385782950
64	NC_017350	AACT	2	8	16940	16947	50 %	25 %	0 %	25 %	385782950
65	NC_017350	GATT	2	8	17342	17349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017350	TCTT	2	8	17800	17807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017350	ATTT	2	8	17842	17849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017350	GAAA	2	8	17862	17869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017350	AAGT	2	8	17933	17940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017350	TTAA	2	8	18826	18833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017350	AAAG	2	8	18928	18935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017350	TGAT	2	8	19036	19043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017350	ATGA	2	8	19182	19189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017350	GAAG	2	8	19451	19458	50 %	0 %	50 %	0 %	385782952
75	NC_017350	AGAA	2	8	19465	19472	75 %	0 %	25 %	0 %	385782952
76	NC_017350	AAGA	2	8	19948	19955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017350	AGAT	2	8	20133	20140	50 %	25 %	25 %	0 %	385782953
78	NC_017350	GATT	2	8	20345	20352	25 %	50 %	25 %	0 %	385782953
79	NC_017350	TTTG	2	8	20490	20497	0 %	75 %	25 %	0 %	385782953
80	NC_017350	TTTA	2	8	20640	20647	25 %	75 %	0 %	0 %	385782953
81	NC_017350	TAAT	2	8	21008	21015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017350	AACA	2	8	21526	21533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017350	AACA	2	8	21672	21679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017350	TGTA	2	8	21800	21807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017350	TAGT	2	8	21871	21878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017350	AATA	2	8	21965	21972	75 %	25 %	0 %	0 %	385782955
87	NC_017350	CAAA	2	8	22047	22054	75 %	0 %	0 %	25 %	385782955
88	NC_017350	ATTT	2	8	22082	22089	25 %	75 %	0 %	0 %	385782955

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.