MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH02

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017344	ACCT	2	8	212	219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017344	TTTG	2	8	404	411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017344	TTTA	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017344	GCTA	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017344	AGTA	2	8	1938	1945	50 %	25 %	25 %	0 %	384863366
6	NC_017344	TTCA	2	8	2061	2068	25 %	50 %	0 %	25 %	384863366
7	NC_017344	ACTA	2	8	2205	2212	50 %	25 %	0 %	25 %	384863366
8	NC_017344	AAAT	2	8	2791	2798	75 %	25 %	0 %	0 %	384863368
9	NC_017344	TAAA	2	8	3125	3132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017344	TACA	2	8	3417	3424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017344	TCAT	2	8	4397	4404	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
12	NC_017344	TCTA	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
13	NC_017344	CATT	2	8	4760	4767	25 %	50 %	0 %	25 %	384863371
14	NC_017344	TGGA	2	8	4769	4776	25 %	25 %	50 %	0 %	384863371
15	NC_017344	CATA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	0 %	25 %	384863371
16	NC_017344	AAAC	2	8	5412	5419	75 %	0 %	0 %	25 %	384863372
17	NC_017344	AATT	2	8	5471	5478	50 %	50 %	0 %	0 %	384863372
18	NC_017344	AAGA	2	8	5523	5530	75 %	0 %	25 %	0 %	384863372
19	NC_017344	TAAA	2	8	5761	5768	75 %	25 %	0 %	0 %	384863372
20	NC_017344	GTTT	2	8	6124	6131	0 %	75 %	25 %	0 %	384863372
21	NC_017344	TAAT	2	8	6143	6150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017344	GTTG	2	8	6308	6315	0 %	50 %	50 %	0 %	384863373
23	NC_017344	AGAA	2	8	6532	6539	75 %	0 %	25 %	0 %	384863373
24	NC_017344	TGTA	2	8	7020	7027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017344	TTTG	2	8	7346	7353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017344	ATTC	2	8	8092	8099	25 %	50 %	0 %	25 %	384863375
27	NC_017344	GGTA	2	8	8614	8621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017344	GATT	2	8	8999	9006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017344	AATA	2	8	9283	9290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017344	TTGA	2	8	9326	9333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017344	ATAA	2	8	9338	9345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017344	ATTT	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017344	TTAT	2	8	9571	9578	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
34	NC_017344	TTCA	2	8	9690	9697	25 %	50 %	0 %	25 %	384863376
35	NC_017344	TATG	2	8	9711	9718	25 %	50 %	25 %	0 %	384863376
36	NC_017344	AATT	2	8	9851	9858	50 %	50 %	0 %	0 %	384863376
37	NC_017344	TTTA	2	8	10046	10053	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
38	NC_017344	TTTA	2	8	10194	10201	25 %	75 %	0 %	0 %	384863376
39	NC_017344	TTAA	2	8	10459	10466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017344	ATTT	2	8	10520	10527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017344	TAGT	2	8	10961	10968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017344	AGTA	2	8	12221	12228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017344	CGTT	2	8	12393	12400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017344	CTTT	2	8	12571	12578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017344	AAAT	2	8	12787	12794	75 %	25 %	0 %	0 %	384863378
46	NC_017344	CTTG	2	8	12905	12912	0 %	50 %	25 %	25 %	384863378
47	NC_017344	CTAT	2	8	13076	13083	25 %	50 %	0 %	25 %	384863378
48	NC_017344	TTCT	2	8	13351	13358	0 %	75 %	0 %	25 %	384863378
49	NC_017344	TCCT	2	8	13646	13653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017344	TATT	2	8	13879	13886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017344	AAAT	2	8	13899	13906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017344	TTAG	2	8	14101	14108	25 %	50 %	25 %	0 %	384863379
53	NC_017344	GTAA	2	8	14218	14225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017344	ATTT	2	8	14242	14249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017344	CAGC	2	8	14304	14311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017344	ATGT	2	8	14739	14746	25 %	50 %	25 %	0 %	384863380
57	NC_017344	GTTA	2	8	15004	15011	25 %	50 %	25 %	0 %	384863380
58	NC_017344	ATTT	2	8	15014	15021	25 %	75 %	0 %	0 %	384863380
59	NC_017344	ATTC	2	8	15659	15666	25 %	50 %	0 %	25 %	384863381
60	NC_017344	TTTA	2	8	16017	16024	25 %	75 %	0 %	0 %	384863381
61	NC_017344	ATAA	2	8	16058	16065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017344	TAAT	2	8	16401	16408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017344	CATT	2	8	16687	16694	25 %	50 %	0 %	25 %	384863382
64	NC_017344	AATT	2	8	16755	16762	50 %	50 %	0 %	0 %	384863382
65	NC_017344	ATTC	2	8	17112	17119	25 %	50 %	0 %	25 %	384863382
66	NC_017344	ATAA	2	8	17468	17475	75 %	25 %	0 %	0 %	384863382
67	NC_017344	TAAC	2	8	17500	17507	50 %	25 %	0 %	25 %	384863382
68	NC_017344	CTGT	2	8	18480	18487	0 %	50 %	25 %	25 %	384863385
69	NC_017344	TTCA	2	8	18760	18767	25 %	50 %	0 %	25 %	384863385
70	NC_017344	TAAT	2	8	19068	19075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017344	TCTT	2	8	19158	19165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017344	TTTA	2	8	19318	19325	25 %	75 %	0 %	0 %	384863386
73	NC_017344	TCTA	2	8	19564	19571	25 %	50 %	0 %	25 %	384863386
74	NC_017344	AAAT	2	8	20200	20207	75 %	25 %	0 %	0 %	384863387
75	NC_017344	TCCA	2	8	20720	20727	25 %	25 %	0 %	50 %	384863388
76	NC_017344	TAAA	2	8	20965	20972	75 %	25 %	0 %	0 %	384863388
77	NC_017344	CTTT	2	8	21008	21015	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
78	NC_017344	TCTT	2	8	21038	21045	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
79	NC_017344	AATT	2	8	21220	21227	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
80	NC_017344	ATTA	2	8	21259	21266	50 %	50 %	0 %	0 %	384863388
81	NC_017344	AATG	2	8	21299	21306	50 %	25 %	25 %	0 %	384863388
82	NC_017344	TCTT	2	8	21441	21448	0 %	75 %	0 %	25 %	384863388
83	NC_017344	ACTT	2	8	21930	21937	25 %	50 %	0 %	25 %	384863388
84	NC_017344	AGCA	2	8	22015	22022	50 %	0 %	25 %	25 %	384863388
85	NC_017344	TAAA	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	384863389
86	NC_017344	TAAA	2	8	22797	22804	75 %	25 %	0 %	0 %	384863389
87	NC_017344	TTAA	2	8	22886	22893	50 %	50 %	0 %	0 %	384863389
88	NC_017344	ATTT	2	8	23207	23214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017344	ATAA	2	8	23262	23269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017344	ACAA	2	8	23388	23395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017344	TAAT	2	8	23448	23455	50 %	50 %	0 %	0 %	384863390
92	NC_017344	TAAA	2	8	23660	23667	75 %	25 %	0 %	0 %	384863390
93	NC_017344	CTTA	2	8	24148	24155	25 %	50 %	0 %	25 %	384863390
94	NC_017344	TTTA	2	8	24163	24170	25 %	75 %	0 %	0 %	384863390
95	NC_017344	TCTT	2	8	24238	24245	0 %	75 %	0 %	25 %	384863390
96	NC_017344	CATA	2	8	24415	24422	50 %	25 %	0 %	25 %	384863390
97	NC_017344	TAAT	2	8	24621	24628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017344	CTTT	3	12	24651	24662	0 %	75 %	0 %	25 %	384863391
99	NC_017344	TAAT	2	8	25156	25163	50 %	50 %	0 %	0 %	384863391
100	NC_017344	TAAA	2	8	25178	25185	75 %	25 %	0 %	0 %	384863391
101	NC_017344	TCTT	2	8	25888	25895	0 %	75 %	0 %	25 %	384863392
102	NC_017344	ATTT	2	8	26690	26697	25 %	75 %	0 %	0 %	384863393
103	NC_017344	TTTA	2	8	26882	26889	25 %	75 %	0 %	0 %	384863393

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.