MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017342	TGC	2	6	172064	172069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866049
4002	NC_017342	ACAT	2	8	172095	172102	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
4003	NC_017342	CAAT	2	8	172149	172156	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
4004	NC_017342	ATC	2	6	172222	172227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866049
4005	NC_017342	GAA	2	6	172275	172280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866049
4006	NC_017342	ATT	2	6	172286	172291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866049
4007	NC_017342	ATCA	2	8	172371	172378	50 %	25 %	0 %	25 %	384866049
4008	NC_017342	AAC	2	6	172423	172428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866049
4009	NC_017342	CAT	2	6	172487	172492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866049
4010	NC_017342	TAAA	2	8	172495	172502	75 %	25 %	0 %	0 %	384866049
4011	NC_017342	ATG	2	6	172555	172560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866049
4012	NC_017342	AT	3	6	172619	172624	50 %	50 %	0 %	0 %	384866049
4013	NC_017342	CA	3	6	172636	172641	50 %	0 %	0 %	50 %	384866049
4014	NC_017342	ATT	2	6	172716	172721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866049
4015	NC_017342	GTA	2	6	172726	172731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866049
4016	NC_017342	ACC	2	6	172774	172779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866049
4017	NC_017342	ACA	2	6	172877	172882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866049
4018	NC_017342	AGG	2	6	172903	172908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384866049
4019	NC_017342	TAA	2	6	172911	172916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866049
4020	NC_017342	CAA	2	6	172937	172942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866050
4021	NC_017342	CAT	2	6	172947	172952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866050
4022	NC_017342	TAC	2	6	173009	173014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866050
4023	NC_017342	ATT	2	6	173023	173028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866050
4024	NC_017342	TGAT	2	8	173051	173058	25 %	50 %	25 %	0 %	384866050
4025	NC_017342	ATTGCA	2	12	173101	173112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384866050
4026	NC_017342	TGA	2	6	173187	173192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866050
4027	NC_017342	CAA	2	6	173315	173320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866050
4028	NC_017342	TAG	2	6	173373	173378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866051
4029	NC_017342	AGT	2	6	173399	173404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866051
4030	NC_017342	AAG	2	6	173427	173432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866051
4031	NC_017342	ATA	2	6	173577	173582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866051
4032	NC_017342	ACA	2	6	173602	173607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866051
4033	NC_017342	ACA	2	6	173626	173631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866051
4034	NC_017342	AGG	2	6	173648	173653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017342	GCAA	2	8	173664	173671	50 %	0 %	25 %	25 %	384866052
4036	NC_017342	TTG	2	6	173714	173719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866052
4037	NC_017342	A	6	6	173752	173757	100 %	0 %	0 %	0 %	384866052
4038	NC_017342	CAA	2	6	173765	173770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866052
4039	NC_017342	CTT	2	6	173802	173807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866052
4040	NC_017342	GTC	2	6	173830	173835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866052
4041	NC_017342	AAC	2	6	173902	173907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866052
4042	NC_017342	AAC	2	6	173943	173948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866052
4043	NC_017342	TCA	2	6	173957	173962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866052
4044	NC_017342	AT	3	6	174015	174020	50 %	50 %	0 %	0 %	384866052
4045	NC_017342	TCA	2	6	174033	174038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866052
4046	NC_017342	CAGT	2	8	174077	174084	25 %	25 %	25 %	25 %	384866052
4047	NC_017342	GGCT	2	8	174094	174101	0 %	25 %	50 %	25 %	384866052
4048	NC_017342	ATT	2	6	174255	174260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866052
4049	NC_017342	TTACT	2	10	174355	174364	20 %	60 %	0 %	20 %	384866052
4050	NC_017342	GTTA	2	8	174388	174395	25 %	50 %	25 %	0 %	384866052
4051	NC_017342	TGC	2	6	174462	174467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866052
4052	NC_017342	TATT	2	8	174473	174480	25 %	75 %	0 %	0 %	384866052
4053	NC_017342	TTA	2	6	174635	174640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866052
4054	NC_017342	TCTTAT	2	12	174662	174673	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866052
4055	NC_017342	TGG	2	6	174675	174680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866052
4056	NC_017342	CGT	2	6	174681	174686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866052
4057	NC_017342	CTT	3	9	174711	174719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866052
4058	NC_017342	GCT	2	6	174730	174735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866052
4059	NC_017342	TAA	2	6	174800	174805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866052
4060	NC_017342	ATT	3	9	174816	174824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866052
4061	NC_017342	GGT	2	6	174847	174852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866052
4062	NC_017342	CAA	2	6	174857	174862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866052
4063	NC_017342	AT	3	6	174918	174923	50 %	50 %	0 %	0 %	384866052
4064	NC_017342	ATT	2	6	174927	174932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866052
4065	NC_017342	TATT	2	8	174944	174951	25 %	75 %	0 %	0 %	384866052
4066	NC_017342	TTA	2	6	174976	174981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866052
4067	NC_017342	GTC	2	6	174986	174991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866052
4068	NC_017342	ACTT	2	8	175076	175083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_017342	TAT	2	6	175100	175105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866053
4070	NC_017342	TGC	2	6	175135	175140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866053
4071	NC_017342	CTT	3	9	175149	175157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866053
4072	NC_017342	CCAA	2	8	175174	175181	50 %	0 %	0 %	50 %	384866053
4073	NC_017342	CGTT	2	8	175196	175203	0 %	50 %	25 %	25 %	384866053
4074	NC_017342	TAA	2	6	175225	175230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866053
4075	NC_017342	CTT	2	6	175239	175244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866053
4076	NC_017342	TGA	2	6	175250	175255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866053
4077	NC_017342	T	6	6	175294	175299	0 %	100 %	0 %	0 %	384866053
4078	NC_017342	TAAT	2	8	175338	175345	50 %	50 %	0 %	0 %	384866053
4079	NC_017342	TC	3	6	175448	175453	0 %	50 %	0 %	50 %	384866053
4080	NC_017342	CAA	2	6	175458	175463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866053
4081	NC_017342	TAA	2	6	175516	175521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866053
4082	NC_017342	ATG	2	6	175551	175556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866053
4083	NC_017342	GATT	2	8	175575	175582	25 %	50 %	25 %	0 %	384866053
4084	NC_017342	CAA	2	6	175614	175619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866053
4085	NC_017342	GCT	2	6	175628	175633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866053
4086	NC_017342	TTA	2	6	175727	175732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866053
4087	NC_017342	TGT	2	6	175787	175792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866053
4088	NC_017342	TCG	2	6	176031	176036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866053
4089	NC_017342	TAA	2	6	176059	176064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866053
4090	NC_017342	AAT	2	6	176071	176076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866053
4091	NC_017342	CAA	2	6	176085	176090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866053
4092	NC_017342	ACC	2	6	176098	176103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866053
4093	NC_017342	TAT	2	6	176118	176123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866053
4094	NC_017342	TCA	2	6	176124	176129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866053
4095	NC_017342	ATT	2	6	176155	176160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017342	TA	3	6	176188	176193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017342	TAT	2	6	176210	176215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017342	AAATGA	2	12	176232	176243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017342	TAA	2	6	176293	176298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017342	ATG	2	6	176316	176321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017342	ATC	2	6	176453	176458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866054
4102	NC_017342	ATA	2	6	176491	176496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866054
4103	NC_017342	TCT	2	6	176531	176536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866054
4104	NC_017342	TGA	2	6	176665	176670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866054
4105	NC_017342	TTC	2	6	176752	176757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866054
4106	NC_017342	TTC	2	6	176851	176856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866054
4107	NC_017342	GCAC	2	8	176912	176919	25 %	0 %	25 %	50 %	384866054
4108	NC_017342	GCG	2	6	177044	177049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384866054
4109	NC_017342	T	6	6	177058	177063	0 %	100 %	0 %	0 %	384866054
4110	NC_017342	ACA	2	6	177193	177198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866054
4111	NC_017342	CCA	3	9	177233	177241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866054
4112	NC_017342	ACT	2	6	177254	177259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866054
4113	NC_017342	TA	3	6	177277	177282	50 %	50 %	0 %	0 %	384866054
4114	NC_017342	AAT	2	6	177342	177347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866054
4115	NC_017342	AT	3	6	177428	177433	50 %	50 %	0 %	0 %	384866054
4116	NC_017342	TC	3	6	177472	177477	0 %	50 %	0 %	50 %	384866055
4117	NC_017342	TGT	2	6	177481	177486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866055
4118	NC_017342	TGT	2	6	177518	177523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866055
4119	NC_017342	TTGAA	2	10	177566	177575	40 %	40 %	20 %	0 %	384866055
4120	NC_017342	CATTTT	2	12	177619	177630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384866055
4121	NC_017342	GTA	2	6	177672	177677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866055
4122	NC_017342	CCAATT	2	12	177681	177692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866055
4123	NC_017342	ACA	2	6	177700	177705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866055
4124	NC_017342	ATC	2	6	177710	177715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866055
4125	NC_017342	ATC	2	6	177843	177848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866055
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4128	NC_017342	ATC	2	6	177899	177904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866055
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4130	NC_017342	TA	3	6	177950	177955	50 %	50 %	0 %	0 %	384866055
4131	NC_017342	TCATA	2	10	177982	177991	40 %	40 %	0 %	20 %	384866055
4132	NC_017342	CAG	2	6	177994	177999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866055
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4140	NC_017342	CTG	2	6	178505	178510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866056
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4143	NC_017342	TTG	2	6	178746	178751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866056
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4161	NC_017342	ATCTT	2	10	179509	179518	20 %	60 %	0 %	20 %	384866057
4162	NC_017342	TCT	2	6	179528	179533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4187	NC_017342	ATTCT	2	10	180764	180773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4190	NC_017342	CAAT	2	8	180877	180884	50 %	25 %	0 %	25 %	384866059
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4233	NC_017342	ATC	2	6	182981	182986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4236	NC_017342	TTA	2	6	183028	183033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_017342	TAG	2	6	183151	183156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_017342	GAT	2	6	183570	183575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866061
4245	NC_017342	TGT	2	6	183622	183627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866061
4246	NC_017342	GCA	2	6	183663	183668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866061
4247	NC_017342	TA	3	6	183710	183715	50 %	50 %	0 %	0 %	384866061
4248	NC_017342	GCT	2	6	183855	183860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866061
4249	NC_017342	TGT	2	6	183887	183892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866061
4250	NC_017342	ACC	2	6	183917	183922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866061
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4259	NC_017342	TTC	2	6	184250	184255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866061
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4261	NC_017342	AAT	2	6	184282	184287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866061
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4264	NC_017342	CTG	3	9	184408	184416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866061
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4274	NC_017342	CAT	2	6	184777	184782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866061
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4281	NC_017342	CAA	2	6	185182	185187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4282	NC_017342	ATACT	2	10	185235	185244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4283	NC_017342	TTCT	2	8	185245	185252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4284	NC_017342	T	7	7	185288	185294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_017342	AT	3	6	185344	185349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4286	NC_017342	T	6	6	185352	185357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4287	NC_017342	TAA	2	6	185375	185380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_017342	TAA	2	6	185386	185391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_017342	ATT	2	6	185413	185418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4290	NC_017342	AAT	2	6	185439	185444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4291	NC_017342	CAACA	2	10	185474	185483	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4293	NC_017342	TA	3	6	185511	185516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4294	NC_017342	TA	4	8	185526	185533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_017342	AAT	2	6	185559	185564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4296	NC_017342	CAT	2	6	185641	185646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866062
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4303	NC_017342	TTTG	2	8	186036	186043	0 %	75 %	25 %	0 %	384866062
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4319	NC_017342	CATT	2	8	186674	186681	25 %	50 %	0 %	25 %	384866062
4320	NC_017342	TTGGC	2	10	186684	186693	0 %	40 %	40 %	20 %	384866062
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4322	NC_017342	GTC	2	6	186829	186834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866062
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4327	NC_017342	CATT	2	8	187052	187059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4328	NC_017342	TAAT	2	8	187087	187094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4336	NC_017342	CAATG	2	10	187515	187524	40 %	20 %	20 %	20 %	384866063
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4343	NC_017342	AT	3	6	187839	187844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_017342	AT	3	6	187895	187900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_017342	ATTT	2	8	187967	187974	25 %	75 %	0 %	0 %	384866064
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4352	NC_017342	TAT	2	6	188341	188346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866064
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4366	NC_017342	T	6	6	188828	188833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_017342	CTT	2	6	188861	188866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4368	NC_017342	GTTG	2	8	188892	188899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_017342	AAC	2	6	188944	188949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4371	NC_017342	CTT	2	6	188997	189002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4372	NC_017342	CAT	2	6	189008	189013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866065
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4493	NC_017342	GCA	2	6	194391	194396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866069
4494	NC_017342	ATC	2	6	194400	194405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866069
4495	NC_017342	GTC	2	6	194406	194411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866069
4496	NC_017342	AGT	2	6	194417	194422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866069
4497	NC_017342	CAA	2	6	194443	194448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866069
4498	NC_017342	AATTTT	2	12	194528	194539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
4499	NC_017342	ATT	2	6	194576	194581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866069
4500	NC_017342	TGT	2	6	194600	194605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866069

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