MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017342	AAC	2	6	149807	149812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866025
3502	NC_017342	TTG	2	6	149886	149891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866025
3503	NC_017342	ACA	3	9	149959	149967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866025
3504	NC_017342	GAA	2	6	150008	150013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866025
3505	NC_017342	A	6	6	150073	150078	100 %	0 %	0 %	0 %	384866025
3506	NC_017342	TTA	2	6	150134	150139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866025
3507	NC_017342	CAT	2	6	150172	150177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866025
3508	NC_017342	TAAT	2	8	150306	150313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017342	TGT	2	6	150316	150321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017342	TTA	2	6	150336	150341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866026
3511	NC_017342	CCA	2	6	150379	150384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866026
3512	NC_017342	ATG	2	6	150392	150397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866026
3513	NC_017342	TCA	2	6	150415	150420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866026
3514	NC_017342	AAT	2	6	150433	150438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866026
3515	NC_017342	AGG	2	6	150516	150521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384866026
3516	NC_017342	TGC	2	6	150555	150560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3517	NC_017342	T	6	6	150603	150608	0 %	100 %	0 %	0 %	384866026
3518	NC_017342	ATA	2	6	150655	150660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866026
3519	NC_017342	TCT	2	6	150733	150738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866026
3520	NC_017342	CAT	2	6	150750	150755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866026
3521	NC_017342	GCA	2	6	150757	150762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3522	NC_017342	CAT	2	6	150764	150769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866026
3523	NC_017342	CTG	2	6	150788	150793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3524	NC_017342	T	6	6	150807	150812	0 %	100 %	0 %	0 %	384866026
3525	NC_017342	TGT	2	6	150970	150975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866026
3526	NC_017342	TTC	2	6	150999	151004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866026
3527	NC_017342	CTA	2	6	151025	151030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866026
3528	NC_017342	CAG	2	6	151037	151042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3529	NC_017342	CAT	2	6	151082	151087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866026
3530	NC_017342	ATTG	2	8	151105	151112	25 %	50 %	25 %	0 %	384866026
3531	NC_017342	TGT	2	6	151139	151144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866026
3532	NC_017342	AGC	2	6	151311	151316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3533	NC_017342	TGTCCT	2	12	151333	151344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384866026
3534	NC_017342	GTA	2	6	151349	151354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866026
3535	NC_017342	GAT	2	6	151362	151367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866026
3536	NC_017342	TAA	2	6	151406	151411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866026
3537	NC_017342	TGC	3	9	151494	151502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866026
3538	NC_017342	GTCAT	2	10	151516	151525	20 %	40 %	20 %	20 %	384866026
3539	NC_017342	AT	3	6	151541	151546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017342	TTA	2	6	151553	151558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017342	ATG	2	6	151668	151673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017342	TTTG	2	8	151677	151684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017342	ATC	2	6	151742	151747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017342	CTAT	2	8	151827	151834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_017342	CCT	2	6	151961	151966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_017342	A	6	6	152002	152007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017342	ATTA	2	8	152027	152034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017342	GTT	2	6	152116	152121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866027
3549	NC_017342	A	6	6	152151	152156	100 %	0 %	0 %	0 %	384866027
3550	NC_017342	AAC	2	6	152173	152178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866027
3551	NC_017342	ATTT	2	8	152202	152209	25 %	75 %	0 %	0 %	384866027
3552	NC_017342	TCA	2	6	152254	152259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866027
3553	NC_017342	T	6	6	152264	152269	0 %	100 %	0 %	0 %	384866027
3554	NC_017342	ATG	2	6	152312	152317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866027
3555	NC_017342	TTC	2	6	152378	152383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866027
3556	NC_017342	TTC	2	6	152387	152392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866027
3557	NC_017342	TATT	2	8	152432	152439	25 %	75 %	0 %	0 %	384866027
3558	NC_017342	GATTA	2	10	152454	152463	40 %	40 %	20 %	0 %	384866027
3559	NC_017342	TAC	2	6	152538	152543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866027
3560	NC_017342	TAT	2	6	152625	152630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866027
3561	NC_017342	ATG	2	6	152642	152647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866027
3562	NC_017342	TAG	2	6	152652	152657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866027
3563	NC_017342	ATC	2	6	152681	152686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866027
3564	NC_017342	TGGT	2	8	152700	152707	0 %	50 %	50 %	0 %	384866027
3565	NC_017342	TCA	2	6	152717	152722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866027
3566	NC_017342	TA	3	6	152750	152755	50 %	50 %	0 %	0 %	384866027
3567	NC_017342	TTA	2	6	152864	152869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866027
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3569	NC_017342	TAAAT	2	10	152923	152932	60 %	40 %	0 %	0 %	384866027
3570	NC_017342	ATG	2	6	152951	152956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866027
3571	NC_017342	TTTA	2	8	153085	153092	25 %	75 %	0 %	0 %	384866027
3572	NC_017342	ATTT	2	8	153152	153159	25 %	75 %	0 %	0 %	384866027
3573	NC_017342	TAA	2	6	153178	153183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866027
3574	NC_017342	AATA	2	8	153189	153196	75 %	25 %	0 %	0 %	384866027
3575	NC_017342	ATC	2	6	153330	153335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_017342	ATAA	2	8	153347	153354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017342	AT	3	6	153356	153361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017342	AAT	2	6	153388	153393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017342	ACC	2	6	153408	153413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_017342	AAAT	2	8	153421	153428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017342	ATT	2	6	153525	153530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017342	TTGT	2	8	153571	153578	0 %	75 %	25 %	0 %	384866028
3583	NC_017342	AT	3	6	153597	153602	50 %	50 %	0 %	0 %	384866028
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3587	NC_017342	ACCAT	2	10	153704	153713	40 %	20 %	0 %	40 %	384866028
3588	NC_017342	AT	3	6	153712	153717	50 %	50 %	0 %	0 %	384866028
3589	NC_017342	GAAA	2	8	153733	153740	75 %	0 %	25 %	0 %	384866028
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3593	NC_017342	TAAA	2	8	153937	153944	75 %	25 %	0 %	0 %	384866028
3594	NC_017342	ATA	2	6	153997	154002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866028
3595	NC_017342	CATC	2	8	154003	154010	25 %	25 %	0 %	50 %	384866028
3596	NC_017342	TCA	2	6	154080	154085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866028
3597	NC_017342	AT	3	6	154139	154144	50 %	50 %	0 %	0 %	384866028
3598	NC_017342	ACT	2	6	154168	154173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866028
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3604	NC_017342	CAT	2	6	154586	154591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866029
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3607	NC_017342	CAT	2	6	154814	154819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866029
3608	NC_017342	TTC	2	6	154830	154835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866029
3609	NC_017342	A	6	6	154839	154844	100 %	0 %	0 %	0 %	384866029
3610	NC_017342	TAC	2	6	154850	154855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866029
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3612	NC_017342	ATTA	2	8	154887	154894	50 %	50 %	0 %	0 %	384866029
3613	NC_017342	TTGT	2	8	154995	155002	0 %	75 %	25 %	0 %	384866029
3614	NC_017342	TGT	2	6	155025	155030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866029
3615	NC_017342	CTC	2	6	155041	155046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_017342	TTTAAT	2	12	155051	155062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866030
3617	NC_017342	TCT	2	6	155070	155075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866030
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3619	NC_017342	TA	3	6	155099	155104	50 %	50 %	0 %	0 %	384866030
3620	NC_017342	AAT	2	6	155178	155183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866030
3621	NC_017342	AATT	2	8	155232	155239	50 %	50 %	0 %	0 %	384866030
3622	NC_017342	ATC	2	6	155316	155321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866030
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3624	NC_017342	A	6	6	155370	155375	100 %	0 %	0 %	0 %	384866030
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3866	NC_017342	ACTT	2	8	165653	165660	25 %	50 %	0 %	25 %	384866043
3867	NC_017342	CATA	2	8	165767	165774	50 %	25 %	0 %	25 %	384866044
3868	NC_017342	GTT	3	9	165842	165850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866044
3869	NC_017342	TCAT	2	8	165877	165884	25 %	50 %	0 %	25 %	384866044
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3997	NC_017342	ACA	2	6	171904	171909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866049
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3999	NC_017342	AAG	2	6	171994	171999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866049
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