MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017342	TGAT	2	8	128144	128151	25 %	50 %	25 %	0 %	384866001
3002	NC_017342	GAA	2	6	128167	128172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866001
3003	NC_017342	CAT	2	6	128181	128186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866001
3004	NC_017342	CTG	2	6	128195	128200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866001
3005	NC_017342	GAA	2	6	128215	128220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866001
3006	NC_017342	ATG	2	6	128309	128314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866001
3007	NC_017342	TGG	3	9	128325	128333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866001
3008	NC_017342	CTG	2	6	128426	128431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866001
3009	NC_017342	AAC	2	6	128460	128465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866001
3010	NC_017342	TCT	2	6	128479	128484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866001
3011	NC_017342	AGC	2	6	128490	128495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866001
3012	NC_017342	ATT	2	6	128617	128622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866001
3013	NC_017342	TAA	2	6	128676	128681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866001
3014	NC_017342	AGC	2	6	128769	128774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866001
3015	NC_017342	ATT	2	6	128808	128813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866001
3016	NC_017342	ACT	2	6	128902	128907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866001
3017	NC_017342	GAA	2	6	128965	128970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866001
3018	NC_017342	ACTTA	2	10	128976	128985	40 %	40 %	0 %	20 %	384866001
3019	NC_017342	CAT	2	6	129023	129028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866001
3020	NC_017342	GTG	2	6	129059	129064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866001
3021	NC_017342	AAT	2	6	129085	129090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866001
3022	NC_017342	TGC	2	6	129111	129116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866001
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3025	NC_017342	ATT	3	9	129148	129156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866001
3026	NC_017342	GCA	2	6	129178	129183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866001
3027	NC_017342	TAT	2	6	129201	129206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866001
3028	NC_017342	TCAT	2	8	129221	129228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_017342	T	7	7	129267	129273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017342	AT	3	6	129307	129312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017342	TA	3	6	129348	129353	50 %	50 %	0 %	0 %	384866002
3032	NC_017342	ATGC	2	8	129371	129378	25 %	25 %	25 %	25 %	384866002
3033	NC_017342	AAG	2	6	129404	129409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866002
3034	NC_017342	TAAA	2	8	129533	129540	75 %	25 %	0 %	0 %	384866002
3035	NC_017342	ATC	2	6	129569	129574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866002
3036	NC_017342	ATTT	2	8	129620	129627	25 %	75 %	0 %	0 %	384866002
3037	NC_017342	GAA	2	6	129712	129717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866002
3038	NC_017342	ACA	2	6	129732	129737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866002
3039	NC_017342	GCAG	2	8	129809	129816	25 %	0 %	50 %	25 %	384866002
3040	NC_017342	ACAA	2	8	129845	129852	75 %	0 %	0 %	25 %	384866002
3041	NC_017342	TTG	2	6	129857	129862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866002
3042	NC_017342	AATT	2	8	129863	129870	50 %	50 %	0 %	0 %	384866002
3043	NC_017342	AAT	3	9	129886	129894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866002
3044	NC_017342	CAT	2	6	129897	129902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866002
3045	NC_017342	TAC	2	6	129921	129926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866002
3046	NC_017342	TTCT	2	8	129944	129951	0 %	75 %	0 %	25 %	384866002
3047	NC_017342	TAA	2	6	130019	130024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866002
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3049	NC_017342	ATG	2	6	130097	130102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866002
3050	NC_017342	TGA	2	6	130176	130181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866002
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3052	NC_017342	A	6	6	130366	130371	100 %	0 %	0 %	0 %	384866002
3053	NC_017342	TAT	2	6	130389	130394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866002
3054	NC_017342	ATC	2	6	130433	130438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866002
3055	NC_017342	CA	3	6	130449	130454	50 %	0 %	0 %	50 %	384866002
3056	NC_017342	AGA	2	6	130482	130487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866002
3057	NC_017342	TATAT	2	10	130526	130535	40 %	60 %	0 %	0 %	384866002
3058	NC_017342	TGT	2	6	130572	130577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866002
3059	NC_017342	TGA	2	6	130608	130613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866002
3060	NC_017342	TAT	2	6	130651	130656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866002
3061	NC_017342	CAAA	2	8	130716	130723	75 %	0 %	0 %	25 %	384866002
3062	NC_017342	TGAA	2	8	130760	130767	50 %	25 %	25 %	0 %	384866002
3063	NC_017342	TTAT	2	8	130825	130832	25 %	75 %	0 %	0 %	384866002
3064	NC_017342	AAC	2	6	130849	130854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866002
3065	NC_017342	ACG	2	6	130862	130867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866002
3066	NC_017342	ATT	2	6	130869	130874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866002
3067	NC_017342	T	6	6	130983	130988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017342	TAC	2	6	131036	131041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866003
3069	NC_017342	ATC	2	6	131108	131113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866003
3070	NC_017342	A	6	6	131149	131154	100 %	0 %	0 %	0 %	384866003
3071	NC_017342	AAGC	2	8	131218	131225	50 %	0 %	25 %	25 %	384866003
3072	NC_017342	AT	3	6	131271	131276	50 %	50 %	0 %	0 %	384866003
3073	NC_017342	CAAA	2	8	131311	131318	75 %	0 %	0 %	25 %	384866003
3074	NC_017342	ATG	2	6	131446	131451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866003
3075	NC_017342	AAAAT	2	10	131525	131534	80 %	20 %	0 %	0 %	384866003
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3078	NC_017342	CAA	2	6	131584	131589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866003
3079	NC_017342	ATAA	2	8	131642	131649	75 %	25 %	0 %	0 %	384866003
3080	NC_017342	CAT	2	6	131658	131663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017342	TCA	2	6	131684	131689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017342	TCTTTA	2	12	131716	131727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3083	NC_017342	AGC	2	6	131780	131785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017342	T	6	6	131803	131808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017342	ATCC	2	8	131827	131834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_017342	ATG	2	6	131917	131922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866004
3087	NC_017342	TAT	2	6	131940	131945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866004
3088	NC_017342	CGA	2	6	131960	131965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866004
3089	NC_017342	AGC	2	6	131982	131987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866004
3090	NC_017342	CAT	2	6	132048	132053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866004
3091	NC_017342	AAT	2	6	132100	132105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866004
3092	NC_017342	TCT	2	6	132121	132126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866004
3093	NC_017342	CA	3	6	132186	132191	50 %	0 %	0 %	50 %	384866004
3094	NC_017342	ATT	2	6	132229	132234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866004
3095	NC_017342	TGG	2	6	132267	132272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866004
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3097	NC_017342	AT	3	6	132379	132384	50 %	50 %	0 %	0 %	384866005
3098	NC_017342	CTT	2	6	132416	132421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866005
3099	NC_017342	AAC	2	6	132452	132457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866005
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3101	NC_017342	ATC	2	6	132489	132494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866005
3102	NC_017342	ACA	2	6	132514	132519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866005
3103	NC_017342	TAA	2	6	132768	132773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866005
3104	NC_017342	AAT	2	6	132812	132817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866005
3105	NC_017342	TAT	2	6	132899	132904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866005
3106	NC_017342	CTAA	2	8	132931	132938	50 %	25 %	0 %	25 %	384866005
3107	NC_017342	ATA	2	6	132949	132954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866005
3108	NC_017342	CTTAT	2	10	132961	132970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3109	NC_017342	ACT	2	6	132998	133003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017342	ATTCT	2	10	133024	133033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3111	NC_017342	A	7	7	133034	133040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017342	AATT	2	8	133042	133049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017342	ATA	2	6	133158	133163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017342	T	7	7	133193	133199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017342	T	6	6	133216	133221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017342	TTA	2	6	133247	133252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017342	A	6	6	133319	133324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017342	ATTTT	2	10	133372	133381	20 %	80 %	0 %	0 %	384866006
3119	NC_017342	T	6	6	133378	133383	0 %	100 %	0 %	0 %	384866006
3120	NC_017342	AAT	2	6	133513	133518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866006
3121	NC_017342	ATA	2	6	133526	133531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866006
3122	NC_017342	ACC	2	6	133543	133548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866006
3123	NC_017342	ATA	2	6	133565	133570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866006
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3125	NC_017342	TATT	2	8	133650	133657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_017342	ATTG	2	8	139017	139024	25 %	50 %	25 %	0 %	384866016
3253	NC_017342	ATT	2	6	139161	139166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866017
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3257	NC_017342	TTAA	2	8	139260	139267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3353	NC_017342	T	7	7	142683	142689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3361	NC_017342	CTTA	2	8	142969	142976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3362	NC_017342	GGT	2	6	143067	143072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3374	NC_017342	ATCCA	2	10	143588	143597	40 %	20 %	0 %	40 %	384866021
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3376	NC_017342	AT	3	6	143744	143749	50 %	50 %	0 %	0 %	384866021
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3489	NC_017342	CAA	2	6	149295	149300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866024
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3492	NC_017342	CAAT	2	8	149319	149326	50 %	25 %	0 %	25 %	384866024
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3497	NC_017342	GCA	2	6	149464	149469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_017342	ATA	2	6	149478	149483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_017342	CAA	2	6	149525	149530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866025
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