MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017342	AATG	2	8	67100	67107	50 %	25 %	25 %	0 %	384865939
1503	NC_017342	CTC	2	6	67131	67136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865940
1504	NC_017342	TGA	2	6	67141	67146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865940
1505	NC_017342	ATT	2	6	67212	67217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1506	NC_017342	GTATT	2	10	67219	67228	20 %	60 %	20 %	0 %	384865940
1507	NC_017342	ATT	2	6	67230	67235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1508	NC_017342	GTC	2	6	67254	67259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865940
1509	NC_017342	ATT	3	9	67275	67283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1510	NC_017342	ACA	2	6	67356	67361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865940
1511	NC_017342	TTG	2	6	67365	67370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865940
1512	NC_017342	ATTT	2	8	67380	67387	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
1513	NC_017342	AAC	2	6	67426	67431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865940
1514	NC_017342	TAT	2	6	67496	67501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1515	NC_017342	ATT	2	6	67598	67603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1516	NC_017342	T	6	6	67668	67673	0 %	100 %	0 %	0 %	384865940
1517	NC_017342	TTTA	2	8	67688	67695	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
1518	NC_017342	ATTT	2	8	67760	67767	25 %	75 %	0 %	0 %	384865940
1519	NC_017342	TAT	2	6	67769	67774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865940
1520	NC_017342	TAA	2	6	67834	67839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865940
1521	NC_017342	ATG	2	6	67864	67869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865940
1522	NC_017342	TTAAG	2	10	67903	67912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017342	AT	3	6	67923	67928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017342	GGT	2	6	67972	67977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017342	TCA	2	6	68000	68005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017342	TTG	2	6	68010	68015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017342	CGA	2	6	68020	68025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017342	ATTTA	2	10	68045	68054	40 %	60 %	0 %	0 %	384865941
1529	NC_017342	ATA	2	6	68071	68076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865941
1530	NC_017342	CGA	2	6	68090	68095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865941
1531	NC_017342	AT	3	6	68110	68115	50 %	50 %	0 %	0 %	384865941
1532	NC_017342	TTG	2	6	68124	68129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865941
1533	NC_017342	ATGTA	2	10	68337	68346	40 %	40 %	20 %	0 %	384865941
1534	NC_017342	A	6	6	68346	68351	100 %	0 %	0 %	0 %	384865941
1535	NC_017342	CA	3	6	68355	68360	50 %	0 %	0 %	50 %	384865941
1536	NC_017342	TGCC	2	8	68362	68369	0 %	25 %	25 %	50 %	384865941
1537	NC_017342	TCACTT	2	12	68452	68463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384865941
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1539	NC_017342	ATG	2	6	68515	68520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865941
1540	NC_017342	ATT	2	6	68526	68531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865941
1541	NC_017342	CAT	2	6	68544	68549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865942
1542	NC_017342	CAG	2	6	68571	68576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865942
1543	NC_017342	CAT	2	6	68589	68594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865942
1544	NC_017342	ATT	2	6	68629	68634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865942
1545	NC_017342	TGT	2	6	68702	68707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865942
1546	NC_017342	AT	3	6	68735	68740	50 %	50 %	0 %	0 %	384865942
1547	NC_017342	TGTTAA	2	12	68755	68766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384865942
1548	NC_017342	TTC	2	6	68773	68778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865942
1549	NC_017342	CTT	2	6	68817	68822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865942
1550	NC_017342	ACC	2	6	68830	68835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865942
1551	NC_017342	ATA	2	6	68842	68847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865942
1552	NC_017342	TCT	2	6	68894	68899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865942
1553	NC_017342	ATC	2	6	68918	68923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865942
1554	NC_017342	AT	3	6	68983	68988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017342	AGT	2	6	68990	68995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017342	ATT	2	6	69030	69035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017342	AGA	2	6	69046	69051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017342	ATT	3	9	69063	69071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017342	TAAAAA	2	12	69164	69175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384865943
1560	NC_017342	CAC	2	6	69244	69249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865943
1561	NC_017342	A	6	6	69258	69263	100 %	0 %	0 %	0 %	384865943
1562	NC_017342	GTT	2	6	69273	69278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865943
1563	NC_017342	TAA	2	6	69283	69288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865943
1564	NC_017342	ATT	2	6	69302	69307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865943
1565	NC_017342	AAT	2	6	69420	69425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017342	TA	4	8	69503	69510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017342	TA	3	6	69513	69518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017342	AT	3	6	69535	69540	50 %	50 %	0 %	0 %	384865944
1569	NC_017342	ATT	2	6	69546	69551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865944
1570	NC_017342	TAC	2	6	69626	69631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865944
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1573	NC_017342	ACG	2	6	69804	69809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865944
1574	NC_017342	TA	3	6	69842	69847	50 %	50 %	0 %	0 %	384865944
1575	NC_017342	GTA	2	6	69895	69900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865944
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1581	NC_017342	ATT	2	6	70164	70169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865944
1582	NC_017342	TAATGA	2	12	70224	70235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384865944
1583	NC_017342	GTA	2	6	70254	70259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865944
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1585	NC_017342	CTA	2	6	70291	70296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865944
1586	NC_017342	ATTAG	2	10	70348	70357	40 %	40 %	20 %	0 %	384865944
1587	NC_017342	TG	3	6	70443	70448	0 %	50 %	50 %	0 %	384865944
1588	NC_017342	AAT	2	6	70503	70508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865944
1589	NC_017342	T	8	8	70521	70528	0 %	100 %	0 %	0 %	384865944
1590	NC_017342	TCC	2	6	70540	70545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865944
1591	NC_017342	TAC	2	6	70590	70595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865944
1592	NC_017342	TGA	2	6	70635	70640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865944
1593	NC_017342	A	7	7	70653	70659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017342	TA	3	6	70661	70666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017342	TCA	2	6	70672	70677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017342	ATT	2	6	70700	70705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017342	TTA	2	6	70711	70716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017342	ATT	2	6	70734	70739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017342	ATA	2	6	70748	70753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017342	CAAA	2	8	70808	70815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_017342	ATTT	2	8	70864	70871	25 %	75 %	0 %	0 %	384865945
1602	NC_017342	TC	3	6	70925	70930	0 %	50 %	0 %	50 %	384865945
1603	NC_017342	CTT	2	6	70964	70969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865945
1604	NC_017342	CAA	2	6	71033	71038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865945
1605	NC_017342	AT	3	6	71044	71049	50 %	50 %	0 %	0 %	384865945
1606	NC_017342	ATCTGA	2	12	71061	71072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384865945
1607	NC_017342	T	6	6	71095	71100	0 %	100 %	0 %	0 %	384865945
1608	NC_017342	TTA	2	6	71131	71136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865945
1609	NC_017342	TGT	2	6	71176	71181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865945
1610	NC_017342	T	6	6	71256	71261	0 %	100 %	0 %	0 %	384865945
1611	NC_017342	TTA	2	6	71267	71272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865945
1612	NC_017342	GCT	2	6	71278	71283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865945
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1615	NC_017342	ATATCA	2	12	71488	71499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384865945
1616	NC_017342	ATC	2	6	71562	71567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865945
1617	NC_017342	T	6	6	71568	71573	0 %	100 %	0 %	0 %	384865945
1618	NC_017342	T	6	6	71634	71639	0 %	100 %	0 %	0 %	384865945
1619	NC_017342	TAC	2	6	71648	71653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865945
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1621	NC_017342	AAT	2	6	71665	71670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865945
1622	NC_017342	TAAC	2	8	71684	71691	50 %	25 %	0 %	25 %	384865945
1623	NC_017342	CAAT	2	8	71693	71700	50 %	25 %	0 %	25 %	384865945
1624	NC_017342	TA	3	6	71736	71741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017342	TCA	2	6	71742	71747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865946
1626	NC_017342	CTAG	2	8	71764	71771	25 %	25 %	25 %	25 %	384865946
1627	NC_017342	TAA	3	9	71825	71833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865946
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1629	NC_017342	ACC	3	9	71886	71894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865946
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