MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017342	CTT	2	6	43758	43763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017342	TAA	2	6	43807	43812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017342	CAG	2	6	43867	43872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017342	GAT	2	6	43876	43881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017342	CTG	2	6	43903	43908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017342	ATT	2	6	43982	43987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017342	TCTT	2	8	44018	44025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017342	A	8	8	44058	44065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017342	T	7	7	44102	44108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017342	CCT	2	6	44202	44207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_017342	AGTA	2	8	44258	44265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017342	ATTT	2	8	44289	44296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017342	TCGA	2	8	44308	44315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_017342	TCA	2	6	44370	44375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017342	G	6	6	44420	44425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017342	CA	3	6	44461	44466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017342	CTC	2	6	44547	44552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017342	ACG	2	6	44570	44575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017342	ACG	2	6	44596	44601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017342	ACC	2	6	44791	44796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017342	ATGA	2	8	44873	44880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017342	AGG	2	6	44927	44932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017342	CAC	2	6	44972	44977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017342	GTG	2	6	44983	44988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017342	GTA	2	6	45015	45020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017342	CCA	2	6	45023	45028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017342	CCTA	2	8	45067	45074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_017342	TC	3	6	45187	45192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017342	GCC	2	6	45284	45289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017342	CTT	2	6	45334	45339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017342	TCGC	2	8	45521	45528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017342	TCTA	2	8	45587	45594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_017342	TCT	2	6	45641	45646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017342	CAATC	2	10	45714	45723	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_017342	C	6	6	45749	45754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1036	NC_017342	GGT	2	6	45774	45779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017342	ATG	2	6	46094	46099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017342	GCT	2	6	46100	46105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017342	AT	3	6	46159	46164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017342	TGG	2	6	46179	46184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017342	AATT	2	8	46244	46251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017342	AAT	2	6	46320	46325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017342	GA	3	6	46358	46363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017342	TCGGT	2	10	46435	46444	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_017342	ACT	2	6	46640	46645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017342	AG	3	6	46735	46740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017342	TCC	2	6	46761	46766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017342	CGT	2	6	46794	46799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017342	AG	3	6	46816	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017342	ACA	2	6	46822	46827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017342	ATT	2	6	46842	46847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017342	CTT	2	6	46850	46855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017342	GAT	2	6	46871	46876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017342	GTC	2	6	46886	46891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017342	CAA	2	6	46925	46930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017342	TTG	2	6	46937	46942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017342	TCGC	2	8	46961	46968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_017342	CTA	2	6	46971	46976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017342	TCC	2	6	47000	47005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017342	CTTA	2	8	47123	47130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017342	TCG	2	6	47148	47153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017342	CCA	2	6	47192	47197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_017342	TAA	2	6	47206	47211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017342	TTA	2	6	47245	47250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017342	ATT	2	6	47281	47286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017342	TACT	2	8	47353	47360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_017342	A	6	6	47421	47426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017342	CTTT	2	8	47491	47498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017342	ATT	2	6	47551	47556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017342	TAAA	2	8	47564	47571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017342	TCT	2	6	47610	47615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017342	GAA	2	6	47616	47621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017342	AT	3	6	47632	47637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017342	AGG	2	6	47646	47651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017342	GTG	2	6	47773	47778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017342	GT	3	6	47788	47793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017342	AAC	2	6	47892	47897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017342	GT	3	6	47957	47962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017342	ATG	2	6	47982	47987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017342	TCC	2	6	48008	48013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_017342	ATG	2	6	48052	48057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017342	CACGA	2	10	48107	48116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_017342	GAC	2	6	48120	48125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017342	CAC	2	6	48133	48138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_017342	TTC	2	6	48210	48215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017342	GCA	2	6	48329	48334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017342	TCC	2	6	48474	48479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_017342	CG	3	6	48607	48612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_017342	AAT	2	6	48623	48628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017342	GCT	2	6	48663	48668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017342	TTAC	2	8	48721	48728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_017342	TTC	2	6	48736	48741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017342	TAA	2	6	48744	48749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017342	TCA	2	6	48774	48779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017342	CTG	2	6	48831	48836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017342	TTACC	2	10	48925	48934	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_017342	TAGG	2	8	49058	49065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017342	CCG	2	6	49089	49094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_017342	AAGC	2	8	49107	49114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_017342	CGC	2	6	49151	49156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_017342	ATG	2	6	49199	49204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017342	AAT	2	6	49227	49232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017342	T	6	6	49253	49258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017342	AATT	2	8	49318	49325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017342	TTA	2	6	49333	49338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017342	CAA	2	6	49349	49354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017342	AATT	2	8	49363	49370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017342	AGTTG	2	10	49398	49407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017342	CAA	2	6	49420	49425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017342	AAC	2	6	49456	49461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017342	A	6	6	49520	49525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017342	T	6	6	49547	49552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017342	AT	3	6	49579	49584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017342	A	6	6	49591	49596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017342	T	7	7	49615	49621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017342	AAAT	2	8	49634	49641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017342	TC	3	6	49659	49664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017342	TAA	2	6	49689	49694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017342	AAG	2	6	49706	49711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017342	ACT	2	6	49716	49721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017342	AC	3	6	49809	49814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017342	GAT	2	6	49835	49840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865927
1123	NC_017342	CAAC	2	8	49877	49884	50 %	0 %	0 %	50 %	384865927
1124	NC_017342	CTT	2	6	49891	49896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865927
1125	NC_017342	CCA	2	6	49936	49941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865927
1126	NC_017342	AC	3	6	49942	49947	50 %	0 %	0 %	50 %	384865927
1127	NC_017342	CAC	2	6	50078	50083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_017342	AGT	2	6	50090	50095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017342	ACACC	2	10	50096	50105	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_017342	A	8	8	50108	50115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017342	AGA	2	6	50175	50180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017342	TCAA	2	8	50394	50401	50 %	25 %	0 %	25 %	384865928
1133	NC_017342	TCT	2	6	50418	50423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865928
1134	NC_017342	TCCA	2	8	50432	50439	25 %	25 %	0 %	50 %	384865928
1135	NC_017342	TC	3	6	50484	50489	0 %	50 %	0 %	50 %	384865928
1136	NC_017342	T	6	6	50491	50496	0 %	100 %	0 %	0 %	384865928
1137	NC_017342	CACAA	2	10	50525	50534	60 %	0 %	0 %	40 %	384865928
1138	NC_017342	CTA	2	6	50635	50640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865928
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