MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017342	GGC	2	6	22300	22305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384865902
502	NC_017342	GTT	2	6	22442	22447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
503	NC_017342	TG	3	6	22505	22510	0 %	50 %	50 %	0 %	384865902
504	NC_017342	CAA	2	6	22514	22519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865902
505	NC_017342	CAA	2	6	22526	22531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865902
506	NC_017342	TCCT	2	8	22545	22552	0 %	50 %	0 %	50 %	384865902
507	NC_017342	GTTT	2	8	22555	22562	0 %	75 %	25 %	0 %	384865902
508	NC_017342	TTCC	2	8	22691	22698	0 %	50 %	0 %	50 %	384865902
509	NC_017342	TGC	2	6	22713	22718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865902
510	NC_017342	CAC	2	6	22754	22759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384865902
511	NC_017342	TGT	2	6	22863	22868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
512	NC_017342	TCTT	2	8	22914	22921	0 %	75 %	0 %	25 %	384865902
513	NC_017342	TA	3	6	22922	22927	50 %	50 %	0 %	0 %	384865902
514	NC_017342	AATC	2	8	22928	22935	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
515	NC_017342	TTG	2	6	22962	22967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
516	NC_017342	T	7	7	22982	22988	0 %	100 %	0 %	0 %	384865902
517	NC_017342	TTTA	2	8	23007	23014	25 %	75 %	0 %	0 %	384865902
518	NC_017342	ATG	2	6	23175	23180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865902
519	NC_017342	T	6	6	23228	23233	0 %	100 %	0 %	0 %	384865902
520	NC_017342	AAT	2	6	23358	23363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
521	NC_017342	GTTTCG	2	12	23455	23466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384865902
522	NC_017342	TTG	2	6	23544	23549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
523	NC_017342	TAA	2	6	23570	23575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
524	NC_017342	TTG	2	6	23597	23602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865902
525	NC_017342	AAT	2	6	23608	23613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
526	NC_017342	TCAA	2	8	23638	23645	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
527	NC_017342	ATC	2	6	23655	23660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
528	NC_017342	TAA	2	6	23714	23719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
529	NC_017342	TTC	2	6	23745	23750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
530	NC_017342	TCA	2	6	23773	23778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
531	NC_017342	AAT	2	6	23811	23816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
532	NC_017342	CATA	2	8	23831	23838	50 %	25 %	0 %	25 %	384865902
533	NC_017342	CTA	2	6	23843	23848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
534	NC_017342	ACG	2	6	23850	23855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865902
535	NC_017342	TGA	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865902
536	NC_017342	AAT	2	6	23887	23892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
537	NC_017342	TTTC	2	8	23909	23916	0 %	75 %	0 %	25 %	384865902
538	NC_017342	CTT	2	6	23978	23983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
539	NC_017342	CTT	2	6	23999	24004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
540	NC_017342	CTT	2	6	24041	24046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
541	NC_017342	ATA	2	6	24157	24162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
542	NC_017342	CCT	2	6	24163	24168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384865902
543	NC_017342	ATAA	2	8	24343	24350	75 %	25 %	0 %	0 %	384865902
544	NC_017342	TCA	2	6	24398	24403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
545	NC_017342	ATA	2	6	24436	24441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865902
546	NC_017342	TTC	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
547	NC_017342	ATT	2	6	24522	24527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865902
548	NC_017342	TAAT	2	8	24530	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	384865902
549	NC_017342	ATC	2	6	24574	24579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865902
550	NC_017342	GT	3	6	24614	24619	0 %	50 %	50 %	0 %	384865902
551	NC_017342	TCT	2	6	24661	24666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865902
552	NC_017342	ATT	2	6	24691	24696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865902
553	NC_017342	ATTC	2	8	24712	24719	25 %	50 %	0 %	25 %	384865903
554	NC_017342	CAA	2	6	24745	24750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865903
555	NC_017342	TGC	2	6	24767	24772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865903
556	NC_017342	TCA	2	6	24804	24809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865903
557	NC_017342	AATACG	2	12	24872	24883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384865903
558	NC_017342	TAA	2	6	24910	24915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865903
559	NC_017342	CCGC	2	8	24936	24943	0 %	0 %	25 %	75 %	384865903
560	NC_017342	ATC	2	6	24989	24994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865903
561	NC_017342	TCT	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865903
562	NC_017342	TAA	2	6	25029	25034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865903
563	NC_017342	TCA	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865903
564	NC_017342	ATT	2	6	25163	25168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865903
565	NC_017342	TAT	3	9	25296	25304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017342	ACA	2	6	25309	25314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017342	ATT	2	6	25344	25349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017342	AGTA	2	8	25359	25366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017342	ATG	2	6	25399	25404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017342	TTG	2	6	25410	25415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017342	AATT	2	8	25440	25447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017342	TTAA	2	8	25473	25480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017342	TAA	2	6	25487	25492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017342	TCT	2	6	25597	25602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
575	NC_017342	CAA	2	6	25613	25618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865904
576	NC_017342	TTC	2	6	25626	25631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
577	NC_017342	TGT	2	6	25636	25641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865904
578	NC_017342	TCT	2	6	25663	25668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
579	NC_017342	TTC	2	6	25677	25682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
580	NC_017342	ACT	2	6	25693	25698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865904
581	NC_017342	TAC	2	6	25701	25706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865904
582	NC_017342	AAT	2	6	25852	25857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865904
583	NC_017342	GTT	2	6	25859	25864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865904
584	NC_017342	CGC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384865904
585	NC_017342	CTT	2	6	25877	25882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
586	NC_017342	TTC	2	6	25932	25937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865904
587	NC_017342	ATTG	2	8	25944	25951	25 %	50 %	25 %	0 %	384865904
588	NC_017342	AAG	2	6	25954	25959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384865904
589	NC_017342	TGA	2	6	26081	26086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865904
590	NC_017342	TCA	2	6	26095	26100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865904
591	NC_017342	ACCGTA	2	12	26124	26135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384865904
592	NC_017342	TAC	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865904
593	NC_017342	GTTT	2	8	26188	26195	0 %	75 %	25 %	0 %	384865904
594	NC_017342	GAT	2	6	26205	26210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865904
595	NC_017342	CAT	2	6	26283	26288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017342	TTGC	2	8	26291	26298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_017342	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017342	ACGA	2	8	26323	26330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_017342	TAT	2	6	26334	26339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017342	ATA	2	6	26386	26391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
601	NC_017342	GT	3	6	26570	26575	0 %	50 %	50 %	0 %	384865905
602	NC_017342	ACA	2	6	26576	26581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865905
603	NC_017342	CTT	2	6	26590	26595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865905
604	NC_017342	CTG	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865905
605	NC_017342	AAT	2	6	26651	26656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
606	NC_017342	AAT	3	9	26663	26671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
607	NC_017342	CAA	2	6	26695	26700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865905
608	NC_017342	TCA	2	6	26704	26709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865905
609	NC_017342	GAC	2	6	26731	26736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384865905
610	NC_017342	AAC	2	6	26816	26821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384865905
611	NC_017342	TTC	2	6	26828	26833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865905
612	NC_017342	ATC	2	6	26849	26854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384865905
613	NC_017342	TCTTG	2	10	27030	27039	0 %	60 %	20 %	20 %	384865905
614	NC_017342	ATA	2	6	27047	27052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
615	NC_017342	ATTG	2	8	27065	27072	25 %	50 %	25 %	0 %	384865905
616	NC_017342	TGC	2	6	27074	27079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384865905
617	NC_017342	ATCA	2	8	27098	27105	50 %	25 %	0 %	25 %	384865905
618	NC_017342	TAAT	2	8	27106	27113	50 %	50 %	0 %	0 %	384865905
619	NC_017342	ATG	2	6	27142	27147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384865905
620	NC_017342	AAT	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865905
621	NC_017342	CT	3	6	27183	27188	0 %	50 %	0 %	50 %	384865905
622	NC_017342	CTT	2	6	27268	27273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865905
623	NC_017342	A	6	6	27301	27306	100 %	0 %	0 %	0 %	384865905
624	NC_017342	ATT	2	6	27332	27337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865905
625	NC_017342	TCC	2	6	27350	27355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017342	ATT	2	6	27357	27362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017342	TAT	2	6	27378	27383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017342	AT	3	6	27382	27387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017342	ATT	2	6	27489	27494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384865906
630	NC_017342	CTT	2	6	27504	27509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384865906
631	NC_017342	TTG	2	6	27510	27515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384865906
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762	NC_017342	AAT	2	6	32465	32470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384865913
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