MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

< Previous12...122123124125126127128129130131132133134Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
66501	NC_017342	CGC	2	6	2795283	2795288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384868558
66502	NC_017342	AAT	2	6	2795332	2795337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868558
66503	NC_017342	AGG	2	6	2795432	2795437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66504	NC_017342	A	7	7	2795488	2795494	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66505	NC_017342	AAT	2	6	2795497	2795502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868559
66506	NC_017342	AAG	2	6	2795517	2795522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868559
66507	NC_017342	TATC	2	8	2795562	2795569	25 %	50 %	0 %	25 %	384868559
66508	NC_017342	AAC	2	6	2795575	2795580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868559
66509	NC_017342	TGA	3	9	2795707	2795715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868559
66510	NC_017342	TGA	2	6	2795737	2795742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868559
66511	NC_017342	TATT	2	8	2795906	2795913	25 %	75 %	0 %	0 %	384868559
66512	NC_017342	TAT	2	6	2796016	2796021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868559
66513	NC_017342	CCA	2	6	2796038	2796043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868559
66514	NC_017342	A	6	6	2796062	2796067	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66515	NC_017342	TTGAAG	2	12	2796087	2796098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868559
66516	NC_017342	TTA	2	6	2796123	2796128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868559
66517	NC_017342	A	7	7	2796135	2796141	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66518	NC_017342	TA	4	8	2796147	2796154	50 %	50 %	0 %	0 %	384868559
66519	NC_017342	A	7	7	2796196	2796202	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66520	NC_017342	AGA	2	6	2796235	2796240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868559
66521	NC_017342	TAT	2	6	2796247	2796252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868559
66522	NC_017342	AGA	2	6	2796253	2796258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868559
66523	NC_017342	AT	3	6	2796388	2796393	50 %	50 %	0 %	0 %	384868559
66524	NC_017342	A	6	6	2796416	2796421	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66525	NC_017342	GGT	2	6	2796500	2796505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868559
66526	NC_017342	TAAA	2	8	2796519	2796526	75 %	25 %	0 %	0 %	384868559
66527	NC_017342	A	6	6	2796640	2796645	100 %	0 %	0 %	0 %	384868559
66528	NC_017342	TAAAG	2	10	2796682	2796691	60 %	20 %	20 %	0 %	384868559
66529	NC_017342	TGA	3	9	2796715	2796723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868559
66530	NC_017342	GAT	2	6	2796776	2796781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868559
66531	NC_017342	TAA	2	6	2796807	2796812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868559
66532	NC_017342	ATTA	2	8	2796817	2796824	50 %	50 %	0 %	0 %	384868559
66533	NC_017342	CTT	2	6	2796835	2796840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66534	NC_017342	TAA	2	6	2796884	2796889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66535	NC_017342	CAG	2	6	2796944	2796949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66536	NC_017342	GAT	2	6	2796953	2796958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66537	NC_017342	CTG	2	6	2796980	2796985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66538	NC_017342	ATT	2	6	2797059	2797064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66539	NC_017342	T	6	6	2797106	2797111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66540	NC_017342	TCG	2	6	2797155	2797160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66541	NC_017342	GCTT	2	8	2797190	2797197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66542	NC_017342	CTA	2	6	2797235	2797240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66543	NC_017342	A	9	9	2797340	2797348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66544	NC_017342	T	7	7	2797385	2797391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66545	NC_017342	CCT	2	6	2797485	2797490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66546	NC_017342	AGTA	2	8	2797541	2797548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66547	NC_017342	ATTT	2	8	2797572	2797579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66548	NC_017342	TCGA	2	8	2797591	2797598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66549	NC_017342	TCA	2	6	2797653	2797658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66550	NC_017342	G	6	6	2797703	2797708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66551	NC_017342	CA	3	6	2797744	2797749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66552	NC_017342	CTC	2	6	2797830	2797835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66553	NC_017342	ACG	2	6	2797853	2797858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66554	NC_017342	ACG	2	6	2797879	2797884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66555	NC_017342	ACC	2	6	2798074	2798079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66556	NC_017342	ATGA	2	8	2798156	2798163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66557	NC_017342	AGG	2	6	2798210	2798215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66558	NC_017342	CAC	2	6	2798255	2798260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66559	NC_017342	GTG	2	6	2798266	2798271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66560	NC_017342	GTA	2	6	2798298	2798303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66561	NC_017342	CCA	2	6	2798306	2798311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66562	NC_017342	CCTA	2	8	2798350	2798357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66563	NC_017342	TC	3	6	2798470	2798475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66564	NC_017342	GCC	2	6	2798567	2798572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66565	NC_017342	CTT	2	6	2798617	2798622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66566	NC_017342	TCGC	2	8	2798804	2798811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66567	NC_017342	TCTA	2	8	2798870	2798877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66568	NC_017342	TCT	2	6	2798924	2798929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66569	NC_017342	CAATC	2	10	2798997	2799006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66570	NC_017342	GGT	2	6	2799056	2799061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66571	NC_017342	ATG	2	6	2799376	2799381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66572	NC_017342	GCT	2	6	2799382	2799387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66573	NC_017342	AT	3	6	2799441	2799446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66574	NC_017342	TGG	2	6	2799461	2799466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66575	NC_017342	AATT	2	8	2799526	2799533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66576	NC_017342	AAT	2	6	2799602	2799607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66577	NC_017342	GA	3	6	2799640	2799645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66578	NC_017342	TCGGT	2	10	2799717	2799726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66579	NC_017342	ACT	2	6	2799921	2799926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66580	NC_017342	AG	3	6	2800016	2800021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66581	NC_017342	TCC	2	6	2800042	2800047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66582	NC_017342	CGT	2	6	2800075	2800080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66583	NC_017342	AG	3	6	2800097	2800102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66584	NC_017342	ACA	2	6	2800103	2800108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66585	NC_017342	ATT	2	6	2800123	2800128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66586	NC_017342	CTT	2	6	2800131	2800136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66587	NC_017342	GAT	2	6	2800152	2800157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66588	NC_017342	GTC	2	6	2800167	2800172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66589	NC_017342	CAA	2	6	2800206	2800211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66590	NC_017342	TTG	2	6	2800218	2800223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66591	NC_017342	TCGC	2	8	2800242	2800249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66592	NC_017342	CTA	2	6	2800252	2800257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66593	NC_017342	TCC	2	6	2800281	2800286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66594	NC_017342	CTTA	2	8	2800404	2800411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66595	NC_017342	TCG	2	6	2800429	2800434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66596	NC_017342	TAA	2	6	2800487	2800492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66597	NC_017342	TTA	2	6	2800526	2800531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66598	NC_017342	ATT	2	6	2800562	2800567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66599	NC_017342	TACT	2	8	2800632	2800639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66600	NC_017342	A	6	6	2800700	2800705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66601	NC_017342	CTTT	2	8	2800770	2800777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66602	NC_017342	A	6	6	2800826	2800831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66603	NC_017342	TAAA	2	8	2800843	2800850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66604	NC_017342	TCT	2	6	2800889	2800894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66605	NC_017342	GAA	2	6	2800895	2800900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66606	NC_017342	AT	3	6	2800911	2800916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66607	NC_017342	AGG	2	6	2800925	2800930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66608	NC_017342	GTG	2	6	2801052	2801057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66609	NC_017342	GT	3	6	2801067	2801072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66610	NC_017342	AAC	2	6	2801171	2801176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66611	NC_017342	GT	3	6	2801236	2801241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66612	NC_017342	ATG	2	6	2801261	2801266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66613	NC_017342	TCC	2	6	2801287	2801292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66614	NC_017342	ATG	2	6	2801331	2801336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66615	NC_017342	CACGA	2	10	2801386	2801395	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66616	NC_017342	GAC	2	6	2801399	2801404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66617	NC_017342	CAC	2	6	2801412	2801417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66618	NC_017342	TTC	2	6	2801489	2801494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66619	NC_017342	GCA	2	6	2801608	2801613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66620	NC_017342	TCC	2	6	2801753	2801758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66621	NC_017342	A	6	6	2801874	2801879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66622	NC_017342	CG	3	6	2801887	2801892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66623	NC_017342	AAT	2	6	2801903	2801908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66624	NC_017342	GCT	2	6	2801943	2801948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66625	NC_017342	TTAC	2	8	2802001	2802008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66626	NC_017342	TTC	2	6	2802016	2802021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66627	NC_017342	TAA	2	6	2802024	2802029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66628	NC_017342	TCA	2	6	2802054	2802059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66629	NC_017342	CTG	2	6	2802111	2802116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66630	NC_017342	TTACC	2	10	2802205	2802214	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66631	NC_017342	TAGG	2	8	2802338	2802345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66632	NC_017342	CCG	2	6	2802369	2802374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66633	NC_017342	AAGC	2	8	2802387	2802394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66634	NC_017342	CGC	2	6	2802431	2802436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66635	NC_017342	ATG	2	6	2802479	2802484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66636	NC_017342	AAT	2	6	2802507	2802512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66637	NC_017342	T	6	6	2802533	2802538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66638	NC_017342	TTA	2	6	2802612	2802617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66639	NC_017342	T	7	7	2802635	2802641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66640	NC_017342	TATTT	2	10	2802650	2802659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66641	NC_017342	T	6	6	2802657	2802662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...122123124125126127128129130131132133134Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.