MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017342	CTT	2	6	254966	254971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866131
6002	NC_017342	TCA	2	6	255013	255018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866131
6003	NC_017342	GAT	2	6	255069	255074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866131
6004	NC_017342	AAC	2	6	255205	255210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866131
6005	NC_017342	T	6	6	255222	255227	0 %	100 %	0 %	0 %	384866131
6006	NC_017342	TCG	2	6	255242	255247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866131
6007	NC_017342	AAAT	2	8	255266	255273	75 %	25 %	0 %	0 %	384866131
6008	NC_017342	ACGA	2	8	255327	255334	50 %	0 %	25 %	25 %	384866131
6009	NC_017342	ACA	3	9	255364	255372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866131
6010	NC_017342	GCC	2	6	255441	255446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384866131
6011	NC_017342	TTC	3	9	255519	255527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866131
6012	NC_017342	CAT	2	6	255554	255559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866131
6013	NC_017342	TAA	2	6	255612	255617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866131
6014	NC_017342	GTAA	2	8	255632	255639	50 %	25 %	25 %	0 %	384866131
6015	NC_017342	CAT	2	6	255701	255706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866131
6016	NC_017342	TCT	2	6	255757	255762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866131
6017	NC_017342	AAT	2	6	255793	255798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866131
6018	NC_017342	TA	4	8	255825	255832	50 %	50 %	0 %	0 %	384866131
6019	NC_017342	TTG	2	6	255947	255952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866132
6020	NC_017342	AAC	2	6	255976	255981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866132
6021	NC_017342	ACA	2	6	256024	256029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866132
6022	NC_017342	ACT	2	6	256056	256061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6023	NC_017342	CTTC	2	8	256144	256151	0 %	50 %	0 %	50 %	384866132
6024	NC_017342	AATC	2	8	256163	256170	50 %	25 %	0 %	25 %	384866132
6025	NC_017342	CCA	2	6	256201	256206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866132
6026	NC_017342	TAA	2	6	256253	256258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866132
6027	NC_017342	AGA	2	6	256259	256264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866132
6028	NC_017342	CAT	2	6	256265	256270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6029	NC_017342	CAA	2	6	256271	256276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866132
6030	NC_017342	AT	3	6	256317	256322	50 %	50 %	0 %	0 %	384866132
6031	NC_017342	TAA	2	6	256347	256352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866132
6032	NC_017342	TGTAA	2	10	256359	256368	40 %	40 %	20 %	0 %	384866132
6033	NC_017342	ACG	2	6	256431	256436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866132
6034	NC_017342	ATA	2	6	256477	256482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866132
6035	NC_017342	ATC	2	6	256494	256499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6036	NC_017342	CAT	2	6	256553	256558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6037	NC_017342	ACT	2	6	256642	256647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6038	NC_017342	AC	3	6	256664	256669	50 %	0 %	0 %	50 %	384866132
6039	NC_017342	TCA	2	6	256744	256749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6040	NC_017342	GCA	2	6	256777	256782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866132
6041	NC_017342	AT	3	6	256792	256797	50 %	50 %	0 %	0 %	384866132
6042	NC_017342	GTT	2	6	256836	256841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866132
6043	NC_017342	ATC	2	6	256891	256896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866132
6044	NC_017342	ACC	2	6	256903	256908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866133
6045	NC_017342	AAT	2	6	256912	256917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866133
6046	NC_017342	GTT	2	6	256946	256951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866133
6047	NC_017342	TA	3	6	256962	256967	50 %	50 %	0 %	0 %	384866133
6048	NC_017342	GTTT	3	12	256992	257003	0 %	75 %	25 %	0 %	384866133
6049	NC_017342	AAT	2	6	257008	257013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866133
6050	NC_017342	TCA	2	6	257045	257050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866133
6051	NC_017342	CTTT	2	8	257066	257073	0 %	75 %	0 %	25 %	384866133
6052	NC_017342	TAA	2	6	257074	257079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866133
6053	NC_017342	ATCA	2	8	257185	257192	50 %	25 %	0 %	25 %	384866133
6054	NC_017342	AGC	2	6	257218	257223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384866133
6055	NC_017342	TAA	2	6	257238	257243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866133
6056	NC_017342	CAT	2	6	257271	257276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866133
6057	NC_017342	CATCGT	2	12	257289	257300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384866133
6058	NC_017342	TTG	2	6	257310	257315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866133
6059	NC_017342	ACC	2	6	257362	257367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384866133
6060	NC_017342	TCA	2	6	257387	257392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866133
6061	NC_017342	TTG	2	6	257437	257442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866133
6062	NC_017342	ATA	2	6	257453	257458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866133
6063	NC_017342	T	6	6	257460	257465	0 %	100 %	0 %	0 %	384866133
6064	NC_017342	ATTA	2	8	257473	257480	50 %	50 %	0 %	0 %	384866133
6065	NC_017342	AAAT	2	8	257481	257488	75 %	25 %	0 %	0 %	384866133
6066	NC_017342	TGT	2	6	257517	257522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866133
6067	NC_017342	TCC	2	6	257613	257618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_017342	CTATAT	2	12	257625	257636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6069	NC_017342	ATT	2	6	257640	257645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017342	ATA	2	6	257797	257802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017342	TAT	2	6	257825	257830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017342	TAAT	2	8	257845	257852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017342	T	6	6	257859	257864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017342	TCT	2	6	257923	257928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866134
6075	NC_017342	T	6	6	258051	258056	0 %	100 %	0 %	0 %	384866134
6076	NC_017342	AGT	2	6	258161	258166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866134
6077	NC_017342	TAAC	2	8	258170	258177	50 %	25 %	0 %	25 %	384866134
6078	NC_017342	ATC	2	6	258237	258242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866134
6079	NC_017342	TCA	2	6	258247	258252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866134
6080	NC_017342	ATGC	2	8	258273	258280	25 %	25 %	25 %	25 %	384866134
6081	NC_017342	TAA	2	6	258282	258287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866134
6082	NC_017342	ATC	3	9	258297	258305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866134
6083	NC_017342	CATA	2	8	258395	258402	50 %	25 %	0 %	25 %	384866134
6084	NC_017342	T	6	6	258408	258413	0 %	100 %	0 %	0 %	384866134
6085	NC_017342	AT	3	6	258451	258456	50 %	50 %	0 %	0 %	384866134
6086	NC_017342	CTTT	2	8	258598	258605	0 %	75 %	0 %	25 %	384866134
6087	NC_017342	T	6	6	258603	258608	0 %	100 %	0 %	0 %	384866134
6088	NC_017342	TGCCA	2	10	258689	258698	20 %	20 %	20 %	40 %	384866134
6089	NC_017342	CGT	2	6	258711	258716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866134
6090	NC_017342	GT	3	6	258749	258754	0 %	50 %	50 %	0 %	384866134
6091	NC_017342	ATC	2	6	258757	258762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866134
6092	NC_017342	T	7	7	258855	258861	0 %	100 %	0 %	0 %	384866134
6093	NC_017342	AAAT	2	8	258955	258962	75 %	25 %	0 %	0 %	384866134
6094	NC_017342	TA	4	8	259004	259011	50 %	50 %	0 %	0 %	384866134
6095	NC_017342	T	6	6	259026	259031	0 %	100 %	0 %	0 %	384866134
6096	NC_017342	TAT	2	6	259116	259121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017342	TAACA	2	10	259201	259210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_017342	A	6	6	259210	259215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017342	GATTG	2	10	259266	259275	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017342	ATT	2	6	259276	259281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017342	AGT	2	6	259361	259366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017342	T	6	6	259397	259402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017342	CAA	2	6	259422	259427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017342	T	6	6	259543	259548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017342	GTA	2	6	259583	259588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017342	ACA	2	6	259667	259672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866135
6107	NC_017342	TCA	2	6	259719	259724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866135
6108	NC_017342	CAG	2	6	259810	259815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017342	CTG	2	6	259846	259851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_017342	T	7	7	259852	259858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017342	TCA	2	6	259928	259933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017342	CTT	2	6	259964	259969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_017342	AT	3	6	260006	260011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017342	CGT	2	6	260208	260213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866136
6115	NC_017342	TCT	2	6	260221	260226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866136
6116	NC_017342	T	6	6	260253	260258	0 %	100 %	0 %	0 %	384866136
6117	NC_017342	AT	3	6	260274	260279	50 %	50 %	0 %	0 %	384866136
6118	NC_017342	AAT	2	6	260288	260293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866136
6119	NC_017342	CAA	2	6	260301	260306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866136
6120	NC_017342	T	6	6	260395	260400	0 %	100 %	0 %	0 %	384866136
6121	NC_017342	A	6	6	260478	260483	100 %	0 %	0 %	0 %	384866136
6122	NC_017342	GAATA	2	10	260529	260538	60 %	20 %	20 %	0 %	384866136
6123	NC_017342	TCA	2	6	260605	260610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866136
6124	NC_017342	ACA	2	6	260644	260649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866136
6125	NC_017342	TCT	2	6	260653	260658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866136
6126	NC_017342	TGA	2	6	260700	260705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866136
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6130	NC_017342	AAT	2	6	260820	260825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866136
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6132	NC_017342	ATC	2	6	260871	260876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866136
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6134	NC_017342	GTA	2	6	261002	261007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866136
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6232	NC_017342	GAAT	2	8	266475	266482	50 %	25 %	25 %	0 %	384866142
6233	NC_017342	TGC	2	6	266495	266500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
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6238	NC_017342	TTTA	2	8	266690	266697	25 %	75 %	0 %	0 %	384866142
6239	NC_017342	ATG	2	6	266802	266807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866142
6240	NC_017342	AC	3	6	266830	266835	50 %	0 %	0 %	50 %	384866142
6241	NC_017342	ACCTAA	2	12	266840	266851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384866142
6242	NC_017342	ACTC	2	8	267028	267035	25 %	25 %	0 %	50 %	384866142
6243	NC_017342	ATC	2	6	267036	267041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866142
6244	NC_017342	CTG	2	6	267088	267093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
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6246	NC_017342	TGC	2	6	267137	267142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866142
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6493	NC_017342	ATCAT	2	10	278507	278516	40 %	40 %	0 %	20 %	384866153
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6498	NC_017342	A	6	6	278758	278763	100 %	0 %	0 %	0 %	384866153
6499	NC_017342	TGA	2	6	278793	278798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866153
6500	NC_017342	CAA	2	6	278837	278842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866153

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