MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 66641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017342	CT	3	6	213686	213691	0 %	50 %	0 %	50 %	384866095
5003	NC_017342	CTG	2	6	213881	213886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866096
5004	NC_017342	CTA	2	6	213914	213919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866096
5005	NC_017342	TTTC	2	8	214020	214027	0 %	75 %	0 %	25 %	384866096
5006	NC_017342	TGT	2	6	214031	214036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866096
5007	NC_017342	TAA	2	6	214049	214054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866096
5008	NC_017342	CCT	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384866096
5009	NC_017342	CAA	2	6	214089	214094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866096
5010	NC_017342	TCTT	2	8	214222	214229	0 %	75 %	0 %	25 %	384866096
5011	NC_017342	AAG	2	6	214231	214236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866096
5012	NC_017342	CTG	2	6	214283	214288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866096
5013	NC_017342	T	6	6	214290	214295	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5014	NC_017342	A	6	6	214311	214316	100 %	0 %	0 %	0 %	384866096
5015	NC_017342	T	6	6	214366	214371	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5016	NC_017342	T	6	6	214434	214439	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5017	NC_017342	ATT	2	6	214446	214451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866096
5018	NC_017342	T	6	6	214483	214488	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5019	NC_017342	TTAA	2	8	214558	214565	50 %	50 %	0 %	0 %	384866096
5020	NC_017342	TTA	2	6	214567	214572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866096
5021	NC_017342	GCT	2	6	214678	214683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866096
5022	NC_017342	TTA	2	6	214868	214873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866096
5023	NC_017342	TTG	2	6	214903	214908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866096
5024	NC_017342	TTA	2	6	214951	214956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866096
5025	NC_017342	T	7	7	214994	215000	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5026	NC_017342	TGT	2	6	215004	215009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866096
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5030	NC_017342	T	7	7	215097	215103	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5031	NC_017342	ATT	2	6	215133	215138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866096
5032	NC_017342	T	6	6	215212	215217	0 %	100 %	0 %	0 %	384866096
5033	NC_017342	ATTG	2	8	215218	215225	25 %	50 %	25 %	0 %	384866096
5034	NC_017342	AAATG	2	10	215227	215236	60 %	20 %	20 %	0 %	384866096
5035	NC_017342	ACT	2	6	215256	215261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866096
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5037	NC_017342	TATT	2	8	215333	215340	25 %	75 %	0 %	0 %	384866096
5038	NC_017342	ATA	2	6	215407	215412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866096
5039	NC_017342	CT	3	6	215420	215425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_017342	ATT	2	6	215426	215431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866097
5041	NC_017342	TCT	3	9	215500	215508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866097
5042	NC_017342	T	6	6	215523	215528	0 %	100 %	0 %	0 %	384866097
5043	NC_017342	CTT	2	6	215535	215540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866097
5044	NC_017342	CAT	2	6	215543	215548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866097
5045	NC_017342	T	7	7	215565	215571	0 %	100 %	0 %	0 %	384866097
5046	NC_017342	TCTT	2	8	215587	215594	0 %	75 %	0 %	25 %	384866097
5047	NC_017342	CTT	2	6	215614	215619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866097
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5050	NC_017342	CTG	2	6	215690	215695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866097
5051	NC_017342	T	6	6	215703	215708	0 %	100 %	0 %	0 %	384866097
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5053	NC_017342	CTT	2	6	215759	215764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866097
5054	NC_017342	TCTT	2	8	215778	215785	0 %	75 %	0 %	25 %	384866097
5055	NC_017342	CTT	2	6	215800	215805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866097
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5058	NC_017342	CAA	2	6	215886	215891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866098
5059	NC_017342	CGT	2	6	215917	215922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866098
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5070	NC_017342	ATT	2	6	216420	216425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
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5083	NC_017342	CAT	2	6	216816	216821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
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5093	NC_017342	GAATT	2	10	217235	217244	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
5094	NC_017342	TAT	2	6	217256	217261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
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5097	NC_017342	ATA	2	6	217315	217320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
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5102	NC_017342	TTC	2	6	217584	217589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
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5107	NC_017342	TGG	2	6	217698	217703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384866099
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5110	NC_017342	TTG	2	6	217828	217833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
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5117	NC_017342	AATTTA	2	12	218062	218073	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
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5121	NC_017342	GTT	2	6	218192	218197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384866099
5122	NC_017342	AAT	2	6	218226	218231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
5123	NC_017342	CTT	2	6	218264	218269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
5124	NC_017342	CAT	2	6	218303	218308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
5125	NC_017342	TGAT	2	8	218348	218355	25 %	50 %	25 %	0 %	384866099
5126	NC_017342	TCAA	2	8	218455	218462	50 %	25 %	0 %	25 %	384866099
5127	NC_017342	AAT	2	6	218520	218525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
5128	NC_017342	CTT	2	6	218696	218701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
5129	NC_017342	AT	3	6	218791	218796	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
5130	NC_017342	TTCTTT	2	12	218847	218858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384866099
5131	NC_017342	AAT	2	6	218895	218900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
5132	NC_017342	CAA	2	6	218939	218944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384866099
5133	NC_017342	AAT	2	6	219006	219011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
5134	NC_017342	AAT	2	6	219054	219059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866099
5135	NC_017342	CTG	2	6	219073	219078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866099
5136	NC_017342	AAAC	2	8	219158	219165	75 %	0 %	0 %	25 %	384866099
5137	NC_017342	CAAC	2	8	219201	219208	50 %	0 %	0 %	50 %	384866099
5138	NC_017342	TTC	2	6	219312	219317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866099
5139	NC_017342	AT	3	6	219340	219345	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
5140	NC_017342	TCG	2	6	219424	219429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866099
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5143	NC_017342	TGA	2	6	219529	219534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866099
5144	NC_017342	T	6	6	219542	219547	0 %	100 %	0 %	0 %	384866099
5145	NC_017342	AT	3	6	219549	219554	50 %	50 %	0 %	0 %	384866099
5146	NC_017342	GATAAT	2	12	219602	219613	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384866099
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5148	NC_017342	TAT	2	6	219662	219667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866099
5149	NC_017342	TC	3	6	219689	219694	0 %	50 %	0 %	50 %	384866099
5150	NC_017342	TTTTC	2	10	219719	219728	0 %	80 %	0 %	20 %	384866099
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5157	NC_017342	ATC	2	6	219975	219980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
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5162	NC_017342	TGTAA	2	10	220342	220351	40 %	40 %	20 %	0 %	384866099
5163	NC_017342	TCA	2	6	220354	220359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866099
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5207	NC_017342	T	7	7	222264	222270	0 %	100 %	0 %	0 %	384866102
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5209	NC_017342	CGAGT	2	10	222365	222374	20 %	20 %	40 %	20 %	384866102
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5231	NC_017342	ATC	2	6	223062	223067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
5232	NC_017342	TGA	2	6	223070	223075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866103
5233	NC_017342	AT	3	6	223114	223119	50 %	50 %	0 %	0 %	384866103
5234	NC_017342	AAT	2	6	223147	223152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
5235	NC_017342	AAT	2	6	223156	223161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
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5237	NC_017342	TGTC	2	8	223261	223268	0 %	50 %	25 %	25 %	384866103
5238	NC_017342	T	6	6	223293	223298	0 %	100 %	0 %	0 %	384866103
5239	NC_017342	ATT	2	6	223407	223412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
5240	NC_017342	CTA	2	6	223504	223509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
5241	NC_017342	TCA	2	6	223546	223551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
5242	NC_017342	ATCA	2	8	223620	223627	50 %	25 %	0 %	25 %	384866103
5243	NC_017342	TCT	2	6	223639	223644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
5244	NC_017342	T	6	6	223648	223653	0 %	100 %	0 %	0 %	384866103
5245	NC_017342	TCA	2	6	223681	223686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
5246	NC_017342	TTC	2	6	223704	223709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
5247	NC_017342	CAT	2	6	223785	223790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
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5249	NC_017342	TCT	2	6	223822	223827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
5250	NC_017342	T	6	6	224142	224147	0 %	100 %	0 %	0 %	384866103
5251	NC_017342	CAT	2	6	224255	224260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384866103
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5254	NC_017342	CTT	2	6	224366	224371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
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5261	NC_017342	TTC	2	6	224706	224711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866103
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5266	NC_017342	TAA	2	6	225042	225047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
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5275	NC_017342	GTTG	2	8	225457	225464	0 %	50 %	50 %	0 %	384866103
5276	NC_017342	TAT	2	6	225494	225499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866103
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5278	NC_017342	TGAT	2	8	225531	225538	25 %	50 %	25 %	0 %	384866103
5279	NC_017342	A	6	6	225558	225563	100 %	0 %	0 %	0 %	384866103
5280	NC_017342	ACTA	2	8	225570	225577	50 %	25 %	0 %	25 %	384866103
5281	NC_017342	TAA	2	6	225587	225592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866103
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5284	NC_017342	A	6	6	225662	225667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_017342	ATT	2	6	225733	225738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866104
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5294	NC_017342	ATA	2	6	226092	226097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_017342	TA	3	6	226096	226101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5296	NC_017342	ATT	2	6	226103	226108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5297	NC_017342	GTATAT	2	12	226110	226121	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5298	NC_017342	T	6	6	226124	226129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_017342	T	7	7	226143	226149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_017342	AAAT	2	8	226150	226157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_017342	AT	3	6	226156	226161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_017342	AT	3	6	226173	226178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5303	NC_017342	CATT	2	8	226190	226197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5304	NC_017342	ATTAA	2	10	226224	226233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5310	NC_017342	TATACT	2	12	226415	226426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384866105
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5323	NC_017342	CTG	2	6	226842	226847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866105
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5332	NC_017342	TTA	2	6	227346	227351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5333	NC_017342	TTA	2	6	227365	227370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5334	NC_017342	ATT	2	6	227374	227379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5335	NC_017342	TAA	2	6	227426	227431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5337	NC_017342	GGA	2	6	227470	227475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5361	NC_017342	AGA	2	6	228246	228251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866106
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5366	NC_017342	ATA	2	6	228446	228451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384866106
5367	NC_017342	AGA	2	6	228480	228485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866106
5368	NC_017342	TCT	2	6	228571	228576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384866106
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5370	NC_017342	ATG	2	6	228632	228637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866106
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5482	NC_017342	TTGCTG	2	12	233558	233569	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384866111
5483	NC_017342	AT	3	6	233587	233592	50 %	50 %	0 %	0 %	384866111
5484	NC_017342	GAT	2	6	233627	233632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384866111
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5489	NC_017342	ATAA	2	8	233955	233962	75 %	25 %	0 %	0 %	384866111
5490	NC_017342	CTG	2	6	234056	234061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384866111
5491	NC_017342	ATAATC	2	12	234078	234089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384866111
5492	NC_017342	AAG	2	6	234102	234107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384866111
5493	NC_017342	ATT	2	6	234114	234119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384866111
5494	NC_017342	CTC	2	6	234158	234163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5495	NC_017342	A	6	6	234222	234227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017342	AATT	2	8	234242	234249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017342	ATTC	2	8	234253	234260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5498	NC_017342	TG	3	6	234301	234306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_017342	ATC	2	6	234315	234320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_017342	CTCAT	2	10	234336	234345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

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