MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_017341	AAC	2	6	1837726	1837731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44003	NC_017341	ATT	2	6	1837754	1837759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_017341	ATT	2	6	1837761	1837766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862336
44005	NC_017341	ATT	2	6	1837810	1837815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862336
44006	NC_017341	ACG	2	6	1837837	1837842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862336
44007	NC_017341	AAC	2	6	1837897	1837902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862336
44008	NC_017341	TGT	2	6	1838086	1838091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862336
44009	NC_017341	CGATAC	2	12	1838184	1838195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384862336
44010	NC_017341	ATCCA	2	10	1838243	1838252	40 %	20 %	0 %	40 %	384862336
44011	NC_017341	CCT	2	6	1838262	1838267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44012	NC_017341	TAA	2	6	1838278	1838283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44013	NC_017341	TAA	3	9	1838290	1838298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44014	NC_017341	TAC	2	6	1838306	1838311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44015	NC_017341	TAT	2	6	1838314	1838319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_017341	ATAA	2	8	1838397	1838404	75 %	25 %	0 %	0 %	384862337
44017	NC_017341	ATTA	2	8	1838450	1838457	50 %	50 %	0 %	0 %	384862337
44018	NC_017341	GT	3	6	1838610	1838615	0 %	50 %	50 %	0 %	384862337
44019	NC_017341	CAA	2	6	1838629	1838634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862337
44020	NC_017341	CTT	2	6	1838635	1838640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862337
44021	NC_017341	TTTC	2	8	1838651	1838658	0 %	75 %	0 %	25 %	384862337
44022	NC_017341	ATC	2	6	1838705	1838710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862337
44023	NC_017341	ACG	2	6	1838747	1838752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862337
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44025	NC_017341	CTT	2	6	1838779	1838784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862337
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44032	NC_017341	GAT	2	6	1839115	1839120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862337
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44034	NC_017341	ATA	2	6	1839283	1839288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862337
44035	NC_017341	TGT	2	6	1839293	1839298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862337
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44037	NC_017341	A	6	6	1839360	1839365	100 %	0 %	0 %	0 %	384862337
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44041	NC_017341	TTA	2	6	1839471	1839476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862337
44042	NC_017341	CATG	2	8	1839574	1839581	25 %	25 %	25 %	25 %	384862337
44043	NC_017341	GT	3	6	1839632	1839637	0 %	50 %	50 %	0 %	384862337
44044	NC_017341	TA	3	6	1839641	1839646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44045	NC_017341	ATT	2	6	1839663	1839668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862338
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44047	NC_017341	TGC	2	6	1839766	1839771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384862338
44048	NC_017341	TAT	2	6	1839774	1839779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862338
44049	NC_017341	ATG	2	6	1839807	1839812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862338
44050	NC_017341	CAT	2	6	1839849	1839854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44051	NC_017341	AAT	2	6	1839857	1839862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862338
44052	NC_017341	TTGTGT	2	12	1839874	1839885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862338
44053	NC_017341	T	7	7	1839885	1839891	0 %	100 %	0 %	0 %	384862338
44054	NC_017341	CAA	2	6	1839892	1839897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862338
44055	NC_017341	ATAG	2	8	1839912	1839919	50 %	25 %	25 %	0 %	384862338
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44059	NC_017341	TCA	2	6	1839968	1839973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
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44112	NC_017341	GATT	2	8	1842158	1842165	25 %	50 %	25 %	0 %	384862338
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44116	NC_017341	TCA	2	6	1842248	1842253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44117	NC_017341	TTGTT	2	10	1842262	1842271	0 %	80 %	20 %	0 %	384862338
44118	NC_017341	AACT	2	8	1842288	1842295	50 %	25 %	0 %	25 %	384862338
44119	NC_017341	TCA	2	6	1842371	1842376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44120	NC_017341	TAT	2	6	1842432	1842437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862338
44121	NC_017341	ATC	2	6	1842451	1842456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44122	NC_017341	TCA	2	6	1842506	1842511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44123	NC_017341	TTC	2	6	1842550	1842555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862338
44124	NC_017341	TTG	2	6	1842562	1842567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862338
44125	NC_017341	T	6	6	1842574	1842579	0 %	100 %	0 %	0 %	384862338
44126	NC_017341	CAA	2	6	1842630	1842635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862338
44127	NC_017341	TAT	2	6	1842669	1842674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862338
44128	NC_017341	AAT	2	6	1842684	1842689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862338
44129	NC_017341	TGT	2	6	1842703	1842708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862338
44130	NC_017341	TGA	2	6	1842709	1842714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862338
44131	NC_017341	TCA	2	6	1842722	1842727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
44132	NC_017341	GAT	2	6	1842728	1842733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862338
44133	NC_017341	ACA	2	6	1842755	1842760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862338
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44135	NC_017341	CTTT	2	8	1842950	1842957	0 %	75 %	0 %	25 %	384862338
44136	NC_017341	GAT	2	6	1842987	1842992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862338
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44138	NC_017341	GTT	2	6	1843146	1843151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862338
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44141	NC_017341	TCT	2	6	1843183	1843188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862338
44142	NC_017341	TTTG	2	8	1843224	1843231	0 %	75 %	25 %	0 %	384862338
44143	NC_017341	CATTTT	2	12	1843290	1843301	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384862338
44144	NC_017341	GAC	2	6	1843341	1843346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384862338
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44146	NC_017341	T	7	7	1843416	1843422	0 %	100 %	0 %	0 %	384862338
44147	NC_017341	TCA	2	6	1843439	1843444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862338
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44149	NC_017341	CCTT	2	8	1843499	1843506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44150	NC_017341	ATT	2	6	1843508	1843513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862339
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44157	NC_017341	ATTTA	2	10	1843848	1843857	40 %	60 %	0 %	0 %	384862339
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44164	NC_017341	AAAT	2	8	1844094	1844101	75 %	25 %	0 %	0 %	384862339
44165	NC_017341	ATT	2	6	1844127	1844132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44166	NC_017341	TTA	2	6	1844144	1844149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862340
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44182	NC_017341	T	7	7	1844694	1844700	0 %	100 %	0 %	0 %	384862340
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44187	NC_017341	T	6	6	1844824	1844829	0 %	100 %	0 %	0 %	384862340
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44192	NC_017341	TA	3	6	1845177	1845182	50 %	50 %	0 %	0 %	384862341
44193	NC_017341	ATA	2	6	1845203	1845208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862341
44194	NC_017341	TTG	2	6	1845376	1845381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862341
44195	NC_017341	GTT	2	6	1845393	1845398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862341
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44197	NC_017341	TA	4	8	1845427	1845434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44198	NC_017341	ATA	2	6	1845446	1845451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44199	NC_017341	GTT	2	6	1845452	1845457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44202	NC_017341	AT	3	6	1845582	1845587	50 %	50 %	0 %	0 %	384862342
44203	NC_017341	CCA	2	6	1845645	1845650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384862342
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44215	NC_017341	T	6	6	1846376	1846381	0 %	100 %	0 %	0 %	384862342
44216	NC_017341	A	6	6	1846388	1846393	100 %	0 %	0 %	0 %	384862342
44217	NC_017341	TACG	2	8	1846424	1846431	25 %	25 %	25 %	25 %	384862342
44218	NC_017341	T	6	6	1846455	1846460	0 %	100 %	0 %	0 %	384862342
44219	NC_017341	CTT	3	9	1846462	1846470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384862342
44220	NC_017341	T	6	6	1846526	1846531	0 %	100 %	0 %	0 %	384862342
44221	NC_017341	TTA	2	6	1846566	1846571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44222	NC_017341	ATC	2	6	1846573	1846578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44223	NC_017341	ATG	2	6	1846627	1846632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862343
44224	NC_017341	AT	3	6	1846644	1846649	50 %	50 %	0 %	0 %	384862343
44225	NC_017341	CAA	2	6	1846655	1846660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384862343
44226	NC_017341	ATT	2	6	1846681	1846686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862343
44227	NC_017341	ATC	2	6	1846699	1846704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384862343
44228	NC_017341	TTA	2	6	1846709	1846714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862343
44229	NC_017341	AT	3	6	1846785	1846790	50 %	50 %	0 %	0 %	384862343
44230	NC_017341	GTTTA	2	10	1846832	1846841	20 %	60 %	20 %	0 %	384862343
44231	NC_017341	ATTTG	2	10	1846958	1846967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44232	NC_017341	T	6	6	1847025	1847030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44233	NC_017341	TTA	2	6	1847070	1847075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862344
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44235	NC_017341	AGT	2	6	1847143	1847148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384862344
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44263	NC_017341	AATA	2	8	1848381	1848388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44354	NC_017341	TTG	2	6	1852272	1852277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384862349
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44356	NC_017341	TAA	2	6	1852376	1852381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384862349
44357	NC_017341	GTCAC	2	10	1852396	1852405	20 %	20 %	20 %	40 %	384862349
44358	NC_017341	ATT	2	6	1852497	1852502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862349
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44388	NC_017341	TA	3	6	1853537	1853542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44390	NC_017341	CGAA	2	8	1853621	1853628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44393	NC_017341	TTC	2	6	1853842	1853847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44395	NC_017341	ATATT	2	10	1853919	1853928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44458	NC_017341	TTA	2	6	1856909	1856914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44459	NC_017341	ATT	2	6	1856959	1856964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44460	NC_017341	AT	3	6	1856969	1856974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44461	NC_017341	TAC	2	6	1857092	1857097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44462	NC_017341	CATACA	2	12	1857142	1857153	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44463	NC_017341	T	6	6	1857160	1857165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44464	NC_017341	AT	3	6	1857184	1857189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44465	NC_017341	A	6	6	1857235	1857240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44466	NC_017341	GGA	2	6	1857280	1857285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44467	NC_017341	ATT	2	6	1857305	1857310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862353
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44469	NC_017341	GT	3	6	1857369	1857374	0 %	50 %	50 %	0 %	384862353
44470	NC_017341	A	7	7	1857384	1857390	100 %	0 %	0 %	0 %	384862353
44471	NC_017341	TGG	2	6	1857421	1857426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384862353
44472	NC_017341	GTAAC	2	10	1857435	1857444	40 %	20 %	20 %	20 %	384862353
44473	NC_017341	ATT	2	6	1857467	1857472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384862353
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