MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017341	TAA	2	6	42393	42398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860715
1003	NC_017341	T	6	6	42401	42406	0 %	100 %	0 %	0 %	384860715
1004	NC_017341	TTC	2	6	42414	42419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860715
1005	NC_017341	ATG	2	6	42473	42478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860715
1006	NC_017341	AT	3	6	42511	42516	50 %	50 %	0 %	0 %	384860715
1007	NC_017341	TAG	2	6	42543	42548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860715
1008	NC_017341	AGA	2	6	42607	42612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017341	TAT	2	6	42662	42667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017341	TTA	2	6	42724	42729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017341	CA	3	6	42736	42741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_017341	AGA	2	6	42750	42755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017341	AG	3	6	42874	42879	50 %	0 %	50 %	0 %	384860716
1014	NC_017341	GAA	2	6	42892	42897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860716
1015	NC_017341	AGA	2	6	42993	42998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860716
1016	NC_017341	TGA	2	6	43049	43054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017341	AAAT	2	8	43079	43086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017341	T	6	6	43106	43111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017341	T	7	7	43134	43140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017341	TC	3	6	43195	43200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_017341	TAA	2	6	43284	43289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017341	T	6	6	43663	43668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017341	ATGAG	2	10	43673	43682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017341	CTT	2	6	43720	43725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017341	ATA	2	6	43777	43782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017341	TTAA	2	8	43791	43798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017341	AAAAAT	2	12	43799	43810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017341	CAT	2	6	43884	43889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860717
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1030	NC_017341	AAC	2	6	43956	43961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860717
1031	NC_017341	TCAT	2	8	43968	43975	25 %	50 %	0 %	25 %	384860717
1032	NC_017341	GAT	2	6	43976	43981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860717
1033	NC_017341	TGAAT	2	10	44020	44029	40 %	40 %	20 %	0 %	384860717
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1035	NC_017341	TTGGT	2	10	44062	44071	0 %	60 %	40 %	0 %	384860717
1036	NC_017341	GAT	2	6	44105	44110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860717
1037	NC_017341	GTA	2	6	44111	44116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860717
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1039	NC_017341	GAA	2	6	44216	44221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860717
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1041	NC_017341	TGT	2	6	44272	44277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860717
1042	NC_017341	AGA	2	6	44293	44298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860717
1043	NC_017341	TTCGT	2	10	44341	44350	0 %	60 %	20 %	20 %	384860717
1044	NC_017341	AAG	2	6	44442	44447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860717
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1046	NC_017341	A	6	6	44632	44637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017341	AAGA	2	8	44649	44656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017341	GA	3	6	44655	44660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017341	AT	3	6	44662	44667	50 %	50 %	0 %	0 %	384860718
1050	NC_017341	GAT	2	6	44675	44680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860718
1051	NC_017341	TAG	2	6	44685	44690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860718
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1055	NC_017341	AT	3	6	44767	44772	50 %	50 %	0 %	0 %	384860718
1056	NC_017341	GCAT	2	8	44829	44836	25 %	25 %	25 %	25 %	384860718
1057	NC_017341	AGA	2	6	44866	44871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860718
1058	NC_017341	GAA	2	6	44885	44890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860718
1059	NC_017341	TTA	2	6	44925	44930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860718
1060	NC_017341	A	7	7	44992	44998	100 %	0 %	0 %	0 %	384860718
1061	NC_017341	AATGAA	2	12	45035	45046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384860718
1062	NC_017341	TTA	2	6	45078	45083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860718
1063	NC_017341	ATA	2	6	45091	45096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860718
1064	NC_017341	T	6	6	45158	45163	0 %	100 %	0 %	0 %	384860719
1065	NC_017341	TCA	2	6	45183	45188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860719
1066	NC_017341	TAGC	2	8	45216	45223	25 %	25 %	25 %	25 %	384860719
1067	NC_017341	CAT	3	9	45260	45268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860719
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1092	NC_017341	TAT	2	6	46231	46236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860719
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1100	NC_017341	AAT	2	6	46748	46753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860719
1101	NC_017341	TCT	2	6	46788	46793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860719
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1103	NC_017341	GTTT	2	8	46835	46842	0 %	75 %	25 %	0 %	384860719
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1108	NC_017341	TAT	2	6	47050	47055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860719
1109	NC_017341	AT	3	6	47084	47089	50 %	50 %	0 %	0 %	384860719
1110	NC_017341	ACAACT	2	12	47100	47111	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384860719
1111	NC_017341	TCA	2	6	47143	47148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860719
1112	NC_017341	TCC	2	6	47152	47157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017341	TA	3	6	47159	47164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017341	GTA	2	6	47176	47181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017341	GTA	2	6	47192	47197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017341	AAT	2	6	47208	47213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017341	ATC	2	6	47251	47256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860720
1118	NC_017341	T	6	6	47257	47262	0 %	100 %	0 %	0 %	384860720
1119	NC_017341	T	7	7	47304	47310	0 %	100 %	0 %	0 %	384860720
1120	NC_017341	TA	3	6	47324	47329	50 %	50 %	0 %	0 %	384860720
1121	NC_017341	TTA	2	6	47366	47371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860720
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1130	NC_017341	TGT	2	6	47905	47910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860720
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1500	NC_017341	TTG	2	6	62969	62974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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