MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017341	TAT	2	6	20545	20550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860698
502	NC_017341	GCAT	2	8	20568	20575	25 %	25 %	25 %	25 %	384860698
503	NC_017341	ATG	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
504	NC_017341	ATG	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
505	NC_017341	ATC	2	6	20685	20690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860698
506	NC_017341	CAG	2	6	20825	20830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860698
507	NC_017341	GGTA	2	8	21075	21082	25 %	25 %	50 %	0 %	384860698
508	NC_017341	TGA	2	6	21108	21113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
509	NC_017341	GTC	2	6	21152	21157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860698
510	NC_017341	TGATTG	2	12	21185	21196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384860698
511	NC_017341	ACT	2	6	21197	21202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860698
512	NC_017341	ACA	2	6	21246	21251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860698
513	NC_017341	TC	3	6	21266	21271	0 %	50 %	0 %	50 %	384860698
514	NC_017341	GTG	2	6	21335	21340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860698
515	NC_017341	AAC	2	6	21344	21349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860698
516	NC_017341	ATG	2	6	21367	21372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
517	NC_017341	TGA	2	6	21435	21440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
518	NC_017341	GTG	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860698
519	NC_017341	GAT	2	6	21466	21471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
520	NC_017341	GAT	2	6	21475	21480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
521	NC_017341	GGT	2	6	21481	21486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860698
522	NC_017341	ATG	2	6	21503	21508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
523	NC_017341	ATC	2	6	21526	21531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860698
524	NC_017341	AGTTA	2	10	21564	21573	40 %	40 %	20 %	0 %	384860698
525	NC_017341	ATA	2	6	21590	21595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860698
526	NC_017341	ATG	2	6	21628	21633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860698
527	NC_017341	A	7	7	21635	21641	100 %	0 %	0 %	0 %	384860698
528	NC_017341	AAT	2	6	21654	21659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017341	AT	3	6	21709	21714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017341	TGA	2	6	21736	21741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017341	TCA	2	6	21918	21923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860699
532	NC_017341	GTA	2	6	21927	21932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860699
533	NC_017341	AAGGAA	2	12	21955	21966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
534	NC_017341	CG	3	6	22004	22009	0 %	0 %	50 %	50 %	384860699
535	NC_017341	GGT	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860699
536	NC_017341	AAT	2	6	22023	22028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860699
537	NC_017341	GTT	2	6	22131	22136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860699
538	NC_017341	GAA	2	6	22260	22265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
539	NC_017341	ATA	2	6	22279	22284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860699
540	NC_017341	A	6	6	22299	22304	100 %	0 %	0 %	0 %	384860699
541	NC_017341	ATT	2	6	22388	22393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860699
542	NC_017341	CAT	2	6	22453	22458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860699
543	NC_017341	TGA	2	6	22460	22465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860699
544	NC_017341	GAA	2	6	22473	22478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
545	NC_017341	TAT	2	6	22479	22484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860699
546	NC_017341	GCA	2	6	22485	22490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860699
547	NC_017341	ATT	2	6	22754	22759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860699
548	NC_017341	CAT	2	6	22773	22778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860699
549	NC_017341	ACA	3	9	22806	22814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860699
550	NC_017341	CGT	2	6	22824	22829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860699
551	NC_017341	GGTT	2	8	22833	22840	0 %	50 %	50 %	0 %	384860699
552	NC_017341	TCG	2	6	22865	22870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860699
553	NC_017341	AGA	2	6	23045	23050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
554	NC_017341	AGA	2	6	23072	23077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860699
555	NC_017341	ATGTA	2	10	23123	23132	40 %	40 %	20 %	0 %	384860699
556	NC_017341	TCT	2	6	23143	23148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860699
557	NC_017341	AACA	2	8	23167	23174	75 %	0 %	0 %	25 %	384860699
558	NC_017341	TA	3	6	23204	23209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017341	AGG	2	6	23258	23263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017341	TCGAT	2	10	23287	23296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
561	NC_017341	A	6	6	23306	23311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017341	GGT	2	6	23324	23329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017341	AGA	2	6	23348	23353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017341	GAT	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017341	ATT	2	6	23489	23494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017341	ATA	2	6	23495	23500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017341	TTC	2	6	23540	23545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017341	A	6	6	23546	23551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017341	A	6	6	23569	23574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017341	ATCT	2	8	23607	23614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017341	CGG	2	6	23665	23670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017341	T	6	6	23703	23708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017341	GCCT	2	8	23735	23742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017341	T	6	6	23811	23816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017341	ATATT	2	10	23824	23833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017341	T	6	6	23955	23960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017341	TTA	2	6	23981	23986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017341	ATA	2	6	24035	24040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017341	TATT	2	8	24042	24049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017341	T	6	6	24081	24086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017341	TAA	2	6	24095	24100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017341	CCG	2	6	24155	24160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_017341	TAA	2	6	24169	24174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017341	A	6	6	24173	24178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017341	AT	3	6	24184	24189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017341	TA	3	6	24235	24240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017341	T	6	6	24309	24314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017341	A	6	6	24339	24344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017341	ATA	2	6	24352	24357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017341	GTT	2	6	24400	24405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860700
591	NC_017341	TGA	3	9	24411	24419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860700
592	NC_017341	A	7	7	24453	24459	100 %	0 %	0 %	0 %	384860700
593	NC_017341	ATG	2	6	24494	24499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860700
594	NC_017341	GAA	3	9	24517	24525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860700
595	NC_017341	A	6	6	24595	24600	100 %	0 %	0 %	0 %	384860700
596	NC_017341	CGT	2	6	24739	24744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860700
597	NC_017341	A	6	6	24835	24840	100 %	0 %	0 %	0 %	384860700
598	NC_017341	TGAATT	2	12	24870	24881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384860700
599	NC_017341	ATT	2	6	24887	24892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860700
600	NC_017341	TTA	2	6	24931	24936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860700
601	NC_017341	GTAC	2	8	24970	24977	25 %	25 %	25 %	25 %	384860700
602	NC_017341	TCG	2	6	24993	24998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860700
603	NC_017341	GAT	2	6	25018	25023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860700
604	NC_017341	AT	3	6	25038	25043	50 %	50 %	0 %	0 %	384860700
605	NC_017341	TCC	2	6	25070	25075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384860700
606	NC_017341	AAC	2	6	25076	25081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860700
607	NC_017341	AAC	2	6	25115	25120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860701
608	NC_017341	GCT	2	6	25221	25226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860701
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610	NC_017341	TTA	2	6	25336	25341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
611	NC_017341	ATT	3	9	25399	25407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
612	NC_017341	CGA	3	9	25409	25417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860701
613	NC_017341	AATC	2	8	25437	25444	50 %	25 %	0 %	25 %	384860701
614	NC_017341	GGT	2	6	25525	25530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860701
615	NC_017341	TA	3	6	25547	25552	50 %	50 %	0 %	0 %	384860701
616	NC_017341	ATA	2	6	25634	25639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
617	NC_017341	TTG	2	6	25655	25660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860701
618	NC_017341	ATT	2	6	25674	25679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
619	NC_017341	ACCAA	2	10	25720	25729	60 %	0 %	0 %	40 %	384860701
620	NC_017341	ATG	2	6	25802	25807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860701
621	NC_017341	TAA	2	6	25833	25838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
622	NC_017341	AAG	2	6	25856	25861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
623	NC_017341	TAT	2	6	25926	25931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860701
624	NC_017341	CGT	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860701
625	NC_017341	CGTATT	2	12	25951	25962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860701
626	NC_017341	AGA	2	6	26001	26006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
627	NC_017341	CAT	2	6	26007	26012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860701
628	NC_017341	GAA	2	6	26062	26067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
629	NC_017341	AAT	2	6	26077	26082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860701
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631	NC_017341	GAA	3	9	26107	26115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860701
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756	NC_017341	TGGCG	2	10	31449	31458	0 %	20 %	60 %	20 %	384860705
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