MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017341	GTT	2	6	209016	209021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860848
5002	NC_017341	GT	3	6	209026	209031	0 %	50 %	50 %	0 %	384860848
5003	NC_017341	TAA	2	6	209074	209079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860848
5004	NC_017341	CAT	2	6	209110	209115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860848
5005	NC_017341	ATT	2	6	209133	209138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860848
5006	NC_017341	ATT	2	6	209169	209174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860848
5007	NC_017341	CAT	2	6	209197	209202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860848
5008	NC_017341	GCA	2	6	209259	209264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860848
5009	NC_017341	AAC	2	6	209372	209377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860848
5010	NC_017341	AGT	2	6	209379	209384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860848
5011	NC_017341	GTA	2	6	209449	209454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860848
5012	NC_017341	ACT	2	6	209455	209460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860848
5013	NC_017341	TAT	2	6	209501	209506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860848
5014	NC_017341	TCG	2	6	209509	209514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860848
5015	NC_017341	GAA	2	6	209595	209600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860849
5016	NC_017341	GCGA	2	8	209705	209712	25 %	0 %	50 %	25 %	384860849
5017	NC_017341	CAAG	2	8	209734	209741	50 %	0 %	25 %	25 %	384860849
5018	NC_017341	CTATG	2	10	209904	209913	20 %	40 %	20 %	20 %	384860849
5019	NC_017341	ATT	2	6	209919	209924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860849
5020	NC_017341	GTT	2	6	209973	209978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860849
5021	NC_017341	AAAC	2	8	210013	210020	75 %	0 %	0 %	25 %	384860849
5022	NC_017341	A	6	6	210084	210089	100 %	0 %	0 %	0 %	384860849
5023	NC_017341	CAA	2	6	210163	210168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860849
5024	NC_017341	ACA	2	6	210176	210181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860849
5025	NC_017341	TAG	2	6	210183	210188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860849
5026	NC_017341	TGA	2	6	210212	210217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860849
5027	NC_017341	CAA	2	6	210220	210225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860849
5028	NC_017341	AATATG	2	12	210286	210297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384860849
5029	NC_017341	TTA	4	12	210307	210318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860849
5030	NC_017341	AAC	2	6	210336	210341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860849
5031	NC_017341	TTA	2	6	210400	210405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860849
5032	NC_017341	GAT	3	9	210409	210417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860849
5033	NC_017341	TAGA	2	8	210494	210501	50 %	25 %	25 %	0 %	384860849
5034	NC_017341	AAT	2	6	210529	210534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860849
5035	NC_017341	AAGGAC	2	12	210610	210621	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384860849
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5038	NC_017341	GGCA	2	8	210780	210787	25 %	0 %	50 %	25 %	384860849
5039	NC_017341	A	6	6	210796	210801	100 %	0 %	0 %	0 %	384860849
5040	NC_017341	A	6	6	210876	210881	100 %	0 %	0 %	0 %	384860849
5041	NC_017341	AAT	2	6	211033	211038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860849
5042	NC_017341	TTAA	2	8	211105	211112	50 %	50 %	0 %	0 %	384860849
5043	NC_017341	ATT	2	6	211132	211137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860849
5044	NC_017341	AGTC	2	8	211154	211161	25 %	25 %	25 %	25 %	384860849
5045	NC_017341	A	6	6	211180	211185	100 %	0 %	0 %	0 %	384860849
5046	NC_017341	AGT	2	6	211221	211226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860849
5047	NC_017341	TTA	2	6	211250	211255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860849
5048	NC_017341	AAT	2	6	211364	211369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860849
5049	NC_017341	AGG	2	6	211393	211398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017341	AAG	2	6	211446	211451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860850
5051	NC_017341	TGG	3	9	211585	211593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860850
5052	NC_017341	TAT	2	6	211607	211612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860850
5053	NC_017341	ACAA	2	8	211674	211681	75 %	0 %	0 %	25 %	384860850
5054	NC_017341	GAT	2	6	211691	211696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860850
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5056	NC_017341	TAAT	2	8	211818	211825	50 %	50 %	0 %	0 %	384860850
5057	NC_017341	CG	3	6	211897	211902	0 %	0 %	50 %	50 %	384860850
5058	NC_017341	GATTG	2	10	211967	211976	20 %	40 %	40 %	0 %	384860850
5059	NC_017341	TGT	2	6	212068	212073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860850
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5061	NC_017341	TTA	2	6	212225	212230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860850
5062	NC_017341	CAT	2	6	212279	212284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860850
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5064	NC_017341	GAT	2	6	212336	212341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860850
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5070	NC_017341	AAGG	2	8	212522	212529	50 %	0 %	50 %	0 %	384860850
5071	NC_017341	ATGG	2	8	212618	212625	25 %	25 %	50 %	0 %	384860850
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5088	NC_017341	TGA	2	6	213337	213342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860850
5089	NC_017341	GAAA	2	8	213458	213465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017341	GTA	2	6	213501	213506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_017341	TAGT	2	8	213589	213596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017341	GAT	2	6	213673	213678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017341	CTA	2	6	213719	213724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5096	NC_017341	CAT	2	6	213816	213821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_017341	AAATTT	2	12	213839	213850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017341	TA	3	6	213867	213872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017341	A	8	8	213901	213908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5108	NC_017341	T	6	6	214166	214171	0 %	100 %	0 %	0 %	384860851
5109	NC_017341	CAG	2	6	214198	214203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860851
5110	NC_017341	AT	3	6	214242	214247	50 %	50 %	0 %	0 %	384860851
5111	NC_017341	GAAA	2	8	214265	214272	75 %	0 %	25 %	0 %	384860851
5112	NC_017341	TTC	2	6	214319	214324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860851
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5114	NC_017341	AAAT	2	8	214442	214449	75 %	25 %	0 %	0 %	384860851
5115	NC_017341	TGT	3	9	214476	214484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860851
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5118	NC_017341	ATT	2	6	214617	214622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017341	ATCA	2	8	214644	214651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_017341	CAT	2	6	214667	214672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017341	TTC	2	6	214674	214679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017341	TAC	2	6	214695	214700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017341	AT	3	6	214742	214747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_017341	GGAT	2	8	214771	214778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_017341	TTCTTG	2	12	220180	220191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384860856
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5499	NC_017341	GACG	2	8	231281	231288	25 %	0 %	50 %	25 %	384860865
5500	NC_017341	TAT	2	6	231369	231374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860865

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