MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 plasmid pSaa6159

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017339	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551480
2	NC_017339	ATT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
3	NC_017339	TTA	2	6	62	67	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
4	NC_017339	TAT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
5	NC_017339	ACA	2	6	122	127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551480
6	NC_017339	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551480
7	NC_017339	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551480
8	NC_017339	TAC	3	9	390	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017339	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017339	AGC	2	6	503	508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017339	AAG	2	6	539	544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017339	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017339	ATC	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017339	TGG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017339	TGA	2	6	989	994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017339	GAA	3	9	1011	1019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017339	ATT	3	9	1056	1064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017339	AGA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017339	TCG	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017339	GTA	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017339	CGA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017339	ACG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017339	TAA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017339	GAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017339	ATT	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017339	TAT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
27	NC_017339	GTT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
28	NC_017339	GCT	3	9	2304	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551481
29	NC_017339	CAG	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551481
30	NC_017339	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
31	NC_017339	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
32	NC_017339	TAT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
33	NC_017339	ATG	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551481
34	NC_017339	ATA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551481
35	NC_017339	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551481
36	NC_017339	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551481
37	NC_017339	TTA	3	9	2851	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551481
38	NC_017339	AGA	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
39	NC_017339	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551482
40	NC_017339	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
41	NC_017339	AGA	2	6	3080	3085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551482
42	NC_017339	CAT	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551482
43	NC_017339	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
44	NC_017339	TTA	2	6	3214	3219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551482
45	NC_017339	AGG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384551482
46	NC_017339	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017339	GAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017339	GAT	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017339	ATA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017339	CAT	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017339	TCA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017339	TAT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017339	CAA	2	6	3521	3526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017339	AGT	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017339	TAG	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017339	ATA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017339	AGT	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017339	TCA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551483
59	NC_017339	AGA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
60	NC_017339	AGT	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
61	NC_017339	TAA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
62	NC_017339	CAG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384551483
63	NC_017339	AGT	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
64	NC_017339	ATA	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
65	NC_017339	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551483
66	NC_017339	GAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
67	NC_017339	AGA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551483
68	NC_017339	TGA	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551483
69	NC_017339	AAT	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
70	NC_017339	ATA	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551483
71	NC_017339	TTG	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017339	TAA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017339	TAT	2	6	4834	4839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551484
74	NC_017339	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551484
75	NC_017339	TCG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
76	NC_017339	TCA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
77	NC_017339	CTA	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551484
78	NC_017339	ACA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551484
79	NC_017339	CTG	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551484
80	NC_017339	TCT	2	6	5773	5778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017339	CAA	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017339	TAA	2	6	6019	6024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017339	GTT	2	6	6030	6035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017339	TTC	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017339	TTA	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017339	ATT	2	6	6196	6201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017339	GTT	2	6	6219	6224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017339	ATG	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017339	ATA	3	9	6519	6527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
90	NC_017339	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551485
91	NC_017339	TAA	2	6	6709	6714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551485
92	NC_017339	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551485
93	NC_017339	TCA	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551485
94	NC_017339	TCC	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
95	NC_017339	TTG	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551486
96	NC_017339	TGC	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
97	NC_017339	GAA	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551486
98	NC_017339	TGC	2	6	7317	7322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384551486
99	NC_017339	ATA	2	6	7334	7339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551486
100	NC_017339	TCT	2	6	7378	7383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551486
101	NC_017339	TCC	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
102	NC_017339	ACA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384551486
103	NC_017339	TCC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384551486
104	NC_017339	CCT	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017339	AGA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017339	TAA	2	6	7825	7830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017339	TAA	2	6	7862	7867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017339	TAT	2	6	7891	7896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017339	TTC	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
110	NC_017339	TTC	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
111	NC_017339	TTA	2	6	8031	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551487
112	NC_017339	TCT	2	6	8070	8075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
113	NC_017339	TGA	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384551487
114	NC_017339	CTT	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551487
115	NC_017339	TTA	2	6	8330	8335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
116	NC_017339	ATA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
117	NC_017339	ACC	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384551488
118	NC_017339	ATT	2	6	8430	8435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
119	NC_017339	AAT	2	6	8503	8508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
120	NC_017339	GAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384551488
121	NC_017339	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551488
122	NC_017339	CTT	2	6	9143	9148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551488
123	NC_017339	TTG	2	6	9214	9219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384551488
124	NC_017339	ATA	2	6	9247	9252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
125	NC_017339	ATT	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
126	NC_017339	ATA	3	9	9373	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
127	NC_017339	TAT	2	6	9447	9452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
128	NC_017339	ATA	2	6	9505	9510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
129	NC_017339	ATA	2	6	9665	9670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
130	NC_017339	ATA	2	6	9697	9702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551488
131	NC_017339	TGG	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384551488
132	NC_017339	ATT	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
133	NC_017339	ATT	2	6	9858	9863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
134	NC_017339	TAC	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384551488
135	NC_017339	ATT	2	6	10024	10029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384551488
136	NC_017339	CTT	2	6	10052	10057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384551488
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259	NC_017339	TAA	2	6	17626	17631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384551498
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307	NC_017339	TAA	2	6	20675	20680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.