MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 67367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017338	AAG	2	6	42278	42283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017338	GCTAAA	2	12	42376	42387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1003	NC_017338	CCA	2	6	42430	42435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_017338	A	6	6	42443	42448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017338	AGCA	2	8	42470	42477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017338	A	7	7	42500	42506	100 %	0 %	0 %	0 %	384548956
1007	NC_017338	A	6	6	42549	42554	100 %	0 %	0 %	0 %	384548956
1008	NC_017338	ATA	2	6	42571	42576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548956
1009	NC_017338	T	6	6	42588	42593	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1010	NC_017338	T	6	6	42599	42604	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1011	NC_017338	ATT	2	6	42606	42611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548956
1012	NC_017338	CTA	2	6	42626	42631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1013	NC_017338	GACA	2	8	42696	42703	50 %	0 %	25 %	25 %	384548956
1014	NC_017338	T	6	6	42778	42783	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1015	NC_017338	TTC	2	6	42841	42846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548956
1016	NC_017338	ATT	2	6	42847	42852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548956
1017	NC_017338	T	7	7	42851	42857	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1018	NC_017338	GTTT	2	8	42858	42865	0 %	75 %	25 %	0 %	384548956
1019	NC_017338	TTGAA	2	10	42866	42875	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
1020	NC_017338	ATC	2	6	42912	42917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1021	NC_017338	TAT	2	6	42995	43000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548956
1022	NC_017338	T	6	6	43071	43076	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1023	NC_017338	AT	3	6	43183	43188	50 %	50 %	0 %	0 %	384548956
1024	NC_017338	TTGAA	2	10	43212	43221	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
1025	NC_017338	ATC	2	6	43234	43239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1026	NC_017338	TTG	2	6	43295	43300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548956
1027	NC_017338	TCT	2	6	43348	43353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548956
1028	NC_017338	CAT	2	6	43373	43378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1029	NC_017338	AAT	2	6	43451	43456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548956
1030	NC_017338	T	6	6	43476	43481	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1031	NC_017338	TTG	2	6	43534	43539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548956
1032	NC_017338	TCT	2	6	43597	43602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548956
1033	NC_017338	TCT	2	6	43624	43629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548956
1034	NC_017338	TCAT	2	8	43687	43694	25 %	50 %	0 %	25 %	384548956
1035	NC_017338	ATC	2	6	43788	43793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1036	NC_017338	AC	3	6	43810	43815	50 %	0 %	0 %	50 %	384548956
1037	NC_017338	AATA	2	8	43830	43837	75 %	25 %	0 %	0 %	384548956
1038	NC_017338	TAA	2	6	43845	43850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548956
1039	NC_017338	AAG	2	6	43895	43900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548956
1040	NC_017338	CAT	2	6	43923	43928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1041	NC_017338	T	6	6	43949	43954	0 %	100 %	0 %	0 %	384548956
1042	NC_017338	TG	3	6	43981	43986	0 %	50 %	50 %	0 %	384548956
1043	NC_017338	CAT	2	6	44010	44015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548956
1044	NC_017338	CAC	2	6	44036	44041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017338	TCG	2	6	44056	44061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017338	CAA	2	6	44084	44089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017338	TTTGT	2	10	44116	44125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017338	TGA	2	6	44222	44227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548957
1049	NC_017338	T	6	6	44230	44235	0 %	100 %	0 %	0 %	384548957
1050	NC_017338	CTTT	2	8	44237	44244	0 %	75 %	0 %	25 %	384548957
1051	NC_017338	AAC	2	6	44289	44294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548957
1052	NC_017338	TCA	2	6	44354	44359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548957
1053	NC_017338	ATA	2	6	44513	44518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548957
1054	NC_017338	TGCA	2	8	44552	44559	25 %	25 %	25 %	25 %	384548957
1055	NC_017338	CTTT	2	8	44561	44568	0 %	75 %	0 %	25 %	384548957
1056	NC_017338	TCA	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548957
1057	NC_017338	TG	3	6	44628	44633	0 %	50 %	50 %	0 %	384548957
1058	NC_017338	TCA	2	6	44654	44659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548957
1059	NC_017338	TTC	2	6	44678	44683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548958
1060	NC_017338	ATA	2	6	44699	44704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548958
1061	NC_017338	T	7	7	44763	44769	0 %	100 %	0 %	0 %	384548958
1062	NC_017338	GTT	2	6	44806	44811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548958
1063	NC_017338	TG	3	6	44820	44825	0 %	50 %	50 %	0 %	384548958
1064	NC_017338	TCT	2	6	44844	44849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548958
1065	NC_017338	T	8	8	44894	44901	0 %	100 %	0 %	0 %	384548958
1066	NC_017338	GATT	2	8	44971	44978	25 %	50 %	25 %	0 %	384548958
1067	NC_017338	TCCC	2	8	44990	44997	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1068	NC_017338	ATG	2	6	45013	45018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017338	GAT	2	6	45021	45026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017338	ATT	2	6	45069	45074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548959
1071	NC_017338	CCT	2	6	45086	45091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548959
1072	NC_017338	TCA	2	6	45110	45115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548959
1073	NC_017338	TGA	2	6	45183	45188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548959
1074	NC_017338	GATA	2	8	45216	45223	50 %	25 %	25 %	0 %	384548959
1075	NC_017338	TCA	2	6	45239	45244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548959
1076	NC_017338	TAG	2	6	45248	45253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548959
1077	NC_017338	TAA	2	6	45294	45299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548959
1078	NC_017338	CTG	2	6	45321	45326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548959
1079	NC_017338	TCC	2	6	45329	45334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548959
1080	NC_017338	TTA	2	6	45359	45364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548959
1081	NC_017338	TA	3	6	45385	45390	50 %	50 %	0 %	0 %	384548959
1082	NC_017338	ATT	2	6	45421	45426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017338	CCT	2	6	45428	45433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_017338	CAT	2	6	45464	45469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017338	ATA	2	6	45474	45479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017338	TA	3	6	45478	45483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017338	TTA	2	6	45497	45502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017338	ACAA	2	8	45594	45601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017338	ATT	2	6	45609	45614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017338	TGA	2	6	45624	45629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017338	TA	4	8	45652	45659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017338	TTAT	3	12	45660	45671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017338	TTC	2	6	45717	45722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017338	A	6	6	45752	45757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017338	A	6	6	45809	45814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017338	ATT	2	6	45914	45919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017338	TCG	2	6	46000	46005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548960
1098	NC_017338	GTT	2	6	46007	46012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548960
1099	NC_017338	TAT	2	6	46013	46018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548960
1100	NC_017338	GTT	2	6	46025	46030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548960
1101	NC_017338	TTA	2	6	46042	46047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548960
1102	NC_017338	T	6	6	46071	46076	0 %	100 %	0 %	0 %	384548960
1103	NC_017338	T	6	6	46089	46094	0 %	100 %	0 %	0 %	384548960
1104	NC_017338	ATCA	2	8	46107	46114	50 %	25 %	0 %	25 %	384548960
1105	NC_017338	GATA	2	8	46117	46124	50 %	25 %	25 %	0 %	384548960
1106	NC_017338	TGT	2	6	46174	46179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548960
1107	NC_017338	TTG	2	6	46227	46232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548960
1108	NC_017338	GTTG	2	8	46241	46248	0 %	50 %	50 %	0 %	384548960
1109	NC_017338	TTAT	2	8	46348	46355	25 %	75 %	0 %	0 %	384548960
1110	NC_017338	TCA	2	6	46369	46374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548960
1111	NC_017338	TTG	3	9	46377	46385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548960
1112	NC_017338	TGA	2	6	46402	46407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548960
1113	NC_017338	TTGA	2	8	46434	46441	25 %	50 %	25 %	0 %	384548960
1114	NC_017338	GT	3	6	46443	46448	0 %	50 %	50 %	0 %	384548960
1115	NC_017338	TAC	2	6	46449	46454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548960
1116	NC_017338	TCA	2	6	46499	46504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548960
1117	NC_017338	TAC	2	6	46574	46579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548960
1118	NC_017338	TTGC	2	8	46633	46640	0 %	50 %	25 %	25 %	384548960
1119	NC_017338	AAT	2	6	46671	46676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548960
1120	NC_017338	TGAC	2	8	46720	46727	25 %	25 %	25 %	25 %	384548960
1121	NC_017338	TAA	2	6	46769	46774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548960
1122	NC_017338	ACG	2	6	46824	46829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548960
1123	NC_017338	ATGT	2	8	46894	46901	25 %	50 %	25 %	0 %	384548960
1124	NC_017338	AT	4	8	47006	47013	50 %	50 %	0 %	0 %	384548960
1125	NC_017338	ATA	2	6	47100	47105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548960
1126	NC_017338	CTT	2	6	47108	47113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548960
1127	NC_017338	TTA	2	6	47155	47160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548960
1128	NC_017338	AGA	2	6	47208	47213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548960
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1130	NC_017338	GTTT	2	8	47316	47323	0 %	75 %	25 %	0 %	384548960
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