MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 67367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017338	ATA	2	6	20415	20420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548939
502	NC_017338	TGT	2	6	20431	20436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548939
503	NC_017338	TGAA	2	8	20472	20479	50 %	25 %	25 %	0 %	384548939
504	NC_017338	ACG	2	6	20525	20530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548939
505	NC_017338	TAT	2	6	20543	20548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548939
506	NC_017338	GATT	2	8	20583	20590	25 %	50 %	25 %	0 %	384548939
507	NC_017338	ATG	2	6	20613	20618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
508	NC_017338	ATG	2	6	20625	20630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
509	NC_017338	ATC	2	6	20683	20688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548939
510	NC_017338	CAG	2	6	20823	20828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548939
511	NC_017338	GGTA	2	8	21073	21080	25 %	25 %	50 %	0 %	384548939
512	NC_017338	TGA	2	6	21106	21111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
513	NC_017338	GTC	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548939
514	NC_017338	ACT	2	6	21195	21200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548939
515	NC_017338	ACA	2	6	21244	21249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548939
516	NC_017338	TC	3	6	21264	21269	0 %	50 %	0 %	50 %	384548939
517	NC_017338	GTG	2	6	21333	21338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548939
518	NC_017338	AAC	2	6	21342	21347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548939
519	NC_017338	ATG	2	6	21365	21370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
520	NC_017338	TGA	2	6	21433	21438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
521	NC_017338	GGC	2	6	21452	21457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548939
522	NC_017338	GAT	2	6	21464	21469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
523	NC_017338	GAT	2	6	21473	21478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
524	NC_017338	ATG	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
525	NC_017338	TGAAAT	2	12	21514	21525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384548939
526	NC_017338	CAT	2	6	21526	21531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548939
527	NC_017338	AGTTA	2	10	21562	21571	40 %	40 %	20 %	0 %	384548939
528	NC_017338	ACAAT	2	10	21583	21592	60 %	20 %	0 %	20 %	384548939
529	NC_017338	ATG	2	6	21626	21631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548939
530	NC_017338	A	7	7	21633	21639	100 %	0 %	0 %	0 %	384548939
531	NC_017338	AAT	2	6	21652	21657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017338	AT	3	6	21707	21712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017338	TCA	2	6	21916	21921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548940
534	NC_017338	GTA	2	6	21925	21930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548940
535	NC_017338	AAGGAA	2	12	21953	21964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
536	NC_017338	CG	3	6	22002	22007	0 %	0 %	50 %	50 %	384548940
537	NC_017338	GGT	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548940
538	NC_017338	AAT	2	6	22021	22026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548940
539	NC_017338	GTT	2	6	22129	22134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548940
540	NC_017338	GAA	2	6	22258	22263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
541	NC_017338	A	6	6	22297	22302	100 %	0 %	0 %	0 %	384548940
542	NC_017338	ATT	2	6	22386	22391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548940
543	NC_017338	AAGC	2	8	22411	22418	50 %	0 %	25 %	25 %	384548940
544	NC_017338	CAT	2	6	22451	22456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548940
545	NC_017338	TGA	2	6	22458	22463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548940
546	NC_017338	GAA	2	6	22471	22476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
547	NC_017338	GCA	2	6	22483	22488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548940
548	NC_017338	ATT	2	6	22752	22757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548940
549	NC_017338	CAT	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548940
550	NC_017338	ACA	3	9	22804	22812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548940
551	NC_017338	CGT	2	6	22822	22827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548940
552	NC_017338	GGTT	2	8	22831	22838	0 %	50 %	50 %	0 %	384548940
553	NC_017338	TCG	2	6	22863	22868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548940
554	NC_017338	AGA	2	6	23043	23048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
555	NC_017338	AGA	2	6	23070	23075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548940
556	NC_017338	ATGTA	2	10	23121	23130	40 %	40 %	20 %	0 %	384548940
557	NC_017338	TCT	2	6	23141	23146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548940
558	NC_017338	AACA	2	8	23165	23172	75 %	0 %	0 %	25 %	384548940
559	NC_017338	TA	3	6	23202	23207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017338	AGG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017338	TCGAT	2	10	23285	23294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
562	NC_017338	GAT	2	6	23355	23360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017338	AAG	2	6	23395	23400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017338	A	6	6	23466	23471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017338	ATT	2	6	23487	23492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017338	ATA	2	6	23493	23498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017338	TTC	2	6	23538	23543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017338	A	6	6	23544	23549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017338	A	6	6	23567	23572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017338	ATCT	2	8	23605	23612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017338	CGG	2	6	23663	23668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017338	T	6	6	23701	23706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017338	GCCT	2	8	23733	23740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017338	T	7	7	23809	23815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017338	TTTA	2	8	23886	23893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017338	T	6	6	23954	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017338	ACC	2	6	23969	23974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017338	TATT	2	8	23977	23984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017338	CTT	2	6	23991	23996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017338	ATA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017338	TATT	2	8	24041	24048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017338	T	7	7	24079	24085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017338	ATT	2	6	24139	24144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017338	TAA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017338	A	6	6	24171	24176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017338	AT	3	6	24182	24187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017338	TA	3	6	24233	24238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017338	T	6	6	24307	24312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017338	A	6	6	24337	24342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017338	ATA	2	6	24350	24355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017338	GTT	2	6	24398	24403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548941
592	NC_017338	TGA	3	9	24409	24417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548941
593	NC_017338	A	7	7	24451	24457	100 %	0 %	0 %	0 %	384548941
594	NC_017338	ATG	2	6	24492	24497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548941
595	NC_017338	GAA	3	9	24515	24523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548941
596	NC_017338	TAT	2	6	24534	24539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548941
597	NC_017338	A	6	6	24593	24598	100 %	0 %	0 %	0 %	384548941
598	NC_017338	CGT	2	6	24737	24742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548941
599	NC_017338	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	384548941
600	NC_017338	TGAATT	2	12	24868	24879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384548941
601	NC_017338	ATT	2	6	24885	24890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548941
602	NC_017338	TTA	2	6	24929	24934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548941
603	NC_017338	GTAC	2	8	24968	24975	25 %	25 %	25 %	25 %	384548941
604	NC_017338	TCG	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548941
605	NC_017338	GAT	2	6	25016	25021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548941
606	NC_017338	TCC	2	6	25068	25073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548941
607	NC_017338	AAC	2	6	25074	25079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548941
608	NC_017338	AAC	2	6	25113	25118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548942
609	NC_017338	GCT	2	6	25219	25224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548942
610	NC_017338	AAG	2	6	25235	25240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
611	NC_017338	TTA	2	6	25334	25339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
612	NC_017338	ATT	3	9	25397	25405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
613	NC_017338	CGA	3	9	25407	25415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548942
614	NC_017338	AATC	2	8	25435	25442	50 %	25 %	0 %	25 %	384548942
615	NC_017338	GGT	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548942
616	NC_017338	TA	3	6	25545	25550	50 %	50 %	0 %	0 %	384548942
617	NC_017338	ATA	2	6	25632	25637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
618	NC_017338	TTG	2	6	25653	25658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548942
619	NC_017338	ATT	2	6	25672	25677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
620	NC_017338	ACCAA	2	10	25718	25727	60 %	0 %	0 %	40 %	384548942
621	NC_017338	ATG	2	6	25800	25805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548942
622	NC_017338	TAA	2	6	25831	25836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
623	NC_017338	AAG	2	6	25854	25859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
624	NC_017338	ATT	2	6	25925	25930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
625	NC_017338	CCG	2	6	25939	25944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384548942
626	NC_017338	AGA	2	6	25999	26004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
627	NC_017338	CAT	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548942
628	NC_017338	TTA	2	6	26014	26019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
629	NC_017338	GAA	2	6	26060	26065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
630	NC_017338	AAT	2	6	26075	26080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548942
631	NC_017338	TTA	2	6	26090	26095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548942
632	NC_017338	GAA	3	9	26105	26113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548942
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