MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133 chromosome

Total Repeats: 67561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67501	NC_017337	TCC	2	6	2829912	2829917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548920
67502	NC_017337	CAC	2	6	2829983	2829988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67503	NC_017337	CAT	2	6	2830046	2830051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67504	NC_017337	CCT	2	6	2830073	2830078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67505	NC_017337	CTT	2	6	2830098	2830103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67506	NC_017337	TCA	2	6	2830174	2830179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548921
67507	NC_017337	AAT	2	6	2830194	2830199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548921
67508	NC_017337	CTG	2	6	2830265	2830270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548921
67509	NC_017337	CTTG	2	8	2830297	2830304	0 %	50 %	25 %	25 %	384548921
67510	NC_017337	TAA	2	6	2830308	2830313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548921
67511	NC_017337	CCA	2	6	2830366	2830371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548921
67512	NC_017337	TCA	2	6	2830402	2830407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548921
67513	NC_017337	CTT	2	6	2830412	2830417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67514	NC_017337	TTA	2	6	2830504	2830509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548921
67515	NC_017337	TCT	2	6	2830558	2830563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67516	NC_017337	TCT	2	6	2830646	2830651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67517	NC_017337	CTA	2	6	2830652	2830657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548921
67518	NC_017337	TCT	2	6	2830660	2830665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67519	NC_017337	CAG	2	6	2830679	2830684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548921
67520	NC_017337	TAT	2	6	2830775	2830780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548921
67521	NC_017337	ATT	2	6	2830791	2830796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548921
67522	NC_017337	GAT	2	6	2830804	2830809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548921
67523	NC_017337	CAA	2	6	2830829	2830834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548921
67524	NC_017337	TAA	2	6	2830884	2830889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548921
67525	NC_017337	AGT	2	6	2830938	2830943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548921
67526	NC_017337	CAT	2	6	2830955	2830960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548921
67527	NC_017337	GTT	2	6	2831021	2831026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548921
67528	NC_017337	T	6	6	2831025	2831030	0 %	100 %	0 %	0 %	384548921
67529	NC_017337	GAC	2	6	2831045	2831050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548921
67530	NC_017337	ACC	2	6	2831238	2831243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548921
67531	NC_017337	AATT	2	8	2831249	2831256	50 %	50 %	0 %	0 %	384548921
67532	NC_017337	CTT	2	6	2831312	2831317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67533	NC_017337	CTT	2	6	2831324	2831329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548921
67534	NC_017337	AAT	2	6	2831343	2831348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548921
67535	NC_017337	TAAT	2	8	2831356	2831363	50 %	50 %	0 %	0 %	384548921
67536	NC_017337	CAT	2	6	2831378	2831383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548921
67537	NC_017337	TA	3	6	2831402	2831407	50 %	50 %	0 %	0 %	384548921
67538	NC_017337	CCT	2	6	2831522	2831527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67539	NC_017337	TTA	2	6	2831557	2831562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67540	NC_017337	CTTCC	2	10	2831631	2831640	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67541	NC_017337	CTTA	2	8	2831652	2831659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67542	NC_017337	TTA	2	6	2831666	2831671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67543	NC_017337	GTC	2	6	2831723	2831728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67544	NC_017337	GCTG	2	8	2831738	2831745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67545	NC_017337	AAT	2	6	2831758	2831763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67546	NC_017337	AT	3	6	2831775	2831780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67547	NC_017337	T	6	6	2831851	2831856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67548	NC_017337	TAT	2	6	2831895	2831900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67549	NC_017337	ACA	2	6	2831912	2831917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67550	NC_017337	T	6	6	2831944	2831949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67551	NC_017337	AT	3	6	2831950	2831955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67552	NC_017337	TTAT	2	8	2832014	2832021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67553	NC_017337	TATT	2	8	2832076	2832083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67554	NC_017337	A	8	8	2832097	2832104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67555	NC_017337	TGA	2	6	2832111	2832116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67556	NC_017337	ACG	3	9	2832154	2832162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548922
67557	NC_017337	GC	3	6	2832163	2832168	0 %	0 %	50 %	50 %	384548922
67558	NC_017337	T	6	6	2832185	2832190	0 %	100 %	0 %	0 %	384548922
67559	NC_017337	ACT	2	6	2832404	2832409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67560	NC_017337	TAC	2	6	2832451	2832456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67561	NC_017337	T	7	7	2832464	2832470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.