MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 68482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017333	GCA	2	6	140943	140948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601423
3502	NC_017333	TGT	2	6	140963	140968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601423
3503	NC_017333	ATG	2	6	140995	141000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601423
3504	NC_017333	AGC	2	6	141032	141037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601423
3505	NC_017333	ATAG	2	8	141072	141079	50 %	25 %	25 %	0 %	387601423
3506	NC_017333	TAT	2	6	141116	141121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601423
3507	NC_017333	TTA	2	6	141176	141181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601423
3508	NC_017333	AAG	2	6	141194	141199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601423
3509	NC_017333	TGG	2	6	141206	141211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601423
3510	NC_017333	AGA	2	6	141293	141298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601423
3511	NC_017333	TGA	2	6	141410	141415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601423
3512	NC_017333	TGAAGA	2	12	141491	141502	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601423
3513	NC_017333	GGCA	2	8	141514	141521	25 %	0 %	50 %	25 %	387601423
3514	NC_017333	ATTT	2	8	141536	141543	25 %	75 %	0 %	0 %	387601423
3515	NC_017333	TGA	2	6	141548	141553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601423
3516	NC_017333	AT	3	6	141564	141569	50 %	50 %	0 %	0 %	387601423
3517	NC_017333	CAT	2	6	141710	141715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601424
3518	NC_017333	GAAC	2	8	141782	141789	50 %	0 %	25 %	25 %	387601424
3519	NC_017333	ATT	2	6	141884	141889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601424
3520	NC_017333	TGG	2	6	141892	141897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601424
3521	NC_017333	AGAC	2	8	141906	141913	50 %	0 %	25 %	25 %	387601424
3522	NC_017333	AGA	2	6	142000	142005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601424
3523	NC_017333	ACACA	2	10	142016	142025	60 %	0 %	0 %	40 %	387601424
3524	NC_017333	TGA	2	6	142120	142125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601424
3525	NC_017333	TTTCAT	2	12	142172	142183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387601424
3526	NC_017333	A	6	6	142241	142246	100 %	0 %	0 %	0 %	387601424
3527	NC_017333	TGG	3	9	142297	142305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601424
3528	NC_017333	AGG	2	6	142513	142518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387601424
3529	NC_017333	CAA	2	6	142523	142528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601424
3530	NC_017333	GCA	2	6	142549	142554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601424
3531	NC_017333	ATTT	3	12	142789	142800	25 %	75 %	0 %	0 %	387601424
3532	NC_017333	CAAA	2	8	142805	142812	75 %	0 %	0 %	25 %	387601424
3533	NC_017333	GGA	2	6	142813	142818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387601424
3534	NC_017333	A	6	6	142911	142916	100 %	0 %	0 %	0 %	387601425
3535	NC_017333	AGT	2	6	142922	142927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601425
3536	NC_017333	GAT	2	6	142937	142942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601425
3537	NC_017333	AT	3	6	142987	142992	50 %	50 %	0 %	0 %	387601425
3538	NC_017333	GT	3	6	143115	143120	0 %	50 %	50 %	0 %	387601425
3539	NC_017333	ACA	2	6	143134	143139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601425
3540	NC_017333	ACT	2	6	143159	143164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601425
3541	NC_017333	GACAA	2	10	143167	143176	60 %	0 %	20 %	20 %	387601425
3542	NC_017333	TTA	2	6	143187	143192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601425
3543	NC_017333	GTT	3	9	143289	143297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601425
3544	NC_017333	AG	3	6	143302	143307	50 %	0 %	50 %	0 %	387601425
3545	NC_017333	CAA	2	6	143339	143344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601425
3546	NC_017333	GTT	2	6	143393	143398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601425
3547	NC_017333	CAG	2	6	143418	143423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601425
3548	NC_017333	GAT	3	9	143492	143500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601425
3549	NC_017333	AAC	2	6	143505	143510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601425
3550	NC_017333	TGG	2	6	143580	143585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601425
3551	NC_017333	ATG	2	6	143618	143623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017333	ATA	2	6	143648	143653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017333	TAAA	2	8	143769	143776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017333	CGT	2	6	143857	143862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601426
3555	NC_017333	T	6	6	143888	143893	0 %	100 %	0 %	0 %	387601426
3556	NC_017333	TCTTA	2	10	143950	143959	20 %	60 %	0 %	20 %	387601426
3557	NC_017333	ACC	2	6	143965	143970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601426
3558	NC_017333	TCA	2	6	144068	144073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601426
3559	NC_017333	GGT	2	6	144082	144087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601426
3560	NC_017333	AGAATG	2	12	144141	144152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601426
3561	NC_017333	TTGAAA	2	12	144159	144170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601426
3562	NC_017333	TAAA	2	8	144247	144254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017333	A	7	7	144271	144277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017333	TCAT	2	8	144288	144295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_017333	TA	3	6	144324	144329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017333	TATT	2	8	144393	144400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017333	ATT	2	6	144418	144423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601427
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3569	NC_017333	AAAG	2	8	144516	144523	75 %	0 %	25 %	0 %	387601427
3570	NC_017333	TAT	2	6	144557	144562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601428
3571	NC_017333	TAT	2	6	144571	144576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601428
3572	NC_017333	GTTT	2	8	144602	144609	0 %	75 %	25 %	0 %	387601428
3573	NC_017333	A	7	7	144632	144638	100 %	0 %	0 %	0 %	387601428
3574	NC_017333	TAC	2	6	144656	144661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601428
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3580	NC_017333	TGA	2	6	144891	144896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601428
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3582	NC_017333	A	7	7	144916	144922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017333	TGT	2	6	145038	145043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017333	GAG	2	6	145091	145096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3586	NC_017333	GTT	2	6	145201	145206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601429
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3593	NC_017333	GT	3	6	145448	145453	0 %	50 %	50 %	0 %	387601429
3594	NC_017333	A	6	6	145486	145491	100 %	0 %	0 %	0 %	387601429
3595	NC_017333	ATG	2	6	145675	145680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601429
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3601	NC_017333	TGG	2	6	145860	145865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601429
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3603	NC_017333	ATAA	2	8	145898	145905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017333	T	6	6	145943	145948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017333	TAA	2	6	145983	145988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017333	ATG	2	6	146009	146014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017333	CAT	2	6	146028	146033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017333	CAT	2	6	146077	146082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_017333	TCATT	2	10	146130	146139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3610	NC_017333	TAAA	2	8	146144	146151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017333	A	6	6	146149	146154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017333	AT	3	6	146192	146197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017333	TGG	2	6	146245	146250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601430
3614	NC_017333	TAG	2	6	146274	146279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601430
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3616	NC_017333	ATG	2	6	146298	146303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601430
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3619	NC_017333	TTAG	2	8	146456	146463	25 %	50 %	25 %	0 %	387601430
3620	NC_017333	TATCT	2	10	146488	146497	20 %	60 %	0 %	20 %	387601430
3621	NC_017333	CGT	2	6	146509	146514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601430
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3623	NC_017333	A	6	6	146543	146548	100 %	0 %	0 %	0 %	387601430
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