MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 68482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017333	A	6	6	20323	20328	100 %	0 %	0 %	0 %	387601306
502	NC_017333	AAG	2	6	20339	20344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601306
503	NC_017333	CTT	2	6	20367	20372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601306
504	NC_017333	A	6	6	20434	20439	100 %	0 %	0 %	0 %	387601306
505	NC_017333	CAA	2	6	20458	20463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601306
506	NC_017333	TTGAAG	2	12	20507	20518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601306
507	NC_017333	GGT	2	6	20539	20544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601306
508	NC_017333	AGTA	2	8	20559	20566	50 %	25 %	25 %	0 %	387601306
509	NC_017333	ATTC	2	8	20644	20651	25 %	50 %	0 %	25 %	387601306
510	NC_017333	AAG	2	6	20687	20692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601306
511	NC_017333	AC	3	6	20712	20717	50 %	0 %	0 %	50 %	387601306
512	NC_017333	GTCT	2	8	20815	20822	0 %	50 %	25 %	25 %	387601307
513	NC_017333	ATT	2	6	20831	20836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601307
514	NC_017333	TAC	2	6	20857	20862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601307
515	NC_017333	ATG	2	6	20924	20929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
516	NC_017333	ATA	2	6	20943	20948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601307
517	NC_017333	TGT	2	6	20959	20964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601307
518	NC_017333	TGAA	2	8	21000	21007	50 %	25 %	25 %	0 %	387601307
519	NC_017333	TAT	2	6	21071	21076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601307
520	NC_017333	GCAT	2	8	21094	21101	25 %	25 %	25 %	25 %	387601307
521	NC_017333	GATT	2	8	21111	21118	25 %	50 %	25 %	0 %	387601307
522	NC_017333	ATG	2	6	21141	21146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
523	NC_017333	ATG	2	6	21153	21158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
524	NC_017333	ATC	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601307
525	NC_017333	CAG	2	6	21351	21356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601307
526	NC_017333	GGTA	2	8	21601	21608	25 %	25 %	50 %	0 %	387601307
527	NC_017333	TGA	2	6	21634	21639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
528	NC_017333	GTC	2	6	21678	21683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601307
529	NC_017333	TGATTG	2	12	21711	21722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387601307
530	NC_017333	ACT	2	6	21723	21728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601307
531	NC_017333	ACA	2	6	21772	21777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601307
532	NC_017333	TC	3	6	21792	21797	0 %	50 %	0 %	50 %	387601307
533	NC_017333	GTG	2	6	21861	21866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601307
534	NC_017333	AAC	2	6	21870	21875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601307
535	NC_017333	ATG	2	6	21893	21898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
536	NC_017333	TGA	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
537	NC_017333	GGC	2	6	21980	21985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387601307
538	NC_017333	GAT	2	6	21992	21997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
539	NC_017333	GAT	2	6	22001	22006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
540	NC_017333	GGT	2	6	22007	22012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601307
541	NC_017333	ATG	2	6	22029	22034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
542	NC_017333	TGAAAT	2	12	22042	22053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601307
543	NC_017333	CAT	2	6	22054	22059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601307
544	NC_017333	AGTTA	2	10	22090	22099	40 %	40 %	20 %	0 %	387601307
545	NC_017333	ATA	2	6	22116	22121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601307
546	NC_017333	ATG	2	6	22154	22159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601307
547	NC_017333	A	7	7	22161	22167	100 %	0 %	0 %	0 %	387601307
548	NC_017333	AAT	2	6	22180	22185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017333	ATTATG	2	12	22187	22198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017333	TTTTA	2	10	22211	22220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017333	AT	3	6	22235	22240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017333	TCA	2	6	22444	22449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601308
553	NC_017333	GTA	2	6	22453	22458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601308
554	NC_017333	AAGGAA	2	12	22481	22492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601308
555	NC_017333	CG	3	6	22530	22535	0 %	0 %	50 %	50 %	387601308
556	NC_017333	GGT	2	6	22543	22548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601308
557	NC_017333	AAT	2	6	22549	22554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601308
558	NC_017333	GTT	2	6	22657	22662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601308
559	NC_017333	GAA	2	6	22786	22791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601308
560	NC_017333	ATA	2	6	22805	22810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601308
561	NC_017333	A	6	6	22825	22830	100 %	0 %	0 %	0 %	387601308
562	NC_017333	ATT	2	6	22914	22919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601308
563	NC_017333	CAT	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601308
564	NC_017333	TGA	2	6	22986	22991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601308
565	NC_017333	GAA	2	6	22999	23004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601308
566	NC_017333	TGC	2	6	23010	23015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601308
567	NC_017333	ATT	2	6	23280	23285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601308
568	NC_017333	CAT	2	6	23299	23304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601308
569	NC_017333	ACA	3	9	23332	23340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601308
570	NC_017333	CGT	2	6	23350	23355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601308
571	NC_017333	GGTT	2	8	23359	23366	0 %	50 %	50 %	0 %	387601308
572	NC_017333	TCG	2	6	23391	23396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601308
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574	NC_017333	AGA	2	6	23598	23603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601308
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576	NC_017333	TCT	2	6	23669	23674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601308
577	NC_017333	AACA	2	8	23693	23700	75 %	0 %	0 %	25 %	387601308
578	NC_017333	TA	3	6	23730	23735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017333	AGG	2	6	23784	23789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017333	TCGAT	2	10	23813	23822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_017333	A	6	6	23832	23837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017333	AGA	2	6	23874	23879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017333	GAT	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017333	AAG	2	6	23923	23928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017333	TGAA	2	8	23972	23979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017333	ATT	2	6	24015	24020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017333	TTC	2	6	24066	24071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017333	A	6	6	24072	24077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017333	A	6	6	24095	24100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017333	ATCT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_017333	CGG	2	6	24191	24196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017333	T	6	6	24229	24234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017333	GCCT	2	8	24261	24268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_017333	T	7	7	24337	24343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017333	ATATT	2	10	24351	24360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017333	AGT	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017333	T	6	6	24460	24465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017333	GAC	2	6	24493	24498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017333	AAAT	2	8	24500	24507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017333	TTA	2	6	24613	24618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017333	AT	3	6	24628	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017333	TTC	2	6	24650	24655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017333	CCA	2	6	24667	24672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017333	TCC	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017333	AAT	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017333	ATTT	2	8	24713	24720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017333	TAT	2	6	24765	24770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017333	TCA	2	6	24784	24789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017333	CCG	2	6	24815	24820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017333	TAA	2	6	24829	24834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017333	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017333	AT	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017333	TA	3	6	24895	24900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017333	T	6	6	24969	24974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017333	A	6	6	24999	25004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017333	ATA	2	6	25012	25017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017333	GTT	2	6	25060	25065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601309
618	NC_017333	TGA	3	9	25071	25079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601309
619	NC_017333	AATTT	2	10	25103	25112	40 %	60 %	0 %	0 %	387601309
620	NC_017333	A	7	7	25113	25119	100 %	0 %	0 %	0 %	387601309
621	NC_017333	ATG	2	6	25154	25159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601309
622	NC_017333	GAA	3	9	25177	25185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601309
623	NC_017333	A	6	6	25255	25260	100 %	0 %	0 %	0 %	387601309
624	NC_017333	CGT	2	6	25399	25404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601309
625	NC_017333	TGAATT	2	12	25530	25541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601309
626	NC_017333	ATT	2	6	25547	25552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601309
627	NC_017333	TTA	2	6	25591	25596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601309
628	NC_017333	GTAC	2	8	25630	25637	25 %	25 %	25 %	25 %	387601309
629	NC_017333	TCG	2	6	25653	25658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601309
630	NC_017333	GAT	2	6	25678	25683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601309
631	NC_017333	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387601309
632	NC_017333	AAC	2	6	25736	25741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601309
633	NC_017333	AAC	2	6	25775	25780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601310
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757	NC_017333	AGC	2	6	31289	31294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601314
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