MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017328	GC	3	6	122213	122218	0 %	0 %	50 %	50 %	384541691
2502	NC_017328	AGAGC	2	10	122226	122235	40 %	0 %	40 %	20 %	384541691
2503	NC_017328	CT	3	6	122242	122247	0 %	50 %	0 %	50 %	384541691
2504	NC_017328	TCGT	2	8	122261	122268	0 %	50 %	25 %	25 %	384541691
2505	NC_017328	GAA	2	6	122286	122291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541691
2506	NC_017328	ATC	2	6	122320	122325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541691
2507	NC_017328	CGA	2	6	122328	122333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2508	NC_017328	CAG	2	6	122395	122400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2509	NC_017328	AGA	2	6	122439	122444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541691
2510	NC_017328	CTGG	2	8	122499	122506	0 %	25 %	50 %	25 %	384541691
2511	NC_017328	GCG	2	6	122509	122514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2512	NC_017328	GAT	2	6	122541	122546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541691
2513	NC_017328	GGC	2	6	122604	122609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2514	NC_017328	CGG	2	6	122640	122645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2515	NC_017328	ACC	2	6	122659	122664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541691
2516	NC_017328	GCA	2	6	122682	122687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2517	NC_017328	GCTTAC	2	12	122749	122760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384541691
2518	NC_017328	TAC	3	9	122824	122832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541691
2519	NC_017328	GCT	2	6	122949	122954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2520	NC_017328	CCT	2	6	123044	123049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541691
2521	NC_017328	TGC	2	6	123095	123100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2522	NC_017328	CG	3	6	123116	123121	0 %	0 %	50 %	50 %	384541691
2523	NC_017328	TGA	2	6	123140	123145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541691
2524	NC_017328	ACG	2	6	123146	123151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2525	NC_017328	GAC	2	6	123220	123225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541691
2526	NC_017328	CAC	2	6	123283	123288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541691
2527	NC_017328	CTT	2	6	123302	123307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541691
2528	NC_017328	GCG	2	6	123319	123324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541691
2529	NC_017328	AAT	2	6	123440	123445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541692
2530	NC_017328	TGA	2	6	123479	123484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541692
2531	NC_017328	CCG	2	6	123670	123675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541692
2532	NC_017328	GCA	2	6	123681	123686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2533	NC_017328	AGA	2	6	123707	123712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2534	NC_017328	GAA	2	6	123713	123718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2535	NC_017328	AGC	2	6	123722	123727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2536	NC_017328	GCA	3	9	123732	123740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2537	NC_017328	GCG	2	6	123750	123755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2538	NC_017328	CGA	2	6	123788	123793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2539	NC_017328	CGG	2	6	124006	124011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2540	NC_017328	CAG	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2541	NC_017328	AAG	2	6	124063	124068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2542	NC_017328	CGG	2	6	124085	124090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2543	NC_017328	CGT	2	6	124211	124216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2544	NC_017328	GCA	2	6	124341	124346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2545	NC_017328	ACG	2	6	124399	124404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2546	NC_017328	CCG	2	6	124430	124435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541692
2547	NC_017328	AAG	2	6	124528	124533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2548	NC_017328	AGC	2	6	124550	124555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2549	NC_017328	CGG	2	6	124558	124563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2550	NC_017328	GGT	2	6	124572	124577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541692
2551	NC_017328	TGC	2	6	124588	124593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2552	NC_017328	GAA	2	6	124632	124637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2553	NC_017328	TGA	2	6	124693	124698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541692
2554	NC_017328	CAG	2	6	124758	124763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2555	NC_017328	GAA	2	6	124767	124772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2556	NC_017328	GCG	2	6	124773	124778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2557	NC_017328	TCA	2	6	124816	124821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541692
2558	NC_017328	TGC	2	6	124832	124837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2559	NC_017328	GAA	2	6	124901	124906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541692
2560	NC_017328	GTT	2	6	124950	124955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541692
2561	NC_017328	CAA	2	6	124973	124978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541692
2562	NC_017328	CAT	2	6	124985	124990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541692
2563	NC_017328	TGA	2	6	125008	125013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541692
2564	NC_017328	CGG	2	6	125090	125095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541692
2565	NC_017328	TAC	2	6	125102	125107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541692
2566	NC_017328	TGC	2	6	125212	125217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541692
2567	NC_017328	TC	4	8	125223	125230	0 %	50 %	0 %	50 %	384541692
2568	NC_017328	ACC	2	6	125236	125241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541692
2569	NC_017328	CAT	2	6	125279	125284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541692
2570	NC_017328	AAC	2	6	125286	125291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541692
2571	NC_017328	GTAA	2	8	125321	125328	50 %	25 %	25 %	0 %	384541692
2572	NC_017328	CGGC	2	8	125343	125350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_017328	T	6	6	125351	125356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_017328	TTA	2	6	125383	125388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_017328	TGT	2	6	125414	125419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_017328	GGT	3	9	125468	125476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_017328	GCA	2	6	125514	125519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_017328	TAAG	2	8	125554	125561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_017328	CGC	2	6	125588	125593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_017328	GAC	2	6	125606	125611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_017328	CCG	2	6	125620	125625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541693
2582	NC_017328	AT	3	6	125633	125638	50 %	50 %	0 %	0 %	384541693
2583	NC_017328	ATG	2	6	125646	125651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541693
2584	NC_017328	ACA	2	6	125761	125766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541693
2585	NC_017328	CTG	2	6	125814	125819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541693
2586	NC_017328	GAA	2	6	125838	125843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541693
2587	NC_017328	GCTG	2	8	125852	125859	0 %	25 %	50 %	25 %	384541693
2588	NC_017328	ATCA	2	8	125928	125935	50 %	25 %	0 %	25 %	384541693
2589	NC_017328	GGT	2	6	125943	125948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541693
2590	NC_017328	CTGG	2	8	125949	125956	0 %	25 %	50 %	25 %	384541693
2591	NC_017328	CAAAGT	2	12	125972	125983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384541693
2592	NC_017328	AAG	2	6	126163	126168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541693
2593	NC_017328	CTG	2	6	126180	126185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541693
2594	NC_017328	ATC	2	6	126201	126206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541693
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2597	NC_017328	A	6	6	126411	126416	100 %	0 %	0 %	0 %	384541693
2598	NC_017328	ACG	2	6	126439	126444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541693
2599	NC_017328	GAC	2	6	126516	126521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541693
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2601	NC_017328	CA	3	6	126610	126615	50 %	0 %	0 %	50 %	384541693
2602	NC_017328	ACT	2	6	126667	126672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541693
2603	NC_017328	CTGA	2	8	126732	126739	25 %	25 %	25 %	25 %	384541693
2604	NC_017328	AAG	2	6	126742	126747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541693
2605	NC_017328	GCT	2	6	126792	126797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541693
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2607	NC_017328	TTG	2	6	126886	126891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541693
2608	NC_017328	CGG	2	6	126899	126904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541693
2609	NC_017328	GCT	2	6	126908	126913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541693
2610	NC_017328	GGC	2	6	127010	127015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541693
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2612	NC_017328	A	6	6	127103	127108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_017328	CGC	2	6	127120	127125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_017328	T	7	7	127126	127132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_017328	TCT	2	6	127156	127161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_017328	AG	3	6	127174	127179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_017328	CTG	2	6	127191	127196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_017328	GGC	2	6	127251	127256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_017328	GTT	2	6	127287	127292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_017328	GGCG	2	8	127317	127324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2621	NC_017328	GCT	2	6	127353	127358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_017328	CT	3	6	127423	127428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_017328	GCT	2	6	127431	127436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_017328	GCT	2	6	127479	127484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_017328	AGGCG	2	10	127486	127495	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2626	NC_017328	GC	3	6	127510	127515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_017328	GCT	2	6	127527	127532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_017328	GCT	2	6	127575	127580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_017328	GCG	2	6	127610	127615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_017328	TGC	2	6	127622	127627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_017328	GCG	2	6	127745	127750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_017328	TGC	2	6	127774	127779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2635	NC_017328	CCG	2	6	127832	127837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2636	NC_017328	TGA	2	6	127850	127855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2639	NC_017328	TGT	2	6	127986	127991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2650	NC_017328	GTT	2	6	128300	128305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_017328	CTGT	2	8	128370	128377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2652	NC_017328	TTC	2	6	128393	128398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2654	NC_017328	TGA	2	6	128425	128430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2662	NC_017328	T	6	6	129206	129211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_017328	CGT	2	6	129227	129232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2724	NC_017328	GCGAT	2	10	132081	132090	20 %	20 %	40 %	20 %	384541695
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2727	NC_017328	CTTG	2	8	132234	132241	0 %	50 %	25 %	25 %	384541695
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2730	NC_017328	GGGCA	2	10	132296	132305	20 %	0 %	60 %	20 %	384541695
2731	NC_017328	TGGA	2	8	132319	132326	25 %	25 %	50 %	0 %	384541695
2732	NC_017328	ACT	2	6	132395	132400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541695
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2738	NC_017328	TAA	2	6	132549	132554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541696
2739	NC_017328	TTTC	2	8	132565	132572	0 %	75 %	0 %	25 %	384541696
2740	NC_017328	CAGCG	2	10	132575	132584	20 %	0 %	40 %	40 %	384541696
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2743	NC_017328	CGC	2	6	132895	132900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541696
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2745	NC_017328	ACC	2	6	133002	133007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541696
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2993	NC_017328	TGC	2	6	145192	145197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541709
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2996	NC_017328	ATG	2	6	145269	145274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541709
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3000	NC_017328	TAA	2	6	145487	145492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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