MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 94805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017328	AGGGC	2	10	47568	47577	20 %	0 %	60 %	20 %	384541623
1002	NC_017328	GCG	2	6	47605	47610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541623
1003	NC_017328	GCA	2	6	47677	47682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541623
1004	NC_017328	CTG	2	6	47692	47697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541623
1005	NC_017328	TCT	2	6	47722	47727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541623
1006	NC_017328	GGA	2	6	47730	47735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541623
1007	NC_017328	GAA	2	6	47761	47766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541623
1008	NC_017328	CG	3	6	47771	47776	0 %	0 %	50 %	50 %	384541623
1009	NC_017328	TGG	2	6	47846	47851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541623
1010	NC_017328	GGAT	2	8	47927	47934	25 %	25 %	50 %	0 %	384541623
1011	NC_017328	GCG	2	6	47953	47958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541623
1012	NC_017328	AACC	2	8	47997	48004	50 %	0 %	0 %	50 %	384541623
1013	NC_017328	ATT	2	6	48049	48054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541623
1014	NC_017328	GCCCGC	2	12	48055	48066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541623
1015	NC_017328	CAGG	2	8	48094	48101	25 %	0 %	50 %	25 %	384541623
1016	NC_017328	CCG	2	6	48213	48218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541623
1017	NC_017328	TGG	2	6	48233	48238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541623
1018	NC_017328	CG	3	6	48274	48279	0 %	0 %	50 %	50 %	384541623
1019	NC_017328	ATC	2	6	48316	48321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541623
1020	NC_017328	TGGC	2	8	48360	48367	0 %	25 %	50 %	25 %	384541623
1021	NC_017328	AGA	2	6	48375	48380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541623
1022	NC_017328	GAAAC	2	10	48415	48424	60 %	0 %	20 %	20 %	384541623
1023	NC_017328	TAA	2	6	48433	48438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541623
1024	NC_017328	TGTT	2	8	48470	48477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017328	GCG	2	6	48494	48499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017328	CAG	2	6	48526	48531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541624
1027	NC_017328	CAT	2	6	48551	48556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541624
1028	NC_017328	CGA	2	6	48569	48574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541624
1029	NC_017328	T	7	7	48605	48611	0 %	100 %	0 %	0 %	384541624
1030	NC_017328	GCG	2	6	48641	48646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541625
1031	NC_017328	CCTG	2	8	48694	48701	0 %	25 %	25 %	50 %	384541625
1032	NC_017328	TAAA	2	8	48732	48739	75 %	25 %	0 %	0 %	384541625
1033	NC_017328	GCC	2	6	48753	48758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541625
1034	NC_017328	AATC	2	8	48768	48775	50 %	25 %	0 %	25 %	384541625
1035	NC_017328	GTC	2	6	48777	48782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541625
1036	NC_017328	CAG	2	6	48811	48816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541625
1037	NC_017328	GCG	2	6	48872	48877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541625
1038	NC_017328	GGC	2	6	48908	48913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541625
1039	NC_017328	ACG	2	6	49047	49052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541625
1040	NC_017328	GCG	2	6	49096	49101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541625
1041	NC_017328	CGC	3	9	49189	49197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541626
1042	NC_017328	GCAG	2	8	49257	49264	25 %	0 %	50 %	25 %	384541626
1043	NC_017328	ACCC	2	8	49272	49279	25 %	0 %	0 %	75 %	384541626
1044	NC_017328	CAG	3	9	49280	49288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1045	NC_017328	TTC	2	6	49366	49371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541626
1046	NC_017328	CTT	2	6	49419	49424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541626
1047	NC_017328	AAGA	2	8	49570	49577	75 %	0 %	25 %	0 %	384541626
1048	NC_017328	CG	4	8	49614	49621	0 %	0 %	50 %	50 %	384541626
1049	NC_017328	GCG	2	6	49650	49655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541626
1050	NC_017328	TCG	2	6	49691	49696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1051	NC_017328	GCA	2	6	49701	49706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1052	NC_017328	AGC	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1053	NC_017328	TCG	2	6	49736	49741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1054	NC_017328	CAG	2	6	49756	49761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1055	NC_017328	CAG	2	6	49813	49818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1056	NC_017328	CG	4	8	49902	49909	0 %	0 %	50 %	50 %	384541626
1057	NC_017328	GCA	2	6	49965	49970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541626
1058	NC_017328	AAC	2	6	49989	49994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541626
1059	NC_017328	AATG	2	8	50034	50041	50 %	25 %	25 %	0 %	384541627
1060	NC_017328	GCCATT	2	12	50239	50250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384541627
1061	NC_017328	CAA	2	6	50272	50277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541627
1062	NC_017328	AACGT	2	10	50326	50335	40 %	20 %	20 %	20 %	384541627
1063	NC_017328	AC	3	6	50386	50391	50 %	0 %	0 %	50 %	384541627
1064	NC_017328	ATC	2	6	50405	50410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541627
1065	NC_017328	ACG	2	6	50568	50573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541628
1066	NC_017328	GGT	2	6	50589	50594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541628
1067	NC_017328	ACG	2	6	50659	50664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541628
1068	NC_017328	GTG	3	9	50681	50689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541628
1069	NC_017328	CGG	2	6	50700	50705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541628
1070	NC_017328	CAC	2	6	50799	50804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541628
1071	NC_017328	CTG	2	6	50964	50969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541628
1072	NC_017328	GCC	2	6	51016	51021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541628
1073	NC_017328	GCC	2	6	51085	51090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541628
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1075	NC_017328	ATT	2	6	51225	51230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541628
1076	NC_017328	TAA	2	6	51274	51279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541629
1077	NC_017328	CGGCGT	2	12	51439	51450	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384541629
1078	NC_017328	GGCA	2	8	51482	51489	25 %	0 %	50 %	25 %	384541629
1079	NC_017328	TCG	2	6	51525	51530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541629
1080	NC_017328	AAT	2	6	51539	51544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541629
1081	NC_017328	CGT	2	6	51725	51730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541629
1082	NC_017328	TTC	2	6	51749	51754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541629
1083	NC_017328	CAT	2	6	51764	51769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541629
1084	NC_017328	CAC	2	6	51770	51775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541629
1085	NC_017328	T	6	6	51776	51781	0 %	100 %	0 %	0 %	384541629
1086	NC_017328	CGT	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541629
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1088	NC_017328	CCA	2	6	51925	51930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541629
1089	NC_017328	CGGT	2	8	52083	52090	0 %	25 %	50 %	25 %	384541629
1090	NC_017328	AAC	2	6	52112	52117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541629
1091	NC_017328	CGG	2	6	52174	52179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541629
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1094	NC_017328	TTC	2	6	52279	52284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541630
1095	NC_017328	TCA	2	6	52299	52304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541630
1096	NC_017328	CAG	2	6	52363	52368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1097	NC_017328	GCA	2	6	52538	52543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1098	NC_017328	CAG	2	6	52569	52574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1099	NC_017328	GTCA	2	8	52606	52613	25 %	25 %	25 %	25 %	384541630
1100	NC_017328	CAG	2	6	52630	52635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
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1102	NC_017328	CAA	2	6	52737	52742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541630
1103	NC_017328	TTC	2	6	52751	52756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541630
1104	NC_017328	CCCCA	2	10	52805	52814	20 %	0 %	0 %	80 %	384541630
1105	NC_017328	GCC	2	6	52819	52824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541630
1106	NC_017328	CTG	2	6	52834	52839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1107	NC_017328	GC	4	8	52904	52911	0 %	0 %	50 %	50 %	384541630
1108	NC_017328	CGT	2	6	52998	53003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1109	NC_017328	CTG	2	6	53017	53022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1110	NC_017328	CGA	2	6	53060	53065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1111	NC_017328	GTT	2	6	53074	53079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541630
1112	NC_017328	ATC	2	6	53096	53101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541630
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1114	NC_017328	GCT	2	6	53220	53225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1115	NC_017328	GAT	2	6	53266	53271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541630
1116	NC_017328	TGG	2	6	53300	53305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541630
1117	NC_017328	GCGTC	2	10	53310	53319	0 %	20 %	40 %	40 %	384541630
1118	NC_017328	GCT	2	6	53328	53333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1119	NC_017328	ACG	2	6	53396	53401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1120	NC_017328	GAC	2	6	53410	53415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1121	NC_017328	G	6	6	53439	53444	0 %	0 %	100 %	0 %	384541630
1122	NC_017328	AGC	2	6	53483	53488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541630
1123	NC_017328	TTC	2	6	53498	53503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541630
1124	NC_017328	CAA	2	6	53551	53556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017328	GCA	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541631
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1232	NC_017328	ATA	2	6	58500	58505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384541634
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1249	NC_017328	ACG	2	6	59894	59899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1250	NC_017328	TCA	3	9	59979	59987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1251	NC_017328	GCA	2	6	60016	60021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1252	NC_017328	CAG	2	6	60076	60081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541634
1253	NC_017328	AG	3	6	60086	60091	50 %	0 %	50 %	0 %	384541634
1254	NC_017328	ATC	2	6	60108	60113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
1255	NC_017328	CAGC	2	8	60148	60155	25 %	0 %	25 %	50 %	384541634
1256	NC_017328	CG	3	6	60160	60165	0 %	0 %	50 %	50 %	384541634
1257	NC_017328	GGC	2	6	60172	60177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541634
1258	NC_017328	CAT	2	6	60184	60189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541634
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1260	NC_017328	TCT	2	6	60447	60452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541634
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1262	NC_017328	TGCG	2	8	60541	60548	0 %	25 %	50 %	25 %	384541634
1263	NC_017328	AAAGT	2	10	60577	60586	60 %	20 %	20 %	0 %	384541634
1264	NC_017328	ACC	2	6	60713	60718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_017328	GTG	2	6	60740	60745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_017328	T	8	8	60831	60838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_017328	GTG	2	6	60954	60959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541635
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1271	NC_017328	CTG	2	6	61243	61248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1272	NC_017328	CTG	2	6	61252	61257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541635
1273	NC_017328	GCG	2	6	61263	61268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541635
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1282	NC_017328	TCAA	2	8	61589	61596	50 %	25 %	0 %	25 %	384541635
1283	NC_017328	TGA	2	6	61619	61624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541635
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1307	NC_017328	GGCG	2	8	62861	62868	0 %	0 %	75 %	25 %	384541635
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1311	NC_017328	A	6	6	63207	63212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1312	NC_017328	CAG	2	6	63318	63323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541636
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1370	NC_017328	CAC	2	6	66575	66580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541638
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