MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017327	AGG	2	6	143664	143669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017327	TGA	2	6	143690	143695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017327	TGC	2	6	143744	143749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017327	AGG	2	6	143850	143855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017327	CGC	2	6	143884	143889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_017327	GC	3	6	143888	143893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_017327	CAA	2	6	143926	143931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017327	TTG	2	6	143949	143954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017327	CGA	2	6	144037	144042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017327	AATT	2	8	144122	144129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017327	ACA	2	6	144130	144135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017327	TTC	2	6	144160	144165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017327	AGG	2	6	144249	144254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017327	CGA	2	6	144267	144272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539961
3015	NC_017327	CGAC	2	8	144276	144283	25 %	0 %	25 %	50 %	384539961
3016	NC_017327	CAA	2	6	144295	144300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539961
3017	NC_017327	GAA	2	6	144310	144315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539961
3018	NC_017327	GC	3	6	144378	144383	0 %	0 %	50 %	50 %	384539961
3019	NC_017327	CGA	2	6	144421	144426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539961
3020	NC_017327	CGG	2	6	144480	144485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539961
3021	NC_017327	ATC	2	6	144500	144505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539961
3022	NC_017327	CGA	2	6	144595	144600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539961
3023	NC_017327	GGTC	2	8	144603	144610	0 %	25 %	50 %	25 %	384539961
3024	NC_017327	AATCTC	2	12	144629	144640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539961
3025	NC_017327	TGA	2	6	144669	144674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539961
3026	NC_017327	GCG	2	6	144678	144683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539961
3027	NC_017327	CGC	2	6	144694	144699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539961
3028	NC_017327	GGC	2	6	144737	144742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539961
3029	NC_017327	CCT	2	6	144811	144816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539961
3030	NC_017327	ATC	2	6	144872	144877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539961
3031	NC_017327	AAG	2	6	144935	144940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539961
3032	NC_017327	CGGA	2	8	144956	144963	25 %	0 %	50 %	25 %	384539961
3033	NC_017327	GGC	3	9	144964	144972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539961
3034	NC_017327	GC	3	6	144971	144976	0 %	0 %	50 %	50 %	384539961
3035	NC_017327	GC	3	6	145028	145033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_017327	CGG	2	6	145101	145106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017327	CGA	2	6	145145	145150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017327	GCGG	2	8	145166	145173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_017327	GCC	2	6	145206	145211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_017327	CCT	2	6	145248	145253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017327	GC	3	6	145260	145265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_017327	TCG	2	6	145280	145285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017327	GTCG	2	8	145289	145296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_017327	GC	3	6	145325	145330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_017327	CCG	2	6	145428	145433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_017327	AAC	2	6	145476	145481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017327	CATTT	2	10	145540	145549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3048	NC_017327	CAT	2	6	145575	145580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_017327	CA	3	6	145599	145604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_017327	AGG	2	6	145677	145682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539962
3051	NC_017327	CGC	3	9	145708	145716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539962
3052	NC_017327	AGGGC	2	10	145739	145748	20 %	0 %	60 %	20 %	384539962
3053	NC_017327	CGGC	2	8	145758	145765	0 %	0 %	50 %	50 %	384539962
3054	NC_017327	CGG	2	6	145858	145863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017327	TCCG	2	8	145892	145899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_017327	TTG	2	6	145940	145945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017327	A	7	7	145998	146004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017327	CT	3	6	146085	146090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_017327	CTG	2	6	146129	146134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017327	CTG	2	6	146212	146217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539963
3061	NC_017327	GAT	2	6	146256	146261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539963
3062	NC_017327	GCT	2	6	146270	146275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539963
3063	NC_017327	TGC	2	6	146291	146296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539963
3064	NC_017327	CGC	2	6	146308	146313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539963
3065	NC_017327	CTTC	2	8	146368	146375	0 %	50 %	0 %	50 %	384539963
3066	NC_017327	CAGA	2	8	146443	146450	50 %	0 %	25 %	25 %	384539963
3067	NC_017327	TTGG	2	8	146515	146522	0 %	50 %	50 %	0 %	384539963
3068	NC_017327	CCAG	2	8	146525	146532	25 %	0 %	25 %	50 %	384539963
3069	NC_017327	CCTTTG	2	12	146533	146544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384539963
3070	NC_017327	CGA	2	6	146579	146584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539963
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3072	NC_017327	CGA	2	6	146672	146677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539963
3073	NC_017327	CAA	2	6	146720	146725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539963
3074	NC_017327	TGG	2	6	146832	146837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539963
3075	NC_017327	GCT	2	6	146871	146876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539963
3076	NC_017327	GC	3	6	146945	146950	0 %	0 %	50 %	50 %	384539963
3077	NC_017327	CAG	2	6	146952	146957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539963
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3079	NC_017327	ACG	2	6	147045	147050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539964
3080	NC_017327	CGT	2	6	147065	147070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539964
3081	NC_017327	ATG	2	6	147142	147147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539964
3082	NC_017327	CG	3	6	147186	147191	0 %	0 %	50 %	50 %	384539964
3083	NC_017327	GC	3	6	147195	147200	0 %	0 %	50 %	50 %	384539964
3084	NC_017327	CAC	2	6	147215	147220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539964
3085	NC_017327	GAT	2	6	147319	147324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539964
3086	NC_017327	GCTG	2	8	147351	147358	0 %	25 %	50 %	25 %	384539964
3087	NC_017327	TTC	2	6	147409	147414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539964
3088	NC_017327	GATGG	2	10	147429	147438	20 %	20 %	60 %	0 %	384539964
3089	NC_017327	CAC	2	6	147573	147578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539964
3090	NC_017327	TTGG	2	8	147613	147620	0 %	50 %	50 %	0 %	384539964
3091	NC_017327	GTC	2	6	147631	147636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539964
3092	NC_017327	AAG	2	6	147710	147715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539964
3093	NC_017327	T	6	6	147723	147728	0 %	100 %	0 %	0 %	384539964
3094	NC_017327	ATCG	2	8	147759	147766	25 %	25 %	25 %	25 %	384539964
3095	NC_017327	TGAAG	2	10	147866	147875	40 %	20 %	40 %	0 %	384539964
3096	NC_017327	TGC	2	6	147935	147940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_017327	GCC	2	6	148083	148088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_017327	GAC	2	6	148092	148097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017327	TCA	2	6	148121	148126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017327	AGGT	2	8	148139	148146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017327	GCCGA	2	10	148183	148192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3102	NC_017327	CAG	2	6	148237	148242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017327	GCA	2	6	148277	148282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017327	AGGAAC	2	12	148301	148312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3105	NC_017327	CAGG	2	8	148360	148367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_017327	AAC	2	6	148410	148415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017327	TGA	2	6	148453	148458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017327	TCG	2	6	148461	148466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017327	TGC	2	6	148471	148476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017327	CAT	2	6	148499	148504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017327	GCA	2	6	148513	148518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017327	GCA	2	6	148522	148527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_017327	CGA	2	6	148546	148551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017327	CGC	2	6	148637	148642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539965
3115	NC_017327	ATT	2	6	148669	148674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539965
3116	NC_017327	TAT	2	6	148722	148727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539965
3117	NC_017327	CAT	2	6	148736	148741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539965
3118	NC_017327	CCG	2	6	148912	148917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539965
3119	NC_017327	ATC	2	6	148918	148923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539965
3120	NC_017327	CAC	2	6	148952	148957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539965
3121	NC_017327	TCG	2	6	148960	148965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539965
3122	NC_017327	GCC	2	6	149021	149026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539965
3123	NC_017327	GAT	2	6	149027	149032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539965
3124	NC_017327	TCATT	2	10	149060	149069	20 %	60 %	0 %	20 %	384539965
3125	NC_017327	GCTTC	2	10	149076	149085	0 %	40 %	20 %	40 %	384539965
3126	NC_017327	TCGC	2	8	149185	149192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_017327	GCA	2	6	149250	149255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_017327	TCGA	2	8	149372	149379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_017327	CGG	2	6	149384	149389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017327	GCT	2	6	149406	149411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017327	AATTC	2	10	149434	149443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3132	NC_017327	GGA	2	6	149447	149452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017327	GGC	2	6	149486	149491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_017327	CCAC	2	8	149529	149536	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3135	NC_017327	GTT	2	6	149584	149589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539966
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3140	NC_017327	GTT	2	6	149733	149738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539966
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3142	NC_017327	TAT	2	6	149883	149888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539966
3143	NC_017327	TTC	2	6	149980	149985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539966
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3145	NC_017327	GC	3	6	150107	150112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3146	NC_017327	CCT	2	6	150127	150132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3147	NC_017327	GA	3	6	150166	150171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_017327	GAG	2	6	150185	150190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539967
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3151	NC_017327	AGA	2	6	150294	150299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539967
3152	NC_017327	CTG	2	6	150301	150306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539967
3153	NC_017327	GCA	2	6	150333	150338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539967
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3158	NC_017327	ATG	2	6	150560	150565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539967
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3160	NC_017327	CGG	2	6	150675	150680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539967
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3162	NC_017327	CCGCG	2	10	150777	150786	0 %	0 %	40 %	60 %	384539967
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3167	NC_017327	TCG	2	6	150965	150970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539967
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3192	NC_017327	GGGC	2	8	152212	152219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3193	NC_017327	CGG	2	6	152261	152266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3228	NC_017327	CTC	2	6	154070	154075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539972
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3231	NC_017327	GTG	2	6	154276	154281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_017327	CGC	2	6	154338	154343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539973
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3242	NC_017327	AGC	2	6	154835	154840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539974
3243	NC_017327	GACC	2	8	154861	154868	25 %	0 %	25 %	50 %	384539974
3244	NC_017327	ACG	2	6	154953	154958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539974
3245	NC_017327	ACG	2	6	154971	154976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539974
3246	NC_017327	CGTCAT	2	12	155002	155013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384539974
3247	NC_017327	CG	3	6	155019	155024	0 %	0 %	50 %	50 %	384539974
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3249	NC_017327	GAA	2	6	155058	155063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539974
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3497	NC_017327	ATG	2	6	167927	167932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_017327	CCA	2	6	167978	167983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3499	NC_017327	AAT	2	6	168001	168006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_017327	CGA	2	6	168052	168057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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