MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_017327	GC	3	6	1137112	1137117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24002	NC_017327	TGC	2	6	1137120	1137125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24003	NC_017327	GAAA	2	8	1137250	1137257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24004	NC_017327	GCC	2	6	1137285	1137290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24005	NC_017327	GC	3	6	1137320	1137325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24006	NC_017327	AAC	2	6	1137351	1137356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24007	NC_017327	ACA	2	6	1137369	1137374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24008	NC_017327	CGC	2	6	1137458	1137463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24009	NC_017327	AC	3	6	1137518	1137523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24010	NC_017327	GCT	2	6	1137866	1137871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24011	NC_017327	TCAA	2	8	1137881	1137888	50 %	25 %	0 %	25 %	384541044
24012	NC_017327	GCT	2	6	1137894	1137899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24013	NC_017327	TGC	2	6	1137963	1137968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24014	NC_017327	AC	3	6	1138062	1138067	50 %	0 %	0 %	50 %	384541044
24015	NC_017327	GAA	2	6	1138123	1138128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541044
24016	NC_017327	TAC	2	6	1138144	1138149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541044
24017	NC_017327	GAG	2	6	1138258	1138263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541044
24018	NC_017327	GTC	2	6	1138363	1138368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24019	NC_017327	CTGG	2	8	1138387	1138394	0 %	25 %	50 %	25 %	384541044
24020	NC_017327	CGA	2	6	1138470	1138475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24021	NC_017327	CGTC	2	8	1138508	1138515	0 %	25 %	25 %	50 %	384541044
24022	NC_017327	GTC	2	6	1138591	1138596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541044
24023	NC_017327	GGC	2	6	1138704	1138709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541044
24024	NC_017327	AAT	2	6	1138775	1138780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24025	NC_017327	TGC	3	9	1138790	1138798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24026	NC_017327	AGCGC	2	10	1138966	1138975	20 %	0 %	40 %	40 %	384541045
24027	NC_017327	GAG	2	6	1139087	1139092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541045
24028	NC_017327	CGA	2	6	1139095	1139100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541045
24029	NC_017327	TGC	2	6	1139163	1139168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541045
24030	NC_017327	TGG	2	6	1139223	1139228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541045
24031	NC_017327	CGG	2	6	1139323	1139328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541045
24032	NC_017327	CGC	2	6	1139351	1139356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541045
24033	NC_017327	GCTG	2	8	1139377	1139384	0 %	25 %	50 %	25 %	384541045
24034	NC_017327	TCGT	2	8	1139403	1139410	0 %	50 %	25 %	25 %	384541045
24035	NC_017327	ATC	2	6	1139514	1139519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541045
24036	NC_017327	CG	3	6	1139520	1139525	0 %	0 %	50 %	50 %	384541045
24037	NC_017327	GGC	2	6	1139545	1139550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541045
24038	NC_017327	TGA	2	6	1139580	1139585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541045
24039	NC_017327	TCAG	3	12	1139586	1139597	25 %	25 %	25 %	25 %	384541045
24040	NC_017327	GC	3	6	1139647	1139652	0 %	0 %	50 %	50 %	384541045
24041	NC_017327	CCA	2	6	1139686	1139691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541045
24042	NC_017327	GAT	3	9	1139951	1139959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_017327	CAT	2	6	1139976	1139981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24044	NC_017327	CGA	2	6	1140032	1140037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24045	NC_017327	ATCA	2	8	1140103	1140110	50 %	25 %	0 %	25 %	384541046
24046	NC_017327	GAA	2	6	1140129	1140134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541046
24047	NC_017327	AGC	2	6	1140182	1140187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541046
24048	NC_017327	CAA	2	6	1140217	1140222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24049	NC_017327	GGC	2	6	1140230	1140235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24050	NC_017327	TTC	2	6	1140258	1140263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24051	NC_017327	CTT	2	6	1140322	1140327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24052	NC_017327	AAG	2	6	1140435	1140440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_017327	ATCAA	2	10	1140452	1140461	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24054	NC_017327	GTCAC	2	10	1140472	1140481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24055	NC_017327	TGC	2	6	1140587	1140592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24056	NC_017327	CATC	2	8	1140601	1140608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24057	NC_017327	CGC	2	6	1140688	1140693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24058	NC_017327	CAGC	2	8	1140702	1140709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24059	NC_017327	TGCTC	2	10	1140727	1140736	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24060	NC_017327	GGC	2	6	1140762	1140767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24061	NC_017327	GAA	2	6	1140799	1140804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_017327	GAAA	2	8	1140918	1140925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24063	NC_017327	GCC	2	6	1140953	1140958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24064	NC_017327	GC	3	6	1140988	1140993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24065	NC_017327	AAC	2	6	1141019	1141024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541047
24066	NC_017327	ACA	2	6	1141038	1141043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541047
24067	NC_017327	G	7	7	1141089	1141095	0 %	0 %	100 %	0 %	384541047
24068	NC_017327	A	6	6	1141168	1141173	100 %	0 %	0 %	0 %	384541047
24069	NC_017327	GCG	3	9	1141218	1141226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541047
24070	NC_017327	CCGC	2	8	1141241	1141248	0 %	0 %	25 %	75 %	384541047
24071	NC_017327	CTT	2	6	1141308	1141313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384541048
24072	NC_017327	CGT	2	6	1141314	1141319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541048
24073	NC_017327	CGA	2	6	1141320	1141325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541048
24074	NC_017327	GC	3	6	1141363	1141368	0 %	0 %	50 %	50 %	384541048
24075	NC_017327	TCG	2	6	1141403	1141408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541048
24076	NC_017327	ACG	2	6	1141442	1141447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541048
24077	NC_017327	TGA	2	6	1141449	1141454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541048
24078	NC_017327	TGG	2	6	1141560	1141565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541048
24079	NC_017327	GGC	2	6	1141572	1141577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541049
24080	NC_017327	GAT	2	6	1141587	1141592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541049
24081	NC_017327	GCA	2	6	1141616	1141621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541049
24082	NC_017327	TCG	2	6	1141624	1141629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541049
24083	NC_017327	T	6	6	1141777	1141782	0 %	100 %	0 %	0 %	384541049
24084	NC_017327	CATT	2	8	1141834	1141841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24085	NC_017327	CAT	2	6	1141847	1141852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24086	NC_017327	ATC	2	6	1141890	1141895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24087	NC_017327	GGCGG	2	10	1141901	1141910	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24088	NC_017327	GAC	2	6	1141924	1141929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24089	NC_017327	TGTCAT	2	12	1141939	1141950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24090	NC_017327	GAG	2	6	1142096	1142101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541050
24091	NC_017327	GAT	2	6	1142150	1142155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384541050
24092	NC_017327	TGT	2	6	1142230	1142235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541050
24093	NC_017327	GGC	2	6	1142243	1142248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24094	NC_017327	AGG	2	6	1142263	1142268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24095	NC_017327	CGC	2	6	1142269	1142274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24096	NC_017327	GCC	2	6	1142295	1142300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541051
24097	NC_017327	CGT	2	6	1142322	1142327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24098	NC_017327	TGC	2	6	1142403	1142408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24099	NC_017327	GC	3	6	1142407	1142412	0 %	0 %	50 %	50 %	384541051
24100	NC_017327	TGAT	2	8	1142438	1142445	25 %	50 %	25 %	0 %	384541051
24101	NC_017327	GCG	2	6	1142468	1142473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541051
24102	NC_017327	CAT	2	6	1142584	1142589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541051
24103	NC_017327	ATT	2	6	1142716	1142721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384541051
24104	NC_017327	CG	4	8	1142722	1142729	0 %	0 %	50 %	50 %	384541051
24105	NC_017327	CCGT	2	8	1142852	1142859	0 %	25 %	25 %	50 %	384541051
24106	NC_017327	TGT	2	6	1142906	1142911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384541051
24107	NC_017327	GACG	3	12	1142946	1142957	25 %	0 %	50 %	25 %	384541051
24108	NC_017327	ACG	2	6	1142962	1142967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24109	NC_017327	CCGAT	2	10	1142983	1142992	20 %	20 %	20 %	40 %	384541051
24110	NC_017327	AGG	2	6	1143119	1143124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384541051
24111	NC_017327	CAC	2	6	1143148	1143153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541051
24112	NC_017327	GCT	2	6	1143195	1143200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24113	NC_017327	CGC	2	6	1143201	1143206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541051
24114	NC_017327	GCT	2	6	1143258	1143263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24115	NC_017327	GCGG	2	8	1143290	1143297	0 %	0 %	75 %	25 %	384541051
24116	NC_017327	CGG	2	6	1143393	1143398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541051
24117	NC_017327	GGC	2	6	1143462	1143467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541051
24118	NC_017327	CGC	3	9	1143508	1143516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541051
24119	NC_017327	ACG	2	6	1143567	1143572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541051
24120	NC_017327	CGC	2	6	1143576	1143581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541051
24121	NC_017327	GAA	2	6	1143621	1143626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384541051
24122	NC_017327	GCC	2	6	1143742	1143747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541051
24123	NC_017327	CG	3	6	1143789	1143794	0 %	0 %	50 %	50 %	384541051
24124	NC_017327	CAT	2	6	1143810	1143815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541051
24125	NC_017327	CGA	2	6	1143825	1143830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541051
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24127	NC_017327	CGT	2	6	1143843	1143848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541051
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24132	NC_017327	GAC	2	6	1144286	1144291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541051
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24140	NC_017327	CAG	2	6	1144721	1144726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541052
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24150	NC_017327	TGC	2	6	1145217	1145222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541052
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24189	NC_017327	TGC	2	6	1147038	1147043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541054
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24208	NC_017327	A	6	6	1148294	1148299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24209	NC_017327	GA	3	6	1148408	1148413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24210	NC_017327	GGAA	2	8	1148459	1148466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24211	NC_017327	CCA	2	6	1148469	1148474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384541055
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24224	NC_017327	TGG	2	6	1149150	1149155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384541055
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24231	NC_017327	CGC	2	6	1149346	1149351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541055
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24233	NC_017327	CCT	2	6	1149390	1149395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541055
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24235	NC_017327	CCG	2	6	1149502	1149507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384541055
24236	NC_017327	CGT	2	6	1149517	1149522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541055
24237	NC_017327	CG	3	6	1149563	1149568	0 %	0 %	50 %	50 %	384541055
24238	NC_017327	TGGA	2	8	1149593	1149600	25 %	25 %	50 %	0 %	384541055
24239	NC_017327	GAC	2	6	1149623	1149628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384541055
24240	NC_017327	CA	3	6	1149709	1149714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24241	NC_017327	ACG	2	6	1149825	1149830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24242	NC_017327	CTA	2	6	1149868	1149873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24243	NC_017327	TCC	2	6	1149961	1149966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384541056
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24247	NC_017327	ACA	2	6	1150117	1150122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384541057
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24301	NC_017327	CAAG	3	12	1152794	1152805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24340	NC_017327	ACAA	2	8	1154904	1154911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24341	NC_017327	GGC	2	6	1155068	1155073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384541063
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24349	NC_017327	TGC	2	6	1155534	1155539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541063
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24353	NC_017327	GC	3	6	1155678	1155683	0 %	0 %	50 %	50 %	384541063
24354	NC_017327	ATC	2	6	1155737	1155742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384541063
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24358	NC_017327	GC	3	6	1155824	1155829	0 %	0 %	50 %	50 %	384541063
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24497	NC_017327	CCGG	2	8	1163490	1163497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24498	NC_017327	TCG	2	6	1163594	1163599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384541072
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