MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017327	AGC	2	6	22871	22876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017327	CGTT	2	8	22993	23000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017327	GGT	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017327	GAA	2	6	23117	23122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539820
505	NC_017327	CTT	2	6	23210	23215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539820
506	NC_017327	GCC	2	6	23227	23232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539820
507	NC_017327	GGCGTC	2	12	23239	23250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384539820
508	NC_017327	GCG	2	6	23258	23263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
509	NC_017327	CAC	2	6	23272	23277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539820
510	NC_017327	GGC	2	6	23334	23339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
511	NC_017327	GTG	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539820
512	NC_017327	GCT	2	6	23452	23457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539820
513	NC_017327	TGG	2	6	23548	23553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539820
514	NC_017327	CGG	2	6	23554	23559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
515	NC_017327	ACC	2	6	23576	23581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539820
516	NC_017327	GCGA	2	8	23633	23640	25 %	0 %	50 %	25 %	384539820
517	NC_017327	ATC	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539820
518	NC_017327	GCG	2	6	23757	23762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
519	NC_017327	GGC	2	6	23767	23772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
520	NC_017327	GGT	2	6	23788	23793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539820
521	NC_017327	TCG	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539820
522	NC_017327	GCC	2	6	23966	23971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539821
523	NC_017327	GC	4	8	23982	23989	0 %	0 %	50 %	50 %	384539821
524	NC_017327	CGG	3	9	24027	24035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539821
525	NC_017327	CGATGC	2	12	24129	24140	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384539821
526	NC_017327	CGC	2	6	24226	24231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539821
527	NC_017327	GC	3	6	24239	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	384539821
528	NC_017327	TGG	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539821
529	NC_017327	AAG	2	6	24313	24318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539821
530	NC_017327	CGC	2	6	24337	24342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539821
531	NC_017327	ATC	2	6	24361	24366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539821
532	NC_017327	CAG	2	6	24367	24372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539821
533	NC_017327	CGA	2	6	24373	24378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539821
534	NC_017327	TCA	2	6	24471	24476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539821
535	NC_017327	CG	3	6	24477	24482	0 %	0 %	50 %	50 %	384539821
536	NC_017327	TGC	2	6	24499	24504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017327	GAC	2	6	24528	24533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017327	GAT	2	6	24573	24578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539822
539	NC_017327	CGA	2	6	24594	24599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539822
540	NC_017327	GGC	2	6	24746	24751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539822
541	NC_017327	CGG	2	6	24755	24760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539822
542	NC_017327	TGT	2	6	24780	24785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539822
543	NC_017327	A	7	7	24913	24919	100 %	0 %	0 %	0 %	384539822
544	NC_017327	CCGG	2	8	24944	24951	0 %	0 %	50 %	50 %	384539822
545	NC_017327	CTCGAT	2	12	24990	25001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017327	TGC	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017327	ATG	2	6	25093	25098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017327	GCT	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017327	GTG	3	9	25170	25178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017327	ACGA	2	8	25230	25237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017327	CGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017327	GTC	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017327	TGA	2	6	25329	25334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017327	CGGG	2	8	25336	25343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
555	NC_017327	GCG	2	6	25435	25440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017327	CGT	2	6	25545	25550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017327	AAC	2	6	25560	25565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017327	GACA	2	8	25593	25600	50 %	0 %	25 %	25 %	384539823
559	NC_017327	GCA	2	6	25714	25719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539823
560	NC_017327	CGC	2	6	25766	25771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539823
561	NC_017327	GC	3	6	25776	25781	0 %	0 %	50 %	50 %	384539823
562	NC_017327	GAA	2	6	25794	25799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539823
563	NC_017327	GATCG	2	10	25840	25849	20 %	20 %	40 %	20 %	384539823
564	NC_017327	TGG	2	6	25856	25861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539823
565	NC_017327	GAT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539823
566	NC_017327	TTC	2	6	25898	25903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539823
567	NC_017327	GCTCT	2	10	26077	26086	0 %	40 %	20 %	40 %	384539823
568	NC_017327	CGA	2	6	26262	26267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539823
569	NC_017327	CAA	2	6	26293	26298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539823
570	NC_017327	AC	3	6	26468	26473	50 %	0 %	0 %	50 %	384539823
571	NC_017327	TTC	2	6	26485	26490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539823
572	NC_017327	CTA	2	6	26634	26639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539823
573	NC_017327	CTT	2	6	26757	26762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539823
574	NC_017327	GAAC	2	8	26816	26823	50 %	0 %	25 %	25 %	384539823
575	NC_017327	CTC	2	6	26895	26900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539824
576	NC_017327	GCCGG	2	10	26971	26980	0 %	0 %	60 %	40 %	384539824
577	NC_017327	ACG	2	6	27058	27063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539824
578	NC_017327	CGT	2	6	27134	27139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539824
579	NC_017327	CA	3	6	27160	27165	50 %	0 %	0 %	50 %	384539824
580	NC_017327	GC	3	6	27194	27199	0 %	0 %	50 %	50 %	384539824
581	NC_017327	TCC	2	6	27217	27222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539824
582	NC_017327	TGC	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539824
583	NC_017327	CG	3	6	27291	27296	0 %	0 %	50 %	50 %	384539824
584	NC_017327	ACT	2	6	27370	27375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539824
585	NC_017327	GCC	3	9	27565	27573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017327	AT	3	6	27603	27608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017327	CAA	2	6	27612	27617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017327	GTT	2	6	27681	27686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017327	ATT	2	6	27721	27726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017327	CT	3	6	27821	27826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017327	GTT	2	6	27837	27842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017327	TGCC	2	8	27918	27925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017327	CGG	2	6	27930	27935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017327	CCA	2	6	28039	28044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539826
595	NC_017327	CAG	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539826
596	NC_017327	CAG	3	9	28092	28100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539826
597	NC_017327	GCA	2	6	28208	28213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539826
598	NC_017327	ACCG	2	8	28334	28341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017327	CCTA	2	8	28344	28351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017327	GTGC	2	8	28391	28398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_017327	ACTC	2	8	28423	28430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_017327	CGT	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017327	TAA	2	6	28467	28472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017327	CTG	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017327	TCC	2	6	28577	28582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017327	TCCG	2	8	28645	28652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_017327	CGCT	2	8	28656	28663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_017327	GCA	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017327	GCC	2	6	28740	28745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017327	CAG	3	9	28760	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017327	GAG	2	6	28786	28791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017327	TGA	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017327	T	6	6	28932	28937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017327	GAC	2	6	28963	28968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017327	ATTTT	2	10	29031	29040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017327	CCG	2	6	29058	29063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017327	TGC	2	6	29098	29103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017327	TGT	2	6	29145	29150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017327	CCT	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_017327	GCGA	2	8	29200	29207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_017327	TCC	3	9	29212	29220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_017327	CTC	3	9	29247	29255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017327	CCT	2	6	29295	29300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017327	GCTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	384539827
625	NC_017327	GA	3	6	29392	29397	50 %	0 %	50 %	0 %	384539827
626	NC_017327	AGC	2	6	29456	29461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539827
627	NC_017327	CGCT	2	8	29487	29494	0 %	25 %	25 %	50 %	384539827
628	NC_017327	CGA	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539827
629	NC_017327	CG	3	6	29629	29634	0 %	0 %	50 %	50 %	384539827
630	NC_017327	TCC	2	6	29657	29662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539827
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632	NC_017327	TGC	2	6	29771	29776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539827
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