MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 34614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017327	CTA	2	6	216440	216445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540051
4502	NC_017327	GAG	2	6	216483	216488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540051
4503	NC_017327	GC	3	6	216505	216510	0 %	0 %	50 %	50 %	384540051
4504	NC_017327	A	6	6	216521	216526	100 %	0 %	0 %	0 %	384540051
4505	NC_017327	TC	3	6	216554	216559	0 %	50 %	0 %	50 %	384540051
4506	NC_017327	GAG	2	6	216567	216572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540051
4507	NC_017327	CT	3	6	216654	216659	0 %	50 %	0 %	50 %	384540052
4508	NC_017327	TCT	2	6	216700	216705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540052
4509	NC_017327	GCG	2	6	216831	216836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540052
4510	NC_017327	GGC	2	6	216856	216861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540052
4511	NC_017327	GGT	2	6	216895	216900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540052
4512	NC_017327	GAA	2	6	216901	216906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540052
4513	NC_017327	CGT	2	6	216922	216927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540052
4514	NC_017327	GC	3	6	217058	217063	0 %	0 %	50 %	50 %	384540052
4515	NC_017327	AAG	2	6	217145	217150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540052
4516	NC_017327	GCC	2	6	217180	217185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540053
4517	NC_017327	TCA	2	6	217226	217231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540053
4518	NC_017327	CGG	2	6	217244	217249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540053
4519	NC_017327	TCG	2	6	217370	217375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540053
4520	NC_017327	GTGG	2	8	217419	217426	0 %	25 %	75 %	0 %	384540053
4521	NC_017327	GCA	2	6	217502	217507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540053
4522	NC_017327	CGT	2	6	217524	217529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540053
4523	NC_017327	GCCG	2	8	217573	217580	0 %	0 %	50 %	50 %	384540053
4524	NC_017327	GTCGC	2	10	217621	217630	0 %	20 %	40 %	40 %	384540053
4525	NC_017327	ACA	2	6	217640	217645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540053
4526	NC_017327	CAG	2	6	217663	217668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540053
4527	NC_017327	GGC	2	6	217677	217682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540053
4528	NC_017327	CG	3	6	217827	217832	0 %	0 %	50 %	50 %	384540053
4529	NC_017327	TCG	2	6	217949	217954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_017327	TCGA	2	8	218023	218030	25 %	25 %	25 %	25 %	384540054
4531	NC_017327	GCC	2	6	218157	218162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540054
4532	NC_017327	ATC	2	6	218163	218168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540054
4533	NC_017327	GCA	2	6	218172	218177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4534	NC_017327	TCG	2	6	218218	218223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4535	NC_017327	CAT	2	6	218246	218251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540054
4536	NC_017327	TGC	2	6	218282	218287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4537	NC_017327	TGC	2	6	218297	218302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4538	NC_017327	AGA	2	6	218333	218338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540054
4539	NC_017327	TCC	2	6	218359	218364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540054
4540	NC_017327	GCT	2	6	218370	218375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4541	NC_017327	ATG	2	6	218551	218556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540054
4542	NC_017327	GCC	2	6	218575	218580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540054
4543	NC_017327	GAG	3	9	218586	218594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540054
4544	NC_017327	CGA	2	6	218711	218716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540054
4545	NC_017327	C	6	6	218767	218772	0 %	0 %	0 %	100 %	384540054
4546	NC_017327	GC	3	6	218780	218785	0 %	0 %	50 %	50 %	384540054
4547	NC_017327	TTC	2	6	218796	218801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540054
4548	NC_017327	GAA	2	6	218873	218878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017327	CGG	2	6	218938	218943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540055
4550	NC_017327	GCC	2	6	219080	219085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540055
4551	NC_017327	GCG	2	6	219101	219106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540055
4552	NC_017327	AAT	2	6	219128	219133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384540055
4553	NC_017327	TC	3	6	219144	219149	0 %	50 %	0 %	50 %	384540055
4554	NC_017327	TCG	2	6	219246	219251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540055
4555	NC_017327	CCA	2	6	219285	219290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540055
4556	NC_017327	AAGA	2	8	219297	219304	75 %	0 %	25 %	0 %	384540055
4557	NC_017327	GCC	2	6	219306	219311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_017327	CAA	2	6	219312	219317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_017327	GGC	2	6	219318	219323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_017327	TTC	2	6	219328	219333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_017327	TTTC	2	8	219418	219425	0 %	75 %	0 %	25 %	384540056
4562	NC_017327	GAGC	2	8	219431	219438	25 %	0 %	50 %	25 %	384540056
4563	NC_017327	TCGCG	2	10	219440	219449	0 %	20 %	40 %	40 %	384540056
4564	NC_017327	TTG	2	6	219488	219493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540056
4565	NC_017327	GGT	2	6	219508	219513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540056
4566	NC_017327	GGC	2	6	219530	219535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540056
4567	NC_017327	CG	3	6	219599	219604	0 %	0 %	50 %	50 %	384540056
4568	NC_017327	ATC	2	6	219666	219671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384540056
4569	NC_017327	TTCCA	2	10	219692	219701	20 %	40 %	0 %	40 %	384540056
4570	NC_017327	CTG	2	6	219745	219750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_017327	AG	3	6	219814	219819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017327	CACC	2	8	219848	219855	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4573	NC_017327	TGC	2	6	219885	219890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_017327	GA	3	6	219938	219943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017327	CT	4	8	219952	219959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_017327	TC	4	8	220029	220036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_017327	GGC	2	6	220252	220257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540057
4578	NC_017327	CAG	2	6	220280	220285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540057
4579	NC_017327	GC	3	6	220303	220308	0 %	0 %	50 %	50 %	384540057
4580	NC_017327	CAG	2	6	220322	220327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540057
4581	NC_017327	GCC	2	6	220363	220368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540057
4582	NC_017327	GGC	2	6	220375	220380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540057
4583	NC_017327	CGG	2	6	220409	220414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_017327	GGC	2	6	220503	220508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540058
4585	NC_017327	GCGA	2	8	220512	220519	25 %	0 %	50 %	25 %	384540058
4586	NC_017327	CAGTT	2	10	220530	220539	20 %	40 %	20 %	20 %	384540058
4587	NC_017327	GGGC	2	8	220597	220604	0 %	0 %	75 %	25 %	384540058
4588	NC_017327	ACC	2	6	220608	220613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384540058
4589	NC_017327	ACG	2	6	220632	220637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540058
4590	NC_017327	ATCG	2	8	220749	220756	25 %	25 %	25 %	25 %	384540058
4591	NC_017327	CG	3	6	220760	220765	0 %	0 %	50 %	50 %	384540058
4592	NC_017327	CCG	2	6	220795	220800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540058
4593	NC_017327	CAGC	2	8	220913	220920	25 %	0 %	25 %	50 %	384540058
4594	NC_017327	CCCAT	2	10	220934	220943	20 %	20 %	0 %	60 %	384540058
4595	NC_017327	GCCT	2	8	220947	220954	0 %	25 %	25 %	50 %	384540058
4596	NC_017327	TGA	2	6	221121	221126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540058
4597	NC_017327	CGAG	2	8	221146	221153	25 %	0 %	50 %	25 %	384540058
4598	NC_017327	ACG	2	6	221178	221183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540058
4599	NC_017327	CCGCTC	2	12	221256	221267	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384540058
4600	NC_017327	GAA	2	6	221276	221281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540058
4601	NC_017327	CTT	2	6	221339	221344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540058
4602	NC_017327	GTT	2	6	221385	221390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384540058
4603	NC_017327	TTC	2	6	221391	221396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540058
4604	NC_017327	CGC	2	6	221418	221423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540058
4605	NC_017327	GC	3	6	221479	221484	0 %	0 %	50 %	50 %	384540059
4606	NC_017327	AGC	2	6	221524	221529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540059
4607	NC_017327	AGG	2	6	221542	221547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540059
4608	NC_017327	CCG	2	6	221606	221611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540059
4609	NC_017327	CTG	2	6	221701	221706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540059
4610	NC_017327	CGC	2	6	221909	221914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540059
4611	NC_017327	CG	3	6	221916	221921	0 %	0 %	50 %	50 %	384540059
4612	NC_017327	TCC	2	6	221929	221934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384540059
4613	NC_017327	GGA	2	6	221975	221980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384540059
4614	NC_017327	CCG	2	6	222133	222138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384540059
4615	NC_017327	AAC	2	6	222187	222192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384540059
4616	NC_017327	AC	3	6	222191	222196	50 %	0 %	0 %	50 %	384540059
4617	NC_017327	GTAT	2	8	222216	222223	25 %	50 %	25 %	0 %	384540059
4618	NC_017327	GAA	2	6	222226	222231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540059
4619	NC_017327	GC	3	6	222243	222248	0 %	0 %	50 %	50 %	384540059
4620	NC_017327	TCG	2	6	222256	222261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540059
4621	NC_017327	TCT	2	6	222269	222274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540059
4622	NC_017327	AGA	2	6	222314	222319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540059
4623	NC_017327	CAG	2	6	222321	222326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384540059
4624	NC_017327	A	6	6	222342	222347	100 %	0 %	0 %	0 %	384540059
4625	NC_017327	CG	3	6	222423	222428	0 %	0 %	50 %	50 %	384540059
4626	NC_017327	GGC	3	9	222607	222615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540059
4627	NC_017327	TGC	2	6	222638	222643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540059
4628	NC_017327	CTT	2	6	222651	222656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384540059
4629	NC_017327	TCG	2	6	222733	222738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540059
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4632	NC_017327	TTTCG	2	10	223034	223043	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4633	NC_017327	TCAA	2	8	223070	223077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4634	NC_017327	CAT	2	6	223120	223125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_017327	TTG	2	6	223130	223135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_017327	CCGAGC	2	12	223181	223192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4637	NC_017327	AGA	2	6	223237	223242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384540060
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4639	NC_017327	CGTG	2	8	223325	223332	0 %	25 %	50 %	25 %	384540060
4640	NC_017327	GGC	2	6	223345	223350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384540060
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4643	NC_017327	CTG	2	6	223626	223631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4644	NC_017327	GTC	2	6	223681	223686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4645	NC_017327	ACT	2	6	223702	223707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4646	NC_017327	CAA	2	6	223718	223723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4647	NC_017327	AAG	2	6	223818	223823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4648	NC_017327	GC	3	6	223939	223944	0 %	0 %	50 %	50 %	384540061
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4715	NC_017327	A	8	8	227427	227434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4722	NC_017327	CG	3	6	227833	227838	0 %	0 %	50 %	50 %	384540067
4723	NC_017327	TGA	2	6	227915	227920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384540067
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4735	NC_017327	A	6	6	228325	228330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4736	NC_017327	CCG	2	6	228335	228340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4737	NC_017327	CTC	2	6	228367	228372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4738	NC_017327	AGG	2	6	228425	228430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4739	NC_017327	GTG	2	6	228434	228439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4740	NC_017327	CAG	3	9	228478	228486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4742	NC_017327	CGAG	2	8	228545	228552	25 %	0 %	50 %	25 %	384540069
4743	NC_017327	TCG	3	9	228560	228568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540069
4744	NC_017327	CCAT	2	8	228577	228584	25 %	25 %	0 %	50 %	384540069
4745	NC_017327	GTG	2	6	228601	228606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384540069
4746	NC_017327	TC	3	6	228667	228672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4748	NC_017327	ATC	2	6	228735	228740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4872	NC_017327	CGTC	3	12	235055	235066	0 %	25 %	25 %	50 %	384540077
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4992	NC_017327	CGT	2	6	242079	242084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384540086
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